Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00171790

Standard Name

NMDP1 (Nonsense Mediated Decay Protein 1)

Aliases

PreTt29788 | 14.m00355

Description

Est1 DNA/RNA-binding domain protein; Mediates cleavage of target mRNA strands

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Gene Ontology Annotations

Biological Process

Domains

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Gene Expression Profile

Tetrahymena Stock Center

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Homologs

Source Identifier Score
Tetrahymena borealis EI9_09962.1 9.997093137033517e-262
Description: hypothetical protein (986 aa)
Oxytricha Contig13105.0.g80 1.999981404597394e-31
Description: Zc3h12a-like Ribonuclease NYN domain
DictyBase DDB_G0276713 2.0009605191578312e-25
Description: DDB_G0276713 on chromosome: 2 position 7112533 to 7116132
WormBase WBGene00016260 0.00000019998969434520019
Description: status:Confirmed UniProt:Q95YE2 protein_id:CCD66238.1

General Information

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Associated Literature

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Sequences 

>TTHERM_00171790(coding)
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CTAGAAAAGCCCTACCAATGA


>TTHERM_00171790(gene)
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AGATTTAATTCTTAAGAGGATTGCTAAAGGATGTTATTGAGGTAATTTTTCCATTCAAAA
ATTACTTTGTAAAATAATAAAAATTTTATAGAAATACAAGTCTGAGCTATGTTCTGAAAT
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AATTAAATAAAGAGAGAAAGTTTCAAGAACATAGACAGCTCCAAATATTAAGAACATGCA
TTTTGCAGCTGGTTAATATATGAAAGCTATTAGCATTTATCCCTTTTGTGGGAAGTTCTT
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TTTAACCATTACTTCGAGAACAACAAGGATAAGTTTAAAATCCTTGAAGATGACTCTCTC
TAATACCCTCTTAAACTCTTTATTATCCTAGATAAGCTTCCAAAAATAGAGTCTTTCAAA
ATTTTGGAAGAAGACGAATAAGTTGATTCAAATAAACAAGACCAAGAAGATTTCTTTTTC
TTGAAAACAACTCCCTAAAAAGTAACTAAATCTAAAATTTATTTAATAATAAAAAATGAA
ATATTCTAAAAAAGATTATATTATTAATTAGCAAATACAAATTTGCAAAAAGTAAAATAA
GGATTTTCTATTGAATAATAAAAATGAATGATAAATTATTTGAAAGAAATAGAATTGATT
CCTATAAAAAAATATGATCAAAAGGATCAAAGATAAGAAAAGAATTAATTTTATTTTAGA
ATGTTTTGCAAAAGAAATATTAAATAATATCTTAAAAATGATTCCAATAAATTTATTAAA
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ATTTTGAAATAAATTAAAGAATGCAAAAATATATTTTTTAATGCAAAATTGAGAAATACT
CCTTAAAATGATTAATTAATTTTATGATTTTGTTTTTATTAGGAAAGTAGTGCATAGCAA
GATAGCAAGCAATTGATAATCATAGATGGTATGAATGTTGCTATCAGATATGGTTAATCT
ACCTTCTGTGCTAAAGGCCTCCAGATTGTTGTTGATTTTTGGCTTAACCATCAGGCTGAA
GTGCTTGTATTTTTACCAGATTTCTGTTTTAGTGCTGATTAAATCGAAAAGAAAAGATAG
AAATTCCAAAAAGAAAAAGTAAACAAACAAATAAATAAATAAATAAAAAATATTGTGTTG
TTTTTATGTTAATTTAATTATTTTCATCTTAAAATAAAGATTCCTGAAAAGTTCAAGACT
TTGCCAGACGAAGTAGAAACTTTAATCAAGTTAAGAGACCAGGTAAATAAATTTGATCAA
AGAAATTAATAAATAAAGATTTTGAAATTAATTCAGATTTTAAATTATTTAATTAGGGTT
ATGCTACAGGTATACCAAACTAGAGCTATGATGACTCTTACATGATAGATTATGCAAGAA
AGAAGAATGCATTCATCATGACTAATGATAGATATAATGACCATATTTAGAACTACAAAA
ATGATCCAAAATAAATGGAAATCGTTAAGTAGTGGATTAGAAACAACTGTATGAGCTTTA
CTTTTGTTAAGGATGAGCTGCAACCTGACCCTGATTTCATATAGAAAAGAACGAAAATAT
CTCTAGAAAAGCCCTACCAATGA


>TTHERM_00171790(protein)
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QQKVYQEYETKQVNQDNGNNHQAQKNNQKNQQRDQNKNNNSNNDNRNQNNGQRQNGKQND
FYPRNQFRQVNDDYDDDEDDDSSFNNSRNSKKKNTNRNNNQNRQQKQYDSSDDDYSDGRR
RNKREKKIDPNGHNPNANVDQQYDRSKIEHYFNSKDIKFSKDKRFNIYHQRDDEYFHNSK
NRNGQNKFEGSSSNSNHHNNQKNNEEFDIDSIVDQVDFQVNLDDIFKETNMEEYEWNNLY
QLFKLSEKKNSLFFTMQSENQVIFDKQEMETEIFKLFQQLARVLILSDLETASEKKIDQR
LWDIYKKKIEYSKKFKLVSTNIQDQLHIFDSKIQFLRGLLKDVIEKYKSELCSEIKQKNQ
KRRIIANLCCYFGELIELKEKVSRTQTAPNIKNMHFAAGQYMKAISIYPFCGKFFLVLAT
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