Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_000309879

Standard Name

TPB1 (Tetrahymena PiggyBac transposase 1)

Aliases

None

Description

PiggyBac-like protein; PiggyBac-like protein; involved in DNA cleavage step of programmed DNA deletion; participates in internal elimination sequence incision

Genome Browser (Macronucleus)

Full Screen View


Genome Browser (Micronucleus)

Full Screen View

Gene Ontology Annotations

Cellular Component

Domains

No Data fetched for Domains

Gene Expression Profile

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source Identifier Score
Tetrahymena borealis EI9_11661.1 9.997093137033517e-262
Description: Ku70/Ku80 beta-barrel domain-containing protein (3177 aa)
Oxytricha Contig9679.0.g87 3.000842737734004e-34
Description: Ku C terminal domain like
DictyBase DDB_G0286303 1.999598840915195e-17
Description: ku80 on chromosome: 4 position 4329334 to 4331844
Stentor Coeruleus SteCoe_28760 0.000000000013887943864964021
Description: None
SGD YMR106C 0.0000899730839127287
Description: YKU80 Subunit of the telomeric Ku complex (Yku70p-Yku80p), involved in telomere length maintenance, structure and telomere position effect; relocates to sites of double-strand cleavage to promote nonhomologous end joining during DSB repair

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:28087716: Cheng CY, Young JM, Lin CG, Chao JL, Malik HS, Yao MC (2016) The piggyBac transposon-derived genes TPB1 and TPB6 mediate essential transposon-like excision during the developmental rearrangement of key genes in Tetrahymena thermophila. Genes & development 30(24):2724-2736
  2. Ref:20357003: Cheng CY, Vogt A, Mochizuki K, Yao MC (2010) A domesticated piggyBac transposase plays key roles in heterochromatin dynamics and DNA cleavage during programmed DNA deletion in Tetrahymena thermophila. Molecular biology of the cell 21(10):1753-62

Sequences 

>TTHERM_000309879(coding)
ATGAAAAATTTAAGAGAAGATTCAGTAACAGATTGGAAGGATAATTAAAATATAGAATTT
CTTATTAAATTGAAGAACCAAATTTCGAAAAAAAATATTCAATTTCTAACATCAGAAGAA
GCTTTATAGATATCACTCAGGATAAAACCTAAGCAGATTCTCTAGAGACCTAAATATAAT
GGCACATTTTAAATCAGAAATGAATTAACTGCTGATGTAGTAGTTTTTACTAAAACATTG
GAAAAGCATTTATTAAATTTGAAGACCTATTCCAATATAACAGAATGGAATCCAAGTACT
TAAAGATAAATGGTTGAATAATAAATATAATATTATTAGGTAGATGATATATTACTTGAA
AATCCTGTGTAGGACATATCTAAATACTATAAATATGGAAATTAACTTGTTAAAATGAGT
GAATTATTTTTGAATTAAATAAATCTCTTTACACTAAAGGAAATTAAGTTAATTGGATCA
GTTTAAAAGTCGTCGATACCAAGATAATCATTTATGTCTGGCTGTGATATTTTATTTGCT
AAGCAAGATTCAAAACGATCTAGATATATAATTGCAAGTTTAATAAAAGCATGCTTTGAA
GAATAAAGGTATCTTGTAGCTAGATTTGTTCTAAGGTAGAACAGCATTCCAAAGCTAGTA
GTTTTGATTCCACATCTTAAAAAAAACTGTGAGTATTTTTATATCATAGAATTGCCAACT
GTAGAATCTATTAGAGATTATTCCTTTAACAGTCTAATAAGATCTACTCCAGAACAATAA
AAACTTATGAGCTAATTGATAGACGAATTAGATTTAGATTAGGATGAAAAAAACTAAAAT
TAATTTAAGATCGGATCACAACCAAATGAGACCATTGCTAAAATTAATGATCTAATATTG
ATGAGAGGAATGAATGTGAATGAAGAAGAAATTAATAAAAAGTTATTTACAAAAGAATAT
TAACAAACATTTAAATCAGCTAGTTAAAAACTTCTGAGTAATATTAATGAATAATTTAAT
TTAAAAATCATTAATTAGTAATTGTATCATGATAGTTTTAACTAAAAGATTTATTGGAAA
AATTTAATAAGTTAAAAAGATGATAAATTATTTAATGATTTAAAAGATATATTTGGCTCA
ATCGAAAAATAGAATTATAAAGATTTAACAAAAAAAGCATATTAATAAATTGATTTTAGT
ATGCCATAGTCAAAAATTATTTCAATTCTATCTTAACCTCTATTTGATATTAGAGAATTT
TAAGAATATATTCAAATTGTGTAAAATTTAATATACAAAACTATGGATACATTTATAAAA
GGATATACTAGTAATATTATTATTGAACTAATTCTTTTAATCAGAAATAAATCTATCTAG
TTTGAATAATATGAGGCATTTAATTAGTTTTTACTCAAATTTTATGAGAAGTTTCAAAAT
GATTAATTTATTTCAGAGATTGTTAGTAGTGAGATAAACTTAATTTCAACAGAAAACCAT
TAAAATTCAGTCATATTGACTTAAATCGAAGAGGAATTTTTAAGATAAAATCTCTTATAA
AAGGAAATGTCATCACTCAGAGTATCAAGTAAAAATTAAGAGAATATATGCCAAAATTAA
ACTTCTAAGATGAAAAAAATTTTAGTGAATAGCTTAAAAAATAATCAAAATAATGATGAA
GAGATATATTATTCTGATGAATCAGAAACAAATCAAGCAAGAAGGCAAAAAGAAAATGAT
AATTCTCTTCCATAGGATAATCATGAAAATTAATAAAATTTTAATACTTAATAATAAAAG
AAATAAAATAAATAATTAGTTTCATTCACTTAATTAAGCAGCTATAATTCAATTTATTCA
GAATCTGAGACTTCTTAGCATGAAGATTAAATCATTTAAAATAATTAAGATCTAAATTCT
TCTATTGAAGAATCAGGAGAAGAAGAATAAAAATAAGACTTAAAAAGAAACAAAGGAAAT
TTTTCCAAAAAGCTTAATTTAAATGATGTTAATTTTAAACTATGCTCAGATAATAAACTT
TTAAAAGAAACTCTCATAAATATCGACCTCACATATAGAAAACCTTAAGTAAAAAATATA
CCTTTAGAGTCAACTCCAGTTTAAATTTTTCAAAAATTGTGGTCTGATGAAATTTGGAAA
TTAATTACAGATGAGACAAATAAATATTCTAAACAAAGCTTTGATTTAAATTAATACAAT
TTAGACAGTTAAAGTCTAAAAAAATAAAAAATTTGCTTTTTTAGTTAAGACTAAATAAAA
AGATTTATAATTTGTGAGATTCTAATGGGAATATAAAGACTTCCCAGCTTTAGTGACTAT
TTTAGTTCAGACCCATTATTGTCTGGAGGTTTGAACAGGATTTTAGGAAGAGAAAATTAT
TAACTGCTGACTAGATATTTGCATATTTCTGATAATTAAAGTAGAATGGTTCATGTAGAT
GATCATACAAAATTTAAATAGTTTTAATCGATTTTAAATCGAAACTATTAATAATTTTAT
GTTCCTTCAAACTATCTTGCAATAGATGAGGGCATTATACCATTTAAAGGAAAAACAAAA
TTTAAAGTGTATTGTCCCTAAAAGCCTGTTAAATTTGGAATTAAAGAGTATTTATTTTGT
GATTACAGTGGTTACACTCTCAACTTAATAATTCATTCACCTCATGAAAAATAAAATATC
AGAGACATTTATCAACCCTAAACTCTTTAAACTCAAGACATTGTAAATGAGTTGATCAAA
GACTATTAGCCACTTTCTGGAAGTATTTTAATCATGGATAATTATTATAATTCATTAAAT
TTAATACATGATCTTAACTAACAAAATATCGGAGTCCTAGGAACTGTTAGGCCGGATAGA
ATGAATTTTACTGAAGAATAAAAAAAAATGATGAAAATTTAAAATTTTAACAAAGGAGAG
ACAAAATCTTTAACTAAGGATAACATTCATATATTCCTTTGGAGAGATAAAGATAAGCTT
GTTAAAATGATTACTAACTTTTTAGATAATAGAAAAATTGTGAAAAGTATGAAAAAAACA
GGCTAAATTAAGACTATTCCTTTAATGGTTGATATTTACAATAAATATGCCCACTCGGTA
GACAAGAGAAACTAAATATGCTAAAATTATAGAATACACAAAAGATCCTAAAAGTGGTGG
AAATGTGTTTTTTATCGTTTATTAGATACAACACTTTGCAATGCTTACATAATTTATAAG
ATATTAAATGAAGGAAAAAAGAGCCTCTTAACACATAAAGACTTTAGAATTAAAATAGTA
GAAGAGTTAATTCAAAGTTTAAATGAATCAACAGCTCAACTCACTAAATCTTTATCCCAT
AATAGAGGTATTATCTACTCTCTAATCGATATAAATAAAGTTAGAAAGTAAGGTGTACAA
CAAGAAATTATAGCTCATTTTCTAGAAAGGTAAAACTAAGTCGGATTATGCTCACTTTGC
AAACAAGCTACTTTTTTTACCTGTGAATCATGTAATTACGGTAATAAAAAGATTGCCTTA
TGCCCTGTGAATTGTCATAAAGAACATATGAAAAAAGTTTATAATCTTATAGATAAGTGA


>TTHERM_000309879(gene)
ATGAAAAATTTAAGAGAAGATTCAGTAACAGATTGGAAGGATAATTAAAATATAGAATTT
CTTATTAAATTGAAGAACCAAATTTCGAAAAAAAATATTCAATTTCTAACATCAGAAGAA
GCTTTATAGATATCACTCAGGATAAAACCTAAGCAGATTCTCTAGAGACCTAAATATAAT
GGCACATTTTAAATCAGAAATGAATTAACTGCTGATGTAGTAGTTTTTACTAAAACATTG
GAAAAGCATTTATTAAATTTGAAGACCTATTCCAATATAACAGAATGGAATCCAAGTACT
TAAAGATAAATGGTTGAATAATAAATATAATATTATTAGGTAGATGATATATTACTTGAA
AATCCTGTGTAGGACATATCTAAATACTATAAATATGGTACATTATATATATTGTTGGTA
AATTAATTGTAGTTTAAAACAATTTTTATTATTTAGGAAATTAACTTGTTAAAATGAGTG
AATTATTTTTGAATTAAATAAATCTCTTTACACTAAAGGAAATTAAGTTAATTGGATCAG
TTTAAAAGTCGTCGATACCAAGATAATCATTTATGTCTGGCTGTGATATTTTATTTGCTA
AGCAAGATTCAAAACGATCTAGATATATAATTGCAAGTTTAATAAAAGCATGCTTTGAAG
AATAAAGGTATCTTGTAGCTAGATTTGTTCTAAGGTAGAACAGCATTCCAAAGCTAGTAG
TTTTGATTCCACATCTTAAAAAAAACTGTGAGTATTTTTATATCATAGAATTGCCAACTG
TAGAATCTATTAGAGATTATTCCTTTAACAGTCTAATAAGATCTACTCCAGAACAATAAA
AACTTATGAGCTAATTGATAGACGAATTAGATTTAGATTAGGATGAAAAAAACTAAAATT
AATTTAAGATCGGATCACAACCAAATGAGACCATTGCTAAAATTAATGATCTAATATTGA
TGAGGTTATTATTATCATTATTAATTAATTTAAATTATTTAAAAATTTTTATTTAAATTG
GCTTTAACAAAATTTATTATTTTGAAATTAATTTTGAACAATAAATCATGAATATGATAT
TAAATAATCTATTATTAAATTTTCTATTCAATTTTAATAACACTAAAATTTAGTTTAATA
AGTTTATGCTTTGATAATTAGTTAAATATAAAAATCTTAATTTTGAAATAAGAAGAAATA
TGAGTGATAATTAATTAAATAAAACTTGAATGAATATTCTTTTTTAAATGTTAAAATTTT
AAGTTTAATTTAAATAAATTTAAAATTTACTTATTTTATTTTTATAATTAAAGAGGAATG
AATGTGAATGAAGAAGAAATTAATAAAAAGTTATTTACAAAAGAATATTAACAAACATTT
AAATCAGCTAGTTAAAAACTTCTGAGTAATATTAATGAATAATTTAATTTAAAAATCATT
AATTAGTAATTGTATCATGATAGTTTTAACTAAAAGATTTATTGGAAAAATTTAATAAGT
TAAAAAGATGATAAATTATTTAATGATTTAAAAGATATATTTGGCTCAATCGAAAAATAG
AATTATAAAGATTTAACAAAAAAAGCATATTAATAAATTGATTTTAGTATGCCATAGTCA
AAAATTATTTCAATTCTATCTTAACCTCTATTTGATATTAGAGAATTTTAAGAATATATT
CAAATTGTGTAAAATTTAATATACAAAACTATGGATACATTTATAAAAGGATATACTAGT
AATATTATTATTGAACTAATTCTTTTAATCAGAAATAAATCTATCTAGTTTGAATAATAT
GAGGTAATCTATTATTTTAAATTTGATCAAATTACTTTAAAAATTAATTAAAATAAATTA
TATTTTAAAATTAAATTAAAAATAATCAATTTTATTGATTTTAAATTACTCTTAATTTGT
TTAAATCTAGTTTAATAAAGTAATAGAATCATTACAAAATTTATTTAAAATAAATCATAA
TATTTTAATCATATAAATAGGCATTTAATTAGTTTTTACTCAAATTTTATGAGAAGTTTC
AAAATGATTAATTTATTTCAGAGATTGTTAGTAGTGAGATAAACTTAATTTCAACAGAAA
ACCATTAAAATTCAGTCATATTGACTTAAATCGAAGAGGAATTTTTAAGATAAAATCTCT
TATAAAAGGAAATGTCATCACTCAGAGTATCAAGTAAAAATTAAGAGAATATATGCCAAA
ATTAAACTTCTAAGATGAAAAAAATTTTAGTGAATAGCTTAAAAAATAATCAAAATAATG
ATGAAGAGATATATTATTCTGATGAATCAGAAACAAATCAAGCAAGAAGGCAAAAAGAAA
ATGATAATTCTCTTCCATAGGATAATCATGAAAATTAATAAAATTTTAATACTTAATAAT
AAAAGAAATAAAATAAATAATTAGTTTCATTCACTTAATTAAGCAGCTATAATTCAATTT
ATTCAGAATCTGAGACTTCTTAGCATGAAGATTAAATCATTTAAAATAATTAAGATCTAA
ATTCTTCTATTGAAGAATCAGGAGAAGAAGAATAAAAATAAGACTTAAAAAGAAACAAAG
GAAATTTTTCCAAAAAGCTTAATTTAAATGATGTTAATTTTAAACTATGCTCAGATAATA
AACTTTTAAAAGAAACTCTCATAAATATCGACCTCACATATAGAAAACCTTAAGTATTCA
TTAAATGATTTATATAAATTTAAATAATAATTTTATCTTAAAAAATAGGTAAAAAATATA
CCTTTAGAGTCAACTCCAGTTTAAATTTTTCAAAAATTGTGGTCTGATGAAATTTGGAAA
TTAATTACAGATGAGACAAATAAATATTCTAAACAAAGCTTTGATTTAAATTAATACAAT
TTAGACAGTTAAAGTCTAAAAAAATAAAAAATTTGCTTTTTTAGTTAAGACTAAATAAAA
AGATTTATAATTTGTGAGATTCTAATGGGAATATAAAGACTTCCCAGCTTTAGTGACTAT
TTTAGTTCAGACCCATTATTGTCTGGAGGTTTGAACAGGATTTTAGGAAGAGAAAATTAT
TAACTGCTGACTAGATATTTGCATATTTCTGATAATTAAAGTAGAATGGTTCATGTAGAT
GATCATACAAAATTTAAATAGTTTTAATCGATTTTAAATCGAAACTATTAATAATTTTAT
GTTCCTTCAAACTATCTTGCAATAGATGAGGGCATTATACCATTTAAAGGTAATTTATAT
ATTCTTAAATTTTAAAGTCTAAACAATTTCATAAAAAAAGGAAAAACAAAATTTAAAGTG
TATTGTCCCTAAAAGCCTGTTAAATTTGGAATTAAAGAGTATTTATTTTGTGATTACAGT
GGTTACACTCTCAACTTAATAATTCATTCACCTCATGAAAAATAAAATATCAGAGACATT
TATCAACCCTAAACTCTTTAAACTCAAGACATTGTAAATGAGTTGATCAAAGACTATTAG
CCACTTTCTGGAAGTATTTTAATCATGGATAATTATTATAATTCATTAAATTTAATACAT
GATCTTAACTAACAAAATATCGGAGTCCTAGGAACTGTTAGGTAAAATATTTAATTTTTA
TATTATAAATTTAATTCAATAATTAAAATTAACAAATAAATAAATATTTTTTTAGCATAT
AATAATTTTTTGAATTCTATTTTTTCAAAAAAAATAAAATACAACAAAAGGTCAAATGAA
TTTTAAATACTAAACTAAAATTTTTTCAAAAACACTTTTTATTTACAACAAAAATTGATT
TTTTATCTTATTCATAATAAATAATTAAATTAAAGTATCTTTTAGGAAAAAAAGAAGTTT
AAACAAAGAAAAATATTTAAAATACAGACTGGATAATTTCATTTAATTTTATTTTAATGA
TTAAAACTTACAATTTAACTAAGTTAATTTTTACTGAGAAATATTTACTTTTGATTAAAA
ATTAAGAAAAATTAAAATTTATTTTAATTATTTTTTAAATTGAATTTATTCTTTAAAAAT
ATTACTAAAAATTCCTTAAAATTTTTAACTTAAAATGAAATAAAAAAATAAATTCACTTT
GATTTTATATTTATTTAACGACAAATTTAAAATTTAAAAATAAAATAATTTATTTAAAAA
GGCCGGATAGAATGAATTTTACTGAAGAATAAAAAAAAATGATGAAAATTTAAAATTTTA
ACAAAGGAGAGACAAAATCTTTAACTAAGGATAACATTCATATATTCCTTTGGAGAGATA
AAGATAAGCTTGTTAAAATGATTACTAACTTTTTAGATAATAGAAAAATTGTGAAAAGTA
TGAAAAAAACAGGCTAAATTAAGACTATTCCTTTAATGGTAAATAATAAAGTTTTAAATT
ACCATTTAAATACTAAAATATATTAATTAGGTTGATATTTACAATAAATATGCCCACTCG
GTAGACAAGAGAAACTAAATATGCTAAAATTATAGAATACACAAAAGATCCTAAAAGTGG
TGGAAATGTGTTTTTTATCGTTTATTAGATACAACACTTTGCAATGCTTACATAATTTAT
AAGATATTAAATGAAGGAAAAAAGAGCCTCTTAACACATAAAGACTTTAGAATTAAAATA
GTAGAAGAGTTAATTCAAAGTTTAAATGAATCAACAGCTCAACTCACTAAATCTTTATCC
CATAATAGAGGTATTATCTACTCTCTAATCGATATAAATAAAGTTAGAAAGTAAGGTGTA
CAACAAGAAATTATAGCTCATTTTCTAGAAAGGTAAAACTAAGTCGGATTATGCTCACTT
TGCAAACAAGCTACTTTTTTTACCTGTGAATCATGTAATTACGGTAATAAAAAGATTGCC
TTATGCCCTGTGAATTGTCATAAAGAACATATGAAAAAAGTTTATAATCTTATAGATAAG
TGA


>TTHERM_000309879(protein)
MKNLREDSVTDWKDNQNIEFLIKLKNQISKKNIQFLTSEEALQISLRIKPKQILQRPKYN
GTFQIRNELTADVVVFTKTLEKHLLNLKTYSNITEWNPSTQRQMVEQQIQYYQVDDILLE
NPVQDISKYYKYGNQLVKMSELFLNQINLFTLKEIKLIGSVQKSSIPRQSFMSGCDILFA
KQDSKRSRYIIASLIKACFEEQRYLVARFVLRQNSIPKLVVLIPHLKKNCEYFYIIELPT
VESIRDYSFNSLIRSTPEQQKLMSQLIDELDLDQDEKNQNQFKIGSQPNETIAKINDLIL
MRGMNVNEEEINKKLFTKEYQQTFKSASQKLLSNINEQFNLKIINQQLYHDSFNQKIYWK
NLISQKDDKLFNDLKDIFGSIEKQNYKDLTKKAYQQIDFSMPQSKIISILSQPLFDIREF
QEYIQIVQNLIYKTMDTFIKGYTSNIIIELILLIRNKSIQFEQYEAFNQFLLKFYEKFQN
DQFISEIVSSEINLISTENHQNSVILTQIEEEFLRQNLLQKEMSSLRVSSKNQENICQNQ
TSKMKKILVNSLKNNQNNDEEIYYSDESETNQARRQKENDNSLPQDNHENQQNFNTQQQK
KQNKQLVSFTQLSSYNSIYSESETSQHEDQIIQNNQDLNSSIEESGEEEQKQDLKRNKGN
FSKKLNLNDVNFKLCSDNKLLKETLINIDLTYRKPQVKNIPLESTPVQIFQKLWSDEIWK
LITDETNKYSKQSFDLNQYNLDSQSLKKQKICFFSQDQIKRFIICEILMGIQRLPSFSDY
FSSDPLLSGGLNRILGRENYQLLTRYLHISDNQSRMVHVDDHTKFKQFQSILNRNYQQFY
VPSNYLAIDEGIIPFKGKTKFKVYCPQKPVKFGIKEYLFCDYSGYTLNLIIHSPHEKQNI
RDIYQPQTLQTQDIVNELIKDYQPLSGSILIMDNYYNSLNLIHDLNQQNIGVLGTVRPDR
MNFTEEQKKMMKIQNFNKGETKSLTKDNIHIFLWRDKDKLVKMITNFLDNRKIVKSMKKT
GQIKTIPLMVDIYNKYAHSVDKRNQICQNYRIHKRSQKWWKCVFYRLLDTTLCNAYIIYK
ILNEGKKSLLTHKDFRIKIVEELIQSLNESTAQLTKSLSHNRGIIYSLIDINKVRKQGVQ
QEIIAHFLERQNQVGLCSLCKQATFFTCESCNYGNKKIALCPVNCHKEHMKKVYNLIDK