Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00287890

Standard Name

APG11 (Adaptor Protein 1 complex Gamma chain 11)

Aliases

PreTt25920 | 26.m00272 | 3688.m00066

Description

APG11 adaptin amine-terminal region family protein

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Gene Ontology Annotations

Molecular Function

Biological Process

  • axial mesodermal cell differentiation (IEA) | GO:0048321
  • negative regulation of mesodermal cell fate determination (IEA) | GO:0048335

Domains

  • ( PF01602 ) Adaptin N terminal region
  • ( PF01814 ) Hemerythrin HHE cation binding domain
  • ( PF02883 ) Adaptin C-terminal domain
  • ( PF02985 ) HEAT repeat
  • ( TIGR02549 ) CRISPR-associated DxTHG motif protein

Gene Expression Profile

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source Identifier Score
Tetrahymena borealis EI9_09298.1 9.997093137033517e-262
Description: adaptin N-terminal region family protein (895 aa)
DictyBase DDB_G0281957 5.001257666360868e-155
Description: ap1g1 on chromosome: 3 position 5194623 to 5197502
Oxytricha Contig11604.0.g35 1.0001043265246556e-154
Description: Adaptin N terminal region
WormBase WBGene00000158 9.997962730346853e-122
Description: locus:apg-1 status:Partially_confirmed UniProt:Q8WQB3 protein_id:CAD21660.1
Stentor Coeruleus SteCoe_18173 1.4411565509640892e-64
Description: None
SGD YPR029C 1.9990871925214856e-61
Description: APL4 Gamma-adaptin, large subunit of the clathrin-associated protein (AP-1) complex; binds clathrin; involved in vesicle mediated transport

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences 

>TTHERM_00287890(coding)
ATGAGTATTAGCAAGCCAGGAGAGGGAGCTACTAAATAACACCCTTTACATGAGTTTAAA
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ATTTGCACTACAGAAATGTGTAGAGAGTTGATTCCAGATCTTATGAAGCAATTCTAAGTT
GGATCAACTTTTATTAAAAAGAAAGTAGCATTATGTTGTATTAAAATGGTTAAAAAGTTA
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AAAAACTATTTCTATAAGCATATTACTCCTTTGAAAAAAATACTGAAAGCTCTTATTAGT
AATATGAGTGCAGAATTTGATGTAAATGGAGTTAATGACCCATTTTTGTAAATTTCTATT
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ATATTGGGAGAGGTTGCCTCAAATACAAATGGAGATAAAAATAGTGGAAGTGCTGTATTA
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ATTTAAAATGAATGGAAAAATTAAGTTCATTATATCTTTTAAACTAATCCTGAATATTCA
AAAGCTACCTAACAGTTTTCTAAAAAGCCTGTCGATGAGTAAAGCTAAAAAAAGCAAACA
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TCATCTATTTAGGGAGAATAGAATGGTATAGATTTATTAAATGATATAATAGGTGGAACT
TCATACACACCTTCAGCTCAAAATGATAACAAAATATAAAAAAATCTAATTACTGACTTA
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TAAAAAGAGAAAAATAATGAGCAATAACAATCTAAAAACTTAATTGATTTACTCGGTGGA
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GATGACTTTGGAGAAATGCAAGTCAGCTAGCCAGTTTTACCAAAACACATATTTACAGCT
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GAGATCACTATAGAGTATGGAAATAAGACTCCATTTATTATAAATGAACTTTAGTTCTAA
GTAGCTGTTCAAAAGCATAATAAACTAACAATGAATCCTATATCATCTACCCAGATACCT
CCTAATTCCTCAAGTGAAACAGTTTAAGTAATGAGTGTTGTTAATACAATGGCAGGGCAA
AAAAGCATAGCTATGAAGGTCCGTCTTCAATATAATATAAATGGAAAGCCAGTAGCACTA
GACAGTCTTGTATAAGATTTCCCCAAGGGATGGTGA


>TTHERM_00287890(gene)
ATGAGTATTAGCAAGCCAGGAGAGGGAGCTACTAAATAACACCCTTTACATGAGTTTAAA
GATATTATAAAGCAAGTGAGGGAATGTAAAACAGCTGCATAGGAAAGAGAGTTAATCAAT
AAGGAAAAAGCTCTAATTAGAGAAAGATTCCTGGTATGATTACAATCATATTAAATTTAA
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TAAAATTATTTTTTATATCCAAAGCTAATTTAGCTTATCTAATATGTTATTCGATTATTT
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TTCAAATTATGGAAATAAAAGAATTGGGTACTTAGGTCTCTGTTAACTTTTCCATGAACA
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TTTTTATAATAATTCTTAATGCAAAAAAAAACATTAAAACAATAGAATTATGACTAAATT
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AGTTGATTCCAGATCTTATGAAGCAATTCTAAGTTGGATCAACTTTTATTAAAAAGAAAG
TAGCATTATGTTGTATTAAAATGGTTAAAAAGTTACCTGAAGCAACTTCCGATATAGTAT
AATAAATAGATAGCTTGATGGAGGATAAGCATCATGGTAAACTATATTTCTTAAAATTTA
GTTTTTGGCATTCTTTCTAAAATAAGATATTAATAAACATTTACAAAAATTAAATAAAAT
TATTGATTTCAAATTAAAATTTGTAGCATTTTTTTAAAGCATTCACAAATAAGTTGAAAA
TTCAATAATATCATTTTATAGAAATATAATGCAATTATTTTATTAAAATCAAAATTTTTT
AAATAAAATTTGAAATAATTAAATGTATTTATTTAATAGCTGATTATAAGAAGTTTAATC
TATTTTTGATATAATTTATTATGAAATAATCTTAATGCAAATAAAAAAAATACTTTTTTA
TTTTAAAAACTTTATTAAATCTAAAAGAATTTGGTGAAAGAAGAAAATTATTTTAATTGA
TTTTGGAATAAATTTTACAATATTTAAAAATTTTGTCTAATTTTTATTTATTATATAATA
TTATTCTTATAAATTATTTGAAAAACTTATTAGGTGTGCTATTAAGTACTGTCTCTTTAA
TGAAATCTTTAGTTGTTTTAAACGAAGAAAATAAAAACTATTTCTATAAGCATATTACTC
CTTTGAAAAAAATACTGAAAGCTCTTATTAGTAATATGAGTGCAGAATTTGATGTAAATG
GAGTTAATGACCCATTTTTGTAAATTTCTATTTTAGAATTCTTCAGAATGATGGCTTAAG
GAAAGCAACACGTAGCAGATGAAATTAGTGGTATATTGGGAGAGGTAAATTTAAAATGGT
TTTACTTTAGAAAACTTTTTTATCATTTTCAATTTTAATTGAGATTATTTTTAAAAAATA
CATTTTTGAAATAAAAAACTTTTACAATTTAAATTTACAACAATTATTTTTTAACAAAAA
AGGTTGCCTCAAATACAAATGGAGATAAAAATAGTGGAAGTGCTGTATTATATGAATGTG
TAAAGACAGTTATGGAGATAGGCAGTACTAGCTCGTTAAAAATATTATGCATAAATGTAT
TGGGAAAGTTCTTAAAAAACGCAGAACCAAACATTAAATATGTTTCTCTCTTTATGCTAT
AGAAAGTTTTGAATTACGATCTAAAAACTGTTTAGAAATATATGTAAACAATTATTTAAT
GCTTAAAGGAAGAAGATATTTCAATTAAGCAACTTGCATTAGATTTGATTTTTATGGTCT
CTTCAAGTGAGAATGTAGAGAGTATTATTAAAGAATTACTGAATCATATGATGGATCCTG
AACAACTAATTTTCTTACCAGAACTAGTTTTAAAGGTTAGAATTATTTTTGAAAGCAGCC
TAAATTTTTACAAAAAAACACTTGTTTTTCTATCTTTTTTTACTTAAAATAGAAAATATC
TTGTTTATTACTTAATTAATTTTCAGAATCGAATTATTTTTAAGTAAAATATTAAATATT
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GCAAATTGATACTGTAAGCTATAACTAAAAAATTTTTAATTATTTTCTAAAATTAATTAC
AATAATAAATAGATCATCAAAGTGCTCAGTTTAGCTGGTAGCTACGCCAAAGAAGATACT
ACTAACAATTTAATTAATCTAATATCTGTTTCTCCTAGTTTGTAATAGTATGCTGTATAA
AAATTATATTTTGCACTTAAACAGAAAATTGATTAGTCAGGCTTGGCAGTTGTCTCTTTA
TACTGTTTTGGTGAGTATGGCCATAAATTAGTAACAGCCACTCAAGGCTCAGAAGACTCA
ATTAGTGAAAAAGATGTATATGACCTTATCTCTAAAGTTTTTGAAAAGTATGTTGAAAAT
GATGACGTAAAAGAATATGGCATGAACTGCTTAATGAAATTATTCTATAAGTTCACTAGT
TTAACTTTAGAAAATTATGTAAACATTTTAAACCCATTAACTACATCAACAACCCCAGAA
GTTCAGAAGAGAGCCTGTGAATATTTGCATATAATTTAAAATGAATGGAAAAATTAAGTT
CATTATATCTTTTAAACTAATCCTGAATATTCAAAAGCTACCTAACAGTTTTCTAAGTAA
TATTTAGATTTAATTTATTTACACTATTATTTCCTCTGAAATTTTAATTCAATTTTCCTT
ATTTTGAAATATCTATCTGATATTTAACTCATTAATTTATTCAAGTGCTTAAGCAAAATA
TCTATGACTTTTTAAAAAGGAGTAAATAAACAAAAAAAATAATTTAAATTTATAAATAAA
TTTTTTTTGTTATCTATTCTACTTTAATTAAAACTGAGTTTGATAGAACATTTTTTATTT
TGTTATATTTCTTACAAAAAGATATTTAATGATTTGAAATATATCGAATATTAAATTACG
TATTTATTTAATAGAAAGCCTGTCGATGAGTAAAGCTAAAAAAAGCAAACAAATTTATTG
GAAGATGATGAAATTCCTCAAACTCCAGTAAGTTAAGCACAAACTGCTTAACAAAATATC
TTAGACGATTTGATTGGAGGTACTAGTACAGCTAATAATGTGCCAACAACTTCATCTATT
TAGGGAGAATAGAATGGTATAGATTTATTAAATGATATAATAGGTGGAACTTCATACACA
CCTTCAGCTCAAAATGATAACAAAATATAAAAAAATCTAATTACTGACTTACTTGATGAT
TTACCTTCCCAAAGCTAGAACTAATAAATTTCTTAAAGTAATACACAGGCTTAAAAAGAG
AAAAATAATGAGCAATAACAATCTAAAAACTTAATTGATTTACTCGGTGGAGACGAAGAA
ATAACAACTACTCCCATCTCTAATCAAAAAATAACCTCAAACAATAATTTTGATGACTTT
GGAGAAATGCAAGTCAGCTAGCCAGTTTTACCAAAACACATATTTACAGCTATCGAAGAT
GCAACTATTAAGATTGTTTTTAAATGCACTAAGGTAAAATCTTAAAAATATTTTGAATAG
ACTCTAGTTTTTAACAGATTTTAATTACTTAATCTCCTCACTTAATTACTTATTTTAGCA
TTCTATATTAACCTCATCAAATTAAATAAACCTAACCCTAAAGTAGTTCTAGTGATTTTT
AATTTTAGGGGTATTTCACAAATTATCCTCTTATTTCTTATTATATTGTTACATACAATT
TAATTAGAAATACTTCATATTGAATACTTAGTACTTTATTTTCTTTTATATAAAAAACTA
TTTCTGCCCTAATACAAATCAATTAAAATAATTAGTCGGAAATTTTATCTAAAAAATATT
TTAAATTTTTATAATTTGATCTTCTGATTTTTTATTGTTAATATTCTATATTTTAAAATA
AAGCAATCTGCAGATACTGTTGAGATCACTATAGAGTATGGAAATAAGACTCCATTTATT
ATAAATGAACTTTAGTTCTAAGTAGCTGTTCAAAAGCATAATAAACTAACAATGAATCCT
ATATCATCTACCCAGATACCTCCTAATTCCTCAAGTGAAACAGTTTAAGTAAGGATTTAA
ATAATCATAAATTTTTTATATATTAATTGCAACAAAAAAATCTCTATTACTAAAATATTC
TCTTTACCAAATTTGATTAAAAATACAATCAAATTTATCAGCTTTGACTTATCCATTTAC
TTTGTTCTGTAACCAAATTATGAATTAATTTATTTGAGTGATTGAGATGTATTTTATAAA
ACTATAAGAATCTTTCGTATTAATATCCACGAAAATAAAATCCAAGAATGTTAATTAAAG
CAATTTATAACCACAAATTAAATTAAATATCAATGTTTCTTTGAGAAAAGCTAATTTAAA
ACTAAAATGTATGCCCATCAAAATTGCTTAATAAAGGAAAAAATTTATCAAATGTTAAAA
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TTTAAATGTATTAATTTTTTTTTGAATTTTATCAGCAAAGAAATTGCTAGTTACTTGGAA
ATTTATTCTTACTAAACTAAATATATTTTAACAGAAATAACTAAAAATATAACAAATTTT
TTATAAAAAATAATAACAATATAGGTAATGAGTGTTGTTAATACAATGGCAGGGCAAAAA
AGCATAGCTATGAAGGTCCGTCTTCAATATAATATAAATGGAAAGCCAGTATACATTCTC
ATTTTTATTTTTTAGATTACTAAAATATTAAAATAATAATTTAAAGGTAGCACTAGACAG
TCTTGTATAAGATTTCCCCAAGGGATGGTGA


>TTHERM_00287890(protein)
MSISKPGEGATKQHPLHEFKDIIKQVRECKTAAQERELINKEKALIRERFLQNKEETRAK
DVAKLLYISMLGHNTDFGQMECLKLITSSNYGNKRIGYLGLCQLFHEHSEILMLATNRIH
IDLNHTNNYVISLAIVALNEICTTEMCRELIPDLMKQFQVGSTFIKKKVALCCIKMVKKL
PEATSDIVQQIDSLMEDKHHGVLLSTVSLMKSLVVLNEENKNYFYKHITPLKKILKALIS
NMSAEFDVNGVNDPFLQISILEFFRMMAQGKQHVADEISGILGEVASNTNGDKNSGSAVL
YECVKTVMEIGSTSSLKILCINVLGKFLKNAEPNIKYVSLFMLQKVLNYDLKTVQKYMQT
IIQCLKEEDISIKQLALDLIFMVSSSENVESIIKELLNHMMDPEQLIFLPELVLKTCMII
DSHAPNRRWQIDTIIKVLSLAGSYAKEDTTNNLINLISVSPSLQQYAVQKLYFALKQKID
QSGLAVVSLYCFGEYGHKLVTATQGSEDSISEKDVYDLISKVFEKYVENDDVKEYGMNCL
MKLFYKFTSLTLENYVNILNPLTTSTTPEVQKRACEYLHIIQNEWKNQVHYIFQTNPEYS
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SSIQGEQNGIDLLNDIIGGTSYTPSAQNDNKIQKNLITDLLDDLPSQSQNQQISQSNTQA
QKEKNNEQQQSKNLIDLLGGDEEITTTPISNQKITSNNNFDDFGEMQVSQPVLPKHIFTA
IEDATIKIVFKCTKQSADTVEITIEYGNKTPFIINELQFQVAVQKHNKLTMNPISSTQIP
PNSSSETVQVMSVVNTMAGQKSIAMKVRLQYNINGKPVALDSLVQDFPKGW