Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00329960

Standard Name

NPC3 (NePhroCystin-3 ortholog)

Aliases

PreTt30301 | 33.m00313 | 3705.m00139

Description

NPC3 tetratricopeptide repeat protein; TPR Domain containing protein; E3 ubiquitin ligase

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External Links

Gene Ontology Annotations

Molecular Function

Domains

  • ( PF00097 ) zinc finger, C3HC4 type (RING
  • ( PF00515 ) tetratricopeptide repeat
  • ( PF00628 ) PHD-finger
  • ( PF01535 ) PPR repeat
  • ( PF06696 ) Streptococcal surface antigen repeat
  • ( PF07719 ) tetratricopeptide repeat
  • ( PF07720 ) Tetratricopeptide repeat
  • ( PF07721 ) Tetratricopeptide repeat
  • ( PF08238 ) Sel1 repeat
  • ( PF08385 ) Dynein heavy chain, N-terminal region
  • ( PF08393 ) Dynein heavy chain, N-terminal region
  • ( PF08908 ) Domain of unknown function (DUF1852)
  • ( PF08946 ) Osmosensory transporter coiled coil
  • ( TIGR00073 ) hydrogenase accessory protein HypB
  • ( TIGR00181 ) oligoendopeptidase F
  • ( TIGR02521 ) type IV pilus biogenesis/stability protein

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source Identifier Score
Tetrahymena borealis EI9_08525.1 9.997093137033517e-262
Description: TPR Domain containing protein (1227 aa)
Stentor Coeruleus SteCoe_4411 6.47023492564546e-26
Description: None
DictyBase DDB_G0292714 1.0004572433669413e-23
Description: DDB_G0292714 on chromosome: 6 position 1780390 to 1784905
WormBase WBGene00002215 1.000361553249356e-16
Description: locus:klc-2 Kinesin light chain status:Confirmed UniProt:P46822 protein_id:CCD65112.1
Oxytricha Contig13558.0.g11 0.00000000000003999587784428659
Description: Tetratricopeptide repeat
SGD YOL013C 0.000009999254677478949
Description: HRD1 Ubiquitin-protein ligase required for endoplasmic reticulum-associated degradation (ERAD) of misfolded proteins; genetically linked to the unfolded protein response (UPR); regulated through association with Hrd3p; contains an H2 ring finger

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences 

>TTHERM_00329960(coding)
ATGAGCAACGATAAAATTCTACTTCCTATCTTCTCTAGAGCAAAGACATAGTTTTAAGAA
AAATAAATAGATTAAGAATTTAGTATTTGCAATAAACAAATCAATGAAAATCTCTCACCA
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GTACTTCCTTGTAGCCACTTTTATCATACGTTCTGCATAGACAAATGGTTACTTGCTAAA
TAATCTTGTCCTAATTGCAGGTAGTGTCCTATTGTAAATTATTAACAAGATAACTAAGAT
AAAATCGAATGA


>TTHERM_00329960(gene)
ATGAGCAACGATAAAATTCTACTTCCTATCTTCTCTAGAGCAAAGACATAGTTTTAAGAA
AAATAAATAGATTAAGAATTTAGTATTTGCAATAAACAAATCAATGAAAATCTCTCACCA
CAAATAACTAAAATATATAAAACAAATAACGAAATAAAAAGCCTTCTTGACTAAGGAAAC
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ATTTATTTGTTTTTTTACTTAGAGTTTTACCAAAAAAAGAATTGAAACATATTTAAAAAA
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TGAGTGTCTAGACTCAAAAGCTAACTTGTTAAGATCTCTAGGAAAACTTGAAGAGTCTTT
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TTATTTGAATATGATTAATCTATTGAACTCAATTAACAAGCGCTAAAAATTTGGTAAAGA
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CAAAAATCCTTAGTTATAAAGTAAAAAATTTTAGGTCATGATCACTTAGATGTAGCAACC
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TTACAGCTACAAATAGAGGTAAACAAAAAATTATTTTAATCTAATGATTTTTCATTTAAA
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TATATGATAGTGGCAAATATGAGCAAGCTATTGTTTATTACCAAGATGAACTAGCTTTGA
TGAGAAAAGTTGAACCTGAAAACCAAGCTAGAGCAGCTACAACACTAAATAATATTGCAT
GTACTTTGCATAACCTGAAGAGATTAAGTGAATCTTTTGAATATCATAATTAAGCATTAA
AGATCCGTAGAGAAAATTTAGGAGAAACTCATCCTGAAACAGTTTCGTCTTTAAATAATA
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TGCTTTAAATTCGTATTCAATAATAAGAGTGTAAAATAAAAATAGCAACAGCCTATGATA
ATGTTGGTTCCACTTATTTCTCTCTCCTCGAATTTGAGAAAGCTCTTGAGCATTTTGAGT
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ACTAAGATAAAATCGAATGA


>TTHERM_00329960(protein)
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ILGKINHPQIISSQENIALVQNELGKFQESYSLIQEVVKNRESLYTSDICPNSHPQIADA
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NLALAQYNRENYEESFKNYQKAHDIKVKIYSNDHIFIPSAKNNIAVALYKQGKTEQSKFF
LNQSLQIISNFENDDKNNKDVDPYLLCSTLNHLAWALTEMEQPEKALQYYKKTEQKMKQL
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YSKQQKHTKALEYHMKSLQIRKQKSKTMKEDIANSYDHVASTYYDLQKYKEALEYYLQEL
KIRKQLNQKGIQLASLLNNIAITYKNLENLDRSLKYHQKTLRLRESYLPFEHQEILSSIS
NIASILYDQEKYTEAIEFYKKELLLKEKLHTPQCAKVAVTLNNIGCSYKNINNLDEAVNY
HRKALELRKKILKENDDDIISSIESISSTLYDMQRFQEGLESYYEELQLKIKKFGEDNLK
VATTYNNIACTLKNLGQIAEALKMHQKSLVIKQKILGHDHLDVATSLDNIASIIYDQNDF
QYALEMYKKVLGIRRKCYQTNNLQIAVTLHNLACTYHNLKDYESALQLQIEVLEMRKQIQ
GPESKDIITSLDNIASNLYDSGKYEQAIVYYQDELALMRKVEPENQARAATTLNNIACTL
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ARQMIQKIEPIRNLPITKYTGKNSQENNDKNNQESIVKGEDEEEICNICLENLNNNQELR
VLPCSHFYHTFCIDKWLLAKQSCPNCRQCPIVNYQQDNQDKIE