Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00499530

Standard Name

BrEt-2 (Bromodomain and ET domain 2)

Aliases

PreTt07996 | 63.m00174 | 3716.m00028

Description

bromodomain domain protein

Genome Browser (Macronucleus)

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Gene Ontology Annotations

No Data fetched for Gene Ontology Annotations

Domains

  • ( PF00439 ) Bromodomain
  • ( PF04702 ) Vicilin N terminal region
  • ( PF06133 ) Protein of unknown function (DUF964)

Gene Expression Profile

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source Identifier Score
Tetrahymena borealis EI9_09681.1 9.997093137033517e-262
Description: bromodomain containing protein (921 aa)
SGD YDL070W 3.001003044337619e-17
Description: BDF2 Protein involved in transcription initiation at TATA-containing promoters; associates with the basal transcription factor TFIID; contains two bromodomains; corresponds to the C-terminal region of mammalian TAF1; redundant with Bdf1p
WormBase WBGene00000366 6.001122775063233e-17
Description: locus:cbp-1 Protein cbp-1 status:Partially_confirmed UniProt:P34545 protein_id:CAD18875.2
DictyBase DDB_G0270170 2.0004286606204839e-16
Description: DDB_G0270170 on chromosome: 1 position 4360881 to 4366105
Oxytricha Contig20804.0.g30 0.00000000000001000191320216021
Description: Bromodomain
Stentor Coeruleus SteCoe_26840 0.00000000000009357622968840175
Description: None

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:29523178: Saettone A, Garg J, Lambert JP, Nabeel-Shah S, Ponce M, Burtch A, Thuppu Mudalige C, Gingras AC, Pearlman RE, Fillingham J (2018) The bromodomain-containing protein Ibd1 links multiple chromatin-related protein complexes to highly expressed genes in Tetrahymena thermophila. Epigenetics & chromatin 11(1):10

Sequences 

>TTHERM_00499530(coding)
ATGAGTGATTAAGTATAAGAAATATTTTTGACATAAGAGTAATCAAAGTACATCAATAGT
ATGCTACCTAGAGGATACTCACTGTAATTCTCATCTTCTCACACTAGACGTGTTCAAATG
AATCCAAATGCTACAAAGTTAAATCAATATGAGCAAACACTGATCTAAGAGAGGTTAAAG
TAAACTAGATCCAAGATGAATCAGGCAGCAAATGCTTAAAATGCCGCATCATTAGCAGCC
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AAAATTTTAGAAAAGTAAGCAGCAAAAAGCTTAAAACAGCAAAATTAAGTTTTATAGTAA
GTAATTAGTGTTGACACACAATAGAAAGGAACAATTCCTGTTTCTGAAGACATAAGGGTG
TGCTTTTCGATATTGTAATAACTAAAGAAAAGCGAAAATGCAGGTCCATTTTTATAAAAA
GTTGATGCCTTAGCACAATAATGCCCTGACTACTATAAAATAATAAGAGATCCAATGGAT
TTATCGAAAGTGGAGTCAAATTTAAAACAGGGCTATTATTAAACTACTTTACAATTCGCA
GATGATGTTAGAAAGATATGGAATAACTCCTTTACATATAACTAAAAAGGAAGCTAAATC
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TAATAATAGAATTAGATTTAATAGCTATCTTCTGCTTCAGTGCCAATAACTTAAAATTCA
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TAACCTGATACAACTGCATAATAAGCCAAAGCTAAAGATAAATATTAAACCAAATTAAGT
TAAGATGAAATCAACTAACTTTATTAAAATATCGGATCGCTTACAGAAGACGATACAAAA
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CAATAGTCATAAGATGAATAGTAAGACAATAAAAAGAAGAAGAAGATTGGAAAATTGGAA
AAGAAAGACATCCCATTAACTATCAGTGAAAAGAAGCAACTAGGAATAAATATACGTAGA
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AATAACCTTTTATCAGACAGCTAACAATAAGCTAAAGCTTAGTTACCATACTCTACGCCT
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GTAAACAACTTCCCACAATAAACTAGCTTTACTGCTGCTTAGTAATATCCTGCCACAGCT
TACGCTAGTAATCCAGGTTATACATAAGCAAATTAACTTATTCAAAATAATGGTTCTGCT
TAAAATGCTGCAAGTGCAAAAGTCAACAACAGCTAAATGATATAGTAGGGATAGTATGTT
CAAGCTAATCCAGTAGCTTAGTAATAACTACCCATTGCTTAAGCAACTACATAATAAAAC
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TACTAAAATTAAATGATGATGAATTAATATCCTTCTGCTTTTCCTATTTAGTAACCTATG
CAAAGCGCTGTCATCGGTGGTTATCAGAACAGACCCAGCTAATAGTATGATGCAGGTTAA
TAAGGCATGGCAATACCAAGCATGATTAATTAAACTTAGCAACCTTATTCAGGATAGCAG
TATAATCAATAGGGATAAGCATAATATTAAGGATATGGAAATAACATGCAAAATATGTAT
ATGAATTAGCCTCTTAGTGCTAATTCAAATGGCAATCACAATAGAAATATTGTGCCTAAT
TAACAAATTCAATATGGAGCTAATACATAAGTGTAAAATGGAATCAGCTAATACCCTCAA
TCGTAAAATTACTACAATGCTTAATATCAATCAAACCCAAGCTAGTATTAGTAACATTTA
CAATAAATGAATGTAAATCCACAGTACAGCAGTAATAGTAATTAAGCTTAGTAATATAAC
GGTCATATTTAAAATTAGAATAACAGTGAGTAAAGTTCTGAAGCAATGCTCTCTGAAAGT
GAGGAAGAGTGA


>TTHERM_00499530(gene)
ATGAGTGATGTAATATCTTAAATAACTTCCTAAACAGAAGAGCAATCATTTATACTCAAT
TATTTGTGAATTAACTATCATTTTATTCTCTAAATTTTTTGAATTTCAGCAAACCTAATC
TTTGTGTATGATTTTAAAATTAGTAAGTATAAGAAATATTTTTGACATAAGAGTAATCAA
AGTACATCAATAGTATGCTACCTAGAGGATACTCACTGTAATTCTCATCTTCTCACACTA
GACGTGTTCAAATGAATCCAAATGCTACAAAGTTAAATGTAATTTACTTAAAATTTTTTA
GACCAAACTTTTGAGCTTTGTTTACAATTTTTGATGTTACATTAAAGATCATAATTTTAA
ACTTGGAAGAAAACTCTTAAGTATTAAGATAAATAACGATATGAAGGCATTCATATACTC
TTCACCCAAATACAATGCATAGGAAATAAATAAAATGAAATAGAATTTATAATATATTAG
TATAGCAAAATATGTTGCATAGAAAGATATGAAAAATAAAGTTCCTAAATTTTAGATTGA
TTTATTTAAATATCAAACAAAAGCAATATGAGCAAACACTGATCTAAGAGAGGTTAAAGT
AAACTAGATCCAAGATGAATCAGGCAGCAAATGCTTAAAATGCCGCATCATTAGCAGCCC
AACAAAATAAAAATGATAAAGATAAAAAGTTGTAATCCAAAAAAGAAAATATACCTGAAA
AAGAATAAATAGCCGATTCTCCAGAAAGCGGAAATACAAAGAAAAGAAAGTAGTAGGAAA
AAATTTTAGAAAAGTAAGCAGCAAAAAGCTTAAAACAGCAAAATTAAGTTTTATAGTAAG
TAATTAGTGTTGACACACAATAGAAAGGAACAATTCCTGTTTCTGAAGACATAAGGGTGT
GCTTTTCGATATTGTAATAACTAAAGAAAAGCGAAAATGCAGGTCCATTTTTATAAAAAG
TTGATGCCTTAGCACAATAATGCCCTGACTACTATAAAATAATAAGAGATCCAATGGATT
TATCGAAAGTGGAGTCAAATTTAAAACAGGGCTATTATTAAACTACTTTACAATTCGCAG
ATGATGTTAGAAAGATATGGAATAACTCCTTTACATATAACTAAAAAGGAAGCTAAATCT
ATAAAATGACAGAAGAAATGAGCAGGTTATTTGAAAAAATTTTTACTCAGGTAAAAAGTT
AATCACTTCCTAACCCTATGGAGTATCAGTAATAATTTTTTATTTAAATTATAAATGTAA
ATTCATTCAGAATGCTGAAAAATATGAATTTTTGTTAACTTAAACGAAGTAAAACACAAA
AGAAAGGTGGAAAAAATAATTTTATTTTCACATACAAAAAATACAGCAGTAAAAGTTATT
GGTTTTGAGTTGATTCATTTAAAAAATATAATTTTTGAACGAAATCCTCTATTTATTCAA
TAAAATTTCCTCAAAATTGTTGCACTTAATCTTCATTAGTTAATTAAGTGAAAATAAAAA
AATAATTCCATTCAAATTAAAAAAAATTGATTGATTGATTAATTAATTATTTGAACGAAC
ATCTTTTTATAAAATTTTTCAAATTTCTTTAGTGGATAAAAAAATTCCAAATAGGAGCAA
TAACAAAAAATTTCAAATAAAAAGCAATAGGTTGATGGTTGTAGCATTTAAATACATTTT
TAATTAAAATTTACACATTTACTTATATATCTTTTTGATCAAAAAATAAACAACATCAAG
ATCCTTTGCTTTCACTTACTTACATATATTAGGATATATAAATATAATTTTTTAATTTTA
GTTTACCAAAGTCGTAGAACTTAATAAATAAAAAATTAAATATCCTTCATTAATTAATTA
TCAATTTGTATTTTCATTCTCATAATTTTTTGCATACAAAATTAGAGATTCAATAGACGC
TTCTTCCAACTCTATCAACAATAATACCGCTTCGTCATTAAAGAAGAGAGCTAATAAATA
AGCATAAAATGTTACTTAATAATAGAATTAGATTTAATAGCTATCTTCTGCTTCAGTGCC
AATAACTTAAAATTCAGCTATACCAGCAAATCCTCCAAAACCTGAAAAATAAAAAAAGAC
TAAATAAACTGCTAACTAACCTGATACAACTGCATAATAAGCCAAAGCTAAAGATAAATA
TTAAACCAAATTAAGTTAAGATGAAATCAACTAACTTTATTAAAATATCGGATCGCTTAC
AGAAGACGATACAAAATAATTATACGAGTTAATAAAGGATTACTGTGAAACAAATAACGA
ATAGATTGAATTAAATATAGATAATCTCCCTATTAAAACTGCAAGAGAAGTACAAGAATT
CGTTCTTTTCAAAAGACGTTTACCATCTTAGCAATAAGTCAATCAATAACAATAATAATA
ATAATAGTTGTAGTAATAATAATAGTTGTAATAATAATAATAATTACAGCAGCAATAAAT
CCAATAATAGAAATAGCAATAGTCATAAGAGTAATTAATTCTATTTAATTTTTTACTTCA
CCATTAATTTTTGCTAAATAACCTTCAACTCAACCATAAATCTTAAATTTTTTCCAACTG
CTGAACTAAAATAAATTAATTGGTTAATGAAAAAAATATTTTGAATTATAAAAAGAAATT
TATATTGAAAATTATCGCAAAATAATTTATTTAAATTTTACATTAATATTATCATTTTAA
TTAACAAAAGTGAATAGTAAGACAATAAAAAGAAGAAGAAGATTGGAAAATTGGAAAAGA
AAGACATCCCATTAACTATCAGTGAAAAGAAGCAACTAGGAATAAATATACGTAGACTTC
CTCCAGAAGATTTAAATGGAATTTGGAGTATAGTATAAGATAGCTAATAAAATAGTGAAG
TGATAGAATTTGATATTGATACATTGCCAGTAAGAAAAGCTAGAGAATTAGAAGCATATG
TCAAGTAAAGAGCTGCATTTCAACAAAAAAAACAACGTGTTTAGAAAAATTAACCAAATA
ACCTTTTATCAGACAGCTAACAATAAGCTAAAGCTTAGTTACCATACTCTACGCCTACAA
CAACTACAACTGCAAGTACTACAGTAAATACTAATTAAACTCCAATTGATGCTGCAGTAA
ACAACTTCCCACAATAAACTAGCTTTACTGCTGCTTAGTAATATCCTGCCACAGCTTACG
CTAGTAATCCAGGTTATACATAAGCAAATTAACTTATTCAAAATAATGGTTCTGCTTAAA
ATGCTGCAAGTGCAAAAGTCAACAACAGCTAAATGATATAGTAGGGATAGTATGTTCAAG
CTAATCCAGTAGCTTAGTAATAACTACCCATTGCTTAAGCAACTACATAATAAAACATGG
CTTCTATATAAGGATACAATCATTTAAATTAATAATAGTATGCTTAGCAATCGACATACT
AAAATTAAATGATGATGAATTAATATCCTTCTGCTTTTCCTATTTAGTAACCTATGGTAC
TTTCTTGTTCACTTTTTTAAAACTTTTTAAAAATTTTATCAAATATAAAAGCAAAGCGCT
GTCATCGGTGGTTATCAGAACAGACCCAGCTAATAGTATGATGCAGGTTAATAAGGCATG
GCAATACCAAGCATGATTAATTAAACTTAGCAACCTTATTCAGGATAGCAGTATAATCAA
TAGGGATAAGCATAATATTAAGGATATGGAAATAACATGCAAAATATGTATATGAATTAG
CCTCTTAGTGCTAATTCAAATGGCAATCACAATAGAAATATTGTGCCTAATTAACAAATT
CAATATGGAGCTAATACATAAGTGTAAAATGGAATCAGCTAATACCCTCAATCGTAAAAT
TACTACAATGCTTAATATCAATCAAACCCAAGCTAGTATTAGTAACATTTACAATAAATG
AATGTAAATCCACAGTACAGCAGTAATAGTAATTAAGCTTAGTAATATAACGGTCATATT
TAAAATTAGAATAACAGTGAGTAAAGTTCTGAAGCAATGCTCTCTGGTAATTTTAAAAAA
CATTAAAATATTTAATAAAATTATTTAAATTGATTTATTTCTTAAAAATAATTAGAAAGT
GAGGAAGAGTGA


>TTHERM_00499530(protein)
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