Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00011340

Standard Name

SEN2 (putative helicase SEN2)

Aliases

PreTt11740 | 1.m00788

Description

SEN2 AAA domain protein; putative helicase required for processing of tRNAs- rRNAs- and small nuclear RNAs

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Domains

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

Tetrahymena Stock Center

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Homologs

Source Identifier Score
Tetrahymena borealis EI9_02812.1 9.997093137033517e-262
Description: hypothetical protein (1812 aa)
Oxytricha Contig9372.0.1.g13 5.001102406662288e-90
Description: AAA domain
SGD YLR430W 2.9997879492220375e-71
Description: SEN1 Presumed helicase required for RNA polymerase II transcription termination and processing of RNAs; homolog of Senataxin which causes Ataxia-Oculomotor Apraxia 2 and a dominant form of amyotrophic lateral sclerosis
DictyBase DDB_G0285243 4.000989088096131e-71
Description: DDB_G0285243 on chromosome: 4 position 2998910 to 3005650
WormBase WBGene00004880 5.997992534675281e-52
Description: locus:smg-2 Regulator of nonsense transcripts 1 status:Confirmed UniProt:O76512 protein_id:CCD73461.1
Stentor Coeruleus SteCoe_14461 3.3057006267607343e-37
Description: None

General Information

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Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences 

>TTHERM_00011340(coding)
ATGAGTAATTATTTTAACTCTTCTTCTAATGGCTAGAAGAGTTATTAATAGTAGTAGCAG
TAGCGTAGCTTATCATTTTTGTCTTAATAGATAGACTAAAATGATTAGTAAAAAAGAGGA
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GGGTAGGAAAAGGATATTATCATTTTTACAACAGTCCGTGTAAACAGTAAACAAGAATGG
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GCTAAATACTGCTTAATTGTTTTAGGTCACGCAGACACTCTTAATTCCAACCCTGTTTGG
GGAGCCTTTGTAGATTTTATGGCAAAAAATAACAGGTATGGCAAATTTAGAAACAAAGAT
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GTTTATGTGAAAAAAGATTGGGGAGAGCAATATCAAGAGATGATACAAAGACAAAACTAA
GTTAATGAACTGAAATTGACTGATTTTGAGCCTATACAAGTTGATGAAAATAACGACGAA
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AATAACAATAAAGAAGGACCTAATGAATAGATTAAATAAGACGCACCTATTGTTAAGTAA
TCATAAGATTTAATAATTATTTCAGAAACTCTAATAGTGGATAAAAAAAATAGCAATTTA
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ACAGGTATTTCCTTTTAAGAAGCTCTCTCTGTCTAGCAGGAATAAATGCAAATGAATAGC
ATGAAAGGAAATGGCTTAGCTAAATTAAGTGCTTTGATTTCTCAACCTTAAAAGGAGAAG
AAGTAGGAAGAAGAGAAGTCACCAATAATATTTGTTAATAAGCTTGAAGATCTTAAAAAA
GAAGAAGATCCTTAAAATGATTTGCTAAAAAAGATATTTGTGCCACAAGATAAAAGATAA
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TTTAAGCTTTAAAATAAATCAGTTTCATCAAATCTAACTCAATAAAAACCTTCTGCTCCA
GCTTCTATGGTCTAACTTGTGTAAAGTGCTTAAAATTAAGTTAAATAAAAATTATAAAAT
TCTAGTTAAACTAACTTGGGTAAGTCTAGTACTTTTACTCCTTCATCTAGCTTGTAAACT
CTTTAATCATTAACTGATAACCAGTCAAATGATTAAAATTCTAAAAAAGGTTTGGGATCT
CTTCTAGGTGGCAACGATGATAAAGAATAATAAAAATCATTTTATAAACCTCAAAAAAGT
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AATACTATTAAAGAGCAAAATCATGATAGTAAAAGTAGCTCAAATAATTTTACAAATTAT
ATTCGCAAGCCCTACAATCCAGATTCTGATAAAAATTCATACTCTCCATCAAGTTCCTTA
TAAAACATATCTAAGCAATCACTGAGCTATTAAAATAACAATTTAAAGTACGACTAAAAG
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AGTGGCAGTGCTTTATTGTTAAATAGTATAACTAATTCTAAGCAATAAGTACCTTCTACT
TCTTAAAGTAATTCCAAAACTAAGGGTGGATTAGGAAGCTTAATTTCAAAATGA


>TTHERM_00011340(gene)
ATGAGTAATTATTTTAACTCTTCTTCTAATGGCTAGAAGAGTTATTAATAGTAGTAGCAG
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GGTATTAAAGAATTTTAGTATGAGAACAAAGAAGAAGATAAAAGTTAAATCACTAATCAT
TCTTTTAAGAGGTAAGGAGGTGCTTAAATGACTTTGGATTTCTTTTCTGGGGCTTTACCA
AAAAATACTTCCCATCTACAAAATATCATAACATCAAAGTAGAATACATAAAATAGTTAG
AATCATAGTAAAAGTAATTAGAACTATAGCATAATTATTGATGAGTTTGAAAGAAACAAC
AATAGCGATGATAATGATGATATTTCAGAAGTTTAAGATATTGGACCATTTACAAAGAGA
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AAAAACGAGAAAAAACCAGCTATTTCTGATCATTTTAACAAAGGGAGGGTAAGAGGATAA
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GAAAATTCAAAAATACAAAGAGAAAAACAACTTTTGTCTAAAAAAAGATAGTAGATGCAA
GAATTAATTAGATAAAAGTAGCTAGCTGAATTAAAAAAGAAGACTTATTAAGAGTTATGC
ATAAATTAGAAGCCTAAATAATTTATACTACAATCATTAGCAAACGACCTTAGCATACCT
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TTATTTTTTAATTTGTTGATATTAAGATTAAAAGATGGTCCTTCAGTAGCTAATCGTCCT
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GATTCTTTCCAAGGGTAGGAAAAGGATATTATCATTTTTACAACAGTCCGTGTAAACAGT
AAACAAGAATGGAGAGAGAATATGATTGGGTAAATAAATAACTAAATACATTTTTTTTAT
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TGTTGCTTTAACAAGAGCTAAATACTGCTTAATTGTTTTAGGTCACGCAGACACTCTTAA
TTCCAACCCTGTTTGGGGAGCCTTTGTAGATTTTATGGTAATTTAGTGATTTATCAGTAT
TTTTTACACAAAAAAAGTTTATTTATAAATTTAAAATGAAATATTTTTCATTTTTTTATC
AAAAAGGCAAAAAATAACAGGTATGGCAAATTTAGAAACAAAGATTAGATTAGTGATATC
GGTAAAATGGTACTAAAAGGCTCTTTGTTAGAGAGCTCTTCTTCGGTTTATGTGAAAAAA
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GAAAACGAAATTTAGACGGAATAGTAACCAGAAAATAAGCAAGATAATAACAATAAAGAA
GGACCTAATGAATAGATTAAATAAGACGCACCTATTGTTAAGTAATCATAAGATTTAATA
ATTATTTCAGAAACTCTAATAGTGGATAAAAAAAATAGCAATTTATTAGAAATCATATAA
GAACCTGAAGACTTTGATTAATAAAAGCAATAAAAGGCTAAGAGGACAGGTATTTCCTTT
TAAGAAGCTCTCTCTGTCTAGCAGGAATAAATGCAAATGAATAGCATGAAAGGAAATGGC
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AAGTCACCAATAATATTTGTTAATAAGCTTGAAGATCTTAAAAAAGAAGAAGATCCTTAA
AATGATTTGCTAAAAAAGATATTTGTGCCACAAGATAAAAGATAAGAACAAGAACAGAAA
AAGAACTTGACCGGTTAATTAGACATTTATGAATAATTAGGATAGCAAAGAAGAGAAAAC
ATTCAAAAGTTAAAGAAAGAATTTTCTCAATAAGATAAAGATAGTTTTAAGCTTTAAAAT
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TTGTTAAATAGTATAACTAATTCTAAGCAATAAGTACCTTCTACTTCTTAAAGTAATTCC
AAAACTAAGGGTGGATTAGGAAGCTTAATTTCAAAATGA


>TTHERM_00011340(protein)
MSNYFNSSSNGQKSYQQQQQQRSLSFLSQQIDQNDQQKRGIEYYFSKQKNQNNGVDRMLD
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LEIIQEPEDFDQQKQQKAKRTGISFQEALSVQQEQMQMNSMKGNGLAKLSALISQPQKEK
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QNISKQSLSYQNNNLKYDQKQNNQKQDQGAAPSQNKLNYTSGSALLLNSITNSKQQVPST
SQSNSKTKGGLGSLISK