Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00455500

Standard Name

JMJ2 (JMJC domain-encoding 2)

Aliases

PreTt20279 | 53.m00181 | 3712.m00042

Description

JMJ2 JmjC domain protein; JmjC domain containing protein

Genome Browser (Macronucleus)



Genome Browser (Micronucleus)

External Links

Gene Ontology Annotations

Biological Process

Domains

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

Tetrahymena Stock Center

  • ( SD01739 ) Micronucleus: PAR1 gene partially replaced by neo4-KanR2 cassette. Macronucleus: JMJ2 gene partially replaced by neo4-KanR2 cassette.
  • ( SD01774 ) Micronucleus: JMJ2 gene partially replaced by neo4-KanR2 cassette.
  • ( SD01775 ) Micronucleus: JMJ2 gene partially replaced by neo4-KanR2 cassette.

Homologs

Source Identifier Score
Tetrahymena borealis EI9_13742.1 9.997093137033517e-262
Description: jmjC domain-containing protein (678 aa)
Oxytricha Contig16165.0.1.g65 7.002855521298715e-86
Description: JmjC domain, hydroxylase
DictyBase DDB_G0268778 3.999543040313994e-55
Description: rbbB on chromosome: 1 position 2082803 to 2086499
WormBase WBGene00004319 6.001502944943701e-53
Description: locus:rbr-2 Lysine-specific demethylase rbr-2 status:Partially_confirmed UniProt:Q23541 protein_id:CAA93426.2
SGD YJR119C 2.9995979253168707e-35
Description: JHD2 JmjC domain family histone demethylase specific for H3-K4 (histone H3 Lys4); removes methyl groups specifically added by Set1p methyltransferase; protein levels regulated by Not4p (E3 ubiquitin ligase) polyubiquitin-mediated degradation
Stentor Coeruleus SteCoe_29255 8.533047625744066e-17
Description: None

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:22427430: Chung PH, Yao MC (2012) Tetrahymena thermophila JMJD3 homolog regulates H3K27 methylation and nuclear differentiation. Eukaryotic cell 11(5):601-14

Sequences

>TTHERM_00455500(coding)
ATGGGTAGAGGTGATAGGTGCAGTGTTAGAACTAAAAAATGCCCAAAAACGGCTGAAAAA
TCTAAACAAAAGGCACATACAAAATAAATATCAAAAAAAATTTAAAACTCTCACGGGAAT
ACGTGCACCATAAATGTAAACACCCATGCTATACTAAGTAACTCAACAGCTATAAAGGTA
AAGGCTAGAAAGGTATCTTAAAAACGCATACCTTCCAATAAAATGATTTCCACTGAAGAT
TAGAAAGTAGAAAGAAATGTTAAAAATCCATCGCTTATACTTATTGAAGATGAATCCCAT
TCCACGAATTTTGAATCATACGCAAGTCCGAGAATGAATTGTGTAGTAAGCTAGTCACCA
GCTAATAGCCCTTCTTAAGACTATAATAATTAAGACTATTGCTCTCATAACTAGCATTTG
CACCCGAACTAGAACTCAATATTCTACTCAATGAGATGCGGTGGCAATGTATAGTAGTAG
TCTAGAAATGGTAGCAAGACTTCTATTGAGAACATTAAATCACATCAATCAATCAATTTT
TAGGGTGAAGATCTATTAAGTCTTAATCCACTTTAAAACCCTAAAATGCGCTTACCTTCC
GAGTATTCTTCTTTTATCGAAGTACCTACAGTATTTCCTACTGAAGAGGAATTCAAAGAC
CCCTATAAATTATTTGCTATGTTACATCAATAGGGTTATCACAAACATGGAATAGTTAAA
ATTATCCCTCCTAAGTCTTGGAAACCCTAATATAATTTTGATAAAATTACAGAAAAAGTT
ACAACAAGAACTCAAATCTTGGCTGAGCTCTCGCAAGCCTAGCCTTTCTCTTAAAATAAT
GACTAATACACTTACAAAGAATTTAAAAAGATGGCAGATGATTTTAAAAAAACGTATAAA
TTTTAGACCAAAACAAACTTTTAGAACGAATATCGTTAAATTGAATATGAGTTTTGGGAG
CATGTAGAGCACCCCGAACTATTCAAGGACGAGCTAGAAGTTGAATATGCTGCCGACTTA
CCCTCAAAAAAATATGGATCAGCATTCTCTGTTATGGATAACATGCACAACTCTACCTTC
AATTTGAATAACATCAACTCTATAAAAAATTCTCTATTTTAGCACTTTTCTAAAGACCAC
AGTGGCATAAGTGGGATCAGTAATCCTTGGGTATATTTAGGAATGATGTTTGCTTCTTTT
TGCTGGCACGTAGAAGATTTATATATGTGCGCCTTAAATTATTTACACATAGGAGAAGCT
AAAACTTGGTATGGCATTCCTCCAGAATACAAATACAAGTTTGAAGAAGTCTATAAGAAA
ACATATCCTCAAATTTTCAAAAAGAAGCCTGATGTTTTATTTCACATTAATTTGATGCTA
TCTCCTGCTGTTGCTTTAGAAAATGGGATACCAGTTTACAGAACTGAATAAAAACCAGGC
GAGTTTATATTTACATTCCCTAAAACATACCATGCTGGATTCTCTCATGGATTTAATTGT
GGAGAGGCTGTGAATGTAATTACTTTTGATTGGTTCTAAAATTATTAAGAGGCTGTATAG
TACTATTAAACAATAAAACACCCGACTAAAAATTATTTTAAGAGTGCCTCTTTTGCTGTT
GAATGGTTAATTTCTTAAGTTATTATGAACATGGAATAATCAAAATTCGATCTTTCAACT
TTAGTTAAAATAAAAGAGGAATGGAGCAAAATTGTTTAAGCAGAGTAGTAAAAAAGAAAA
AAAGTTTTAGCCAAATATGGAGAAGAAAATGTAAAAATATGCGAGTTTTCAAACAAAAAG
GAAAGATATGACAGACATATCTGCTGGCTTTGTGGATATTATAGTTTTTACAGCTACTTA
TTTTGTAATAGTTGTATTAAAAAGAGTTGCACCAGCCATGATACTCCTTGTAAGTGCAAT
AAAACTCCTTAACTTTTCATTCGCTTTACAGATGAGGACTTTGCAGAGTAGGAAGAAATA
ATAAATTAAAAAATGAAAGAATGCTCCTAATGA


>TTHERM_00455500(gene)
ATGGGTAGAGGTGATAGGTGCAGTGTTAGAACTAAAAAATGCCCAAAAACGGCTGAAAAA
TCTAAACAAAAGGCACATACAAAATAAATATCAAAAAAAATTTAAAACTCTCACGGGAAT
ACGTGCACCATAAATGTAAACACCCATGCTATACTAAGTAACTCAACAGCTATAAAGGTA
AAGGCTAGAAAGGTATCTTAAAAACGCATACCTTCCAATAAAATGATTTCCACTGAAGAT
TAGAAAGTAGAAAGAAATGTTAAAAATCCATCGCTTATACTTATTGAAGATGAATCCCAT
TCCACGAATTTTGAATCATACGCAAGTCCGAGAATGAATTGTGTAGTAAGCTAGTCACCA
GCTAATAGCCCTTCTTAAGACTATAATAATTAAGACTATTGCTCTCATAACTAGCATTTG
CACCCGAACTAGAACTCAATATTCTACTCAATGAGATGCGGTGGCAATGTATAGTAGTAG
TCTAGAAATGGTAGCAAGACTTCTATTGAGAACATTAAATCACATCAATCAATCAATTTT
TAGGGTGAAGATCTATTAAGTCTTAATCCACTTTAAAACCCTAAAATGCGCTTACCTTCC
GAGTATTCTTCTTTTATCGAAGTACCTACAGTATTTCCTACTGAAGAGGAATTCAAAGAC
CCCTATAAATTATTTGCTATGTTACATCAATAGGGTTATCACAAACATGGAATAGTTAAA
ATTATCCCTCCTAAGTCTTGGAAACCCTAATATAATTTTGATAAAATTACAGAAAAAGTT
ACAACAAGAACTCAAATCTTGGCTGAGCTCTCGCAAGCCTAGGTAAATATTTAGAATATT
TAAATAAATATAAAATGATGGAGAATTTTTAGTATGTTTCTTAAAGTAGGAGTGATATTA
AAGGGAGTATAAAAATCTTAAAATAAATCTATTTTTACTTTTTTTGACATTAAAAAATAG
CTTTGATTAAGCTAATACAAATATAATTTCTGATTCAGCTGTCTCTTAATATTGATTATA
AAAATTCAGCTTCTAAATTTATAGACATAGCAGAATGAATCTAAATGAGTGGATTTTATT
GCACCAAATTTATTTTACTCTAATCCTACTTTTATAGCTCTTATTAAAAACAAACAAATT
AATTTCTCCTTCTTTACTTAAAAAATTAATCAGCGGTTCAATAATTTTACAAAATAATTT
TGTATGAACTTGATAAAATATTAATATTTTATTTTTAAAATATATTTATTAATAGCCTTT
CTCTTAAAATAATGACTAATACACTTACAAAGAATTTAAAAAGATGGCAGATGATTTTAA
AAAAACGTATAAATTTTAGACCAAAACAAACTTTTAGAACGAATATCGTTAAATTGAATA
TGAGTTTTGGGAGCATGTAGAGCACCCCGAACTATTCAAGGACGAGCTAGAAGTTGAATA
TGCTGCCGACTTACCCTCAAAAAAATATGGATCAGCATTCTCTGTTATGGATAACATGCA
CAACTCTACCTTCAATTTGAATAACATCAACTCTATAAAAAATTCTCTATTTTAGCACTT
TTCTAAAGACCACAGTGGCATAAGTGGGATCAGTAATCCTTGGGTATATTTAGGAATGAT
GTTTGCTTCTTTTTGCTGGCACGTAGAAGATTTATATATGTGCGCCTTAAATTATTTACA
CATAGGAGAAGCTAAAACTTGGTAATTATTTTATTATTTTATCCTCAATTTAATGAATAA
ATTTTTTTTTCTATTTCCTTCATTAAAACTTTTAGCTTATTTTTCTATTTCGAATTATTT
TTTGTGTGATAATTTAAAAAAATCACAATCTAAAAAGATTAAATGGCTTCCTTCATTATT
TTAAATTACATTTATTATTTTAAGGAAAGCCATTCATTCTACTAATCCTAATTAATTCAA
TCATATTTTTACATATCAATCTATTAATTATGCATTGGCTAGATAGATCGCATTCAAGTT
TTTTTAAATACAAGCAAATTCCCCCCTTTATTCATATGTATTCATTTACAATACAAAGAC
TATTAAATAAATGTATTAAATCAAGATTCTTTACTATCTGCACATTTTGTAAATATTCAT
ATTATGGAAATCTAACAGATGGAGGTTTTATTAATTTTTATCTAAGGAATTATTAAATTA
CGTCATATCACATTAGTATTTTTAGATAAAATTTAAAAAATTCCAACTTAAATTTTGCAC
TTTTTTAATACTTTTTTCTTCCAAAATTGAAAAAAATTAATGCATTTGATAAAGATTAAA
GTTATATTTAAATAATCATTAAGAAATTTAAGTCGTTTAAATTAACTGCAAGTCTCATTT
CAAATTTATTTTTTTTAAAAGGTATGGCATTCCTCCAGAATACAAATACAAGTTTGAAGA
AGTCTATAAGAAAACATATCCTCAAATTTTCAAAAAGAAGCCTGATGTTTTATTTCACAT
TAATTTGATGCTATCTCCTGCTGTTGCTTTAGAAAATGGGATACCAGTTTACAGAACTGA
ATAAAAACCAGGCGAGTTTATATTTACATTCCCTAAAACATACCATGCTGGATTCTCTCA
TGGATTTAATTGTGGAGAGGCTGTGAATGTAATTACTTTTGATTGGTTCTAAAATTATTA
AGAGGCTGTATAGTACTATTAAACAATAAAACACCCGACTAAAAATTATTTTAAGAGTGC
CTCTTTTGCTGTTGAATGGTTAATTTCTTAAGTTATTATGAACATGGAATAATCAAAATT
CGATCTTTCAACTTTAGTTAAAGTAATTTTCTTGAAAATTAGCAAGCATTAATTTAATTT
TTTTAAACATTTTAAATAAAATTTATATTTGTTATTAAACTTAGATAAAAGAGGAATGGA
GCAAAATTGTTTAAGCAGAGTAGTAAAAAAGAAAAAAAGTTTTAGCCAAATATGGAGAAG
AAAATGTAAAAATATGCGAGTTTTCAAACAAAAAGGAAAGATATGACAGACATATCTGCT
GGCTTTGTGGATATTATAGTTTTTACAGCTACTTATTTTGTAATAGTTGTATTAAAAAGA
GTTGCACCAGCCATGATACTCCTTGTAAGTGCAATAAAACTCCTTAACTTTTCATTCGCT
TTACAGATGAGGTAATTATAATTTATAAATAAATTAGCTTTCTTTACTTTAGAAACATTT
AAAAAATAAATGAATAAAATATAATATATTTTTTTACAAAAAAAGGACTTTGCAGAGTAG
GAAGAAATAATAAATTAAAAAATGAAAGAATGCTCCTAATGA


>TTHERM_00455500(protein)
MGRGDRCSVRTKKCPKTAEKSKQKAHTKQISKKIQNSHGNTCTINVNTHAILSNSTAIKV
KARKVSQKRIPSNKMISTEDQKVERNVKNPSLILIEDESHSTNFESYASPRMNCVVSQSP
ANSPSQDYNNQDYCSHNQHLHPNQNSIFYSMRCGGNVQQQSRNGSKTSIENIKSHQSINF
QGEDLLSLNPLQNPKMRLPSEYSSFIEVPTVFPTEEEFKDPYKLFAMLHQQGYHKHGIVK
IIPPKSWKPQYNFDKITEKVTTRTQILAELSQAQPFSQNNDQYTYKEFKKMADDFKKTYK
FQTKTNFQNEYRQIEYEFWEHVEHPELFKDELEVEYAADLPSKKYGSAFSVMDNMHNSTF
NLNNINSIKNSLFQHFSKDHSGISGISNPWVYLGMMFASFCWHVEDLYMCALNYLHIGEA
KTWYGIPPEYKYKFEEVYKKTYPQIFKKKPDVLFHINLMLSPAVALENGIPVYRTEQKPG
EFIFTFPKTYHAGFSHGFNCGEAVNVITFDWFQNYQEAVQYYQTIKHPTKNYFKSASFAV
EWLISQVIMNMEQSKFDLSTLVKIKEEWSKIVQAEQQKRKKVLAKYGEENVKICEFSNKK
ERYDRHICWLCGYYSFYSYLFCNSCIKKSCTSHDTPCKCNKTPQLFIRFTDEDFAEQEEI
INQKMKECSQ