Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00488350

Standard Name

COP1 (COat Protein (COP) complex subunit 1)

Aliases

PreTt08338 | 60.m00135

Description

COP1 coatomer subunit beta

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Gene Ontology Annotations

Molecular Function

Biological Process

  • axial mesodermal cell differentiation (IEA) | GO:0048321
  • hormone-mediated apoptotic signaling pathway (IEA) | GO:0008628
  • positive regulation of axial mesodermal cell fate specification (IEA) | GO:0048330

Domains

  • ( PF01602 ) Adaptin N terminal region
  • ( PF02985 ) HEAT repeat
  • ( PF03789 ) ELK domain
  • ( PF07718 ) Coatamer beta C-terminal region
  • ( PF08385 ) Dynein heavy chain, N-terminal region
  • ( PF08752 ) Coatomer gamma subunit appendage domain
  • ( TIGR00741 ) ribosomal subunit interface protein
  • ( TIGR01716 ) transcriptional activator, Rgg/GadR/MutR family, C-terminal

Gene Expression Profile

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source Identifier Score
Tetrahymena borealis EI9_13523.1 9.997093137033517e-262
Description: adaptin N-terminal region family protein (954 aa)
Oxytricha Contig21140.0.g103 4.999394169176705e-180
Description: Adaptin N terminal region
DictyBase DDB_G0284735 1.9992336839414155e-150
Description: copB on chromosome: 4 position 2394561 to 2397811
WormBase WBGene00021292 9.996472444528484e-132
Description: locus:copb-1 Coatomer subunit beta status:Confirmed UniProt:Q9TYL9 protein_id:CCD61981.1
SGD YDR238C 9.998919090800975e-129
Description: SEC26 Essential beta-coat protein of the COPI coatomer, involved in ER-to-Golgi protein trafficking and maintenance of normal ER morphology; shares 43% sequence identity with mammalian beta-coat protein (beta-COP)
Stentor Coeruleus SteCoe_21807 8.074506789675094e-73
Description: None

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences 

>TTHERM_00488350(coding)
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TTAAATAACTCAGAAAACAATGTTAAAATGGTAGTTCTTGATAAAATTTAATATATTCTC
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>TTHERM_00488350(gene)
ATGGCATCAGCAAATATATAATAAGCTAGCGAGCACAAAGAACGTTATTGTAGCATTTAT
ATTAGAGCTGAATAAGAGCAGCTCACTCCTTAAGAAATTAAGACTCTTCTTATGGGAAAA
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CTATTATCGCTATTTACTAAATATTTTTAAATTTCGGTGATGATCTGATTAATGATATCG
ATACTGAAATGGAAAAGGTCCTCTAAAACGAAACTGATTTGTCAACCAAAAGAAACGCTT
TCCTACTTCTTTATCATACCAACCTTGAGAAAGCTATGGCTTACCTCTATTAAATTATTT
AAGATGATAGAGTTGACGAAATGGGAGACATCATGCAACTTTCAGTCTTGGAACTCTTTA
GGTAATTTAATACTCAAAATATTTTTTGGATACAAAAAAAATGATATTGTCTACAAAAGC
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ATTTGGAATTGGAATGTATTTAGTTAAATAGCCAACAAATTGACTGATCATTCATTCTTT
GAATAAAGCATAATGTATAGTAGCAAAGAGTTAGAAATAATGTTAAATAAATAAAATTAC
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TGTCAAATTTTAGGTTTTTAGATCTCATTATTTAATTAATAGTTCAATAGTTGGTTTAAA
TTCTCATCAATAATTTTCGATATTAATATTATTATATCTATTACTCATTTTAAACTCTAA
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TACATATACAATGGTGTTCTCTGGATTCTTGGTGAATACTCCTCAGGAGAATAAGTCACC
CGTAGCTTAGATTAAATCTTAGAAGCAATTGGTTCACTTCCAATCACCTATGTTTAATAA
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AAAACAGTCATTTTAGCTGATGGTAGCTATGGTACTGAAGTAATTGAAGAAAAGGAAGCA
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TAAAAATAAAAAATAAATAATTACCATAATTTTTTACAAAAAAATAGAATAATCAGTTGA
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TAGTATTGCTGCCCGTACTTTACTAAAGCTGGTTTTCAAGATCAAGCTTGATGCTAAGAA
ATACAACAAGTACACTAGCTAAATTTTGTTAGTTTTCTGTTCTTTGATTAGATTGTACAC
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GTGTTAAGTTATTGACTGAGCCTAAGAAGTTTGTAAATGAAAAGATTTAATGGTTAGAAA
GCAATGAAAATATTGTGAAGCACAAAGAGAAATTGACAAAGAGAACTGATCTTGAACAAT
AAAGAGAAGAAAAGAAAGATTCACATATTGCCAAATAGCCTGATGATTTAATTGTTATTA
GAGCCTTGAAGTAAATAAAAAAATAAAATTGTAATAATTAACTTTTTAAATGTAAACTTA
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AGAATTTAAAGGAGTTGGAGAAGACAATGATTTTGCAAGCAAATTAAATAAATTGGTCTA
ATTAACTGGATATAGTGATCCAATTTATGCTGAATCATTTGTTTACATTCATAAATATGA
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AGAATTCTTCACTCAAGAAAATGATTAAAAGAGAGTAATTGAGAAGGCATAGGCTGTAAC
CTTATAACCTAACTAAAGTGCTTATGTAAAAACTTCTCTTAAATTCACCTCAATAGATAT
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AATCACTAAAGAAATAGATATTGACCTAATTGATTTCGTATATCCTGCAGAAATAGATTT
TAATTCTTATAGAGAAATGTGGGCTAAGTATGAATGGGAAAACCGTATTGTCATCAATCC
TCAAAAGATGTAAATAATTATTTAATAATTAACCTTAATATAAAATTTAAAAAAATATTT
ATTTATATTAATTAAAACTAAAATTTATTTTAATGTCTAAAAAAGCGAGATGTTATAATT
CTTCCTCTAATTCAAAGAATAATTTAAATTATATATGCTTAACGACGAAGAGGAAATCAA
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AAAGAAATAACTTTAAACTAAATTTAAATTATATAATATTAGGTGATGATTTCCTCATAA
ACATCAGCGCAGAGTCTCAAAATGGTTCTGTTACAGGAACAATTAGAATCAGAAGTAAAG
TTAAAGTAATTTTAATAATTTATCTAAATGAAGGTCGTTAACAATATATAATATAAAAAA
AGGGTGTAGTTGTAAGCATAGGATAAAAATATAGGTAATGA


>TTHERM_00488350(protein)
MASANIQQASEHKERYCSIYIRAEQEQLTPQEIKTLLMGKYEEKIKGLKSLIYAIIQDEN
FDKLTMTIITYLVPYQAENHDLKKILLYYWEIIEKVNKDGKLKDEMILVCNSLRSDLLHP
NEYLRGRTLRLVSRIMYKGILEPLISSIMESLNHKHTYVRRNAIIAIYQIFLNFGDDLIN
DIDTEMEKVLQNETDLSTKRNAFLLLYHTNLEKAMAYLYQIIQDDRVDEMGDIMQLSVLE
LFRKTCKYDPSQKSKLMKCILFFQKSRSPSVQFECANTLIQISNTPTTLKLATNIYVQLL
LNNSENNVKMVVLDKIQYILNIEPKYLEEQVIEITKVLNNPSNQIRKNAIDIISSLTNSR
NVSYIFPKVVKEVKKTISEENGKEFTKILLDFVEYCVFNFESVLDDVMNLINEVFLTNSG
LKQKTQDQVKRILTGIVTTYPQSRERLMSKLLERFRDISSPYIYNGVLWILGEYSSGEQV
TRSLDQILEAIGSLPITYVQQTTDDQKSEEKEAPKPTQKKYKTVILADGSYGTEVIEEKE
ARKQSVDASEQQDSQFRIILSQYSYIGSIAARTLLKLVFKIKLDAKKYNKYTSQILLVFC
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DFVYPAEIDFNSYREMWAKYEWENRIVINPQKIEMLQFFLQFKEQFKLYMLNDEEEIKNA
TVICVNFYAKTKLGDDFLINISAESQNGSVTGTIRIRSKVKGVVVSIGQKYRQ