Identifiers and Description
Gene Model Identifier
TTHERM_00421020Standard Name
RRM20 (RNA Recognition Motif-containing protein 20)Aliases
PreTt07227 | 46.m00282 | 3679.m00132Description
RRM20 RNA recognition motif proteinGenome Browser (Macronucleus)
Genome Browser (Micronucleus)
External Links
Gene Ontology Annotations
Molecular Function
- nucleic acid binding (IEA) | GO:0003676
- protein binding (IEA) | GO:0005515
Domains
- ( PF00076 ) RNA recognition motif. (a.k.a. RRM,
- ( PF00397 ) WW domain
- ( TIGR01622 ) splicing factor, CC1-like family
- ( TIGR01628 ) polyadenylate binding protein, human types
- ( TIGR01648 ) hnRNP-R, Q splicing factor family
- ( TIGR01659 ) sex-lethal family splicing factor
- ( TIGR01661 ) ELAV/HuD family splicing factor
Gene Expression Profile
Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)
GeneMania
Tetrahymena Stock Center
No Data fetched for Tetrahymena Stock Center
Homologs
Source Identifier Score Tetrahymena borealis EI9_10972.1 9.997093137033517e-262 Description: hypothetical protein (797 aa) WormBase WBGene00006807 9.99967697349061e-30 Description: locus:unc-75 status:Confirmed UniProt:G5EE68 protein_id:CAB03896.4 DictyBase DDB_G0291486 7.002116201343823e-26 Description: DDB_G0291486 on chromosome: 6 position 413873 to 415521 Oxytricha Contig18677.0.g10 2.000769134519826e-18 Description: RNA recognition motif_ (a_k_a_ RRM, RBD, or RNP domain) SGD YGR250C 0.000000000003998907168546896 Description: YGR250C Putative RNA binding protein; localizes to stress granules induced by glucose deprivation; interacts with Rbg1p in a two-hybrid Stentor Coeruleus SteCoe_10259 0.00000000003775134544279098 Description: None
General Information
No Data fetched for General Information
Associated Literature
No Data fetched for Associated Literature
Sequences
>TTHERM_00421020(coding)
ATGCAATTTTAACAATATTCAAGTTCCAGTAGCAAATCAAATAAATTGGGAGGTCAGTAA
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CCTAGTCTTAGTTAAAATGGATATTAACCCTTTTGA>TTHERM_00421020(gene)
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AACATACAGGTTAAGTGGGCTGATAATGAGCCTGATAGGCTAGGAATCAGACAAGACCAA
GACTATGTCTTATATGTAGCTCATATTCCTAAAAATGCATCAGAGGTGAGCTATTTATTT
TTTCAAACTTTGAATTTATGCTCTATCTATTTTAAAAATAAATCAAGTGATATTTTTTAC
ATTTATATAATACTAGCCTGAAATAAGAAATGTTTTTGAAAACTATGGAATTGTTAAAGA
AGTTGATATCCCTAAAGATTAATCTGGAACAAGCAGAGGATTTGTTTTTGTGAAATTTGA
AAATATTGAACAAGCTATTTTAGCCAAATAGGCTCTCCATGAAAAATAAGTTTTAAATAA
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TACCAAAGAGAATAGCACTCTAATTATAACTAAGGAAGCTAGTCATAAGGATATAGAGGA
GGATAAGGAAATTATCACGGGCATCATGAAAGCAAAGGGTCCTATAACTAAAATAATTAA
AATTACCCAAGAGAAAGTGCCAATTTAAACAACAGTGAACATTATGATTAGCCAAGCTAG
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AACAACAATAACAGTAATAATAGCAGCAACAATAACTTTTAGTATAGCAGTAGCTACCCC
TCTAATTAGCCTGCTGGAAATAATTTGAGCAATTAGCAATTTAATTAAACTTATAATAAC
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AATGGACCTGTTCCAAATAGTGCTAATAATAATTAAATTTAATAGTTTAATCCATACTAT
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ACTCCAAATTAACCTCCATAATAAATACCTTAACATGAAATAAATTAACCTCCATTATTC
AATATGCCATAATAATAACAACAACCAATAAACCCATAGCCTTCATTAGACATTTCTTAG
CCTAGTAGTGGTTACTAAGAGCCAATCCCTGCTGTAGAACCTAATTAATAGCCAATTTAA
GTAAAATCTTTGTTTCCAATTAAATTATTTATTCTTTTTTATTTAATAGCAAAAAGCCTA
TATTAAGTATTACACTGATGACAAAGTCCCTTATTACTATGATACTCAAACTTAATCTAC
ATCATATGACTAACCTCCTTTAGGATCGATAATATATAATCCAGATGGAACACAAGAACA
TGTATAACCAGAAAGCATCGAACAACTGCAAAAATTTTAACAAGAAACAGGATTAGCAGA
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ATTAATTAAATTTTTTAAAGCCTAAAAAACAACAGGACCTCCAGGAGCTAATTTATTCAT
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AAAAAAAAATTAAAATAAATTTAATTTAAACATTTAATTTTATTTGAACTAGGTTTTGTA
AGTTATACAAGCCCAGATGGTGCTCAACAAGCTATACAGTAAATGAATGGCCTATAAGTT
GGAAGTAAATAAAAATTAAAGTATGAGTTTTAAATTAAATATAATTTACATTAAATAGAG
AAAAAGCTAAAAGTAGAAGTAAAAAAAGGTCAAGGTGATGGAGATTTACCACCTAGTCTT
AGTTAAAATGGATATTAACCCTTTTGA>TTHERM_00421020(protein)
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