Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00157890

Standard Name

LRC1 (Fusion of a protein phosphatase and ER-golgi vesicle tethering protein.)

Aliases

PreTt28379 | 13.m00338 | 3829.m01190

Description

LRC1 hypothetical protein; Fusion of a protein phosphatase and ER-golgi vesicle tethering protein.

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External Links

Gene Ontology Annotations

No Data fetched for Gene Ontology Annotations

Domains

  • ( PF00038 ) Intermediate filament protein
  • ( PF00560 ) Leucine Rich Repeat
  • ( PF00904 ) Involucrin repeat
  • ( PF01576 ) Myosin tail
  • ( PF02197 ) Regulatory subunit of type II
  • ( PF02370 ) M protein repeat
  • ( PF02524 ) KID repeat
  • ( PF07725 ) Leucine Rich Repeat
  • ( PF08385 ) Dynein heavy chain, N-terminal region
  • ( PF08946 ) Osmosensory transporter coiled coil
  • ( TIGR00162 ) conserved hypothetical protein TIGR00162
  • ( TIGR00293 ) prefoldin, alpha subunit
  • ( TIGR01442 ) small, acid-soluble spore protein, gamma-type
  • ( TIGR01612 ) rhoptry protein

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source Identifier Score
Tetrahymena borealis EI9_05255.1 9.997093137033517e-262
Description: hypothetical protein (1719 aa)
Stentor Coeruleus SteCoe_36285 0.000000000000001713908431542013
Description: None
Oxytricha Contig1132.0.g11 0.000000000010004361180063202
Description: Leucine Rich repeats (2 copies)
SGD YKL193C 0.00000009004106436083642
Description: SDS22 Conserved nuclear regulatory subunit of Glc7p type 1 protein serine-threonine phosphatase (PP1), functions positively with Glc7p to promote dephosphorylation of nuclear substrates required for chromosome transmission during mitosis

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences 

>TTHERM_00157890(coding)
ATGAAAACTTTGAGCAGAAACAATAGTGAAAAAAGAAAAAGAGACTCTGAAAGCGATTAA
AAGGCAGGAGTCATTAGGATAAATGAGGCTCTCATTAAATAAGTTACAAATCAAAGTGAT
TTCTCATAGATCAAAGCACTTAATTTTCATATTAGATTGAATAATAATTCAAAAATATAA
AGACTAGAAGGATTGGATGATCTAGTTAATTTATAAGAGCTTAACCTTAGTTATAATAGC
ATTTAAAAAATTGAGAATTTGGCTCGTTTGCAAAATCTGAGAGAACTCAATTTAGCGGAA
AATAATATATCAAGATTAGAAGGCCTAGAGATGCTTAAGAATATAGAAAATATAAATCTT
AATGGAAATAGTATAGTTGAGTTACCAATAGATATCCTAAAAAATTTATAAAGGTTAAGA
GTGTTAAAGTTGACAAGAAATAAAGTTAAAGAGTTAGGATAGGTTTAAAATTTAAGTGTG
TTGAGTAGTCTCGAAAGTCTTTCCATAAGCGAAAATCCATTCTGTAAATCTATAACATAT
CAAGAATTTTGCATTTATGCCATGACTAGCTTGAAGGTTTTAGATTCTAAAAAAATAGAT
GAAGACTAAAGGAAGAATGCTTTGTTTTTATTCTCTAGCGGCTTGTAGAATAAATAGGGA
AAGAATTAAGGAAATAATCCTTAAAGTAGTGCTCGTGATGATGTAAGCATGATAAAAAAG
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GAAGAGAGAGATTAGTTAAATTAGTAAATTGAGGGCTTAAATGAAAGATTTTAGATTAAA
TTAAGGGAAAATTCTGCTTTTAGTGAAAAAATTGCTAAATTAGAGGCAGAGCTTTAAAAT
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TTAATGGATATTTAGAATACTTAAAATTTAGTAGAATTTGACAATTAATATTTCAATAAG
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AATTTAGAAGCCTAGTGTGAAAGGTTAAAAGAAAGAATCATAGAAAGAGAAAAAGAAATG
AACTAAGCAGCTGAATCTTACTTTCAGATGAAGAATCAAATTAGAATGAATAGCAATGTT
AAGTTTATGAAAGACTCATTCATGCCTGACTCAGATGACTTAGAAATCCTTATCAAATAA
AAGGAAGCAAAACTTGCCTTTCATTACAATGAAAATGAAAAGCTAAGATTTGCTAATAGT
GAACTTTAGAGAGAAATTGATTTGACAAGGGAAAAAATAGATAAGACTAGAATTTTGATT
AATAAATTAGATGCTATTAATGATGGAGAAAGTACTTCTAGTGAGGTTGAGGATGAGAGA
GTTCTTTTAGATAAGAAAATAAATTCTCTTTATCAAAAATTAACTTCTTAGTAAGAAAAG
AATAATGAAATAATTCATTTAATTACATCTATTAATAATGAAGTTAATTTTTTAAGCTCT
GAGATTGAGGATTTAAAAAAGTAAAGGTAAGAGAGCTACTTAAAACCTTAGAAGACAGTA
AAAACAAACGAATCTGAAAGTGTTGGATTAGATAATGAAAAACTTAAGGAACTAAGCAAT
AACATAACGTTTTTCTAAAATGAAATTAATTTAATGAAGGAAAAATTAGAAGATAATTAA
AAAGTCTTAAAAGAATTTCATATTTTACTGTAAAAAAATTAATCTGAAATTGATATTTTG
GAATCACAGAAATAATAAATTTAAAATAACTTTAAAGCAAGCACATTTGTCAATAATTTA
AGCAACAGTTTCAAAAAGACTGTTTAAAACTAGTTAAATAATGCTGCTAATAACCTTTAA
AATATTGTTCACGTGCTTAAGACTAAGGCTCCAAAGGTTTTAAATAAAAAATTATCTATT
ATTAATAAAATAGAGTAATAAGTTAACTCAGTTGCTGCTGACCCTTAGATTGACAATTTT
TCTTAGTGCTTAGCTGACTTGAGTGGTGCTATAAGGTTTATCTTTGAGGAAATGGATGAC
TATAAAATTGAACAAGGCGTTATTTTTGATGAGTAAACAAACTAAAAGCGCAAAGAATTT
TATCACTTACAACAATAAATTGATGATTACCAATAAGATAAGTAAAGGTGCTTTGATCAA
ATCAACACTTTATATAAAGAATATATTTATGATCAAGTTAATAACGCTGCTAAAAAGAAA
AAATACAAATCAGGATAAGATGAGTATAATTTTCCAGAGAAATTTGAAAGCTTTGAAGAC
ATGCAATAAGTCTTTAAAATTATTTAAAAACTAATGAAAAATGTAGAAAAAAACGAGTTA
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ATAAATAAAGAAAGAGAATAGCTATATTAGTAATTAGAACAAGAATATGAGAAGGTCAAA
TCAGAGAGAGAAGCTATCAAAAATGATCGTTAAAGATTTTATGAAGAGTAAGAAAATTAC
TTTTTAAGTCAACAAAAAAATAAAGAAAAAGAGGAAAACGATAAATTTACTGTTATCAAA
GATGTTGAAGATTAAAGATAGCTTAAATAGAATTTAGAAATGGAAATTTATTAACTTAAA
TCTCATTTAACTCGTCTTTAGAGTGCTTCTGATGAAACAGAAGCTAAAAGAAGTGTAGCA
GAGAAAGATCTTTAAAGAATACTTCAGTAAATTTAAAAGGAGACAGAGAAAGTTTTAAGC
TAGAATGAGTCTAAAGAAAAGTAGCACAAAATACAGCATGTCTTTGAAGAAAGCATAAAC
AAACTTAACTAAGAAAATGAAAGACTTTAAAATATTAATTAATAACTATAAGCTTAAAAG
CAAGAATTGCAATCAGAAGTTTAAAAATTTGAAGTCGATATGAAAATAATAATCTAAAAG
TTTGAGGGAGAGGAAACAATTTACAAACAAAAGCTGAAAGAACTTGAAAGCAGCATTCAA
GAAAAAAGAAAAATTTTATATTCTATAGAGTAAACTTTAAATGACAAGGAGATAAATATT
AACAGAGTTGATAGCCTTTTAGAGGAATATGAAAATACAAAAGAAAAATACAAACAAATT
AAAATGGAAAGCTTGAATTTAGAAAAATAAATTGAAGAAGGTAAAATAAAACTAGACGAA
AATGAAATGAAAATTAAAATGCAGTAAAATTAACTAACTTCCCTAAAAAAGCATCTTGAG
AGTCTTAGTTCTTTGTCTAAGCAGAAGCAGCAAGAAGTTATTTCATTAGAAAAGCAATAC
AGTGACATTTAGTAGCAATTGCTTGATGCTGAGCTTAAAATCTAAAAACTTGATGGATAA
TAATAATATTATATAGAAGAGATGAATAAAATTGAAAAATCAAGAACAGAAAAGAGAAAA
GATTTGCAAATCTTAGAAAAGCAGGTGCATGATAAAGACCTAGAACTTTAAAGTATTAGT
TTGAAGCTTGAGCATGTTAAATAAGAATATGAAGTAAAGCAAAAAGAACTTCAGGAAATT
AGACAAACATATTAATTGGATGAAAAGAAATTTAAGTCCTTAATGGAAGAAAATCACAAT
ACTCTTTAACAGCTTAGAGAAACAATTGAAGAAAGAGAGCAACAATATTATAATCTAAGC
AAAAAAAGAGAATAGCTCGAAAACACCGAAAAATAAAAATAAGATAACCTGTAAAATTTA
ATAAGCTCCTCTAATGAGAGAGAGCATTAGTTGAAAATTTTAAATCAACAAGTAGATAGC
ATGTCCGAAGAATAAAACCTTCTTGCTAATAGATTACAAGAATTGTCAAGCATCCAATCT
AAACTAATTGATGATAACACAATCTTGGAAGAAAGGAGATAGGAATTAAATGATTAAGTG
AATGATTTGGAATAATATGCTGAAGAATTAAAAGATGAATAAAAAGATATTTTAGAAAGA
ATCAAAACGTTGACTAAGAAGGAAGAAACAATTTATATTAATAAGGCTTTCAGTGGAGAA
GAATTAGATAAAGATATTTAATTAAAGATAGAATAAATAATAGAAAGCTATTATGCTAAT
TAAAATAAGGATGAAGAGATTGAATAGCTGAATAAATAAATCAAATAACTAAAGCTAGAA
AGTGAAAATTATAAGAATATTTTAAATTCTAAAAACCACCAAATTATTTCTCAGTCTTAA
TAGAAAGCACAATTAAACAGTAAAAATGCTAATTATCAGAACAACTTAAATTCAACAGGT
AAATTGGGTATAGGATAATCCTCTTCTTTAAAAAATATATAAAAATAAAATCAATTATCT
ACATAAAATTAAGAGAATGAGATTTAGTCTAATTCTAAATTTTAACTTGATACCTTTGCT
AATAAAAATGGTTTTATGGGATTAAGCACTCTTGCCAATAATAATATGATGATGATTTAA
AATGATAATGAGTCTCTACTTTTATCAAGTGATAATAAATACAAAAATTTAGTAACTAGT
ATTCAACAAAAAAATAATCAGGATTTATTGAATGAACTCAATTCATAGAGATTAAAATAA
GTTAAAACTGGCTAATAAGATAATCCTTTCCTAAGAAAGTTATAATAGCAACTTGAATTA
GAAGCCACTCCTGAAAAATAAAAAAGCTAAGATAACCTATTAGATGATAATCTTTTTTCC
TCTAATAATAATCCAGCAGGCTATTCAGCTTCAAAAGCTTCATAGAATAACTCATATAAA
AAGCCAATTTCAACTATTTAGGAACTTTAGCAGCAAGAATCTGCTAATATAAATAAAAGT
CCTTATTATATAAATTAAGAATAAAAATAAAATCCTAGATCAGACAATTCTTCTAATTAG
AAATAAAAACATTAATCTTCAGTAGATAAAATATACCAAGAGTTAGAAGAAGCAGATAGA
CAGCTTTTATAGCTTCAAGATTAGAATGAAATAAAAAACTTGATGGAATCTTCTCAATCT
GAAGACAATAGCTAAAAAAAATAAAATGAATAATATTAAAGAGAGTAATAAGAAGAAGAA
GAATAGTATTAAGGATAATAAGAACAATAAGATTACGACTTTTTAGGAGAAGAATAATTT
TAAGATGAAGATAATGAATTTAATTGA


>TTHERM_00157890(gene)
ATGAAAACTTTGAGCAGAAACAATAGTGAAAAAAGAAAAAGAGACTCTGAAAGCGATTAA
AAGGCAGGAGTCATTAGGATAAATGAGGCTCTCATTAAATAAGTTACAAATCAAAGTGAT
TTCTCATAGATCAAAGCACTTAATTTTCATATTAGATTGAATAATAATTCAAAAATATAA
GTAAATAAATAAATAAATACATTAGCAAATGGTATTGAATTTATCAAAATAAAATTATAA
TATAATAGAGACTAGAAGGATTGGATGATCTAGTTAATTTATAAGAGCTTAACCTTAGTT
ATAATAGCATTTAAAAAATTGAGAATTTGGCTCGTTTGCAAAATCTGAGAGAACTCAATT
TAGCGGAAAATAATATATCAAGATTAGAAGGCCTAGTAAACAATTTTATATTTATTTATC
TGCAAACAATATATTTCAATATAATGATAATTAATGTCTTTAACTAATATGCAATTAGGA
GATGCTTAAGAATATAGAAAATATAAATCTTAATGGAAATAGTATAGTTGAGTTACCAAT
AGATATCCTAAAAAATTTATAAAGGTTAAGAGTGTTAAAGTTGACAAGAAATAAAGTTAA
AGAGTTAGGATAGGTTTAAAATTTAAGTGTGTTGAGTAGTCTCGAAAGTCTTTCCATAAG
CGAAAATCCATTCTGTAAATCTATAACATATCAAGAATTTTGCATTTATGCCATGACTAG
CTTGAAGGTAAAATAAATAAGCATCAAATTTCTTTAATTGTATTAAAATTCAAATATTAA
TTTTTTAAAATAATACTTTTTTTCAGTGCTTTTAAAACAAATATGTTTTATTATAGGTTT
TAGATTCTAAAAAAATAGATGAAGACTAAAGGAAGAATGCTTTGTTTTTATTCTCTAGCG
GCTTGTAGAATAAATAGGGAAAGAATTAAGGAAATAATCCTTAAAGTAGTGCTCGTGATG
ATGTAAGCATGATAAAAAAGCAAATTGAGTAAGCTAATCAGCAAAGAGACTAATTATCAT
ATGAAAATTAATACTTAAAAGAAGAGAGAGATTAGTTAAATTAGTAAATTGAGGGCTTAA
ATGAAAGATTTTAGATTAAATTAAGGGAAAATTCTGCTTTTAGTGAAAAGTAGCTTAAAA
ATCTCCTATTCATATTCTAACAATTTTTTTATATAATGTAGAATTGCTAAATTAGAGGCA
GAGCTTTAAAATTACAAAATTGATGACTTATTTTAATCTTTTAAAGATACGAGAAACTTT
GATCTAAATAAGTTAATGGATATTTAGAATACTTAAAATTTAGTAGAATTTGACAATTAA
TATTTCAATAAGCTAGAATAAAAATCAAAAGATCTCCACGAAAAAAGAGAAGAATACCTA
TTTAAAATAGAGTAAAATTATTGATCCTAAAATTTAAACTTATTGTATTTCTAACGAAAG
AAATTTAGAAGCCTAGTGTGAAAGGTTAAAAGAAAGAATCATAGAAAGAGAAAAAGAAAT
GAACTAAGCAGCTGAATCTTACTTTCAGATGAAGAATCAAATTAGAATGAATAGCAATGT
TAAGTTTATGAAAGACTCATTCATGCCTGACTCAGATGACTTAGAAATCCTTATCAAATA
AAAGGAAGCAAAACTTGCCTTTCATTACAATGAAGTACAAATCATTGTTTTTTATTTTTT
GTTAAAATTTTTCAATAAGCATTTTATCATTTATAATTAAATTAATATTTAAGAATAAAA
TAAACATTAGAAATAAAATTAAGAATGCTTTTAAATTTAAATTTATAAAATAAAGAGTTG
AATTATTCAACAAGCAAGCTTTAGTTAATTCATCAATCAATATTCAAAAATTTTTAAAAA
TTTTATTTAAATATAATAAGAATGAAAAGCTAAGATTTGCTAATAGTGAACTTTAGAGAG
AAATTGATTTGACAAGGGAAAAAATAGATAAGACTAGAATTTTGATTAATAAATTAGATG
CTATTAATGATGGAGAAAGTACTTCTAGTGAGGTTGAGGATGAGAGAGTTCTTTTAGATA
AGAAAATAAATTCTCTTTATCAAAAATTAACTTCTTAGTAAGAAAAGAATAATGAAATAA
TTCATTTAATTACATCTATTAATAATGAAGTATTTTTATTTAAATTTGTATTAAAATAAT
AATTTTAAATTAATTTAATAATTTCTAGGTTAATTTTTTAAGCTCTGAGATTGAGGATTT
AAAAAAGTAAAGGTAAGAGAGCTACTTAAAACCTTAGAAGACAGTAAAAACAAACGAATC
TGAAAGTGTTGGATTAGATAATGAAAAACTTAAGGAACTAAGCAATAACATAACGTTTTT
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ATTTCATATTTTACTGTAAAAAAATTAATCTGAAATTGATATTTTGGAATCACAGAAATA
ATAAATTTAAAATAACTTTAAAGCAAGCACATTTGTCAATAATTTAAGCAACAGTTTCAA
AAAGACTGTTTAAAACTAGTTAAATAATGCTGCTAATAACCTTTAAAATATTGTTCACGT
GCTTAAGACTAAGGCTCCAAAGGTTTTAAATAAAAAATTATCTATTATTAATAAAATAGA
GTAATAAGTTAACTCAGTTGCTGCTGACCCTTAGATTGACAATTTTTCTTAGTGCTTAGC
TGACTTGAGTGGTGCTATAAGGTTTATCTTTGAGGAAATGGATGACTATAAAATTGAACA
AGGCGTTATTTTTGATGAGTAAACAAACTAAAAGCGCAAAGAATTTTATCACTTACAACA
ATAAATTGATGATTACCAATAAGATAAGTAAAGGTGCTTTGATCAAATCAACACTTTATA
TAAAGAATATATTTATGATCAAGTTAATAACGCTGCTAAAAAGAAAAAATACAAATCAGG
ATAAGATGAGTATAATTTTCCAGAGAAATTTGAAAGCTTTGAAGACATGCAATAAGTCTT
TAAAATTATTTAAAAACTAATGAAAAATGTAGAAAAAAACGAGTTAACAATTAAGAATTT
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AAAATGGAGAGAATTTGAGTCAAAAAAATTAGAACATAAGTCTAAGATAAATAAAGAAAG
AGAATAGCTATATTAGTAATAATTATTAATTACTTCAAATAATAATTGCAATTAAAAAAA
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AAAAAGAGGAAAACGATAAATTTACTGTTATCAAAGATGTTGAAGATTAAAGATAGCTTA
AATAGAATTTAGAAATGGAAATTTATTAACTTAAATCTCATTTAACTCGTCTTTAGAGTG
CTTCTGATGAAACAGAAGCTAAAAGAAGTGTAGCAGAGAAAGATCTTTAAAGAATACTTC
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GCATGTCTTTGAAGAAAGCATAAACAAACTTAACTAAGAAAATGAAAGACTTTAAAATAT
TAATTAATAACTATAAGCTTAAAAGCAAGAATTGCAATCAGAAGTTTAAAAATTTGAAGT
CGATATGAAAATGTAAAATATATTTTATAAAAAATCAATCAGATAGTCTAACTTTTTATT
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AAATACAAACAAATTAAAATGGAAAGCTTGAATTTAGAAAAATAAATTGAAGAAGGTAAA
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AAAAAGCATCTTGAGAGTCTTAGTTCTTTGTCTAAGCAGAAGCAGCAAGAAGTTATTTCA
TTAGAAAAGCAAGTATTCTTCATAATTATTTTTGTTATCACTTAATGAGTTTTATAAATT
AAACTAAATAGTACAGTGACATTTAGTAGCAATTGCTTGATGCTGAGCTTAAAATCTAAA
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AAGAAAATCACAATACTCTTTAACAGCTTAGAGAAACAATTGAAGAAAGAGAGCAACAAT
ATTATAATCTAAGCAAAAAAAGAGAATAGCTCGAAAACACCGAAAAATAAAAATAAGATA
ACCTGTAAAATTTAATAAGCTCCTCTAATGAGAGAGAGCATTAGTTGAAAATTTTAAATC
AACAAGTAGATAGCATGTCCGAAGAATAAAACCTTCTTGCTAATAGATTACAAGAATTGT
CAAGCATCCAATCTAAACTAGTAAAATCTTCTTCAATTCTTCAGACCTAACAATCTATTT
ATTAAAAAAAGATCAAAAAATAAATACATTTTTTTCTTAGAAAAATATATTTTTTATTTT
TATTTTTTAAATAGTTTCCTTTAAAAAATAATTAAATTCTTAATTGAAGATAAACTAAAA
AATCAATTTTAATCATAATTTAAATGAATTTGATCCAATTTTTTTCAAACAAATTTGAAA
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ATTGATGATAACACAATCTTGGAAGAAAGGAGATAGGAATTAAATGATTAAGTGAATGAT
TTGGAATAATATGCTGAAGAATTAAAAGATGAATAAAAAGATATTTTAGAAAGAATCAAA
ACGTTGACTAAGAAGGAAGAAACAATTTATATTAATAAGGCTTTCAGTGGAGAAGAATTA
GATAAAGATATTTAATTAAAGATAGAATAAATAATAGAAAGCTATTATGCTAATTAAAAT
AAGGATGAAGAGATTGAATAGCTGAATAAATAAATCAAATAACTAAAGCTAGAAAGTGAA
AATTATAAGAATATTTTAAATTCTAAAAACCACCAAATTATTTCTCAGTCTTAATAGAAA
GCACAATTAAACAGTAAAAATGCTAATTATCAGAACAACTTAAATTCAACAGGTAAATTG
GGTATAGGATAATCCTCTTCTTTAAAAAATATATAAAAATAAAATCAATTATCTACATAA
AATTAAGAGAATGAGATTTAGTCTAATTCTAAATTTTAACTTGATACCTTTGCTAATAAA
AATGGTTTTATGGGATTAAGCACTCTTGCCAATAATAATATGATGATGATTTAAAATGAT
AATGAGTCTCTACTTTTATCAAGTGATAATAAATACAAAAATTTAGTAACTAGTATTCAA
CAAAAAAATAATCAGGATTTATTGAATGAACTCAATTCATAGAGATTAAAATAAGTTAAA
ACTGGCTAATAAGATAATCCTTTCCTAAGAAAGTTATAATAGCAACTTGAATTAGAAGCC
ACTCCTGAAAAATAAAAAAGCTAAGATAACCTATTAGATGATAATCTTTTTTCCTCTAAT
AATAATCCAGCAGGCTATTCAGCTTCAAAAGCTTCATAGAATAACTCATATAAAAAGCCA
ATTTCAACTATTTAGGAACTTTAGCAGCAAGAATCTGCTAATATAAATAAAAGTCCTTAT
TATATAAATTAAGAATAAAAATAAAATCCTAGATCAGACAATTCTTCTAATTAGAAATAA
AAACATTAATCTTCAGTAGATAAAATATACCAAGAGTTAGAAGAAGCAGATAGACAGCTT
TTATAGCTTCAAGATTAGAATGAAATAAAAAACTTGATGGAATCTTCTCAATCTGAAGAC
AATAGCTAAAAAAAATAAAATGAATAATATTAAAGAGAGTAATAAGAAGAAGAAGAATAG
TATTAAGGATAATAAGAACAATAAGATTACGACTTTTTAGGAGAAGAATAATTTTAAGAT
GAAGATAATGAATTTAATTGA


>TTHERM_00157890(protein)
MKTLSRNNSEKRKRDSESDQKAGVIRINEALIKQVTNQSDFSQIKALNFHIRLNNNSKIQ
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