Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00497660

Standard Name

KAT3 (KATanin 3)

Aliases

PreTt06931 | 62.m00215 | 3715.m00076

Description

KAT3 katanin con80 domain protein; Katanin p80 noncatalytic subunit

Genome Browser (Macronucleus)

Full Screen View

No Genome Browser Data Present

Genome Browser (Micronucleus)

Full Screen View

No Genome Browser Data Present

Gene Ontology Annotations

Biological Process

• renal sodium ion transport (IDA) | GO:0003096 | Ref:27726198

Domains

• ( PF00400 ) WD domain, G-beta repeat
• ( PF01344 ) kelch repeat protein

Gene Expression Profile

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source	Identifier	Score
Tetrahymena borealis	EI9_12714.1	9.997093137033517e-262
	Description: hypothetical protein (795 aa)
Oxytricha	Contig8346.0.g10	2.0007467515522948e-59
	Description: WD domain, G-beta repeat
Stentor Coeruleus	SteCoe_21826	1.0806392777072785e-30
	Description: None
SGD	YCR072C	1.9994498063102785e-22
	Description: RSA4 WD-repeat protein involved in ribosome biogenesis; may interact with ribosomes; required for maturation and efficient intra-nuclear transport or pre-60S ribosomal subunits, localizes to the nucleolus
DictyBase	DDB_G0282189	3.0007793728221555e-22
	Description: tupA on chromosome: 3 position 5574241 to 5576373
WormBase	WBGene00006474	4.001630327199692e-20
	Description: locus:wdr-5.1 WD repeat-containing protein wdr-5.1 status:Confirmed UniProt:Q17963 protein_id:CAA85487.1

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

1. Ref:27726198: Waclawek E, Joachimiak E, Hall MH, Fabczak H, Wloga D (2017) Regulation of katanin activity in the ciliate Tetrahymena thermophila. Molecular microbiology 103(1):134-150
2. Ref:17821280: Harrison JA, Fowler EH (1945) AN ANTIGEN-ANTIBODY REACTION WITH TETRAHYMENA WHICH RESULTS IN DYSTOMY. Science (New York, N.Y.) 102(2638):65-6

Sequences

>TTHERM_00497660(coding)
ATGAAGCGTAGGAATGCTAAGCTGATTGACTTTTAAAATAATCCTGGTTGTAAGATTTTA
ACTGCTAAATTTGGTAATTAGTCAAAATCAATTATTGCTTCTGGTGATGATAAAAATAAC
ATTTGTTTATGGAAATTCTCAAACGATATACCCATAAAAAAATTTGCTGGTTAAAATTAG
ACAAACCATTAAATAGAAACAACAGCTGTTTAATTTAACCATAGCGATAATATTTTATAT
ACTGGAACAAATAGAGGTATCATAAGTGTCTTGGATTTAGAAGCATAAAAATTAAGTCAT
ACTCTCAAGGGACATGGAGGCGGAATTAGTTCCTTAGCAATATTTCCTTATGAAGATTAA
AAAAATTTGTTGATATCTGGTTCAATGGATACTAATATTAAAATTTGGGATTTAAGAACT
AAAGAATGTGTTCACTAATTTAAGGGTCATACTATGCTAGTTAATTGCTTGGCAGGTTCT
CCTGATGGAAAAATGATAGCATCTGGTGGGTCAGATAGTTAAGTGAGGCTTTGGGATTAA
ACTACAGGAAAATGTTCTAATATATTTACACTACACGATGCATCAGTAACATGCTTATAA
TTTAATCCTGTAGAAATGGCTTTAGCAAGCGCAAGTGCTGATAGAACAGTGAAGTATTAT
GACTTAGATACTTATACTCTAATAAGCTAAACTAAGCCAGAGGCTACTAGCATCTAAAAA
ATTTTGTTTAACGTTGATGGAGATGTTCTATTTAGTGCAGCACATGAAAGTCTAAAAGTA
TGGAACCTAGATAAAGATGGATTGCTTCTTGATAATGTAGAGTCTTAATGGAGAGGAATC
ATGGATATGTAAATTTCAGAGAATGAAGATAATATAATTGGCGTTACTTCATATTAATAA
AACTTTGCTTTATGGGTATGCCCTTTAAAATTAATAAATATGGATTCTTCTGAGCAAGCT
ATCAATAATTAACTAAACAGAGTAAAAACAGGTTAATAAAATAATTCTAATAATCCTCCT
TAAAGAAACTTCTTACCATAAATAGACCCCATAAAAGGAAAATCTCCTCCTACGGATGAT
AATACATACGCTAAAATTCATAGCCCAGAAAACCATCTTCCTGGAAACTAAAGATCATAT
TCAGAAATGCATTCAAATAATTATTAGAACAACTAAGATTATCAGTATTTAAATTAAGGA
TATCAAAATACTCCTCAAATATTGCAAACTAAAGTAGAGAGCTATCCTAATTTACCATAA
ATAAATAATAACAGTGTCCATCATAATCTACCAAACTAATATGGGTATGCAAAATAATAA
TCTTAAGAATAGTTTGGTTACCCTAATTAATAGTAGGTCACAAACCAAAATATGCTTCCT
CCAACAAAGAGCCCTTAAATCATTAATGCAGTAATTCACAATTAGTACTCAAACGATGAT
TAAATGTTAAATAAAAAGAAAATTGTTGAATAAGAAGAAGATGAACACATAAATGAAGCA
ATAATTAACAAATAATTTGAAGAACTCAACAACTAATCAAGAATTTATAATTAAATTCTT
CCTCCAAAAGAATAAATTAAAATTGAATCCAACCTAAGCTCCTAATCTTCAAAAGAGGAA
ATTGAAGAAGAAATAGAAACATAAGAAAATAATAAAAAACAAAAACCCAAACCTCAATCA
CACGATGCTGTTGATAGAAATTTTGTGTAACCTTAATCATCAGGAGAGTAGCCCTTAGAT
TAGTCAAGTCTATCTATAGTAGATTCAATAGCTTAAAGCTTTCATTTGAATGCTGTTTTT
GATTAATAGTAATAATAATTACTAAAGCAAACTGAATTTATTGGCGATATCTCCAAAGAA
CATCAAAAATTTTTGATACTCATGAATAATAGATTAAACTATGTAAAGCCAATATAACAT
TGGTGGAATTAGGGAAATTCAAAATCATCTTTATATGCAATAAGTTAATTATATGATCCT
TGTTATGTTATGGATGCTCTATAAATGACATTAAATATGAATAAATTATAATACGTAAAT
GTTGAAGGTGTTGGAACTTTACTCTAAAAATGCAAAATCTTGATTGAAAGCAAATATTAG
TCGCATATTAAATTTGGTTTAGAATTTGTAAAGAAGATATTAGAATAATACAGAGATGAA
TTAATTAATGTGAAGACTTTTTCATTAATGAGCAAGGTAGATTTAGCAAGAGAGGAAAGA
ATAAAAAAGTATAACTCATTGATAGATGAGTTAAGGTCTATCTAAAAAATTTCAAGAATA
AAAAAAATAGTTGAACGCAAAGCTAAAGAAGATATTGGTCAGCTAGCTAATTTAGTATTG
ACAGATTTGAATTATCTTTTCGGTAAATTAGACAATGCAGCTCAGTAAGTTTGA

>TTHERM_00497660(gene)
ATGAAGCGTAGGAATGCTAAGCTGAGTAAATTTTAACTTCTTTTTTCTAAAAATATTTAC
AAGCATCCTTCAATTCAGATTCATTTTAAAAAACATGAATTTGATTGACTAATAAAAATG
AAAAATCATATTTTTTAATGACTGAAGAAGGTTTAGTTTATAGAATGGCATTTAAAAATA
TTGTTAAAATAATTAATGCATATATTTCATAATATTTTTGTTTTTAGTTGACTTTTAAAA
TAATCCTGGTTGTAAGATTTTAACTGCTAAATTTGGTAATTAGTCAAAATCAATTATTGC
TTCTGGTGATGATAAAAATAACATTTGTTTATGGAAATTCTCAAACGATATACCCATAAA
AGTAAAATCTAATCAATAATTTTAATAGCTAGCCATTTAATTTAAATTTAATTTTAAATA
ATTCGTAGAAATTTGCTGGTTAAAATTAGACAAACCATTAAATAGAAACAACAGCTGTTT
AATTTAACCATAGCGATAATATTTTATATACTGGAACAAATAGAGGTATCATAAGTGTCT
TGGATTTAGAAGCATAAAAATGTATAAAACTAGATTTTGTTACAAAAATTGTTTGCATAA
ACCTATTATTATTTTGAATAGTAAGTCATACTCTCAAGGGACATGGAGGCGGAATTAGTT
CCTTAGCAATATTTCCTTATGAAGATTAAAAAAATTTGTTGATATCTGGTTCAATGGATA
CTAATATTAAAATTTGGGATTTAAGAACTAAAGAATGTGTTCACTAATTTAAGGGTCATA
CTATGCTAGTTAATTGCTTGGCAGGTTCTCCTGATGGAAAAATGATAGCATCTGGTGGGT
CAGATAGTTAAGTGAGGGTATACTAATTCGCATTTATTAACTTAGCTAATTAACTTTAAA
ATTAATAATTTATTAAAAGCTTTGGGATTAAACTACAGGAAAATGTTCTAATATATTTAC
ACTACACGATGCATCAGTAACATGCTTATAATTTAATCCTGTAGAAATGGCTTTAGCAAG
CGCAAGTGCTGATAGAACAGTGAAGTATTATGACTTAGATACTTATACTCTAGTAAATAT
ATATTTATGAAAAAAGTATTTACAATATTGATATTAATTAGATAAGCTAAACTAAGCCAG
AGGCTACTAGCATCTAAAAAATTTTGTTTAACGTTGATGGAGATGTTCTATTTAGTGCAG
CACATGAAAGTCTAAAAGTAAATTAAAAGTTGCCATTTTAAAGAATGAAAAACTAGTTAA
TTAATTAAAATTTAATTAGGTATGGAACCTAGATAAAGATGGATTGCTTCTTGATAATGT
AGAGTCTTAATGGAGAGGAATCATGGATATGTAAATTTCAGAGAATGAAGATAATATAAT
TGGCGTTACTTCATATTAATAAAACTTTGCTTTATGGGTATGCCCTTTAAAATTAATAAA
TATGGATTCTTCTGAGCAAGCTATCAATAATTAACTAAACAGAGTAAAAACAGGTTAATA
AAATAATTCTAATAATCCTCCTTAAAGAAACTTCTTACCATAAATAGACCCCATAAAAGG
AAAATCTCCTCCTACGGATGATAATACATACGCTAAAATTCATAGCCCAGAAAACCATCT
TCCTGGAAACTAAAGATCATATTCAGAAATGCATTCAAATAATTATTAGAACAACTAAGA
TTATCAGTATTTAAATTAAGGATATCAAAATACTCCTCAAATATTGCAAACTAAAGTAGA
GAGCTATCCTAATTTACCATAAATAAATAATAACAGTGTCCATCATAATCTACCAAACTA
ATATGGGTATGCAAAATAATAATCTTAAGAATAGTTTGGTTACCCTAATTAATAGTAGGT
CACAAACCAAAATATGCTTCCTCCAACAAAGAGCCCTTAAATCATTAATGCAGTAATTCA
CAATTAGTACTCAAACGATGATTAAATGTTAAATAAAAAGAAAATTGTTGAATAAGAAGA
AGATGAACACATAAATGAAGCAATAATTAACAAATAATTTGAAGAACTCAACAACTAATC
AAGAATTTATAATTAAATTCTTCCTCCAAAAGAATAAATTAAAATTGAATCCAACCTAAG
CTCCTAATCTTCAAAAGAGGAAATTGAAGAAGAAATAGAAACATAAGAAAATAATAAAAA
ACAAAAACCCAAACCTCAATCACACGATGCTGTTGATAGAAATGTAATAATTTAAATTAT
CTTAAAACAATTTTATTATTATCATTTTATAATTTTTAAAATTAATTATTTATTTCTATT
TTATACAATCAAGTTTGTGTAACCTTAATCATCAGGAGAGTAGCCCTTAGATTAGTCAAG
TCTATCTATAGTAGATTCAATAGCTTAAAGCTTTCATTTGAATGCTGTTTTTGATTAATA
GTAATAATAATTACTAAAGCAAACTGAATTTATTGGCGATGTAATTGTTTTAGAATTTTA
TTAATTTAATTAAACTGTTTTTTTTAACTAAGATCTCCAAAGAACATCAAAAATTTTTGA
TACTCATGAATAATAGATTAAACTATGTAAAGCCAATATAACATTGGTGGAATTAGGGAA
ATTCAAAATCATCTTTATATGCAATAAGTTAGTAAAATATATTTTTTGTTTTAAAATAAC
TGAGAATTTGGATTTTTTTAAAATTGAATTTATATTTTTTGAAAAAAATGAACACATTTT
TTCAAATTGAGATGTTTGAATCTAATATTTATAATAATTTAGATTATATGATCCTTGTTA
TGTTATGGATGCTCTATAAATGACATTAAATATGAATAAATTATAATACGTAAATGTTGA
AGGTGTTGGAACTTTACTCTAAAAATGCAAAATCTTGATTGAAAGCAAATATTAGGTAAA
TTTGTATTAAAAATGATGAAATTTAACAAATTGTATAATTAAATTAAAGTCGCATATTAA
ATTTGGTTTAGAATTTGTAAAGAAGATATTAGAATAATACAGAGATGTAATTTTATTTAA
TTATATTATGTAAATTTATATCGTTTCTTGTAAAGGAATTAATTAATGTGAAGACTTTTT
CATTAATGAGCAAGGTAGATTTAGCAAGAGAGGAAAGAATAAAAAAGTATAACTCATTGA
TAGATGAGTTAAGGTCTATCTAAAAAATTTCAAGAATAAAAAAAATAGTTGAACGCAAAG
CTAAAGAAGATGTAAATCAATTTCATTAAAAATTTAATCCACTAATTGAATAAATAAATA
AATAGATTGGTCAGCTAGCTAATTTAGTATTGACAGATTTGAATTATCTTTTCGGTAAAT
TAGACAATGCAGCTCAGTAAGTTTGA

>TTHERM_00497660(protein)
MKRRNAKLIDFQNNPGCKILTAKFGNQSKSIIASGDDKNNICLWKFSNDIPIKKFAGQNQ
TNHQIETTAVQFNHSDNILYTGTNRGIISVLDLEAQKLSHTLKGHGGGISSLAIFPYEDQ
KNLLISGSMDTNIKIWDLRTKECVHQFKGHTMLVNCLAGSPDGKMIASGGSDSQVRLWDQ
TTGKCSNIFTLHDASVTCLQFNPVEMALASASADRTVKYYDLDTYTLISQTKPEATSIQK
ILFNVDGDVLFSAAHESLKVWNLDKDGLLLDNVESQWRGIMDMQISENEDNIIGVTSYQQ
NFALWVCPLKLINMDSSEQAINNQLNRVKTGQQNNSNNPPQRNFLPQIDPIKGKSPPTDD
NTYAKIHSPENHLPGNQRSYSEMHSNNYQNNQDYQYLNQGYQNTPQILQTKVESYPNLPQ
INNNSVHHNLPNQYGYAKQQSQEQFGYPNQQQVTNQNMLPPTKSPQIINAVIHNQYSNDD
QMLNKKKIVEQEEDEHINEAIINKQFEELNNQSRIYNQILPPKEQIKIESNLSSQSSKEE
IEEEIETQENNKKQKPKPQSHDAVDRNFVQPQSSGEQPLDQSSLSIVDSIAQSFHLNAVF
DQQQQQLLKQTEFIGDISKEHQKFLILMNNRLNYVKPIQHWWNQGNSKSSLYAISQLYDP
CYVMDALQMTLNMNKLQYVNVEGVGTLLQKCKILIESKYQSHIKFGLEFVKKILEQYRDE
LINVKTFSLMSKVDLAREERIKKYNSLIDELRSIQKISRIKKIVERKAKEDIGQLANLVL
TDLNYLFGKLDNAAQQV