Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00077230

Standard Name

RPB2 (RNA Polymerase B )

Aliases

PreTt10069 | 5.m00420 | 3828.m01330

Description

RPB2 DNA-directed RNA polymerase II protein; RNA polymerase II subunit 2

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Gene Ontology Annotations

Molecular Function

• tryptophanase activity (ISS) | GO:0009034 | Ref:8982086

Biological Process

• defense response to fungus, incompatible interaction (IEA) | GO:0009817
• fruit ripening, non-climacteric (ISS) | GO:0009837 | Ref:8982086
• glucosylceramide biosynthetic process (IEA) | GO:0006679
• negative regulation of protein kinase activity (IEA) | GO:0006469

Domains

• ( PF00562 ) DNA-directed RNA polymerase, beta subunit
• ( PF04560 ) RNA polymerase Rpb2, domain 7
• ( PF04561 ) RNA polymerase Rpb2, domain 2
• ( PF04563 ) DNA-directed RNA polymerase, beta subunit
• ( PF04565 ) RNA polymerase Rpb2, domain 3
• ( PF04566 ) RNA polymerase Rpb2, domain 4
• ( PF04567 ) RNA polymerase Rpb2, domain 5
• ( PF06828 ) Fukutin-related
• ( TIGR02013 ) DNA-directed RNA polymerase, beta subunit

Gene Expression Profile

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source	Identifier	Score
Stentor Coeruleus	SteCoe_22675	0
	Description: None
WormBase	WBGene00016140	9.997093137033517e-262
	Description: locus:rpb-2 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 status:Confirmed UniProt:Q10578 protein_id:CCD65728.1
Tetrahymena borealis	EI9_07105.1	9.997093137033517e-262
	Description: DNA-directed RNA polymerase, beta subunit protein (1236 aa)
DictyBase	DDB_G0288257	9.997093137033517e-262
	Description: rpb2 on chromosome: 5 position 1296275 to 1300079
Oxytricha	Contig1141.1.g1	9.997093137033517e-262
	Description: RNA polymerase Rpb2, domain 6
SGD	YOR151C	9.997093137033517e-262
	Description: RPB2 RNA polymerase II second largest subunit B150, part of central core; similar to bacterial beta subunit

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

1. Ref:8982086: Guerreiro P, Rodrigues-Pousada C (1996) Characterization of a polyubiquitin gene in T. thermophila and of ubiquitin gene expression during sexual reproduction and under stress conditions. Gene 182(1-2):183-8

Sequences

>TTHERM_00077230(coding)
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>TTHERM_00077230(gene)
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TACAATCCTTACACAGGTATGAGACTCTCTACTTAAATTTATTATGGTCCTACTTTCTAT
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GCAATTGTCAGACAACCTACTCACGGTCGTTCCAGAGGTGGTGGTTTACGTTTTGGTGAA
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TAAAGCAGATGTTACAAATCACAAGTATGACTGTACTGGCTGCTCTTAAGGTGATAAGAA
GCACTACAAAATCGTCCAAGTGTATCTCCCATATGCAGCTAAGCAACTTATTCAAGAACT
TATGGCTATGCATATTGTTCCAAGAATTAAAGTTGATGTCACTAGTAAAAAGTATGTTTG
A

>TTHERM_00077230(protein)
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VKVKLRSNRIPQIGDKFASRHGQKGTCGMTIRGEDLPYNIEGIIAELVINPHCIPSRMTI
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KQLIQELMAMHIVPRIKVDVTSKKYV