Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00245500

Standard Name

RPB9 (RNA polymerase II subunit 9)

Aliases

PreTt02445 | 21.m00276

Description

RPB9 F-box protein; !!! Two genes- RPB9 and a F-box domian containg gene- are fused in TTHERM_00245500 !!!

Genome Browser (Macronucleus)

Full Screen View

No Genome Browser Data Present

Genome Browser (Micronucleus)

Full Screen View

No Genome Browser Data Present

Gene Ontology Annotations

No Data fetched for Gene Ontology Annotations

Domains

• ( PF00646 ) F-box domain
• ( PF01414 ) Delta serrate ligand
• ( PF02150 ) RNA polymerases M/15 Kd subunit
• ( PF07754 ) Domain of unknown function (DUF1610)
• ( PF08271 ) TFIIB zinc-binding
• ( PF08274 ) PhnA Zinc-Ribbon

Gene Expression Profile

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source	Identifier	Score
Tetrahymena borealis	EI9_00587.1	8.001983224960958e-155
	Description: hypothetical protein (468 aa)

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_00245500(coding)
ATGGGACATAAATCTAAGAATTTTAATCATTAAACTCCCATAAAAGATTAGATTTTTGTA
AATTAAAATTTCCATATCTTTGATCTTTAGGATAATAAAGCTGATGATAGTTACTCAAAA
AGCCTTTTGCAGCATTCTTTGATTAACTCATCAAGAGAATATATAAATTTACCAGATAGT
AAAAGTATTTAATCTCATAGAAACAGCAAAGAAAAACTTATGATTGGGAGTTCTTTGCCA
ATAAAATATTACAAATTTTAAGATCAAAAATAAGACAAAGTTCAACTCTTTTCTAAAGAT
GTGCTTGGTTCAAATTTACAAAAAAGCCCAAAAAATTAAAAAATTGAAAAGGAGCAGCAA
CAAGAAATAAAATTTTAATCTTGCTACTTGCGAAACATGATGCCTCTAAACAGCCCAGCT
ATCTTCTATAAGAGAATGAAAAACTGTAAAGTAGTTAGAGCGAATACTCCTGCTAATCTA
GAGGAAGGATCTAAAGAATTATAAAACAGGAGTAATATGCAGATACCTATTTTAGTTTTT
GACTCTTCCAATTCACAAAGTCCACAAAAGATGCAAAATGTTTATAATGAATAATAATCT
TTTAGATAGTGCCTTTACTAATAATTAGGATTTTTAAAGGAGCAAAAGGAAGATTTCTAA
GATGTTATTATAAAAAATAATGAAATTTTAGAGAGTGAAAAATAAGGAATTGAAAATCAA
GATTAGAAATACCACCAGCATTAAATATTTTAAGAAGTTTCATCACAAATATAATTTAAG
TAGCTTTAAAGTACTACTAGTGCAATTAGTACTACTGAAAAATCATAAAGAACTAAAAGT
GCAAATAATAGTTATAGAAAACAAAGAAATATCAATGATGATGGTGATTAACTATTTCAA
AATTTGTTAGTAATCAACAATTAAAAAAATAATAACAATTCAGATGATAATTAATTACAA
AACATTTAGTAATATTAAAATAAGACATTTTTTTAAGATAAGCTCATATAACAAACTAAT
TATTTAATCAATGAATAGCACAATTTTAGTTAAAAATATCAATAAGCATAATAACCTACT
TAACTCTCACCTTTTCAACATATTTAGAAATAAAAGAAAAATTAAATTTTATAAAGGATA
CAAAATACTAAAAAACTATAATAAATAAGATACAGCCCTCAGAAATATTAAATCTAAGCA
CACTCTGACTATAAAAAAGAAAAAGTAAATTCAGATAGTAAAAAGGAATAATTCCTTTCA
GAGAATAAAAATGATTAATTAAATTCTATAAGTAATGAAAATAAGACAGATATTAATAGC
TCCTTTTAAAATTCATATTATAAAAATCATCAAATTTAAGTTTAACAAGAATAAAAAGAG
AGTTAAGAAGAGATAAAATTAAATCTTAATAAAATTAAAAATGAATTGACTTCTTCTTCA
TCTGAAGAAGAGGAAATATCTCCTTTAAATGTACTGAATTAAAGGCATTTATTGACTCCA
AAATCTGTTTAAAAGAATAATCAAATTCAGTTATTTAAATAAAAATAAGATAATATATTA
ATCTACCTTGAAGATATTAGAAAGCAGCAAGATTAGCAGCTGCAATTAATAGAATAATCT
TTAACTGAAAGAAAGAATGAAAATATCAATAAAAGTAACTAGATATTAAATTTTAATTCT
TTTTTAAATTTAAGTGAGTCACATGTCCAACAAATAAACTCTGATAAAATCAAAAATAAT
CTATAAAATCATTACATGCTTCAAGAATAGAACTTAAATGAGTAAAAAAATAGTTCTACA
ACTGATTAAATTAATAAAAATATTAGAAAAAACTCTCTTTTAAGTTTCTTTCGTGGTTAA
ATTAGTTAGACAACTCCACAGAGAAATAAAGGATCTGCTTTAAACTAATATGAAAATTTA
AATGAAAACATGTTTAAATCTAATTATTATGAATTTGTAGAATAATGTGATTTAAAAAAC
TAGTTTTAAAACATATAGAATAGCATTTACATATTAAAAAATGAAGAATTTGATGGCAAT
ACCTCAAAAGTAAATACTATTCATTCAAATGGAAATAACGATTACAGCCATAGCTTGACT
AGAAAGTATGATACATAATTTGAAAGATAAATAGTGAGACAATAAAAAACTAATCAAAAA
ATATAAAGGATAGAAGCTTCAAATTAAAGTAGCATCGAAAAACTAGATACAAGAATTTAT
TTTTCTTCTACAGCTAATAGCCCTACAAGAGCTAAAAATTAGTCTGCTTTATCTCAGTTA
GAATGTATTAAAGATGAGCCTAAGCGCAGTAGAATTATACATTCTTCGTATGATAAAAGT
AGAAGTGATGTTGTCTCTTAAAAGGTTTGTAATGAAGTAGAAAAGAATATTGCAAACATC
AAGAGCAGAATAAATAGGATAAACCCTTTTTTGATAGCAAAAGCAAAAGAAGAAATACCA
GGATTTATATCTGAGTTAAAATAAAAAGAATTTGACATGGAAAATATTTAAGGATTATAG
ACAGAGAGAAAAGATAGAATGTACTCTGCTAGATTGAGGAGTGCAAATTAGAAGAAATAA
TCTTCCTCTGATATGAAAAGCAAGTAATAAACAAAAGAAACAGGCAAGAATTGTATAGTT
GTAATTAAAGATAGATAATCCTACTACAATTAAAAATCAGCAAGTACTTGCAGCTCACCA
TCTTAGAAGTATGTGTGGAATAAATTAGTAGAAAGTAAACCTGTTGAGATGAATTTAGAG
CTGTGGAATATGATAACACGATTCCTGAGTGTTGCTGACTTAAGCTTTACAAGACAAGTA
AGTAAATCGTGGAATAAATATGCCTTAAATGTGATTTAAGAGAGACACAGAAATTAATTA
TTGATAGATACTTAAAAGTCTGAAGAAATAAAGAAAAAATATGATATTTAAATGATATAC
AAAGTATTAAATTCAAAAACATAAGATATTTATTAATTATTTGGACCAATGTGTAGTTTT
TCGATACAATAGTTGTAGCAGCCTTTGTTTTTAAGTTTTCAGCCTCCTTGCTTAAAAATA
ACTCTTGAGTGTTTCCGCCTCTTTCTTTATCAAAACAAAATATATACTTTTAACAACATT
TTATTTCAATAAAAATAAAAGAAAATCAATCATCATAATTTAAGTGGAGAATCATTAGGC
TTACAAAACATGATAAATTAAATAGAAAAAAAAAGCAATAGAATTAATGACAACACATGT
AGCAACTATTCAGGTAAAATATTTAATAGCAGTAACTCTGGTTTACTCAATACAAATATA
GCAACAAATGCTATACAAGTATATGAAGACAATTCAAGAATGCAAGCTATGAGAAAAAGG
TATTATAGCAAATTATTTCTGGGAGAAAACATGAATAAGCTAAGTATCTTGCATGATGCA
GTGAATTAAAAAAAAGATTTACTTTGGTTTATTTGCACTTTTGATTACAATTAATTTGAA
AAAATTTAAAGATTATTAAAACAAAATTCAAAAATAATGTATTCAAAACAAATTTTAACT
TAGTATGGAGAAGTTGTTTTTAAAATCACAGATCTTTTATTAGGAATTGTAGCATTGTAT
AAAAAGCTATAATAGCATTATCCTCACATTATTTAATATGTAGATTCAATAAGATATTAT
TACACTATTCATTATTAGATAGGAGATAAGATAAATAAATAGATTTGA

>TTHERM_00245500(gene)
ATGGGACATAAATCTAAGAATTTTAATCATTAAACTCCCATAAAAGATTAGATTTTTGTA
AATTAAAATTTCCATATCTTTGATCTTTAGGATAATAAAGCTGATGATAGTTACTCAAAA
AGCCTTTTGCAGCATTCTTTGATTAACTCATCAAGAGAATATATAAATTTACCAGATAGT
AAAAGTATTTAATCTCATAGAAACAGCAAAGAAAAACTTATGATTGGGAGTTCTTTGCCA
ATAAAATATTACAAATTTTAAGATCAAAAATAAGACAAAGTTCAACTCTTTTCTAAAGAT
GTGCTTGGTTCAAATTTACAAAAAAGCCCAAAAAATTAAAAAATTGAAAAGGAGCAGCAA
CAAGAAATAAAATTTTAATCTTGCTACTTGCGAAACATGATGCCTCTAAACAGCCCAGCT
ATCTTCTATAAGAGAATGAAAAACTGTAAAGTAGTTAGAGCGAATACTCCTGCTAATCTA
GAGGAAGGATCTAAAGAATTATAAAACAGGAGTAATATGCAGATACCTATTTTAGTTTTT
GACTCTTCCAATTCACAAAGTCCACAAAAGATGCAAAATGTTTATAATGAATAATAATCT
TTTAGATAGTGCCTTTACTAATAATTAGGATTTTTAAAGGAGCAAAAGGAAGATTTCTAA
GATGTTATTATAAAAAATAATGAAATTTTAGAGAGTGAAAAATAAGGAATTGAAAATCAA
GATTAGAAATACCACCAGCATTAAATATTTTAAGAAGTTTCATCACAAATATAATTTAAG
TAGCTTTAAAGTACTACTAGTGCAATTAGTACTACTGAAAAATCATAAAGAACTAAAAGT
GCAAATAATAGTTATAGAAAACAAAGAAATATCAATGATGATGGTGATTAACTATTTCAA
AATTTGTTAGTAATCAACAATTAAAAAAATAATAACAATTCAGATGATAATTAATTACAA
AACATTTAGTAATATTAAAATAAGACATTTTTTTAAGATAAGCTCATATAACAAACTAAT
TATTTAATCAATGAATAGCACAATTTTAGTTAAAAATATCAATAAGCATAATAACCTACT
TAACTCTCACCTTTTCAACATATTTAGAAATAAAAGAAAAATTAAATTTTATAAAGGATA
CAAAATACTAAAAAACTATAATAAATAAGATACAGCCCTCAGAAATATTAAATCTAAGCA
CACTCTGACTATAAAAAAGAAAAAGTAAATTCAGATAGTAAAAAGGAATAATTCCTTTCA
GAGAATAAAAATGATTAATTAAATTCTATAAGTAATGAAAATAAGACAGATATTAATAGC
TCCTTTTAAAATTCATATTATAAAAATCATCAAATTTAAGTTTAACAAGAATAAAAAGAG
AGTTAAGAAGAGATAAAATTAAATCTTAATAAAATTAAAAATGAATTGACTTCTTCTTCA
TCTGAAGAAGAGGAAATATCTCCTTTAAATGTACTGAATTAAAGGCATTTATTGACTCCA
AAATCTGTTTAAAAGAATAATCAAATTCAGTTATTTAAATAAAAATAAGATAATATATTA
ATCTACCTTGAAGATATTAGAAAGCAGCAAGATTAGCAGCTGCAATTAATAGAATAATCT
TTAACTGAAAGAAAGAATGAAAATATCAATAAAAGTAACTAGATATTAAATTTTAATTCT
TTTTTAAATTTAAGTGAGTCACATGTCCAACAAATAAACTCTGATAAAATCAAAAATAAT
CTATAAAATCATTACATGCTTCAAGAATAGAACTTAAATGAGTAAAAAAATAGTTCTACA
ACTGATTAAATTAATAAAAATATTAGAAAAAACTCTCTTTTAAGTTTCTTTCGTGGTTAA
ATTAGTTAGACAACTCCACAGAGAAATAAAGGATCTGCTTTAAACTAATATGAAAATTTA
AATGAAAACATGTTTAAATCTAATTATTATGAATTTGTAGAATAATGTGATTTAAAAAAC
TAGTTTTAAAACATATAGAATAGCATTTACATATTAAAAAATGAAGAATTTGATGGCAAT
ACCTCAAAAGTAAATACTATTCATTCAAATGGAAATAACGATTACAGCCATAGCTTGACT
AGAAAGTATGATACATAATTTGAAAGATAAATAGTGAGACAATAAAAAACTAATCAAAAA
ATATAAAGGATAGAAGCTTCAAATTAAAGTAGCATCGAAAAACTAGATACAAGAATTTAT
TTTTCTTCTACAGCTAATAGCCCTACAAGAGCTAAAAATTAGTCTGCTTTATCTCAGTTA
GAATGTATTAAAGATGAGCCTAAGCGCAGTAGAATTATACATTCTTCGTATGATAAAAGT
AGAAGTGATGTTGTCTCTTAAAAGGTTTGTAATGAAGTAGAAAAGAATATTGCAAACATC
AAGAGCAGAATAAATAGGATAAACCCTTTTTTGATAGCAAAAGCAAAAGAAGAAATACCA
GGATTTATATCTGAGTTAAAATAAAAAGAATTTGACATGGAAAATATTTAAGGATTATAG
ACAGAGAGAAAAGATAGAATGTACTCTGCTAGATTGAGGAGTGCAAATTAGAAGAAATAA
TCTTCCTCTGATATGAAAAGCAAGTAATAAACAAAAGAAACAGGCAAGAATTGTATAGTT
GTAATTAAAGATAGATAATCCTACTACAATTAAAAATCAGCAAGTACTTGCAGCTCACCA
TCTTAGAAGTATGTGTGGAATAAATTAGTAGAAAGTAAACCTGTTGAGATGAATTTAGAG
CTGTGGAATATGATAACACGATTCCTGAGTGTTGCTGACTTAAGCTTTACAAGACAAGTA
AGTAAATCGTGGAATAAATATGCCTTAAATGTGATTTAAGAGAGACACAGAAATTAATTA
TTGATAGATACTTAAAAGTCTGAAGAAATAAAGAAAAAATATGATATTTAAATGATATAC
AAAGTATTAAATTCAAAAACATAAGATATTTATTAATTATTTGGACCAATGTGTAGTTTT
TCGATACAATAGTTGTAGCAGCCTTTGTTTTTAAGTTTTCAGCCTCCTTGCTTAAAAATA
ACTCTTGAGTGTTTCCGCCTCTTTCTTTATCAAAACAAAATATATACTTTTAACAACATT
TTATTTCAATAAAAATAAAAGAAAATCAATCATCATAATTTAAGTGGAGAATCATTAGGC
TTACAAAACATGATAAATTAAATAGAAAAAAAAAGCAATAGAATTAATGACAACACATGT
AGCAACTATTCAGGTAAAATATTTAATAGCAGTAACTCTGGTTTACTCAATACAAATATA
GCAACAAATGCTATACAAGTATATGAAGACAATTCAAGAATGCAAGCTATGAGAAAAAGG
TATTATAGCAAATTATTTCTGGGAGAAAACATGAATAAGCTAAGTATCTTGCATGATGCA
GTGAATTAAAAAAAAGATTTACTTTGGTTTATTTGCACTTTTGATTACAATTAATTTGAA
AAAATTTAAAGATTATTAAAACAAAATTCAAAAATAATGTATTCAAAACAAATTTTAACT
TAGTATGGAGAAGTTGTTTTTAAAATCACAGATCTTTTATTAGGAATTGTAGCATTGTAT
AAAAAGCTATAATAGCATTATCCTCACATTATTTAATATGTAGATTCAATAAGATATTAT
TACACTATTCATTATTAGATAGGAGATAAGATAAATAAATAGATTTGA

>TTHERM_00245500(protein)
MGHKSKNFNHQTPIKDQIFVNQNFHIFDLQDNKADDSYSKSLLQHSLINSSREYINLPDS
KSIQSHRNSKEKLMIGSSLPIKYYKFQDQKQDKVQLFSKDVLGSNLQKSPKNQKIEKEQQ
QEIKFQSCYLRNMMPLNSPAIFYKRMKNCKVVRANTPANLEEGSKELQNRSNMQIPILVF
DSSNSQSPQKMQNVYNEQQSFRQCLYQQLGFLKEQKEDFQDVIIKNNEILESEKQGIENQ
DQKYHQHQIFQEVSSQIQFKQLQSTTSAISTTEKSQRTKSANNSYRKQRNINDDGDQLFQ
NLLVINNQKNNNNSDDNQLQNIQQYQNKTFFQDKLIQQTNYLINEQHNFSQKYQQAQQPT
QLSPFQHIQKQKKNQILQRIQNTKKLQQIRYSPQKYQIQAHSDYKKEKVNSDSKKEQFLS
ENKNDQLNSISNENKTDINSSFQNSYYKNHQIQVQQEQKESQEEIKLNLNKIKNELTSSS
SEEEEISPLNVLNQRHLLTPKSVQKNNQIQLFKQKQDNILIYLEDIRKQQDQQLQLIEQS
LTERKNENINKSNQILNFNSFLNLSESHVQQINSDKIKNNLQNHYMLQEQNLNEQKNSST
TDQINKNIRKNSLLSFFRGQISQTTPQRNKGSALNQYENLNENMFKSNYYEFVEQCDLKN
QFQNIQNSIYILKNEEFDGNTSKVNTIHSNGNNDYSHSLTRKYDTQFERQIVRQQKTNQK
IQRIEASNQSSIEKLDTRIYFSSTANSPTRAKNQSALSQLECIKDEPKRSRIIHSSYDKS
RSDVVSQKVCNEVEKNIANIKSRINRINPFLIAKAKEEIPGFISELKQKEFDMENIQGLQ
TERKDRMYSARLRSANQKKQSSSDMKSKQQTKETGKNCIVVIKDRQSYYNQKSASTCSSP
SQKYVWNKLVESKPVEMNLELWNMITRFLSVADLSFTRQVSKSWNKYALNVIQERHRNQL
LIDTQKSEEIKKKYDIQMIYKVLNSKTQDIYQLFGPMCSFSIQQLQQPLFLSFQPPCLKI
TLECFRLFLYQNKIYTFNNILFQQKQKKINHHNLSGESLGLQNMINQIEKKSNRINDNTC
SNYSGKIFNSSNSGLLNTNIATNAIQVYEDNSRMQAMRKRYYSKLFLGENMNKLSILHDA
VNQKKDLLWFICTFDYNQFEKIQRLLKQNSKIMYSKQILTQYGEVVFKITDLLLGIVALY
KKLQQHYPHIIQYVDSIRYYYTIHYQIGDKINKQI