Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00077230

Standard Name

RPB2 (RNA Polymerase B )

Aliases

PreTt10069 | 5.m00420 | 3828.m01330

Description

RPB2 DNA-directed RNA polymerase II protein; RNA polymerase II subunit 2

Genome Browser (Macronucleus)



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External Links

Gene Ontology Annotations

Cellular Component

Molecular Function

Biological Process

Domains

  • ( PF00562 ) DNA-directed RNA polymerase, beta subunit
  • ( PF04560 ) RNA polymerase Rpb2, domain 7
  • ( PF04561 ) RNA polymerase Rpb2, domain 2
  • ( PF04563 ) DNA-directed RNA polymerase, beta subunit
  • ( PF04565 ) RNA polymerase Rpb2, domain 3
  • ( PF04566 ) RNA polymerase Rpb2, domain 4
  • ( PF04567 ) RNA polymerase Rpb2, domain 5
  • ( PF06828 ) Fukutin-related
  • ( TIGR02013 ) DNA-directed RNA polymerase, beta subunit

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source Identifier Score
Stentor Coeruleus SteCoe_22675 0
Description: None
WormBase WBGene00016140 9.997093137033517e-262
Description: locus:rpb-2 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 status:Confirmed UniProt:Q10578 protein_id:CCD65728.1
Tetrahymena borealis EI9_07105.1 9.997093137033517e-262
Description: DNA-directed RNA polymerase, beta subunit protein (1236 aa)
DictyBase DDB_G0288257 9.997093137033517e-262
Description: rpb2 on chromosome: 5 position 1296275 to 1300079
Oxytricha Contig1141.1.g1 9.997093137033517e-262
Description: RNA polymerase Rpb2, domain 6
SGD YOR151C 9.997093137033517e-262
Description: RPB2 RNA polymerase II second largest subunit B150, part of central core; similar to bacterial beta subunit

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:8982086: Guerreiro P, Rodrigues-Pousada C (1996) Characterization of a polyubiquitin gene in T. thermophila and of ubiquitin gene expression during sexual reproduction and under stress conditions. Gene 182(1-2):183-8

Sequences

>TTHERM_00077230(coding)
ATGGACGAGGAAGAATCATTTTTCGAAGGTGAAAACAGCGCACCTGTTTATGATGATGAA
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AAGCAACTTATTCAAGAACTTATGGCTATGCATATTGTTCCAAGAATTAAAGTTGATGTC
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>TTHERM_00077230(gene)
ATGGACGAGGAAGAATCATTTTTCGAAGGTGAAAACAGCGCACCTGTTTATGATGATGAA
TTAAATGAAAATATAGATTAAGATGACTGTTGGAAAATTATTGATGAATATTTCAAGGAT
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TGTAGCTATTGCTTGCTTTACTGGTTACAACCAAGAAGATAGTATTATCATTAATTAGAG
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ACTATTAGAGGTGAAGATTTGCCATACAACATTGAAGGTATCATTGCTGAATTGGTTATT
AATCCACATTGTATTCCCTCTCGTATGACTATTGGTCATATGATTGAAGGTCTTAATTCA
AAGCTATCTTCTTTAAAGGGTATTTGGGGTGATGCTACTCCATTCTCTGGCATTAAATTA
CAAGATATTGCCTCCGAACTTCACACTTATGGATATCAAAGATATGGTAATGAAGTCTTG
TACAATCCTTACACAGGTATGAGACTCTCTACTTAAATTTATTATGGTCCTACTTTCTAT
CAACGTCTTAGACATTTAGTCGATGATAAAATGTATTCTCGTTCTAGAGGTCCAGTTGTA
GCAATTGTCAGACAACCTACTCACGGTCGTTCCAGAGGTGGTGGTTTACGTTTTGGTGAA
ATGGAAAGAGATTGTATCATTGCTCACGGTAAATTTATCTCATAATTCTATTTAAATCTT
GTTTTTATTAAATGATATTATTTAAAATTTACTAGGTACCAGTAATTTCTTAAAAGAAAG
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TAAAGCAGATGTTACAAATCACAAGTATGACTGTACTGGCTGCTCTTAAGGTGATAAGAA
GCACTACAAAATCGTCCAAGTGTATCTCCCATATGCAGCTAAGCAACTTATTCAAGAACT
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A


>TTHERM_00077230(protein)
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