Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00347990

Standard Name

RAB11C (RAB GTPase 11C)

Aliases

PreTt05211 | 36.m00175 | 3703.m00008

Description

RAB11C Ras family protein; Rab II family protein; small monomeric GTPase that regulates membrane fusion and fission events

Genome Browser (Macronucleus)

Full Screen View

No Genome Browser Data Present

Genome Browser (Micronucleus)

Full Screen View

No Genome Browser Data Present

External Links

• Uniprot
• Alphafold

Gene Ontology Annotations

Cellular Component

• intracellular anatomical structure (IEA) | GO:0005622

Molecular Function

• GTP binding (IEA) | GO:0005525

Biological Process

• small GTPase-mediated signal transduction (IEA) | GO:0007264

Domains

• ( PF00025 ) ADP-ribosylation factor family
• ( PF00027 ) cyclic nucleotide-binding domain
• ( PF00071 ) Ras family
• ( PF01926 ) GTPase of unknown function
• ( PF08477 ) Miro-like protein
• ( TIGR00231 ) small GTP-binding protein domain

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

No results were calculated for this gene in GeneMania.

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source	Identifier	Score
Tetrahymena borealis	EI9_09718.1	9.997217559668329e-127
	Description: hypothetical protein (851 aa)

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

1. Ref:16933976: Eisen JA, Coyne RS, Wu M, Wu D, Thiagarajan M, Wortman JR, Badger JH, Ren Q, Amedeo P, Jones KM, Tallon LJ, Delcher AL, Salzberg SL, Silva JC, Haas BJ, Majoros WH, Farzad M, Carlton JM, Smith RK, Garg J, Pearlman RE, Karrer KM, Sun L, Manning G, Elde NC, Turkewitz AP, Asai DJ, Wilkes DE, Wang Y, Cai H, Collins K, Stewart BA, Lee SR, Wilamowska K, Weinberg Z, Ruzzo WL, Wloga D, Gaertig J, Frankel J, Tsao CC, Gorovsky MA, Keeling PJ, Waller RF, Patron NJ, Cherry JM, Stover NA,

Sequences

>TTHERM_00347990(coding)
ATGAGTAATGTGAAAATATCTTCAATAAATGAAAATTAAAATATACAAATGAAGCTTGCA
GGGCTAAAAGATTTGCTTAAAACATAAGTAGAAAATAGAAACTAAGAGTAGATCAGCAAA
ATTTCTAGCATTATTAAATAATTATCTGTTCTTCCGAACTACTTTTCATCTTAAAATGTA
TTGGGATACTAAATAGGCAATTATCAAGATAAAATAGATTATTTTATAGCTTCATAGCTA
GAATACTTGGTATTCGATTCAAATATTGACATTCAAAATAAAATAAGAGACGATAAAGGG
ATTTGCCTTTTACTATCTGGAAAAATAACGCTTGAAAAGATTATATAAAATGAAAATATT
CAAAATAAAAGTATTGATAAAAGTATAGTAGTATTAAAAGAGTTTAAAAAGGGTAGCTTT
TTCAGCTTTTACGATATTCAGTATTAAGTAGAAGGTTCAAAAATTACAATTTCAGGTCAA
AACGATTTAATGAATGTCCTGGGAGAAAGTGAATAGAAACAAAAATTTGACAATATAGAA
GTTGGCTATTTAAATTTATAGTTGTAGAAAGAGATAAAAAGTTAATTACAAACAGCAAAT
TATAAATCATCTATATTTAATTATTATGATAGCATTATAAAGAAAGAAATATCATTAATG
AAATTAAATTATGGTTTTACACAATATCTCTCAGAGATCTAGATAGGATAAATTCTTTTT
CATTCTTAAATTAGAAATTTTTCAAATAAAGAACCTGTGTTTCTAAATAAAGAAGAATCT
AATTATGTCTATATTGTTAGAAAAGGAAGTTTTTAAGTTTTTTGGAGAGACTATTCTATA
AATTAGTAAAGATAATCTATATTCTTTTCAAACTTAGACTAAGAAAATTCCCTGCTTAGA
AGATGGTCTTTGAGAGTTTATGAATCTAAGGAAATATTTGGTGAAGATGATATTATTTTT
AATTGCAGATAAAGATGCTTTGATGTTATATGTAATAGTGTGTCAGGCCAACTTATAACA
ATACAAAAAAACTATTTTCTTTATTGCTTATATCCTATGCTGAAGAATTACTTTAATGTT
TTGGTTGAGGATAAAGAAAAGCTCATTAATGAAAGAATTAATTAAATTAGAAATTAATAA
GGCAAAAACTTTACTATTGTCTCTCCATCTTTATAATCTACACAACCCATATCAAGAGAA
TGTAAGGAAATTTCCTTAGAAGATAGCTATAATAGTGTGCAGTTTATATAAAAGTAGTAA
TCATTATCATCTCCTTCTGTTTCTCCTGATAATTTTTGTACTAATGTTAGTTAAAAAGAA
AAAAAAGATGCTTTAATATTACAATAAGGACTCTCAAGTCAGCTCACTCAACAAAATTCA
AAATAAGAAAGCTAAAAAAGCAATTTAGAACATAAAAATTCAAATAAAATGCTTTTTTAG
TTTATTTTAAATAAATCAAATTATGCTCAAAATTAACCATAATAAATGAACAAAAAAATT
AATAACAGTATTTAAGCAAGATTAAATACAAAAAGATATGATAATATAGGTAATGTAAAC
AGGTTAGAACAAAATATTATAGAAAATAAATAAATAGAAGTTAGCTAAAGCAATAATTTA
AATTAAAAAGTTTAAAAGTTATTACAATAAAATTTAACAAATTCTTTATCCTTTACTTAA
AAGGAGGAGTTTGAATAATCATTTTAAAACTCCCTTAACAAATTAATTGAATATCAAGTC
TCTTAAACTTTTTCTTCTCGCTCAATAAAAAATAACAGTCATACATTCAACAACCCTAAA
TCAGAAACAGCTATTGGAATAAAAAAGAGATAAAAAAATTTAATTTCTGAACCCTCTTTT
TCGTTTTAGTAGATATCACCTTCACTTAAAGACTCGAATTCATTAATAGCTAAACAAAAA
AAATTAAAAACTAATAATTTTTAGTATTCTTAATCGCCAAACAAAAATTCTTTACAAAAC
TTTTCAGAGATTAATTTTCCTTAAACTTCAGAGAGAAGAACAATAAAAAAAAATAATAGT
TAAAATGCAGTTTTAAAGAGATAAGCAAACAGAGTTAGCCCGATTTAATCGGACAAAGCA
ATAGTCTTAAAAAGTAGCAGCGAAAGTGCAAGTTAAGGAACTAATAATTCTGAAGGAGTT
TGTATTTTGCAGGCTCTCCAAGCATCAAATAGTGCAAATTTAACTAACACTAATAATAGT
CATAGTACATAAAATAATAAAAGTATAAATTAAAAATTAATTTTAAACAGCAACAATAGC
AGTAGTATTTCAGTTTAAAGTGCAAAAATATCTAATGGCATATATTTGAATTAAAGCTCA
GGAGTCATTTAAGAAGAAAATTAATAAACTTTTTAAAAATTTCATAGCTTTAAATAAGAA
ATGCTTGAAAAGCTAAAGGAAAATCACAATTTAAAATCTAAAAAAGAAATTTTATCTAAA
AGTTTATCTTAAAAATAGCAATAATAATAGTAGACATAATCTCTTTCATGCTATAGCAAT
ATGATATACAGTAAAATCAAAGAAAAAGATAGCATAAGAAAAAATTTGAAAAAGGAATAT
TCTGTTTTAAATAAAAAGGGTAATATTAATGCGCTCTCACAATATTCTTTTAAACTTGGA
AATTATAAAATTAAAAGTGAGCTATTGTCAAACTCTTTTGAAAACTTAAAATAAATATCT
ACTTCAAACCAAGAAAAAATAAATAAGTTAAGAAGAAAGTTTTCTGGAGAAGAAAATATG
AATAGTAATAAACCAAAATATTTATTTACTCCTTCAAGCGTTTCTCATAGTAAATTTAGT
AAAAAAAGTAAAGGTTAATAGCTTTTAGAAAAAATAGTAGGAGGAAGCTAGTTAAACAAC
AAGTTAGAATATTAAAATTTATTTTTGAATTCTCCACTTTAATAAGATGTTAAAAGTTTA
CTTGAAAAATAGTAGTCATAAATGTTTGGAATAGACAAAATTCTAACTGAGCAGAGCTAA
AAACCTTCTATTACTTAAAGGGCTACCTAGTATATTACTAATGAATTGAAATTTTTTAAC
AATGATACTTAAAACAGCTCGCAAGCTCACATTTAAACTGATACTTCCCCTTAAACACAG
GATCGTCTTAAATAAATTAATGAAACACCATAAACAGCTTCAAAAACTCCAATAAATACG
AATCTTGATAAAGAATCAGATAAAACAGCAAAAAGCAATTAAAATAACTCTTAAAAGTTC
AACAATATACATTCGAACTAGTAGTCTTCTAGTTATCATTTACTCTAACAAATCACTAAA
TATCAACATTTTAACTAAAATATAAAATAAATTAATAATAAAAATTTTGGAAAATTAAAG
TAGCTAATTAGTTAAAGCTTTGCTACTCCAAAATGCAAGAATATATCTTCTTAAAAAATT
TAATAAACATGTATCGGAGAAACGCCTAAAAATCTTAGTATATAAAATGATTAAAGTATA
ACTTAACAGCAATAAAATTGA

>TTHERM_00347990(gene)
ATGAGTAATGTGAAAATATCTTCAATAAATGAAAATTAAAATATACAAATGAAGCTTGCA
GGGGTAAGATCTTTTCAATATGGCTAATTCAGCATTTTTTTTATAAATGTCAATTCTTTA
TACAGTTTATACTTATTTTTTGTTTTTTAGCTAAAAGATTTGCTTAAAACATAAGTAGAA
AATAGAAACTAAGAGTAGATCAGCAAAATTTCTAGCATTATTAAATAATTATCTGTTCTT
CCGAACTACTTTTCATCTTAAAATGTATTGGGATACTAAATAGGCAATTATCAAGATAAA
ATAGATTATTTTATAGCTTCATAGCTAGAATACTTGGTATTCGATTCAAATATTGACATT
CAAAATAAAAGTATTTCGATAGCAATATTTCTTTTCTTTAATTAAATATGGATTTTTTTA
AAAATATTTCAAAATATAAACCTAAGACACTAAATTTTTTTTTCTTTGTATTAGTAAGAG
ACGATAAAGGGATTTGCCTTTTACTATCTGGAAAAATAACGCTTGAAAAGATTATATAAA
ATGAAAATATTCAAAATAAAAGTATTGATAAAAGTATAGTAGTATTAAAAGAGTTTAAAA
AGGGTAGCTTTTTCAGCTTTTACGATATTCAGTATTAAGTAGAAGGTTCAAAAATTACAA
TTTCAGGTCAAAACGATTTAATGAATGTCCTGGGAGAAAGTGAATAGAAACAAAAATTTG
ACAATATAGAAGTTGGCTATTTAAATTTATAGTTGTAGAAAGAGATAAAAAGTTAATTAC
AAACAGCAAATTATAAATCATCTATATTTAATTATTATGATAGCATTATAAAGAAAGAAA
TATCATTAATGAAATTAAATTATGGTTTTACACAATATCTCTCAGAGATCTAGATAGGAT
AAATTCTTTTTCATTCTTAAATTAGAAATTTTTCAAATAAAGAACCTGTGTTTCTAAATA
AAGAAGAATCTAATTATGTCTATATTGTTAGAAAAGGAAGTTTTTAAGTAATTAATTATT
TTTTAGAGTCGTTTTACTTGTATTAAAAATAATCTATTATAATAATTCTATGATTTAAAT
ATTTGTTAGATCTAATTTATTTTTTAAATTTTAATTTTTAAAAAATATTTTAAAATATAA
ATAAAATTATAGGTTTTTTGGAGAGACTATTCTATAAATTAGTAAAGATAATCTATATTC
TTTTCAAACTTAGACTAAGAAAATTCCCTGCTTAGAAGATGGTCTTTGAGAGTTTATGAA
TCTAAGGAAATATTTGGTGAAGATGATATTATTTTTAATTGCAGATAAAGATGCTTTGAT
GTTATATGTAATAGTGTGTCAGGCCAACTTATAACAATACAAAAAAACTATTTTCTTTAT
TGCTTATATCCTATGCTGAAGAATTACTTTAATGTTTTGGTTGAGGATAAAGAAAAGCTC
ATTAATGAAAGAATTAATTAAATTAGAAATTAATAAGGCAAAAACTTTACTATTGTCTCT
CCATCTTTATAATCTACACAACCCATATCAAGAGAATGTAAGGAAATTTCCTTAGAAGAT
AGCTATAATAGTGTGCAGTTTATATAAAAGTAGTAATCATTATCATCTCCTTCTGTTTCT
CCTGATAATTTTTGTACTAATGTTAGTTAAAAAGAAAAAAAAGATGCTTTAATATTACAA
TAAGGACTCTCAAGTCAGCTCACTCAACAAAATTCAAAATAAGAAAGCTAAAAAAGCAAT
TTAGAACATAAAAATTCAAATAAAATGCTTTTTTAGTTTATTTTAAATAAATCAAATTAT
GCTCAAAATTAACCATAATAAATGAACAAAAAAATTAATAACAGTATTTAAGCAAGATTA
AATACAAAAAGATATGATAATATAGGTAATGTAAACAGGTTAGAACAAAATATTATAGAA
AATAAATAAATAGAAGTTAGCTAAAGCAATAATTTAAATTAAAAAGTTTAAAAGTTATTA
CAATAAAATTTAACAAATTCTTTATCCTTTACTTAAAAGGAGGAGTTTGAATAATCATTT
TAAAACTCCCTTAACAAATTAATTGAATATCAAGTCTCTTAAACTTTTTCTTCTCGCTCA
ATAAAAAATAACAGTCATACATTCAACAACCCTAAATCAGAAACAGCTATTGGAATAAAA
AAGAGATAAAAAAATTTAATTTCTGAACCCTCTTTTTCGTTTTAGTAGATATCACCTTCA
CTTAAAGACTCGAATTCATTAATAGCTAAACAAAAAAAATTAAAAACTAATAATTTTTAG
TATTCTTAATCGCCAAACAAAAATTCTTTACAAAACTTTTCAGAGATTAATTTTCCTTAA
ACTTCAGAGAGAAGAACAATAAAAAAAAATAATAGTTAAAATGCAGTTTTAAAGAGATAA
GCAAACAGAGTTAGCCCGATTTAATCGGACAAAGCAATAGTCTTAAAAAGTAGCAGCGAA
AGTGCAAGTTAAGGAACTAATAATTCTGAAGGAGTTTGTATTTTGCAGGCTCTCCAAGCA
TCAAATAGTGCAAATTTAACTAACACTAATAATAGTCATAGTACATAAAATAATAAAAGT
ATAAATTAAAAATTAATTTTAAACAGCAACAATAGCAGTAGTATTTCAGTTTAAAGTGCA
AAAATATCTAATGGCATATATTTGAATTAAAGCTCAGGAGTCATTTAAGAAGAAAATTAA
TAAACTTTTTAAAAATTTCATAGCTTTAAATAAGAAATGCTTGAAAAGCTAAAGGAAAAT
CACAATTTAAAATCTAAAAAAGAAATTTTATCTAAAAGTTTATCTTAAAAATAGCAATAA
TAATAGTAGACATAATCTCTTTCATGCTATAGCAATATGATATACAGTAAAATCAAAGAA
AAAGATAGCATAAGAAAAAATTTGAAAAAGGAATATTCTGTTTTAAATAAAAAGGGTAAT
ATTAATGCGCTCTCACAATATTCTTTTAAACTTGGAAATTATAAAATTAAAAGTGAGCTA
TTGTCAAACTCTTTTGAAAACTTAAAATAAATATCTACTTCAAACCAAGAAAAAATAAAT
AAGTTAAGAAGAAAGTTTTCTGGAGAAGAAAATATGAATAGTAATAAACCAAAATATTTA
TTTACTCCTTCAAGCGTTTCTCATAGTAAATTTAGTAAAAAAAGTAAAGGTTAATAGCTT
TTAGAAAAAATAGTAGGAGGAAGCTAGTTAAACAACAAGTTAGAATATTAAAATTTATTT
TTGAATTCTCCACTTTAATAAGATGTTAAAAGTTTACTTGAAAAATAGTAGTCATAAATG
TTTGGAATAGACAAAATTCTAACTGAGCAGAGCTAAAAACCTTCTATTACTTAAAGGGCT
ACCTAGTATATTACTAATGAATTGAAATTTTTTAACAATGATACTTAAAACAGCTCGCAA
GCTCACATTTAAACTGATACTTCCCCTTAAACACAGGATCGTCTTAAATAAATTAATGAA
ACACCATAAACAGCTTCAAAAACTCCAATAAATACGAATCTTGATAAAGAATCAGATAAA
ACAGCAAAAAGCAATTAAAATAACTCTTAAAAGTTCAACAATATACATTCGAACTAGTAG
TCTTCTAGTTATCATTTACTCTAACAAATCACTAAATATCAACATTTTAACTAAAATATA
AAATAAATTAATAATAAAAATTTTGGAAAATTAAAGTAGCTAATTAGTTAAAGCTTTGCT
ACTCCAAAATGCAAGAATATATCTTCTTAAAAAATTTAATAAACATGTATCGGAGAAACG
CCTAAAAATCTTAGTATATAAAATGATTAAAGTATAACTTAACAGCAATAAAATTGA

>TTHERM_00347990(protein)
MSNVKISSINENQNIQMKLAGLKDLLKTQVENRNQEQISKISSIIKQLSVLPNYFSSQNV
LGYQIGNYQDKIDYFIASQLEYLVFDSNIDIQNKIRDDKGICLLLSGKITLEKIIQNENI
QNKSIDKSIVVLKEFKKGSFFSFYDIQYQVEGSKITISGQNDLMNVLGESEQKQKFDNIE
VGYLNLQLQKEIKSQLQTANYKSSIFNYYDSIIKKEISLMKLNYGFTQYLSEIQIGQILF
HSQIRNFSNKEPVFLNKEESNYVYIVRKGSFQVFWRDYSINQQRQSIFFSNLDQENSLLR
RWSLRVYESKEIFGEDDIIFNCRQRCFDVICNSVSGQLITIQKNYFLYCLYPMLKNYFNV
LVEDKEKLINERINQIRNQQGKNFTIVSPSLQSTQPISRECKEISLEDSYNSVQFIQKQQ
SLSSPSVSPDNFCTNVSQKEKKDALILQQGLSSQLTQQNSKQESQKSNLEHKNSNKMLFQ
FILNKSNYAQNQPQQMNKKINNSIQARLNTKRYDNIGNVNRLEQNIIENKQIEVSQSNNL
NQKVQKLLQQNLTNSLSFTQKEEFEQSFQNSLNKLIEYQVSQTFSSRSIKNNSHTFNNPK
SETAIGIKKRQKNLISEPSFSFQQISPSLKDSNSLIAKQKKLKTNNFQYSQSPNKNSLQN
FSEINFPQTSERRTIKKNNSQNAVLKRQANRVSPIQSDKAIVLKSSSESASQGTNNSEGV
CILQALQASNSANLTNTNNSHSTQNNKSINQKLILNSNNSSSISVQSAKISNGIYLNQSS
GVIQEENQQTFQKFHSFKQEMLEKLKENHNLKSKKEILSKSLSQKQQQQQQTQSLSCYSN
MIYSKIKEKDSIRKNLKKEYSVLNKKGNINALSQYSFKLGNYKIKSELLSNSFENLKQIS
TSNQEKINKLRRKFSGEENMNSNKPKYLFTPSSVSHSKFSKKSKGQQLLEKIVGGSQLNN
KLEYQNLFLNSPLQQDVKSLLEKQQSQMFGIDKILTEQSQKPSITQRATQYITNELKFFN
NDTQNSSQAHIQTDTSPQTQDRLKQINETPQTASKTPINTNLDKESDKTAKSNQNNSQKF
NNIHSNQQSSSYHLLQQITKYQHFNQNIKQINNKNFGKLKQLISQSFATPKCKNISSQKI
QQTCIGETPKNLSIQNDQSITQQQQN