Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00392760

Standard Name

CPD2 (CAP-D2 homolog)

Aliases

PreTt23504 | 42.m00238 | 3813.m01460 | CPDT2

Description

non-SMC mitotic condensation complex subunit 1 amine-terminal protein; Condensin subunit; homolog of CAP-D2 or S. cerevisiae YCS4

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External Links

Gene Ontology Annotations

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Domains

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Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

Tetrahymena Stock Center

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Homologs

Source Identifier Score
Tetrahymena borealis EI9_11482.1 9.997093137033517e-262
Description: hypothetical protein (1495 aa)
Oxytricha Contig17170.0.g39 6.996594825025754e-146
Description: non-SMC mitotic condensation complex subunit 1
SGD YLR272C 9.001992589090134e-64
Description: YCS4 Subunit of the condensin complex; required for establishment and maintenance of chromosome condensation, chromosome segregation, chromatin binding of condensin, tRNA gene clustering at the nucleolus, and silencing at the mating type locus
DictyBase DDB_G0293984 5.000412888119721e-59
Description: ncapD2 on chromosome: 6 position 3563765 to 3568484
Stentor Coeruleus SteCoe_9969 7.095474162284704e-23
Description: None
WormBase WBGene00001087 0.000000000003998907168546896
Description: locus:dpy-28 Condensin complex subunit 1 status:Confirmed UniProt:Q9U2M1 protein_id:CAA16340.3

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:29237819: Howard-Till R, Loidl J (2018) Condensins promote chromosome individualization and segregation during mitosis, meiosis, and amitosis in Tetrahymena thermophila. Molecular biology of the cell 29(4):466-478

Sequences

>TTHERM_00392760(coding)
ATGGTTGATTATTTCGTATTTCCTTATACTTACGAAGACATCTTGAAGTCTGCAGACGAG
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ATTTAGGATAAACTCATCATCGAGTCTCCAATTTATAGCTACTTCTGTAGTATCGCAACA
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GATATGCTTAAGGTCAAAGCTGAAATCTCCTCTATTGCAATTCTAATTGAAGACTCTGAT
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GAGTCTCTTGTTGATAAACTTTGCTAACGTTTCACTTTAGTTAACACTGAAAAGGAATGG
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TTCAAGGCAATAATCTTAAAAACCAAAAAAATGCCTCGTTAATCATAGGAGTAAAAGCAA
TTAATTGATGAACTTGACAGCAAAATATCTAATTTCAAAAAAGAGACTTTTGATGATAAA
AAATACAAGAAAGAGAAGCCTAAACCCAAACAAGCAGCTGGAACTAAAGGAAACTAAGCT
AACAAAGGAGCTGTAGGAAATGCCTAAAAGAAAGGAAAATAAAATGTTTAAGTACCCAAT
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TTAGCAGCCAACCATCCAAATAACTAAAGGAACACCAAATAAAGGGCTGAACCTGAAGAA
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AGAGGTTAATCTAGCAGAGCTTAATAAAGTAATTAAAGAGCATCATCAAGAAATGTACAG
AGAAAATCGTTGAAAGAAGATTCAGATGATGATGACTTTGATGAGGAGTTTTGA


>TTHERM_00392760(gene)
ATGGTTGATTATTTCGTATTTCCTTATACTTACGAAGACATCTTGAAGTCTGCAGACGAG
AGATATTGCGTCAATGCGGAAGAATAGAGGAGAATAAAAAATATGGAAGATAAGAGAATG
AATAGAACCCTGAAAGAATTAGAATCTGCCTTTGTCGAGGACTATACTGAAATAAAGTAG
CACGAAAGGTAAATTAATAATTGTTATCAAACAAACATCAGCAGTCATTTGCAAATATAA
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TTAATCTTATCTATGAAGACGAAAATTTAGTTCAGCCTATTGCAGATTTTATAATTGATC
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GAATCTTAAGGCCTATCCTATTCAAGATTAGGTTTTTGCTGAAGTTTGGGAAATATTCAC
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TTGCATTTCAGAATAGGTAAAATCAGAAGATAACAAGGCTATTATTGAGTCTATTGCTCA
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TGCTGTTGATGAAGAAGAAGATGAACCTAATTAGAATAAAGATGACTTAGAAATGCAGCT
TGAGAAAGATAACAAAAAGGATGATGGAGTTTAAAAGCCTCTTACAAGCAAAGCCTATGA
GCATAAGCTAGCTCAAGTCTTGTACGTTGCAGGTAATAGTGCATTAAAATTCTTGATGCA
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GGTCAAAGCTGAAATCTCCTCTATTGCAATTCTAATTGAAGACTCTGATTAGAGGTATAT
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AATTTGTTGCCTGAATTGATTGGCAGATTATCTACTGAGAATATTAATGAGTCTATCTTT
AATAACTTTTGTGAAAATGTGTTACCACATATCGATAAGGATAAATAAGCAGAGTCTCTT
GTTGATAAACTTTGCTAACGTTTCACTTTAGTTAACACTGAAAAGGAATGGATTAATATC
TCTCATGCTCTTAAAATGTTCTCGTACAATGAAAAGAGCTTAAAGAAACTATTGGAACAC
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AAAGAGAAGCCTAAACCCAAACAAGCAGCTGGAACTAAAGGAAACTAAGCTAACAAAGGA
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AAAATTTTAAAATCTAATTTGGAAGAAGTGAAAAATGTTAAGAATGCTTTATTAGCAGCC
AACCATCCAAATAACTAAAGGAACACCAAATAAAGGGCTGAACCTGAAGAAATTGATATT
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TCTAGCAGAGCTTAATAAAGTAATTAAAGAGCATCATCAAGAAATGTACAGAGAAAATCG
TTGAAAGAAGATTCAGATGATGATGACTTTGATGAGGAGTTTTGA


>TTHERM_00392760(protein)
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SFEELLLSMMDTHKISQEELKSQNLKAYPIQDQVFAEVWEIFTKNFRRLCEADPNRERTE
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