Identifiers and Description
Gene Model Identifier
TTHERM_00150000Standard Name
MSH6L3 (MutS Homolog 6 (MSH6)-like protein 3)Aliases
PreTt20760 | 12.m00434 | 3700.m00155Description
DNA mismatch repair MutS family DNA-binding domain protein; MutS domain III family proteinGenome Browser (Macronucleus)
Genome Browser (Micronucleus)
External Links
Gene Ontology Annotations
Molecular Function
- ATP binding (IEA) | GO:0005524
- mismatched DNA binding (IEA) | GO:0030983
Biological Process
- mismatch repair (IEA) | GO:0006298
Domains
Gene Expression Profile
Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)
GeneMania
Tetrahymena Stock Center
No Data fetched for Tetrahymena Stock Center
Homologs
Source Identifier Score Tetrahymena borealis EI9_05062.1 9.997093137033517e-262 Description: MutS domain III family protein (1389 aa) Oxytricha Contig820.1.g122 1.999489510516749e-128 Description: MutS domain V DictyBase DDB_G0268614 1.0003926095686843e-81 Description: msh6 on chromosome: 1 position 238722 to 242663 SGD YDR097C 1.0000310450948521e-65 Description: MSH6 Protein required for mismatch repair in mitosis and meiosis, forms a complex with Msh2p to repair both single-base & insertion-deletion mispairs; potentially phosphorylated by Cdc28p WormBase WBGene00003422 1.9990871925214856e-61 Description: locus:msh-6 status:Partially_confirmed UniProt:Q9N3T8 protein_id:CCD72556.1 Stentor Coeruleus SteCoe_17585 3.392270193026015e-47 Description: None
General Information
No Data fetched for General Information
Associated Literature
- Ref:23884606: Gao S, Xiong J, Zhang C, Berquist BR, Yang R, Zhao M, Molascon AJ, Kwiatkowski SY, Yuan D, Qin Z, Wen J, Kapler GM, Andrews PC, Miao W, Liu Y (2013) Impaired replication elongation in Tetrahymena mutants deficient in histone H3 Lys 27 monomethylation. Genes & development 27(15):1662-79
Sequences
>TTHERM_00150000(coding)
ATGCCTCCTAAAAAGACTAAATCAAGCGAAGTAAAAGAAAGCAGATCTTCTTCTAAGAAA
AATGTTATTGATTCTGAAGACAGTGAAGATCAAGCTATTAAGAAAACACCTAATACTAAA
AAAGGATCAAATGCTGCAAATGCAAAAAGTGTTTTATCAAAAGAAAGCTCAGTTTAAAAA
AGCAACTCATCAGATAATAAAAGAGCTTTAAAAAAAATCTAATTAAGTGAATCTGAGGGA
GAAGATAAAGAGCTTTTTCCCACAGCACCTGCGAAAAAGAAATCTGCTCCTGCTCCCAAA
GAAATTATAGTTAAGGAAGAAGAAAGTAGCGAAGATGATTAAGTTGTGAAAATTAAAAAT
AATAAAAATGGATCAGCTGCTGCTGCTACAACAACAAATAAAGTTGCTAAAAATAAAAAG
AAAATTAGTGATAATGAATCTTGTGATGAAGAAGAAGAATAAATGACTAAAAATAAAAAA
GCAACAAATTAAGCTAAAAATAAAAAAACTGACAAAGAAAATGAAACTAAGTAGACTACC
TAACGCTCGTCAAGAAATTAGAAAAAGATTTCTTACAAAGAAGAAGATGAAGAAGACGAA
TACACTCCTGAATAAGAAGATGAAGATTTTAAGGATGAAGAAGTTGATGAAGTTGAAGAG
GATGAAGAAGAAGGAGATGAGCTTAACTCAGATGATGATTTTGAAGAATAAGGCAAAAAG
AATAAAAAGAATGGATAAAGAAAAAATAATAAAAAAGCAAATGGAAGAAGTGAAGGCGCA
AATAATGAAAAAGCTGCTAAAAAAATTCATAAGGCTCCAGAAAATGCTGATGACAATCAC
ATAATAGATGTATAAAAAGAATAAGGAAAATTGGATATAGAAGATTAATATGAATTGCCA
TACTTTTTAACAAAGAAGTATTTAAAAGATGCAGAAGGTAGACCAGTAGACGATCCTGAG
TACGATCCATCAACTCTGTTTATCCCTATATAAGAGTTAAAAAAGGAAACACCTCTTTTC
TAATAATATTGGAAAATTAAAGTAAAGCATTTTGACAAGGTAGTGTTTTTTAGATTTGGA
AGAAATTTTGTTTGCTTTTATACTGATGCCATTCTGATGAAAAAGCTCTTCGATTGCTAT
ATTGGAGTCTGGGGCAAAAGACCTGTTGCTAATATTTTCGATAATCACTATCGTTTTTAT
GTAAAAGAACTTCTCGAAAAAGCAGATAAGTCTTGTTTAGTTGTAGATTAAGTTCAATTT
TCAGATGATAGATCAAATGAATAATATCTTATTAAAAGAGAAGTTACCTAGATTATAACT
AAGGGTACTTATACTGATTATGTAGATAATGTCGAAGATTATAATGCAAGATATTTAATG
TGTATAGTAGAGAGTGAAACTGATCATTCATTTGGTTTAGTTCTTATAGATTGTACAACC
CATCAAATATATTTAGATGATATCAAAAATGACCCAGCAGGAAACCAAATTCGTACAATT
TTAAGAAAAATGAAACCTGTTGAAATTCACTCAGTCTTTAATAATCTTTCTGAATAAACT
AAAAATATTTGCAAAACAACATGCAAACCATAATTTACATTTGATAAATCGTTTGAATTT
TATGAGCTTTAAAGTATTTTCGAAGAGCTTAAAAATGAGTTTAGAGAGAAAATTCCAATT
AATAATCCCGATAGTATGAAGAAAAGTAATTAAATGGAGATAGAAAAACCCAAGGCCAAC
AAGAAAAACAATAAAAAAAATAATAAAAAGAAATAAAGTGATGATGATGAAGATGGATCA
GATGAAAGCTCTGATGAAGAAAAATCAAAAAGCTTAGTAGATGAAGAAGATGATGACGGA
AGTGACAGTGAAGATGATATTGAAAACCTGTACAAGCCTGAAGTTAAAAAAGAGCCTAAA
TTTACTTACGGTGAACTTAGCAGCGATTATCCTTTACTATTGAAAGATATAGAGGAAATG
TACAACATAGATAAAAAAAAATTTGAGGAAGAACTCTAAAAAAAAGCTAATAGGAAGCAA
AAAAATTCTCAAGATATGTAAAATGAAGAAGATGATGATGAACCTTGCTTCGACATAGAA
TACCAGTATTATATGATGCTTTAAGCATTAATGCTTGGACTAAGCTACTTGAGAAAGCTG
AAATTGAATGATAATGTATTTAGACTTGGTTCCTTTTCTCTTTTAGATTCAACTGTTTAA
AAGAATACTTTTCTCCATTTAGATGCTCATGCAATAGAAAATTTAGATATTTTCGAGGTC
AATTTATAAAACCGTGTTACTTCTGAAGGGTCTTTGATGTCTTTTATTGATTACACTAAA
ACTCAATTCGGAAAAAGAATGCTTAAGAGATGGCTATCTTATCCACTAAAAAGTATATAG
CAAATAGAATAAAGGTAAGAAGCCATAGAAGATTTAATGAAAATAGAGGATGTAATTGAG
TAATTTGATAAGAAACTCAGTAAATTAGGAGATGTCGAAAGATAAATTAGCAAAATTTTT
AACTCATCTTAGAAATCAAGACTTAAACCTACTTCTTTTGAAAACTTCTCAAATGTCAGA
TTAAAAGATGCTTATTCTTTAGTTGAGGATTTAAAAAATTTAGAAGAAATTTTACTTATT
TTCAAAGATTATTAAGACAATTTTAATTCAACTAAACTCAAAAAATTGGTTACTGTAAAG
GATCCTGAATAAATTAATAAAATTTTAGAGAGTACCAGATAAAAAAATAACTCGTAAACC
TATCTTTCATAAAAATTACTTAATAGGTAAAGCAGCACAAATAGTAAATCTAAGCAGTAA
ATTATAGTTGGTATTTTCCCAGACTTAAAGCCTTTTGTAGAGTTGATATAGAGTTAGCTC
GAATAGGATGAATAAGGTTACTGCCAACCTAAATAAGGAGCAGATGCAGTTTATGATGAA
ATTGTATTTAAAATGAAAAAAATTTATAAGAAGATGAATAATGAAGCACTTGTCTGGCGT
AAAAAATTTAACAATAACTAAGATATAAAATTAATAAAAAGCAAAATGTAATGGGAAATA
TAAATACCTGAGAAGCTTGTTGAAGGATCAAAGAAACCTAAAGAACTTTATCTCACTTCT
AAAGTTAAAGGTTATCAAAGATTCTAAACAGATAAAATAATTAGTCTATGTGCAAAACTT
AAAAAAGTAGAAGTCTAATTGCAAAAAGCCCTCTCTCCTTTTTGTGAAAGATTTTTCCAT
TTGTTTTATTAAAATAGAGAACTATTGTATTAGGCTGTTAATTGCATTGGTGAGTTAGAT
TGCTTATGCTCTTTGGCTAAGTGTTCTCTTAATCTTAAGATAAGATGCAAACCAACTTTT
ATTCCAGAAAGTTTAAATAAAAATGTTTTCGAACTTATAGAAATGTATCACCCCTAACTG
CTAAAGGAAAATAAAAAAAATTTAGTACCAAATGATACAATTTTCGAAGATAATGTTACT
TGTATGCTTGTCACAGGTCCAAATATGGGTGGTAAATCAACACTTCTTAGATAAAATTGC
TTAGCTGTTATTCTAGCACAATTAGGTTGCTTCTTGCCTGCTAAAAGTTTTAAAACAATT
ATAAGAGACAGAATTTTCTGTAGAATAGGTGCTTCTGATAGATTACTAGAAGGAAAATCA
ACCTTTTTGGTAGAAATGGAAGAGACAGGAGATATAGTGAAAGAGGCAACAAATTAAAGC
TTGGTTTTATTAGATGAATTAGGAAGAGGTACAAGCACATTTGATGGTGTATCTATAGCA
TATGGTGTTTTGAGATATCTTGTTGAGAATGTTAAATGTCTTACCCTGTTTTCAACTCAT
TATCATATGCTTGTTGATGAATTTAAACTTTACAAAAATGTTCAATCCTATGTCATGGAT
TTTGATTACTGCTCATAATAAAAGAAAATAGATTTCAAATATAAATATATTAAAGGTTCT
TCAGAAAAAAGTTTTGGTGTAAATGTAGCTAAAATGGCAGGACTTCCTGACAGTGTAATA
GATAAAGCTCATAAAATGGAACATTATATGAATTCAGAAGATTAAAATATAGGTAATGTT
CGTAGAATTACTTAAAAGTTTAATTCTATTATAGAAGCTTAGCATTAAAGTGACGATACA
CTTTTATAATTACTTAAAAATAGTTTTTGA>TTHERM_00150000(gene)
ATGCCTCCTAAAAAGACTAAATCAAGCGAAGTAAAAGAAAGCAGATCTTCTTCTAAGAAA
AATGTTATTGATTCTGAAGACAGTGAAGATCAAGCTATTAAGAAAACACCTAATACTAAA
AAAGGATCAAATGCTGCAAATGCAAAAAGTGTTTTATCAAAAGAAAGCTCAGTTTAAAAA
AGCAACTCATCAGATAATAAAAGAGCTTTAAAAAAAATCTAATTAAGTGAATCTGAGGGA
GAAGATAAAGAGCTTTTTCCCACAGCACCTGCGAAAAAGAAATCTGCTCCTGCTCCCAAA
GAAATTATAGTTAAGGAAGAAGAAAGTAGCGAAGATGATTAAGTTGTGAAAATTAAAAAT
AATAAAAATGGATCAGCTGCTGCTGCTACAACAACAAATAAAGTTGCTAAAAATAAAAAG
AAAATTAGTGATAATGAATCTTGTGATGAAGAAGAAGAATAAATGACTAAAAATAAAAAA
GCAACAAATTAAGCTAAAAATAAAAAAACTGACAAAGAAAATGAAACTAAGTAGACTACC
TAACGCTCGTCAAGAAATTAGAAAAAGATTTCTTACAAAGAAGAAGATGAAGAAGACGAA
TACACTCCTGAATAAGAAGATGAAGATTTTAAGGATGAAGAAGTTGATGAAGTTGAAGAG
GATGAAGAAGAAGGAGATGAGCTTAACTCAGATGATGATTTTGAAGAATAAGGCAAAAAG
AATAAAAAGAATGGATAAAGAAAAAATAATAAAAAAGCAAATGGAAGAAGTGAAGGCGCA
AATAATGAAAAAGCTGCTAAAAAAATTCATAAGGCTCCAGAAAATGCTGATGACAATCAC
ATAATAGATGTATAAAAAGAATAAGGAAAATTGGATATAGAAGATTAATATGAATTGCCA
TACTTTTTAACAAAGAAGTATTTAAAAGATGCAGAAGGTAGACCAGTAGACGATCCTGAG
TACGATCCATCAACTCTGTTTATCCCTATATAAGAGTTAAAAAAGGAAACACCTCTTTTC
TAGTAAATTTGATATTAAAATTTAATAATATAATAAAAATGTTTTTTTTAAAATAAATTA
ATAGATAATATTGGAAAATTAAAGTAAAGCATTTTGACAAGGTAGTGTTTTTTAGATTTG
GAAGAAATTTTGTTTGCTTTTATACTGATGCCATTCTGATGAAAAAGCTCTTCGATTGCT
ATATTGGAGTCTGGGGCAAAAGACCTGTTGCTAATATTTTCGATAATCACTATCGTTTTT
ATGTAAAAGAACTTCTCGAAAAAGCAGATAAGTCTTGTTTAGTTGTAGATTAAGTTCAAT
TTTCAGATGATAGATCAAATGAATAATATCTTATTAAAGTAATTTTTAGTTTAAATAATA
AAAAATTAATATTTTTTTTTAAAGAGAGAAGTTACCTAGATTATAACTAAGGGTACTTAT
ACTGATTATGTAGATAATGTCGAAGATTATAATGCAAGATATTTAATGTGTATAGTAGAG
AGTGAAACTGATCATTCATTTGGTTTAGTTCTTATAGATTGTACAACCCATCAAATATAT
TTAGATGATATCAAAAATGACCCAGCAGGAAACCAAATTCGTACAATTTTAAGAAAAATG
AAACCTGTTGAAATTCACTCAGTCTTTAATAATCTTTCTGAATAAACTAAAAATATTTGC
AAAACAACATGCAAACCATAATTTACATTTGATAAATCGTTTGAATTTTATGAGCTTTAA
AGTATTTTCGAAGAGCTTAAAAATGAGTTTAGAGAGAAAATTCCAATTAATAATCCCGAT
AGTATGAAGAAAAGTAATTAAATGGAGATAGAAAAACCCAAGGCCAACAAGAAAAACAAT
AAAAAAAATAATAAAAAGAAATAAAGTGATGATGATGAAGATGGATCAGATGAAAGCTCT
GATGAAGAAAAATCAAAAAGCTTAGTAGATGAAGAAGATGATGACGGAAGTGACAGTGAA
GATGATATTGAAAACCTGTACAAGCCTGAAGTTAAAAAAGAGCCTAAATTTACTTACGGT
GAACTTAGCAGCGATTATCCTTTACTATTGAAAGATATAGAGGAAATGTACAACATAGAT
AAAAAAAAATTTGAGGAAGAACTCTAAAAAAAAGCTAATAGGAAGCAAAAAAATTCTCAA
GATATGTAAAATGAAGAAGATGATGATGAACCTTGCTTCGACATAGAATACCAGTATTAT
ATGATGCTTTAAGCATTAATGCTTGGAGTAATTAACTTTAGACATTATTTTTCAAAGTAC
CAAAAATATTTTATTTAATTAAATTTAAGCTAAGCTACTTGAGAAAGCTGAAATTGAATG
ATAATGTATTTAGACTTGGTTCCTTTTCTCTTTTAGATTCAACTGTTTAAAAGAATACTT
TTCTCCATTTAGATGCTCATGCAATAGAAAATTTAGATATTTTCGAGGTCAATTTATAAA
ACCGTGTTACTTCTGAAGGGTATAAATTATAGATATTAAAAATAGTAAAAACATTAATAA
TTTCAATAATAAAGGTCTTTGATGTCTTTTATTGATTACACTAAAACTCAATTCGGAAAA
AGAATGCTTAAGAGATGGCTATCTTATCCACTAAAAAGTATATAGCAAATAGAATAAAGG
TAAGAAGCCATAGAAGATTTAATGAAAATAGAGGATGTAATTGAGTAATTTGATAAGAAA
CTCAGTAAATTAGGAGATGTCGAAAGATAAATTAGCAAAATTTTTAACTCATCTTAGAAA
TCAAGACTTAAACCTACTTCTTTTGAAAACTTCTCAAATGTCAGATTAAAAGATGCTTAT
TCTTTAGTTGAGGATTTAAAAAATTTAGAAGAAATTTTACTTATTTTCAAAGATTATTAA
GACAAGTAATTTTTATTTAACATTAATTATATATTCAAATTAAATTAATACTTTTAAAAA
TAGTTTTAATTCAACTAAACTCAAAAAATTGGTTACTGTAAAGGATCCTGAATAAATTAA
TAAAATTTTAGAGAGTACCAGATAAAAAAATAACTCGTAAACCTATCTTTCATAAAAATT
ACTTAATAGGTAAAGCAGCACAAATAGTAAATCTAAGCAGTAAATTATAGTTGGTATTTT
CCCAGACTTAAAGCCTTTTGTAGAGTTGATATAGAGTTAGCTCGAATAGGATGAATAAGG
TTACTGCCAACCTAAATAAGGAGCAGATGCAGTTTATGATGAAATTGTATTTAAAATGAA
AAAAATTTATAAGAAGATGAATAATGAAGCACTTGTCTGGCGTAAAAAATTTAACAATAA
CTAAGATATAAAATTAATAAAAAGCAAAATGTAATGGGAAATATAAATACCTGAGAAGCT
TGTTGAAGGATCAAAGAAACCTAAAGAACTTTATCTCACTTCTAAAGTTAAAGGTTATCA
AAGATTCTAAACAGATAAAATAATTAGTCTATGTGCAAAACTTAAAAAAGTAGAAGTCTA
ATTGCAAAAAGCCCTCTCTCCTTTTTGTGAAAGATTTTTCCATTTGTTTTATTAAAATAG
AGAACTATTGTATTAGGTAAAATTTTATTGACATTTAAATTATTTTTAAAATTTTTAAAT
AAATTATAAATCAGGCTGTTAATTGCATTGGTGAGTTAGATTGCTTATGCTCTTTGGCTA
AGTGTTCTCTTAATCTTAAGATAAGATGCAAACCAACTTTTATTCCAGAAAGTTTAAATA
AAAATGTTTTCGAACTTATAGAAATGTATCACCCCTAACTGCTAAAGGAAAATAAAAAAA
ATTTAGTACCAAATGATACAATTTTCGAAGATAATGTTACTTGTATGCTTGTCACAGGTC
CAAATATGGGTGGTAAATCAACACTTCTTAGATAAAATTGCTTAGCTGTTATTCTAGCAC
AATTAGGTTGCTTCTTGCCTGCTAAAAGTTTTAAAACAATTATAAGAGACAGAATTTTCT
GTAGAATAGGGTAAACAAATATCTTTAAACATAATAATTTGTAAAGATTTTAATATTCTT
ATTATTGAATTAATTTAGTGCTTCTGATAGATTACTAGAAGGAAAATCAACCTTTTTGGT
AGAAATGGAAGAGACAGGAGATATAGTGAAAGAGGCAACAAATTAAAGCTTGGTTTTATT
AGATGAATTAGGAAGAGGTACAAGCACATTTGATGGTGTATCTATAGCATATGGTGTTTT
GAGATATCTTGTTGAGAATGTTAAATGTCTTACCCTGTTTTCAACTCATTATCATATGCT
TGTTGATGAATTTAAACTTTACAAAAATGTTCAATCCTATGTCATGGATTTTGATTACTG
CTCATAATAAAAGAAAATAGATTTCAAATATAAATATATTAAAGGTTCTTCAGAAAAAAG
TTTTGGTGTAAATGTAGCTAAAATGGCAGGACTTCCTGACAGTGTAATAGATAAAGCTCA
TAAAATGGAACATTATATGAATTCAGAAGATTAAAATATAGGTAATGTTCGTAGAATTAC
TTAAAAGTTTAATTCTATTATAGAAGCTTAGCATTAAAGTGACGATACACTTTTATAATT
ACTTAAAAATAGTTTTTGA>TTHERM_00150000(protein)
MPPKKTKSSEVKESRSSSKKNVIDSEDSEDQAIKKTPNTKKGSNAANAKSVLSKESSVQK
SNSSDNKRALKKIQLSESEGEDKELFPTAPAKKKSAPAPKEIIVKEEESSEDDQVVKIKN
NKNGSAAAATTTNKVAKNKKKISDNESCDEEEEQMTKNKKATNQAKNKKTDKENETKQTT
QRSSRNQKKISYKEEDEEDEYTPEQEDEDFKDEEVDEVEEDEEEGDELNSDDDFEEQGKK
NKKNGQRKNNKKANGRSEGANNEKAAKKIHKAPENADDNHIIDVQKEQGKLDIEDQYELP
YFLTKKYLKDAEGRPVDDPEYDPSTLFIPIQELKKETPLFQQYWKIKVKHFDKVVFFRFG
RNFVCFYTDAILMKKLFDCYIGVWGKRPVANIFDNHYRFYVKELLEKADKSCLVVDQVQF
SDDRSNEQYLIKREVTQIITKGTYTDYVDNVEDYNARYLMCIVESETDHSFGLVLIDCTT
HQIYLDDIKNDPAGNQIRTILRKMKPVEIHSVFNNLSEQTKNICKTTCKPQFTFDKSFEF
YELQSIFEELKNEFREKIPINNPDSMKKSNQMEIEKPKANKKNNKKNNKKKQSDDDEDGS
DESSDEEKSKSLVDEEDDDGSDSEDDIENLYKPEVKKEPKFTYGELSSDYPLLLKDIEEM
YNIDKKKFEEELQKKANRKQKNSQDMQNEEDDDEPCFDIEYQYYMMLQALMLGLSYLRKL
KLNDNVFRLGSFSLLDSTVQKNTFLHLDAHAIENLDIFEVNLQNRVTSEGSLMSFIDYTK
TQFGKRMLKRWLSYPLKSIQQIEQRQEAIEDLMKIEDVIEQFDKKLSKLGDVERQISKIF
NSSQKSRLKPTSFENFSNVRLKDAYSLVEDLKNLEEILLIFKDYQDNFNSTKLKKLVTVK
DPEQINKILESTRQKNNSQTYLSQKLLNRQSSTNSKSKQQIIVGIFPDLKPFVELIQSQL
EQDEQGYCQPKQGADAVYDEIVFKMKKIYKKMNNEALVWRKKFNNNQDIKLIKSKMQWEI
QIPEKLVEGSKKPKELYLTSKVKGYQRFQTDKIISLCAKLKKVEVQLQKALSPFCERFFH
LFYQNRELLYQAVNCIGELDCLCSLAKCSLNLKIRCKPTFIPESLNKNVFELIEMYHPQL
LKENKKNLVPNDTIFEDNVTCMLVTGPNMGGKSTLLRQNCLAVILAQLGCFLPAKSFKTI
IRDRIFCRIGASDRLLEGKSTFLVEMEETGDIVKEATNQSLVLLDELGRGTSTFDGVSIA
YGVLRYLVENVKCLTLFSTHYHMLVDEFKLYKNVQSYVMDFDYCSQQKKIDFKYKYIKGS
SEKSFGVNVAKMAGLPDSVIDKAHKMEHYMNSEDQNIGNVRRITQKFNSIIEAQHQSDDT
LLQLLKNSF