Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00426230

Standard Name

MSH3 (homolog to human protein MSH3)

Aliases

PreTt14058 | 47.m00253 | MSH6L1

Description

MSH3 DNA mismatch repair MutS family ATPase domain protein; MutS domain III family protein

Genome Browser (Macronucleus)



Genome Browser (Micronucleus)

External Links

Gene Ontology Annotations

Molecular Function

Biological Process

Domains

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source Identifier Score
Tetrahymena borealis EI9_00176.1 9.997093137033517e-262
Description: MutS domain III family protein (2231 aa)
Oxytricha Contig820.1.g122 9.997093137033517e-262
Description: MutS domain V
Tetrahymena borealis EI9_05250.1 9.997093137033517e-262
Description: hypothetical protein (553 aa)
DictyBase DDB_G0268614 2.000319284850678e-127
Description: msh6 on chromosome: 1 position 238722 to 242663
SGD YDR097C 9.997006461365152e-115
Description: MSH6 Protein required for mismatch repair in mitosis and meiosis, forms a complex with Msh2p to repair both single-base & insertion-deletion mispairs; potentially phosphorylated by Cdc28p
WormBase WBGene00003422 1.9994050701445255e-104
Description: locus:msh-6 status:Partially_confirmed UniProt:Q9N3T8 protein_id:CCD72556.1
Stentor Coeruleus SteCoe_17585 9.710436457780846e-67
Description: None

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:23884606: Gao S, Xiong J, Zhang C, Berquist BR, Yang R, Zhao M, Molascon AJ, Kwiatkowski SY, Yuan D, Qin Z, Wen J, Kapler GM, Andrews PC, Miao W, Liu Y (2013) Impaired replication elongation in Tetrahymena mutants deficient in histone H3 Lys 27 monomethylation. Genes & development 27(15):1662-79

Sequences

>TTHERM_00426230(coding)
ATGCAAATCAACTTGAAAGCAAAAGAGTTTAGTACACTCGATGAAGATTCATCGTCAGAT
GATGATTAAGAATTCGTCAAAAGAATATTAGGATAAACTTCTAAAAATGAAAATAAATCA
GACATTAATACTAATCCGATTTAAAGCAATGCTCAAATAGGACAAAAATAGTAAAGCAAT
CTAAAATAAAATGTAGCTAATAGTTACGAAAATTAATTCAAGGGATTGAATGGGTTATAT
TAAAATAATTCACCTCAATAAAAGCTTCAGCCATAAGCTAAGACTTCATCAAATAATCTC
TCAGGAATCAACAAATCTTTATTAAATAAAAGTAAAAAGTCTACTTTAAATTAAAGTGAT
GATGAAGCTGAATAAATGAACATCGAAGAAGACTAAAATAGCGTTTAGACAAACCAAAAT
GATTTTTTAAACTAATTCTAGATGCAATCAAAACAAACTACTTTTAAGAACTCAACTTCA
AGATAAAGCAAATAGTATAGTGGAGATAATTAAAAAGGCAGCTTATCAATACCTAATAAA
GAGGAGGAATAGTTAAATTAAATCCCAAAATTTGCTTAACAAAGGTATCGTAAAGATTCC
AGATAAATTCCATTTGGGAATCCATAATATGACCCAACAACTTTGTATATTCCACCCTAA
GAATTTAGTAAACTCACAAGTGCGATGAAATAGTATTGGTAAATAAAAGCAAAGCATTTT
GACAAAATCATCTTATTCAAGATGGGAAAATTTTATGAACTCTTTTATGAAGATGCTATA
ATTGCAACTAGACTTTTAGATATCACTTTTACAAACAAAGAATTGCATTGTGGTTTCCCT
GAGAAGGCATTGGAAAAATTTGCTTCAAAGCTTGTTCAATTCGGATACAAAGTAGTTGTA
GTAGAGTAAACTTCTAAAAAGACGACTACAGGTATAGTAGACAGAGACATTACATAAATC
ATTACAAAAGGTACAATTAACTTCACTTTTGAAGAGTAAAATCACGATCCTAAGTATCTC
CTTGTTATCAGATAAAAAACAAACTAAGAGTTCGGTATAATTGTTTATGAATCTTTTACT
AGCAAAATTCAAGTCGGCCTACTGTAAGACGACAAAACATAGACAAGACTAAAATCATTT
TTATGTGTTACTAAACCTTAAGAAATAGTTTATGATCCAGGAAATATAACATCAGACATT
CTTAAAATATTGAAAAGTTAATATTTTTAGTCTGTTATGAGTCCCATGAGAGATAACAAA
GACTAATGGAGTACTCAGCTTGCAACCTTTTATATTGAGAAGCAATTTGGAAGCGAAGTG
CAAAAATACCCTCAAGAACTTAGAGATATTAGAACTAATGACGAAATTAGGGGCTAAGTT
ATTAATTTAAAATATGCTGCGCTTGCAGGATTTTTTTCATATATGGATTCTACTCTCCAG
TTAGAAAGTATTCTTAATTCCTCAGAATACGTTGAATGCGATTTCGATAATAAATAATTT
TCACAAAGAATGATCTTAGACAGCCAAGCACTTCAGCACTTAGAAATATTTGAAAACTCT
TAAACTGCTTTAACAACAACTTTTTAATAAGTTGACTAAAAGAAAGGAACACTTTTGAAT
TACCTTGACTACACTAAAACGCCATATGGTAAAAGAATGTTAAAAAAATGGGTTTGCTCT
CCATTGATTGACATTTCAGCTATAAATGATCGTTACGATGCTATTGAAGATATTTAAAAC
AATCTTGCGATGAAAGATAAGTTTTAATATGGAATAGCTAGATACGCAGATATTGAGCGT
CTTTGCTCTTCTATTTACAGATATAGCGTTAAATAAAAACATGCTGAGAAAGCTGTAATG
TATGAAAATATTTCCAGTGCAAGATTGAAAGAATTTAAAAATTTAATTAATTCAATGAAA
GAGATCGAAAAACTTATTGAAGAAACATTTATGGTTAACCAAGAAAATTTTAAGAGTTAA
AGACTCAAACGTTTATGTACTTATAGACTGAAAGGTGATCCAAAACTTTCTGGAGATTTA
CCTAAAGTCAGTAGCTTTATAAAAGTTCTTGAGGACATTATTGTCTTAGACTCTAAAGAA
AAAATAGCAGGAAAGTATATAGAATAACCAGTACCAAAGGATGGGTTTTGCTAAGAATAT
GATAGCATCAGACTTCAGATTAAAGCTTATTAAGATGAACTTGATTAATATTTAGAACAA
TTAAAAGTAAAATTCAAAACAAATGATATTTCATATGCATTTCTGAATAATAGATAATAT
GATATTTAAGTCAACAAAACTCTTTTTGATAAAATATAAAAACCTGCTGATTTCTCTCTA
TAAAGCCATTCTGGGTCGTTTCAGAGATTTACTAGCAGATTTACATCTGAAAAAGTTGCA
TTCATTGAGGAGTTGGAGGAATAACTTAAAGAAATTTTATCAAACTTCTGTGTAACTGTG
TTTAGAGAGTTCTATAAAAAGAAGCATGTTTGGGATAAATTTGTAAGTATAGTAGCTGAA
CTGGATTGCTTAATAAGCATAAGCCATGCTTGCTTTACAATGGCTGATGGTGTTATGTGC
AGACCTGTCATAAAGTTTGCAAAAAATTAAAAAGAAACCTTTTTCTATTTAAAATAAGGA
AGAAACCCTAATCTAATTTAATTGGATTTAAAATAAGTTCCAAATGATATCATTCTAGGA
AACATTGCAGGAATGAATGCTTAGCCTAATATTATGATTTTAACAGGTCCAAATATGGGT
GGTAAATCAACAACTTTAAGGTTGTTCTGTTTATCTGCTATTTTAGCTTAAATAGGTTGT
TATGTTCCTGCAGAGTAATGCGAATTTAGTTTAGTGGACAGAATTTTCACAAGAATTGGT
GCTGGTGATAAATTGATAGAAGGAAAAAGTACATTTTATATAGAAATGGAAGAAGTTAAA
AATTCAATTATGTATGGTACTTACAACAGTATTGCAATATTTGATGAATTAGGAAGAGGA
ACTTCCACATTTGATGGTGTAGCTATTGCTTTTGGAATTCTTAAATATTTTATTGAAAAA
ATTTAAAGTAGATGCATATTTGCTACCCATTTTTTCCTTTTGATAAATGAATTAAGATTT
TATAAAGAAATATCCTTTTATCATATGGAATACTATTACGATAACAAATCTAAAAAGCTC
ATATTTAAATACAAACTTAAATAAGGCAACGCAGAAAGCAGCTTTGGTATAGATTTAGCA
AAGATAGTCGGTATAGAATAATCTGTACTTAATTTAGCCTAAAAGAAGTAACTAGAATTC
GAAAACAGCTTAGAGTATGCAGAAGTAGAAAAGTAATAAACTATAAAATAGTTTAATGGG
CTCATTTCTAAGCTATTTACCTATGAAAAAGATAGAATATAATGA


>TTHERM_00426230(gene)
ATGCAAATCAACTTGAAAGCAAAAGAGTTTAGTACACTCGATGAAGATTCATCGTCAGAT
GATGATTAAGAATTCGTCAAAAGAATATTAGGATAAACTTCTAAAAATGTAAGTTCATAC
TTAAAATTTAATGATAACGACATAATATTTTTGAGATTCGCAGCACATATTAGAATTAAA
TCTAAACTTTTATTGACTATTAGGAAAATAAATCAGACATTAATACTAATCCGATTTAAA
GCAATGCTCAAATAGGACAAAAATAGTAAAGCAATCTAAAATAAAATGTAGCTAATAGTT
ACGAAAATTAATTCAAGGGATTGAATGGGTTATATTAAAATAATTCACCTCAATAAAAGC
TTCAGCCATAAGCTAAGACTTCATCAAATAATCTCTCAGGAATCAACAAATCTTTATTAA
ATAAAAGTAAAAAGTCTACTTTAAATTAAAGTGATGATGAAGCTGAATAAATGAACATCG
AAGAAGACTAAAATAGCGTTTAGACAAACCAAAATGATTTTTTAAACTAATTCTAGATGC
AATCAAAACAAACTACTTTTAAGAACTCAACTTCAAGATAAAGCAAATAGTATAGTGGAG
ATAATTAAAAAGGCAGCTTATCAATACCTAATAAAGAGGAGGAATAGTTAAATTAAATCC
CAAAATTTGCTTAACAAAGGTATCGTAAAGATTCCAGATAAATTCCATTTGGGAATCCAT
AATATGACCCAACAACTTTGTATATTCCACCCTAAGAATTTAGTAAACTCACAAGTGCGA
TGAAATAGTATTGGTAAATAAAAGCAAAGCATTTTGACAAAATCATCTTATTCAAGATGG
GAAAATTTTATGAACTCTTTTATGAAGATGCTATAATTGCAACTAGACTTTTAGATATCA
CTTTTACAAACAAAGAATTGCATTGTGGTTTCCCTGAGAAGGCATTGGAAAAATTTGCTT
CAAAGCTTGTTCAATTCGGATACAAAGTAGTTGTAGTAGAGTAAACTTCTAAAAAGACGA
CTACAGGTATAGTAGACAGAGACATTACATAAATCATTACAAAAGGTACAATTAACTTCA
CTTTTGAAGAGTAAAATCACGATCCTAAGTATCTCCTTGTTATCAGGTAAGAAAAATATT
CATTTGATCAATTTTTTTTACTTACTACTGATCAAATCTTATCAAATTCTAAGCTTAATT
AAATGGCGCTTCAATTTATTTTTTCTCAAACAATTTGATAGATTAAATTTGAAATTATCA
AAAAAACAAATTAAGATTTTTAATTCTTATTCTAAATTATTAATTTAACAATCAACAAAA
ATAAAATTCTAAAGATGGCAATCGAAAATACTTTTATCGAATATATAACACATTAGATTT
TTTGTTTAGATTATAAAAATCTAAATTTTAGATTTCTGTCTCTATTTTTTATTATTTAAA
AACATTTTCCATAACTCTATTTTAAAAAATTGATGAGTTGACTTATTTTATAATCAGGCA
ATTAAACTTTATTTGATTTTTATGTTTATAAAAAGATGATAAATGATAAATTTTCAGAAT
AAGCTTATTTTAACAATACATTATTATTAGAAGTGACTTTTACTTACATTTTAATTTTTC
TAACAAAGCAAATCGTTTATTCGAGTATTTAAGTTTCGTTAATTTATACAGTAACTCGAT
TGATGATTGTGATATAGATTATTTATGTTTTTTATTTAAAAGCAAATAATTTCTATCTAT
TTTACAAATTTACTTAAAATAGATTAATCAATTTATTTATTGATTATCTGTTTCAACCTT
GTTTTAATTTTAATAGATAAAAAACAAACTAAGAGTTCGGTATAATTGTTTATGAATCTT
TTACTAGCAAAATTCAAGTCGGCCTACTGTAAGACGACAAAACATAGACAAGACTAAAAT
CATTTTTATGTGTTACTAAACCTTAAGAAATAGTTTATGATCCAGGAAATATAACATCAG
ACATTCTTAAAATATTGAAAAGTTAATATTTTTAGTCTGTTATGAGTCCCATGAGAGATA
ACAAAGACTAATGGAGTACTCAGCTTGCAACCTTTTATATTGAGAAGCAATTTGGAAGCG
AAGTGCAAAAATACCCTCAAGAACTTAGAGATATTAGAACTAATGACGAAATTAGGGGCT
AAGTTATTAATTTAAAATATGCTGCGCTTGCAGGATTTTTTTCATATATGGATTCTACTC
TCCAGTTAGAAAGTATTCTTAATTCCTCAGAATACGTTGAATGCGATTTCGATAATAAAT
AATTTTCACAAAGAATGATCTTAGACAGCCAAGCACTTCAGCACTTAGAAATATTTGAAA
ACTCTTAAACTGCTTTAACAACAACTTTTTAATAAGTTGACTAAAAGAAAGGAACACTTT
TGAATTACCTTGACTACACTAAAACGCCATATGGTAAAAGAATGTTAAAAAAATGGGTTT
GCTCTCCATTGATTGACATTTCAGCTATAAATGATCGTTACGATGCTATTGAAGATATTT
AAAACAATCTTGCGATGAAAGATAAGTTTTAATATGGAATAGCTAGATACGCAGATATTG
AGCGTCTTTGCTCTTCTATTTACAGGTATTTATCTATCTATATTTCTTTCTCTTCTTTAG
CAAATTTCCTTTTTTTATTTAATTTATTTTATAATTAATAACATGAAAGGGTTTTTATTT
GAGTTTGATTTATAATTGTTTATTTTTAATTAAAATTGAACAGATATAGCGTTAAATAAA
AACATGCTGAGAAAGCTGTAATGTATGAAAATATTTCCAGTGCAAGATTGAAAGAATTTA
AAAATTTAATTAATTCAATGAAAGAGATCGAAAAACTTATTGAAGAAACATTTATGGTTA
ACCAAGAAAATTTTAAGAGTTAAAGACTCAAACGTTTATGTACTTATAGACTGAAAGGTG
ATCCAAAACTTTCTGGAGATTTACCTAAAGTCAGTAGCTTTATAAAAGTTCTTGAGGACA
TTATTGTCTTAGACTCTAAAGAAAAAATAGCAGGAAAGTATATAGAATAACCAGTACCAA
AGGATGGGTTTTGCTAAGAATATGATAGCATCAGACTTCAGATTAAAGCTTATTAAGATG
AACTTGATTAATATTTAGAACAATTAAAAGTAAAATTCAAAACAAATGATATTTCATATG
CATTTCTGAATAATAGATAATATGATATTTAAGTCAACAAAACTCTTTTTGATAAAATAT
AAAAACCTGCTGATTTCTCTCTATAAAGCCATTCTGGGTCGTTTCAGAGATTTACTAGCA
GATTTACATCTGAAAAAGTTGCATTCATTGAGGAGTTGGAGGAATAACTTAAAGAAATTT
TATCAAACTTCTGTGTAACTGTGTTTAGAGAGTTCTATAAAAAGAAGCATGTTGGTTTTT
CATTTTTATTTAATTTTTTGCAATTATTTTTTTATTTTAAAATCAGTTAATTTTTTTTGG
AATAAATTAAAAAATTTCACTTTAGATTTTATTAAATTTTTCAGGTTTTTAGTTGAATTA
TTTATTTACTTAACAAAAATATTTTTTAATAATTTATTATTTTGAATTTTATTTTACTTA
AAAATAAAATAGGTTTGGGATAAATTTGTAAGTATAGTAGCTGAACTGGATTGCTTAATA
AGCATAAGCCATGCTTGCTTTACAATGGCTGATGGTGTTATGTGCAGACCTGTCATAAAG
TTTGCAAAAAATTAAAAAGAAACCTTTTTCTATTTAAAATAAGGAAGAAACCCTAATCTA
ATTTAATTGGATTTAAAATAAGTTCCAAATGATATCATTCTAGGAAACATTGCAGGAATG
AATGCTTAGCCTAATATTATGATTTTAACAGGTCCAAATATGGGTGGTAAATCAACAACT
TTAAGGTTGTTCTGTTTATCTGCTATTTTAGCTTAAATAGGTATTTATTTTAGAAATTAT
TAAAATTTTAAACTGATTCTTTAATTGAAACAAGGTTGTTATGTTCCTGCAGAGTAATGC
GAATTTAGTTTAGTGGACAGAATTTTCACAAGAATTGGTGCTGGTGATAAATTGATAGAA
GGAAAAAGTACATTTTATATAGAAATGGAAGAAGTTAAAAATTCAATTATGTATGGTACT
TACAACAGTATTGCAATATTTGATGAATTAGGAAGAGGAACTTCCACATTTGATGGTGTA
GCTATTGCTTTTGGAATTCTTAAATATTTTATTGAAAAAATTTAAAGTAGATGCATATTT
GCTACCCATTTTTTCCTTTTGATAAATGAATTAAGATTTTATAAAGAAATATCCTTTTAT
CATATGGAATACTATTACGATAACAAATCTAAAAAGCTCATATTTAAATACAAACTTAAA
TAAGGCAACGCAGAAAGCAGCTTTGGTATAGATTTAGCAAAGGTAAATTAAATTTATATC
TTTATTTAAAATATGTGAAAATTAAAAAAAAATATTTTAGATAGTCGGTATAGAATAATC
TGTACTTAATTTAGCCTAAAAGAAGTAACTAGAATTCGAAAACAGCTTAGAGTATGCAGA
AGTAGAAAAGTAATAAACTATAAAATAGTTTAATGGGCTCATTTCTAAGCTATTTACCTA
TGAAAAAGATAGAATATAATGA


>TTHERM_00426230(protein)
MQINLKAKEFSTLDEDSSSDDDQEFVKRILGQTSKNENKSDINTNPIQSNAQIGQKQQSN
LKQNVANSYENQFKGLNGLYQNNSPQQKLQPQAKTSSNNLSGINKSLLNKSKKSTLNQSD
DEAEQMNIEEDQNSVQTNQNDFLNQFQMQSKQTTFKNSTSRQSKQYSGDNQKGSLSIPNK
EEEQLNQIPKFAQQRYRKDSRQIPFGNPQYDPTTLYIPPQEFSKLTSAMKQYWQIKAKHF
DKIILFKMGKFYELFYEDAIIATRLLDITFTNKELHCGFPEKALEKFASKLVQFGYKVVV
VEQTSKKTTTGIVDRDITQIITKGTINFTFEEQNHDPKYLLVIRQKTNQEFGIIVYESFT
SKIQVGLLQDDKTQTRLKSFLCVTKPQEIVYDPGNITSDILKILKSQYFQSVMSPMRDNK
DQWSTQLATFYIEKQFGSEVQKYPQELRDIRTNDEIRGQVINLKYAALAGFFSYMDSTLQ
LESILNSSEYVECDFDNKQFSQRMILDSQALQHLEIFENSQTALTTTFQQVDQKKGTLLN
YLDYTKTPYGKRMLKKWVCSPLIDISAINDRYDAIEDIQNNLAMKDKFQYGIARYADIER
LCSSIYRYSVKQKHAEKAVMYENISSARLKEFKNLINSMKEIEKLIEETFMVNQENFKSQ
RLKRLCTYRLKGDPKLSGDLPKVSSFIKVLEDIIVLDSKEKIAGKYIEQPVPKDGFCQEY
DSIRLQIKAYQDELDQYLEQLKVKFKTNDISYAFLNNRQYDIQVNKTLFDKIQKPADFSL
QSHSGSFQRFTSRFTSEKVAFIEELEEQLKEILSNFCVTVFREFYKKKHVWDKFVSIVAE
LDCLISISHACFTMADGVMCRPVIKFAKNQKETFFYLKQGRNPNLIQLDLKQVPNDIILG
NIAGMNAQPNIMILTGPNMGGKSTTLRLFCLSAILAQIGCYVPAEQCEFSLVDRIFTRIG
AGDKLIEGKSTFYIEMEEVKNSIMYGTYNSIAIFDELGRGTSTFDGVAIAFGILKYFIEK
IQSRCIFATHFFLLINELRFYKEISFYHMEYYYDNKSKKLIFKYKLKQGNAESSFGIDLA
KIVGIEQSVLNLAQKKQLEFENSLEYAEVEKQQTIKQFNGLISKLFTYEKDRIQ