Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00218280

Standard Name

TRM3 (TRNA Methyltransferase 3)

Aliases

PreTt22255 | 18.m00281 | 3701.m00041

Description

TRM3 TrmH family RNA methyltransferase; RNA methyltransferase; TrmH family protein; assists with high fidelity protein synthesis

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Gene Ontology Annotations

Biological Process

Domains

  • ( PF00119 ) ATP synthase, A subunit
  • ( PF00335 ) Tetraspanin family
  • ( PF00499 ) NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 6
  • ( PF00588 ) RNA methyltransferase, TrmH family
  • ( PF01461 ) 7TM chemoreceptor
  • ( PF01578 ) cytochrome C assembly protein
  • ( PF02524 ) KID repeat
  • ( PF02532 ) Photosystem II reaction center I
  • ( PF02687 ) efflux ABC transporter, permease protein
  • ( PF03006 ) Haemolysin-III related
  • ( PF07690 ) transporter, major facilitator family
  • ( PF07695 ) 7TM diverse intracellular signalling
  • ( PF08385 ) Dynein heavy chain, N-terminal region
  • ( TIGR00185 ) RNA methyltransferase, TrmH family, group
  • ( TIGR00186 ) RNA methyltransferase, TrmH family, group
  • ( TIGR00669 ) aspartate--ammonia ligase
  • ( TIGR00864 ) polycystin cation channel protein
  • ( TIGR01191 ) heme exporter protein CcmC
  • ( TIGR01257 ) rim ABC transporter
  • ( TIGR01612 ) rhoptry protein
  • ( TIGR01906 ) integral membrane protein TIGR01906

Gene Expression Profile

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source Identifier Score
Tetrahymena borealis EI9_06599.1 9.997093137033517e-262
Description: hypothetical protein (2559 aa)
Oxytricha Contig12667.0.g30 8.997777707990486e-82
Description: SpoU rRNA Methylase family
DictyBase DDB_G0285499 9.999142814001536e-47
Description: DDB_G0285499 on chromosome: 4 position 3314745 to 3319892
WormBase WBGene00020498 5.999781043483669e-32
Description: status:Partially_confirmed UniProt:Q22484 protein_id:CCD65279.1
SGD YDL112W 1.9996410647472548e-29
Description: TRM3 2-O-ribose methyltransferase, catalyzes the ribose methylation of the guanosine nucleotide at position 18 of tRNAs

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences 

>TTHERM_00218280(coding)
ATGAGCATAGACGTTGTTTTACAATCATTAATTCCAAAAAAGGCTACAGATGATTAAACA
ATTTACACTTTGCTGAAGTAGTATGCTGTTTTATAAGTTAGCTTAAAGCAAAATGAGTAA
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CATGCACTTCTTTGCAATTTAATGAGCTTGCTAAGCTTTAGCAACGAAATTTATAACAAC
CCTAATTTCACCAATATTATTGATAAAGTAGTTGCAGATGCATATTATCTTGCAGATGTC
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CTTGTAAGTCACCTCAATGATGAAAACTAAGAATAGCTTATTAAAGACTTTAAAAATCTT
TTTGAGTTATGTTTCAACCAAAATATTTTAACAACTTAATTAAATTACATAACTTATAAA
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TGGTTACTATAGAGAAAAGTTGTGGATAAAATAGCTTCAATATTTTATTCTGACCCTTCT
TTACTTGTTTCTTTTGAGAAAACTATTTATAGATTCATCAAAATAAAAGAATATAGAGGA
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TTAGATGAGGTTACTAAAGCTAAATTTAAAACTTTAATTGATTTTTATATAAAATATACA
TAAAATTTGTTAGAAAGAAATTACTAAAAGAAGTACTAAAAGTCAAGAAACTCACTTCTT
CCAAATACCAACCATTATAACTCAAAAATCCGTATGTGGCAGTGTCTCTGTGTTATTAAA
GATTTCTTTACTGAAAAAGTTATGAACTTCATTAAAAATACCTTTGATTAATCAGAGTAT
AATGTTGATAGACTTATATCTGACATCAAAGAAAAAATTTGGGGAATCTTAGATTTTAAC
AATTAAGTCAACATTAGACAATATATTGAAGTATTTACTCTTCACTTATACAATGAATTC
CCAGTTTATTTTGAATAGAGCATCATAGATGGAATCAAGGAAAAAAATAACAGATCTCAA
TACTCTATTCCCTTAGTTTTTATGGCTGGTTATCAATTATGCAGAAAACCAAATAATCTT
AAAGCCAAAGAAGTTTTATCTCATTTAATTCCATATACTGGATCACATGTTGCATATCTT
AGATCTATTGCATAGTACTTTGTTTCCAAATTCACTGAAGCTAATGAAGAACAAATTAAG
GATGATATTTTATTGAAGAATCTGAATTCATTTTTTACAGAAAACAAAGAATCCATAAAA
ATGAGAAAAACATTTGATAAAATTGTAGAAAAATTCCAAAAGGTTATTGAAAACTTTAAT
ACAGAGCAACTTTTGAGTATTGACATGGATGGAAATGGTGAGGTGGTTCACGAAAATGTG
ATTGAAGAAATAAAAAATGTTTGTATGAACTTGATATATTAATTAAAAGAACATGAAGAT
GCTCCTCCCAAAAAAGACGATTTATGGAGATTAAAAACTTAAGAATTCATTCAAGATATT
CCAATTCCTGATTTAAGTGAGGTTACAAACTTCTAGAGAAAAATTGATGTGGTTTAGAAT
GAACTAGATTAAATTGAAGCTGAAAAGAAAAAAAGGAGAAAAGAAAAAGACATCATAGTT
GTAGCATCATTGTTAGAAAAGATACCTAATTTCGGACACTTAACAAGAACTAGTGAAATT
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GCTATATCAGTTACAGCAGAGAAATGGCTTCCTATTTAAGAAGTAAAGGAAAAAGATCTT
ATGGCTTTCCTGATTCTTAAGAAAAAGCTTGGCTACAAAATTGTTGGATTAGAACAAACA
AGCAAAAGTAAGATGATACAACATTAAGAATTCCCTGATAAATGTATACTTCTTTTAGGA
AGAGAAAAAACAGGTATCCCTCTTGAGTATATTGAAATATTAGATGAATGTGTAGAGATT
CCTTAATTCGGATAAGTAAGATCTCTTAACGTTCATGTTAGTGCAGTTATTTGCATTTGG
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>TTHERM_00218280(gene)
ATGAGCATAGACGTTGTTTTACAATCATTAATTCCAAAAAAGGCTACAGATGATTAAACA
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CAGCAACTCAAATAAAATAAAATTATGGTCTAAATAGATGTTTTACAAGGACTTTTTGAA
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TCTACAAAACTCTTAAAGAAAAAGTAGAACATGCAGATATAGAAAGTCACCATACTCAAC
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ATAGCATAACTTACTTTGTTTTGAAGTTATTAAATTTGTAGAGCTCTTGTACTTCAATAG
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TTAAAAAGATCCTGTAGGGATCAATAAAATTGTAGAAAAAATCCCAATTTTACATCATTT
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GCTTCCTATTTAAGAAGTAAAGGAAAAAGATCTTATGGCTTTCCTGATTCTTAAGAAAAA
GCTTGGCTACAAAGTAAATTTTAAGCATAAAAATAAACCTAAAATGATATTTAAAAATTA
AGATTGTTGGATTAGAACAAACAAGCAAAAGTAAGATGATACAACATTAAGAATTCCCTG
ATAAATGTATACTTCTTTTAGGAAGAGAAAAAACAGGTATCCCTCTTGAGTATATTGAAG
TAAATATTGTTCGTTCAATTCAATTATTCTAAAATAAATAAATTTAAAATAACTCTTTAA
ATATTTTTAATTAATTAGATATTAGATGAATGTGTAGAGATTCCTTAATTCGGATAAGTA
AGATCTCTTAACGTTCATGTTAGTGCAGTTATTTGCATTTGGGAGTTTGTCAAGTAAAAA
TTTATCAAAGAATGA


>TTHERM_00218280(protein)
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LIQLLNRQTSQSHSNESILSPGEEQLVCLYFEILSCICKSNLDIIQQSQKSANSSIFIDD
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WLLQRKVVDKIASIFYSDPSLLVSFEKTIYRFIKIKEYRGFDNGMEFYKDELEIPLANEL
KTKFSNNIEYYGAFPRFMILKLLENIVIWINNCVNNPSDLLDEVTKAKFKTLIDFYIKYT
QNLLERNYQKKYQKSRNSLLPNTNHYNSKIRMWQCLCVIKDFFTEKVMNFIKNTFDQSEY
NVDRLISDIKEKIWGILDFNNQVNIRQYIEVFTLHLYNEFPVYFEQSIIDGIKEKNNRSQ
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DDILLKNLNSFFTENKESIKMRKTFDKIVEKFQKVIENFNTEQLLSIDMDGNGEVVHENV
IEEIKNVCMNLIYQLKEHEDAPPKKDDLWRLKTQEFIQDIPIPDLSEVTNFQRKIDVVQN
ELDQIEAEKKKRRKEKDIIVVASLLEKIPNFGHLTRTSEIFGVSSLVIPNKAILEEEGFK
AISVTAEKWLPIQEVKEKDLMAFLILKKKLGYKIVGLEQTSKSKMIQHQEFPDKCILLLG
REKTGIPLEYIEILDECVEIPQFGQVRSLNVHVSAVICIWEFVKQKFIKE