Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00421020

Standard Name

RRM20 (RNA Recognition Motif-containing protein 20)

Aliases

PreTt07227 | 46.m00282 | 3679.m00132

Description

RRM20 RNA recognition motif protein

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Gene Ontology Annotations

Molecular Function

Biological Process

Domains

  • ( PF00076 ) RNA recognition motif. (a.k.a. RRM,
  • ( PF00397 ) WW domain
  • ( TIGR01622 ) splicing factor, CC1-like family
  • ( TIGR01628 ) polyadenylate binding protein, human types
  • ( TIGR01648 ) hnRNP-R, Q splicing factor family
  • ( TIGR01659 ) sex-lethal family splicing factor
  • ( TIGR01661 ) ELAV/HuD family splicing factor

Gene Expression Profile

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source Identifier Score
Tetrahymena borealis EI9_10972.1 9.997093137033517e-262
Description: hypothetical protein (797 aa)
WormBase WBGene00006807 9.99967697349061e-30
Description: locus:unc-75 status:Confirmed UniProt:G5EE68 protein_id:CAB03896.4
DictyBase DDB_G0291486 7.002116201343823e-26
Description: DDB_G0291486 on chromosome: 6 position 413873 to 415521
Oxytricha Contig18677.0.g10 2.000769134519826e-18
Description: RNA recognition motif_ (a_k_a_ RRM, RBD, or RNP domain)
SGD YGR250C 0.000000000003998907168546896
Description: YGR250C Putative RNA binding protein; localizes to stress granules induced by glucose deprivation; interacts with Rbg1p in a two-hybrid
Stentor Coeruleus SteCoe_10259 0.00000000003775134544279098
Description: None

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences 

>TTHERM_00421020(coding)
ATGCAATTTTAACAATATTCAAGTTCCAGTAGCAAATCAAATAAATTGGGAGGTCAGTAA
TACTATCATCAAGAAAAGCATTATAAAAACGCTGAATAAGAAGATTCTAATTCCTCTCTT
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TTTGTTGTTTTTGCCTCTATTTTATGCGCCAATATTGCAATTGAAGCTCTCAAAGCAACT
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TCCTTAGTGGTCAAGTTTTATGATCCTAAAAAGAAATAAACTCAAGGAAATTAAGGACCA
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CATCACTCAAATAGGGATAACTAAGGACAGTCTAATTATTATCCATCTTCTTCATAGCCT
TAAATGTACTCATAAGGTTAATAGCCTAACCAAAGAAACTCTGACAATTATAATTACCAA
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TAAATAGAGAAAAAGCTAAAAGTAGAAGTAAAAAAAGGTCAAGGTGATGGAGATTTACCA
CCTAGTCTTAGTTAAAATGGATATTAACCCTTTTGA


>TTHERM_00421020(gene)
ATGCAATTTTAACAATGTGAAATTTGATTTAATCTTCATTACAATAATGAGGATATTATT
TTACATGCAAACATTTTTTATGAACGATTTTAACTTATTATTCAACCTAACCTTCCTTTT
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TTATTTATTTGCATATTTTATGAAAGTATCTGCAAGAGATTGATAAACAATTTCAAAATT
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TCTTTCTCTTGTTTTTTTTGAAAGCTATCACCCTAGCAAATAAATTTTCATTTATAATTA
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GGTGAAATTGTGAAAGTTTAAGTAATCAGAGACAAAAATAATTAGCACAAAGGGTGTGCT
TTTGTTGTTTTTGCCTCTATTTTATGCGCCAATATTGCAATTGAAGCTCTCAAAGCAACT
AAATTGCCTGGAGTATATTTGAAATTATATATAAATATATATACATATACATTTTTTCAA
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TTTATTGAAATTATGTTTTCAATAAATTAATTCATTCACTCATTAACTGTTTATTTATTT
AAAATCCCATTTTTTTCAAAGGTTTGTAGGCAAACAATTTTTTTTTCAATTGTTTATTGA
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TTTGAAACTTACACACCAACCAACAATAAAAATGTTTTAATCCTTTTTAAGATGTAAAAC
AACATACAGGTTAAGTGGGCTGATAATGAGCCTGATAGGCTAGGAATCAGACAAGACCAA
GACTATGTCTTATATGTAGCTCATATTCCTAAAAATGCATCAGAGGTGAGCTATTTATTT
TTTCAAACTTTGAATTTATGCTCTATCTATTTTAAAAATAAATCAAGTGATATTTTTTAC
ATTTATATAATACTAGCCTGAAATAAGAAATGTTTTTGAAAACTATGGAATTGTTAAAGA
AGTTGATATCCCTAAAGATTAATCTGGAACAAGCAGAGGATTTGTTTTTGTGAAATTTGA
AAATATTGAACAAGCTATTTTAGCCAAATAGGCTCTCCATGAAAAATAAGTTTTAAATAA
TCAAACACAGTCCTTAGTGGTCAAGTTTTATGATCCTAAAAAGAAATAAACTCAAGGAAA
TTAAGGACCATAGTAAGGTCAATCTGGCAATTCTTCAAACAGTAAATGCTTTTTTTTTTT
AAAGAGATAAATAAAATATATTATTTAAAAAAAATAGATTACAACAACAATGGACAGGGA
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TAGCCTTAAATGTACTCATAAGGTTAATAGCCTAACCAAAGAAACTCTGACAATTATAAT
TACCAAAGAGAATAGCACTCTAATTATAACTAAGGAAGCTAGTCATAAGGATATAGAGGA
GGATAAGGAAATTATCACGGGCATCATGAAAGCAAAGGGTCCTATAACTAAAATAATTAA
AATTACCCAAGAGAAAGTGCCAATTTAAACAACAGTGAACATTATGATTAGCCAAGCTAG
TCGTTCGATAGCTTCTAAAGTCACTCTTCTAATTTTAGAGAGTAATATGGCAATCAAAAT
CTCCAATAATCATAACATAAGTAAATTTTTTATTTTTATTTTTAACTTGTAAAAAGTATT
TAAGTATTTTCATTTTTAATTAGTAACGGTTATCCTCACCATAATCGTAACAACAACAGC
AACAACAATAACAGTAATAATAGCAGCAACAATAACTTTTAGTATAGCAGTAGCTACCCC
TCTAATTAGCCTGCTGGAAATAATTTGAGCAATTAGCAATTTAATTAAACTTATAATAAC
AGCAACTAGAGTAATGACTATAACTACCAAAACCCTTAGTAAAACGACTATGTTCCTCCA
CCACAAGGACAAAATAACTTTTAGTTTAATGATTATTAACAGCAGCATCACAGTAATAAT
AATGGACCTGTTCCAAATAGTGCTAATAATAATTAAATTTAATAGTTTAATCCATACTAT
AATAACGAAAATTTTGATAACTATAACAATCCTTAGATTCACAACGAATAGCCCAGCTTT
ACTCCAAATTAACCTCCATAATAAATACCTTAACATGAAATAAATTAACCTCCATTATTC
AATATGCCATAATAATAACAACAACCAATAAACCCATAGCCTTCATTAGACATTTCTTAG
CCTAGTAGTGGTTACTAAGAGCCAATCCCTGCTGTAGAACCTAATTAATAGCCAATTTAA
GTAAAATCTTTGTTTCCAATTAAATTATTTATTCTTTTTTATTTAATAGCAAAAAGCCTA
TATTAAGTATTACACTGATGACAAAGTCCCTTATTACTATGATACTCAAACTTAATCTAC
ATCATATGACTAACCTCCTTTAGGATCGATAATATATAATCCAGATGGAACACAAGAACA
TGTATAACCAGAAAGCATCGAACAACTGCAAAAATTTTAACAAGAAACAGGATTAGCAGA
AAATAAAGAACTTGAAATTTTATGTAATAAAAAGTTTTTAATTAAAGTTAAATTAAATTA
ATTAATTAAATTTTTTAAAGCCTAAAAAACAACAGGACCTCCAGGAGCTAATTTATTCAT
TTTCCATCTTCCAAACGACTACCGTGATTCAGATCTTTTAAGACTCTTCAAAAAATTCGG
TGATTTGCTCTCCGCAAGAGTTATCACACGTCCTGATGGTTCTAGCAAAGGCTATGGTAA
AAAAAAAAATTAAAATAAATTTAATTTAAACATTTAATTTTATTTGAACTAGGTTTTGTA
AGTTATACAAGCCCAGATGGTGCTCAACAAGCTATACAGTAAATGAATGGCCTATAAGTT
GGAAGTAAATAAAAATTAAAGTATGAGTTTTAAATTAAATATAATTTACATTAAATAGAG
AAAAAGCTAAAAGTAGAAGTAAAAAAAGGTCAAGGTGATGGAGATTTACCACCTAGTCTT
AGTTAAAATGGATATTAACCCTTTTGA


>TTHERM_00421020(protein)
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