Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00443100

Standard Name

RRM22 (RNA Recognition Motif-containing protein 22)

Aliases

PreTt05710 | 50.m00279 | 3681.m00138

Description

RRM22 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit B putative

Genome Browser (Macronucleus)

Full Screen View


Genome Browser (Micronucleus)

Full Screen View

Gene Ontology Annotations

No Data fetched for Gene Ontology Annotations

Domains

  • ( PF00076 ) RNA recognition motif. (a.k.a. RRM,
  • ( PF07676 ) WD40-like Beta Propeller Repeat

Gene Expression Profile

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source Identifier Score
Tetrahymena borealis EI9_12642.1 9.997093137033517e-262
Description: hypothetical protein (731 aa)
DictyBase DDB_G0283597 9.9981864321491e-40
Description: eif3B on chromosome: 4 position 847464 to 849687
Oxytricha Contig19782.0.g58 5.001052752541194e-37
Description: Eukaryotic translation initiation factor eIF2A
WormBase WBGene00001225 3.0010664139725277e-29
Description: locus:eif-3.B Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit B status:Confirmed UniProt:Q9XWI6 protein_id:CAA21681.2
Stentor Coeruleus SteCoe_160 7.781132241133797e-20
Description: None
SGD YOR361C 1.000116773704384e-19
Description: PRT1 eIF3b subunit of the core complex of translation initiation factor 3 (eIF3), essential for translation; part of a subcomplex (Prt1p-Rpg1p-Nip1p) that stimulates binding of mRNA and tRNA(i)Met to ribosomes

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences 

>TTHERM_00443100(coding)
ATGGTCGATTTATACAAAGAAATAGATTTTTCTTAAGAATTAAAGGATACCCCAGAATTA
GAACCTTTCTTAAAAGCAAAAGCAAAAGAAGAATAGGAAGAATTGAGCTCAGATTATATT
CAAAAGCCATTCTTAGATAGATCATATCATGAGTTTATTATTGTTACTGGTTTACCCAAT
ACTGAAGCAGCAAAAACTGAACAATTTAAAACTTTCTTCTAAAATAAAATTCTTTAACCA
ACTGCTCTTCTTGAAAAGATTAAAGTTATCGAATTCTAACTTGACAACGATGGAAACTTT
TAAGGTATCTGCATTCTCGCTTTCGATAACGCTACTAATGCTTAAGAAGGTTTAAATAAA
TTGAACGGTCTTAAATTCATGAAATATTAATTGAGCGCTTATTCTTTGTATAGTTTCTAA
CAAGCTCTTGACTGTCCTGATGAATTCACAGCTCCTGTTAATTTGACCAAAAGAGAACTT
TTAGAGTGGAACTTTGAAAACAGAAAAAGTTTAATGTCATTATAAATCGGTAACAAGGTC
TATAATTACTGGGTTTCCCATCTAGAAAACGAACTTTAAAACATTTTAATGAAGCCTGTT
GAAGAAGGTTAAGCTCCAGTCAATCCTGAAAATTTGTACACACCCCTTGAAAGCTCTACT
AATGAAATCGTTTGGAGCAAGAATGGTACTTACATGGTTGAAATTTTACCTACTGGTTTC
AGATTATATGGTGGAAAAGATTTGAAAAAGCTTTCTTTCTTCCCTCACCCTGAAGTTAAA
AATATCGAATTCTCTCCTTGCGAAAACTATATTCTTTCTTATAACGGAACTATTGTCGAT
GCTCCTAATGAAGATAATTTCATCGTATGGTAACTTAACGAAGTTAAGGTACTCAGAGTT
TTCAAAGCTAAACAACAAGATGTTTGGACTACTATGAAATGGAGTTACGATGGTAAATAT
ATTGGTAAAATCGATGATCACAAGGTCTCCGTTTACGAACTCCCTGAAATGAAAATGCTT
GAAGATAGTTCAAAAAATCCTACATCAATAAATATTAGAAATGTACAGAAATTTTTCTGG
TCTAGCAAGTAAAATATTCTTATTGGCTGTTCTTACTATGGTCCTCATCGTGAACACGAT
AAGCAAGTCTCAACTAGAATTTCAATGTTTGAAATTCCTAGTAGAAGAGAATTCAAGTGG
AGAACAATTAGCAACGAAAGTTCTGATATTGATATTTTCCCAAGTGTCAATGGTCAATAC
GTTATTGCCATCATTAAAAAGATTAAGAATAAAAAATCTAATTAATAGTCCTCTTCCCAT
ACTATATAAGTTGCCAATATTCGTAACAAAGGTTAAATGGATATCTGTGAACAAGAAATT
AATGAAAAGGTTCACACTTACTCTGTCGATCCTTACTAAGGTCGTATTGGTTTAATTTAC
AAGGCTGGCGAATTAAGAGGAGAATAAAAGTCTATGATTTATCACACTTAAATTTACCAT
ATTGAAGAAGAAAGCAAGAGTTATACCATTAAAGATGCTGGTAGATTTAGCAATAAAAAT
ACAAACGAAATCTAGTTCTCTAACAGCAGTGGATTCTTTGTTTTGATTAATAAGGATATT
AATTCTTCCTATTGTGGTTATATGGAAACTGGTTTCACTCGTAAGGATAAGGGCAAATTA
ATTAGTGAAATTACCAGATCTTACAATAACTTATCATATATTGATAGTGCTGCTTACGAT
CAATCAGGACGTTACATATTTACTAGCTCTCAAAAAACAAAATCATTCCAAATTTGGACT
GCTTTTGGTGATTAAATTTTCAAGGATACTATAACTGACCCTGCTGGTATTAAAAATATA
ATTTGGAGACCTAGACTTACTCATTTACTTGACGAAAAGTAGGAATCATTAATCCAAACC
ACTTACAAGGATTACAAAAAAACCTACGAAGAAGAAGACGATAAGATTATCAATAAGAAA
GAACATGAAAGAAGAGAAAAAAGAGACAAATTAAAATAAGAATTCTTAGAATATTTAAAT
GCCAAGAGAAAAGAATGGAAAGATACTAAACAAGAAAGAGTTGCTCTTTTAGGTTTTGAT
GAAGAAGATGAGACTGATATTGTTTATGATGAATTCATTGAAAACGAAAGAGTTGTACAA
ACTGAAATCATTGATGAAGAAGAAATCGAAGATCCTAACAACTGA


>TTHERM_00443100(gene)
ATGGTCGATTTATACAAAGAAATAGATTTTTCTTAAGAATTAAAGGATACCCCAGAATTA
GAACCTTTCTTAAAAGCAAAAGCAAAAGAAGAATAGGAAGAATTGAGCTCAGATTATATT
CAAAAGCCATTCTTAGATAGATCATATCATGAGTTTATTATTGGTAATTTGCCTTTATAT
TTTGCATAATATCCAAATGTCTAGATTCATCACAATCATTCATTAATTTGTTTGTTTGCA
AGAAAATTTCATTGATTTCTTATCTATTAAGGCTTTTTTTTATAAAATATTTTTTAATTA
TTATAGTTACTGGTTTACCCAATACTGAAGCAGCAAAAACTGAACAATTTAAAACTTTCT
TCTAAAATAAAATTCTTTAACCAACTGCTCTTCTTGAAAAGATTAAAGTTATCGAATTCT
AACTTGACAACGATGGAAACTTTTAAGGGTAAATTATTTATTAAGTTAAAGTGTATTAGA
ATTAATGACTGAAAATTTAACTTTAGTTAGTTAAATAAGATTAAGATAAAGAAAAATAAT
ATATTAATATAATATAAATTTTCAATTTTAAATCAATCATTAAGTTGTTTAATGTTTAAT
AGAAAATTAGTAATGTAAAAATTAGATGATGTTTAAATTTATTTTTAAAATTAAATCAAA
CAGTATCTGCATTCTCGCTTTCGATAACGCTACTAATGCTTAAGAAGGTTTAAATAAATT
GAACGGTCTTAAATTCATGAAATATTAATTGAGCGCTTATTCTTTGTATAGTTTCTAACA
AGCTCTTGACTGTCCTGATGAATTCACAGCTCCTGTTAATTTGACCAAAAGAGAACTTTT
AGAGTGGAACTTTGAAAACAGAAAAAGTTTAATGTCATTATAAATCGGTAACAAGGTCTA
TAATTACTGGGTTTCCCATCTAGAAAACGAACTTTAAAACATTTTAATGAAGCCTGTTGA
AGAAGGTAATACTTTGTTTATTTCAATAAAAGATATTTTTATTTTCTTCTTTTTAAAAAA
ACAAAAAAAATTAATAAATCAAAAGTTTTTTTAATTTTAGCTTAGTTAGCAAAGTGCTAC
TTGATAATTATTTTAAAAATGGATAGAAAATCAATCGCAATCAATTAAAAAAAACAAATC
AACAATTAACAACCCTTTTAACAATATATTTTGATAGAAATAAAACCTAATTTAGCAATT
ATAATATTTTTTTACTCAATAAAAATTAATTATGCAAATCAGCCACATTAAATTGATAAT
CAGAAATAATCATCGAAATTAACATGCATTAATTTTTATAAAATACAAACGCTTTTTATA
TTGAGATTGTAATATTCTTTTTTATGCCAACAATTAGGTTAAGCTCCAGTCAATCCTGAA
AATTTGTACACACCCCTTGAAAGCTCTACTAATGAAATCGTTTGGAGCAAGAATGGTACT
TACATGGTTGAAATTTTACCTACTGGTTTCAGATTATATGGTGGAAAAGATTTGAAAAAG
CTTTCTTTCTTCCCTCACCCTGAAGTTAAAAATATCGAATTCTCTCCTTGCGAAAACTAT
ATTCTTTCTTATAACGGAACTATTGTCGATGCTCCTAATGAAGATAATTTCATCGTATGG
TAACTTAACGAAGTTAAGGTACTCAGAGTTTTCAAAGCTAAACAACAAGATGTTTGGACT
ACTATGAAATGGAGTTACGATGGTAAATATATTGGTAAAATCGATGATCACAAGGTCTCC
GTTTACGAACTCCCTGAAATGAAAATGCTTGAAGATAGTTCAAAAAATCCTACATCAATA
AATATTAGAAATGTACAGAAATTTTTCTGGTCTAGCAAGTAAAATATTCTTATTGGCTGT
TCTTACTATGGTCCTCATCGTGAACACGATAAGCAAGTCTCAACTAGAATTTCAATGTTT
GAAGTAAGCATTTAAATATTAAAATCAAATTGTTTTTATTTACATATACTGACATTAATT
TGTAATAAAAAGATTCCTAGTAGAAGAGAATTCAAGTGGAGAACAATTAGCAACGAAAGT
TCTGATATTGATATTTTCCCAAGTGTCAATGGTCAATACGTTATTGCCATCATTAAAAAG
ATTAAGAATAAAAAATCTAATTAATAGTCCTCTTCCCATACTATATAAGTTGCCAATATT
CGTAACAAAGGTTAAATGGATATCTGTGAACAAGAAATTAATGAAAAGGTTCACACTTAC
TCTGTCGATCCTTACTAAGGTCGTATTGGTTTAATTTACAAGGCTGGCGAATTAAGTAAG
ATCAATAATTTATTTTGGATAGCTTATAAATTTTAAATTAAATTTGCAAATTATTAGGAG
GAGAATAAAAGTCTATGATTTATCACACTTAAATTTACCATATTGAAGAAGAAAGCAAGA
GTTATACCATTAAAGATGCTGGTAGATTTAGCAATAAAAATACAAACGAAATCTAGTTCT
CTAACAGCAGTGGATTCTTTGTTTTGATTAATAAGGATATTAATTCTTCCTATTGTGGTT
ATATGGAAACTGGTTTCACTCGTAAGGATAAGGGCAAATTAATTAGTGAAATTACCAGAT
CTTACAATAACTTATCATATATTGATAGTGCTGCTTACGATCAATCAGGACGTTACATAT
TTACTAGCTCTCAAAAAACAAAATCATTCCAAATTTGGACTGCTTTTGGTGATTAAATTT
TCAAGGATACTATAACTGACCCTGCTGGTATTAAAAATATAATTTGGAGACCTAGACTTA
CTCATTTACTTGACGAAAAGTAGGAATCATTAATCCAAACCACTTACAAGGATTACAAAA
AAACGTAAATTTTAAATTATTAATGAAACACCATAATAGTAAAATGTTAAAAAAATAGCT
ACGAAGAAGAAGACGATAAGATTATCAATAAGAAAGAACATGAAAGAAGAGAAAAAAGAG
ACAAATTAAAATAAGAAGTAATAATATTAATTGATATGTTATAATTAATAATAATAATAA
TTTATTATAAAATATAAGTTCTTAGAATATTTAAATGCCAAGAGAAAAGAATGGAAAGAT
ACTAAACAAGAAAGAGTTGCTCTTTTAGGTAATTAATTAATTAATTAATTTTATTAAGTA
TATTAATAATTTTATTCACTTATTTATATAGGTTTTGATGAAGAAGATGAGACTGATATT
GTTTATGATGAATTCATTGAAAACGAAAGAGTTGTACAAACTGAAATCATTGATGAAGAA
GAAATCGAAGATCCTAACAACTGA


>TTHERM_00443100(protein)
MVDLYKEIDFSQELKDTPELEPFLKAKAKEEQEELSSDYIQKPFLDRSYHEFIIVTGLPN
TEAAKTEQFKTFFQNKILQPTALLEKIKVIEFQLDNDGNFQGICILAFDNATNAQEGLNK
LNGLKFMKYQLSAYSLYSFQQALDCPDEFTAPVNLTKRELLEWNFENRKSLMSLQIGNKV
YNYWVSHLENELQNILMKPVEEGQAPVNPENLYTPLESSTNEIVWSKNGTYMVEILPTGF
RLYGGKDLKKLSFFPHPEVKNIEFSPCENYILSYNGTIVDAPNEDNFIVWQLNEVKVLRV
FKAKQQDVWTTMKWSYDGKYIGKIDDHKVSVYELPEMKMLEDSSKNPTSINIRNVQKFFW
SSKQNILIGCSYYGPHREHDKQVSTRISMFEIPSRREFKWRTISNESSDIDIFPSVNGQY
VIAIIKKIKNKKSNQQSSSHTIQVANIRNKGQMDICEQEINEKVHTYSVDPYQGRIGLIY
KAGELRGEQKSMIYHTQIYHIEEESKSYTIKDAGRFSNKNTNEIQFSNSSGFFVLINKDI
NSSYCGYMETGFTRKDKGKLISEITRSYNNLSYIDSAAYDQSGRYIFTSSQKTKSFQIWT
AFGDQIFKDTITDPAGIKNIIWRPRLTHLLDEKQESLIQTTYKDYKKTYEEEDDKIINKK
EHERREKRDKLKQEFLEYLNAKRKEWKDTKQERVALLGFDEEDETDIVYDEFIENERVVQ
TEIIDEEEIEDPNN