Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00442760

Standard Name

NMD2 (Nonsense-Mediated mRNA Decay protein 2)

Aliases

PreTt05676 | 50.m00245 | 3681.m00104

Description

NMD2 MIF4G domain protein; MIF4G domain containing protein; factor in Tetrahymena NMD pathway

Genome Browser (Macronucleus)

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Gene Ontology Annotations

Molecular Function

• quinoprotein glucose dehydrogenase activity (IEA) | GO:0008876

Biological Process

• lipoate metabolic process (IDA) | GO:0009106
• norepinephrine biosynthetic process (IEA) | GO:0042421

Domains

• ( PF02170 ) PAZ domain
• ( PF02854 ) MIF4G domain
• ( PF04546 ) Sigma-70, non-essential region
• ( PF05178 ) Krr1 family
• ( PF08432 ) Fungal protein of unknown function

Gene Expression Profile

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source	Identifier	Score
Tetrahymena borealis	EI9_12612.1	9.997093137033517e-262
	Description: MIF4G domain-containing protein (1027 aa)
Oxytricha	Contig22006.0.g86	5.9981191891941984e-64
	Description: MIF4G domain
WormBase	WBGene00004881	2.00017271388466e-38
	Description: locus:smg-3 status:Confirmed UniProt:C2BR97 protein_id:CCD74194.1
DictyBase	DDB_G0281623	9.00381557957642e-37
	Description: upf2 on chromosome: 3 position 4719332 to 4723605
SGD	YHR077C	2.0008113830639685e-30
	Description: NMD2 Protein involved in the nonsense-mediated mRNA decay (NMD) pathway; interacts with Nam7p and Upf3p; involved in telomere maintenance
Stentor Coeruleus	SteCoe_10276	6.305116760146989e-16
	Description: None

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_00442760(coding)
ATGGATAGCGAATAAATTCCTGAAGAAATTAAAAAATTTTTTGATGAAAGAGCTTAGTTA
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AATAATTTCATATATGGTCCTGATGGTTTAATTCAAAACGAACAAATTCAATTTAAAATG
CCTAAGACTAAAAAGAAATGA

>TTHERM_00442760(gene)
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TTAATCATTAGCTAAAAATTCAATAAGATGAAAAGCTAAATAAGCTAATAAGTGAAGAAA
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TATCACAAAGAGACGCACATTCCCTAAAATGCTTAGATTCTTAATCTTTTTCCAAAGATA
TATTCTCTCTAAGAAGTATGTTCCTATAGACATAGAATTCATGGTCCTAGATACTTTCGA
AAGTCTAGATTCAGGTAGCAGCAGATTGACAAAAATTAAAACTTACAATGATGCTAATGA
GCTTGTTAATTCTATAGAGTAAAAAGAGAAAAAAGGAACTCTGAAAACAGTGGAAGAAGA
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AAAACCATCACAATTATTAAAAAGAAAAAAGATGTAATTACACTTAATTATTTATTTTTT
TAAATTTTTAATTTTTATTTTTTAAATTTAGACATAAAAAAATGATATAACCAATATTAA
TAATTTCATATATGGTCCTGATGGTTTAATTCAAAACGAACAAATTCAATTTAAAATGCC
TAAGACTAAAAAGAAATGA

>TTHERM_00442760(protein)
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