Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00222280

Standard Name

POP1 (Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1)

Aliases

PreTt12435 | 19.m00227

Description

POP1 ribonuclease P/MRP protein subunit POP1; Ribonucleases P/MRP protein subunit

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Gene Ontology Annotations

Molecular Function

  • obsolete mitochondrial processing peptidase activity (IEA) | GO:0004240

Biological Process

Domains

  • ( PF06978 ) Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1
  • ( PF08170 ) POPLD (NUC188) domain
  • ( TIGR01784 ) conserved hypothetical protein

Gene Expression Profile

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source Identifier Score
Tetrahymena borealis EI9_05553.1 9.997093137033517e-262
Description: ribonuclease P/MRP protein subunit POP1 containing protein (757 aa)
DictyBase DDB_G0291320 6.002971818577897e-50
Description: pop1 on chromosome: 6 position 120925 to 123655
Oxytricha Contig1019.1.g97 2.0003218023735366e-33
Description: Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1
Stentor Coeruleus SteCoe_8648 3.221340285992516e-27
Description: None
WormBase WBGene00015486 2.0002795641672355e-21
Description: Uncharacterized protein C05D11.9 status:Confirmed UniProt:Q11188 protein_id:CCD63199.1
SGD YNL221C 0.00000030014504373857585
Description: POP1 Subunit of both RNase MRP and nuclear RNase P; RNase MRP cleaves pre-rRNA, while nuclear RNase P cleaves tRNA precursors to generate mature 5 ends and facilitates turnover of nuclear RNAs; binds to the RPR1 RNA subunit in RNase P

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences 

>TTHERM_00222280(coding)
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>TTHERM_00222280(gene)
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AATAATTTGATTTGTAAACAAACAGCTTGAAGCAAAAGTAACTAAACATTTCCTGAAACC
TAAAGGTAAAAGAGTAAATTATATGAAGATAAACTCACCTTTCCCTTTTAAACCTAATTT
CGATTACATTTTGAGTAAATATCTTGAGAGTGAAGATAAGATAATTGCTCAGCAAGAAGA
TCTATAAGATGTTAGAGTTATTATGGTAGGCAGGGGAAAGCCTGATACTAATTCTTACAT
TTGTTTGCCAGAGCCAGAAGATTTCAAAAAATACTAAGATATGCTCTTAAAAGACAAATC
CAGAGTTTATTCTATTCACGATGAGCCTTCTTATGTAAAAGTAGCTTCTAAATCGCTTGA
TATTCCAGAACCCTCTCAAATCAGCACAACAAGAAAAATTATCGGTATTTGCTTGCTTTA
TTGCTTATTAAAATTTTTTCTTTCTTTCCAATTTTGAGTTATAAATTTAATCAAATTTTT
AAATTTTTTCTATTTTTATGGAATTTTGATTCAAGAAATTCGTTGATTTTCTAATCTTTT
TAATTAAATCTTTATTGTAAAAGGGTTTTTATCATTTGGAGATTTTTCATTTAAATCTGG
AGTTGGAAAGGGAAGAGGCTAAATCATAAAGTATTATTTGGATGCTTTAAAAGCTAAAAG
CCAAGGAAACAACATGGAAATAGAGGATAAGCAAAAAAATAAAAAATAAAATGAAATATT
CTGCTTAATCCGTAATCCTACTTCAAGAAAGTACTATTTGGCAAACCTTTATTTAATTTG
A


>TTHERM_00222280(protein)
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MSHNRYRIPSRIRNRMNVQELDVIEKTQDPIKCRKHLRKPKLLMNSYIRRSRSDKWMETH
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