Identifiers and Description
Gene Model Identifier
TTHERM_00329960Standard Name
NPC3 (NePhroCystin-3 ortholog)Aliases
PreTt30301 | 33.m00313 | 3705.m00139Description
NPC3 tetratricopeptide repeat protein; TPR Domain containing protein; E3 ubiquitin ligaseGenome Browser (Macronucleus)
Genome Browser (Micronucleus)
External Links
Gene Ontology Annotations
Molecular Function
- protein binding (IEA) | GO:0005515
- zinc ion binding (IEA) | GO:0008270
Domains
- ( PF00097 ) zinc finger, C3HC4 type (RING
- ( PF00515 ) tetratricopeptide repeat
- ( PF00628 ) PHD-finger
- ( PF01535 ) PPR repeat
- ( PF06696 ) Streptococcal surface antigen repeat
- ( PF07719 ) tetratricopeptide repeat
- ( PF07720 ) Tetratricopeptide repeat
- ( PF07721 ) Tetratricopeptide repeat
- ( PF08238 ) Sel1 repeat
- ( PF08385 ) Dynein heavy chain, N-terminal region
- ( PF08393 ) Dynein heavy chain, N-terminal region
- ( PF08908 ) Domain of unknown function (DUF1852)
- ( PF08946 ) Osmosensory transporter coiled coil
- ( TIGR00073 ) hydrogenase accessory protein HypB
- ( TIGR00181 ) oligoendopeptidase F
- ( TIGR02521 ) type IV pilus biogenesis/stability protein
Gene Expression Profile
Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)
GeneMania
Tetrahymena Stock Center
No Data fetched for Tetrahymena Stock Center
Homologs
Source Identifier Score Tetrahymena borealis EI9_08525.1 9.997093137033517e-262 Description: TPR Domain containing protein (1227 aa) Stentor Coeruleus SteCoe_4411 6.47023492564546e-26 Description: None DictyBase DDB_G0292714 1.0004572433669413e-23 Description: DDB_G0292714 on chromosome: 6 position 1780390 to 1784905 WormBase WBGene00002215 1.000361553249356e-16 Description: locus:klc-2 Kinesin light chain status:Confirmed UniProt:P46822 protein_id:CCD65112.1 Oxytricha Contig13558.0.g11 0.00000000000003999587784428659 Description: Tetratricopeptide repeat SGD YOL013C 0.000009999254677478949 Description: HRD1 Ubiquitin-protein ligase required for endoplasmic reticulum-associated degradation (ERAD) of misfolded proteins; genetically linked to the unfolded protein response (UPR); regulated through association with Hrd3p; contains an H2 ring finger
General Information
No Data fetched for General Information
Associated Literature
No Data fetched for Associated Literature
Sequences
>TTHERM_00329960(coding)
ATGAGCAACGATAAAATTCTACTTCCTATCTTCTCTAGAGCAAAGACATAGTTTTAAGAA
AAATAAATAGATTAAGAATTTAGTATTTGCAATAAACAAATCAATGAAAATCTCTCACCA
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TTACAATTATCTTTCAAATTAGCAAAAAAGTAGTATGAATCTAAAAAGAATAATCGAAAT
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TTACATTAGAGTTTAATGTATGCTGAGTGTCTAGACTCAAAAGCTAACTTGTTAAGATCT
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ATTTTAGGTAAAATAAATCATCCTTAAATAATTTCTTCATAAGAAAATATTGCACTGGTA
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AGAGAGTCATTATATACCTCAGATATATGCCCAAATAGTCACCCTCAGATAGCAGATGCT
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TAAAATTTCCTTTAGAAAATATTCAATACTGTTAATAGCAATTTGATTAAACTATAATTT
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AGTACATACTATGACCTTCAAAAATACAAAGAAGCTTTAGAGTATTATTTGCAGGAATTA
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TCCACTTATTTCTCTCTCCTCGAATTTGAGAAAGCTCTTGAGCATTTTGAGTAATCTTAT
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GTACTTCCTTGTAGCCACTTTTATCATACGTTCTGCATAGACAAATGGTTACTTGCTAAA
TAATCTTGTCCTAATTGCAGGTAGTGTCCTATTGTAAATTATTAACAAGATAACTAAGAT
AAAATCGAATGA>TTHERM_00329960(gene)
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AAATAAATAGATTAAGAATTTAGTATTTGCAATAAACAAATCAATGAAAATCTCTCACCA
CAAATAACTAAAATATATAAAACAAATAACGAAATAAAAAGCCTTCTTGACTAAGGAAAC
TTACAATTATCTTTCAAATTAGCAAAAAAGTAGTATGAATCTAAAAAGAATAATCGAAAT
TCTTCAAATAAGACATTTATTGAATCTCAAATAACTTACGCTGATGTTCTATTTTAATTA
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TTAGAAGAACTAGAATAAGAATACAGCAAGGCTTTGGACATGGCAGGTATTTATTTATTG
ATTTATTTGTTTTTTTACTTAGAGTTTTACCAAAAAAAGAATTGAAACATATTTAAAAAA
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TAGTTTTATTTATTTATTAATAGGAAAAGCCTATCTAAAGCTAGGCTATTTGAAGAAGGC
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TTGTGAAAAGAGCTTAAAACTATATATGTCTGTTAATTTACATTAGAGTTTAATGTATGC
TGAGTGTCTAGACTCAAAAGCTAACTTGTTAAGATCTCTAGGAAAACTTGAAGAGTCTTT
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TTAATTTTCATTAAAATTCGCATTTCTATTTTATGATTAAAAAATATAAATTAAAATTAG
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TTATTAAAAGTACTTATTTATTATAAAGGAAAGGCATTTAAACAAATAAGTATAATGCAA
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TTAAATAATTAAAAAAAGGCTTTGAGTTTAAGAGAATCTATTTATTAGTATGACCGCTAA
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GAAAATGAAAATATCTTATCAGCTCTTTCTATCACCTATTTAGCCTGGTCATATTACAAT
TTATTTGAATATGATTAATCTATTGAACTCAATTAACAAGCGCTAAAAATTTGGTAAAGA
AATATTAAGAGTCACCCTTATATTACTTCTACTTTAGAAAACTTAGCTTTGGCGTAGTAT
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TTATATAAGCAGGGAAAGACAGAACAAAGCAAGTTCTTCTTAAACTAATCTCTATAAATA
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TTTTTTAATTTTTGTTATATTTTCTAAATAATTAATTATGCTAAAAAACGCTTTATAATT
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TTAATAATTTTTTTATATAAGATAATAAAGATGTAGATCCCTACCTTTTATGCTCAACAT
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TGAGAAAAGTTGAACCTGAAAACCAAGCTAGAGCAGCTACAACACTAAATAATATTGCAT
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AGATCCGTAGAGAAAATTTAGGAGAAACTCATCCTGAAACAGTTTCGTCTTTAAATAATA
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TGCTTTAAATTCGTATTCAATAATAAGAGTGTAAAATAAAAATAGCAACAGCCTATGATA
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ACTAAGATAAAATCGAATGA>TTHERM_00329960(protein)
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