Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00557810

Standard Name

RRM37 (RNA recognition motif-containing protein 37)

Aliases

PreTt07879 | 73.m00123 | 3735.m00017

Description

RRM37 RNA recognition motif protein

Genome Browser (Macronucleus)

Full Screen View


Genome Browser (Micronucleus)

Full Screen View

Gene Ontology Annotations

No Data fetched for Gene Ontology Annotations

Domains

  • ( PF00076 ) RNA recognition motif. (a.k.a. RRM,
  • ( TIGR01628 ) polyadenylate binding protein, human types
  • ( TIGR01648 ) hnRNP-R, Q splicing factor family
  • ( TIGR01661 ) ELAV/HuD family splicing factor

Gene Expression Profile

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source Identifier Score
Tetrahymena borealis EI9_14346.1 6.997264088033092e-153
Description: RNA binding protein (487 aa)
Oxytricha Contig10739.0.g63 2.998863950472602e-38
Description: RNA recognition motif_ (a_k_a_ RRM, RBD, or RNP domain)
SGD YBR212W 9.998720540547892e-23
Description: NGR1 RNA binding protein that negatively regulates growth rate; interacts with the 3 UTR of the mitochondrial porin (POR1) mRNA and enhances its degradation; overexpression impairs mitochondrial function; expressed in stationary phase
WormBase WBGene00015943 1.9991095569230066e-20
Description: locus:tiar-1 status:Confirmed UniProt:Q95QV8 protein_id:CCD65015.1
DictyBase DDB_G0290745 2.9992476920535046e-16
Description: pabpc1B on chromosome: 5 position 4494408 to 4497035
Stentor Coeruleus SteCoe_7581 0.00000000027894680928689246
Description: None

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences 

>TTHERM_00557810(coding)
ATGAGCAATTTAGATTTAAGAACATTGTGGGTTGGAGATATTGAAAACTGGATGACTGAA
TAATTTATTGAAAGTGTTTTTAATAAAGTTGGTAAGGTTGTTAGCGTTAAGTTAATCAGA
ACAAAAGAAACAAGTCTCCCTGCTGGTTATTGCTTCGTTGAATTTTAGACTCATGAACAA
GCAGAAAGAATTTTGATGAATTACAACTAGTAGTTAATCCCTGGAACTCAAAATACCTTC
AGAATGAATTGGGGAAAGAACCCTACTAACACTGGTATTATCAAGCAACCTACAACCTAA
GCTAATAATGGTTATGGAAATAATTAATATGGCATGATGCAATAGCCAGTGATCTAAATG
CCACCTATTTAAGAATTCTCAATTTATGTTGGTGAATTAGAACTTGGCATTAACGAGTAA
CAACTTGCAGAGCACTTCAGATCTAAGTATTCTAGTGTAATTGGCTCTAAGATTATTACT
GAACCTACCAGCAAGATGAGCAAAGGTTACGGCTTTGTAAAGTTTTCTAATCCTATTGAA
GGACAACGTGCTATTCATGAAATGAATGGCTCTCTTTTTAAGGGCAAATTCATTAAGGTT
TCTCAAGCTGTTTCAAGGTAATAATAACAGGCTTAAGCTTAAGCTGCTGGAACACCTGGA
TTCCCTTAACCCGCAGGTTATGGTGCTGCTACAGGTGCAGCTGATTATAACGGTTACGGC
TATTATCCTTAACAACCTTCTTAAGATCCTTATTATTAATACTAATAATAGTATGCTGGC
TATGCTTCTACTTAAAATACACAATATTAATATCCCTATTCATATTCTTCTTCTTACTAT
TAAAACGGAGTTTATGGTACAGACCCTTCTTAAATGTATGGCCAACCTGCTTAGGCAAGC
AATATGCATGGATATCAATATCCCGCCACTGCTAGTACCTAAAATGCATAGGGATAAGCT
CAATAGTACTCATAACAATATCCATAGTAAGGTTAAGTTCCTCAAGTACCTACTGCAACT
ACAGCTACTAATCCTGCTGCTATTTAATAATAGTATTATAATTAAACTGCTTAAACTCCT
CAAGCTGCAAACAGCTAATAAGTAGCCTCTACTCATGATAAATATTCTTAAAATAATTAT
TAATCCCAATAATAATCTGCTAGCAATGCTCACTACTCTCAATAGTAATAGTATTCTCAT
TAATAGCAGTAATCTTAAGTTCAATCACAAGCATCCAGCCAATCATAAACTGCTCAACAA
CAATAGCTCTCAACTTAATAGTAATTGAACTAAACTGAAAAGAAGTCTGATGCTAACTCT
ATACCCACTCCCTCTGTTAAGGAATCATCTTTATTCCAAAAGCCTAGCTCTGATTTCATC
GGATATTAAACTGAATACGTAAGCATGACTGGCGAGCTTGAATTCATTTTGAAGCACAAC
ATATGCTGA


>TTHERM_00557810(gene)
ATGAGCAATTTAGATTTAAGAACATTGTGGGTTGGAGATATTGAAAACTGGATGACTGAA
TAATTTATTGAAAGTGTTTTTAATAAAGTTGGTAATAAATTAATTATTTATCAATAAGTT
TAACTAAAAATATGATTTTTATTTTGAAATTTTATGATATGCAGCTTGAAATAAATTCTA
ATACATTATTTTTTATAACAATAGGTAAGGTTGTTAGCGTTAAGTTAATCAGAACAAAAG
AAACAAGTCTCCCTGCTGGTAATGAAAGCTTTATATTATCTGTCTTGAAGACTCTTAACA
TATTATTTATTTATATTATAAAGGTTATTGCTTCGTTGAATTTTAGACTCATGAACAAGC
AGAAAGAATTTTGATGAATTACAACTAGTAGTTAATCCCTGGAACTCAAAATACCTTCAG
AATGAATTGGGGAAAGAACCGTAAGATTCATTTATAAGCCAAAAACCTTATTTATCTTTT
TTTATAATTAAATAGCTACTAACACTGGTATTATCAAGCAACCTACAACCTAAGCTAATA
ATGGTTATGGAAATAATTAATATGGCATGATGCAATAGCCAGTGATCTAAATGCCACCTA
TTTAAGAATTCTCAGTAATTAAAATGATTATTTTAGAAAAACAATTTGCCTATTTTTAGA
AACATTGTTAAAAATTGCTCTTAATTATGAATAAATAATTGATTGATTGATCATCCCACT
TTAGAAAAAGACTTTTATTCTACAAAGTCAAAAATTATTTTAGCATATTTATCTTCTATG
GAATACTAAGAAAAGTGATCTCATACGTAGTGTGCGAGTTAATAGATGAGAAATTGGAAT
TGATATTTAAAATGATGAAAGTTGAAAAAAAGATATTAAACAAATAAATTTATCTAGACG
ACAGCTGTTATAAATAAGATTGATTATAAAAAAATTTAAAAGAAGATAAATAGAGAGCGA
AAATATCTTATAATCAAATAAATTAAACTTGTATTTTTTGAAAAAGAAGAGCATATATTA
TAAATAAGGAAATAATTAAATATCTTCGATAGCAAAAAAAAACAAACTTTGTAATAGACT
AAATTTTTACTCAAAATAAGTGTTTAAATTAAGTGGGAAAATTATCATATTTCATTGGTT
CATTCATTCATTTGTTTATCTTAAGGGCAATATTTAATAATCACTTGCAAAATAAATAAA
ACAGAAATTAACTTTTTTTTTTAAATATTTAGATTTATGTTGGTGAATTAGAACTTGGCA
TTAACGAGTAACAACTTGCAGAGCACTTCAGATCTAAGTATTCTAGTGTAATTGGCTCTA
AGATTATTACTGAACCTACCAGCAAGATGAGCAAAGGTTACGGCTTTGTAAAGTTTTCTA
ATCCTATTGAAGGACAACGTGCTATTCATGAAATGAATGGCTCTCTTTTTAAGGGCAAAT
TCATTAAGGTTTCTCAAGCTGTTTCAAGGTAATAATAACAGGCTTAAGCTTAAGCTGCTG
GAACACCTGGATTCCCTTAACCCGCAGGTTATGGTGCTGCTACAGGTGCAGCTGATTATA
ACGGTTACGGCTATTATCCTTAACAACCTTCTTAAGATCCTTATTATTAATACTAATAAT
AGTATGCTGGCTATGCTTCTACTTAAAATACACAATATTAATATCCCTATTCATATTCTT
CTTCTTACTATTAAAACGGAGTTTATGGTACAGACCCTTCTTAAATGTATGGCCAACCTG
CTTAGGCAAGCAATATGCATGGATATCAATATCCCGCCACTGCTAGTACCTAAAATGCAT
AGGGATAAGCTCAATAGTACTCATAACAATATCCATAGTAAGGTTAAGTTCCTCAAGTAC
CTACTGCAACTACAGCTACTAATCCTGCTGCTATTTAATAATAGTATTATAATTAAACTG
CTTAAACTCCTCAAGCTGCAAACAGCTAATAAGTAGCCTCTACTCATGATAAATATTCTT
AAAATAATTATTAATCCCAATAATAATCTGCTAGCAATGCTCACTACTCTCAATAGTAAT
AGTATTCTCATTAATAGCAGTAATCTTAAGTTCAATCACAAGCATCCAGCCAATCATAAA
CTGCTCAACAACAATAGCTCTCAACTTAATAGTAATTGAACTAAACTGAAAAGAAGTCTG
ATGCTAACTCTATACCCACTCCCTCTGTTAAGGAATCATCTTTATTCCAAAAGGTAACTT
TATTAATTTAAACTAATAAAATATGATATTTATTTTAGATCGATTTTAAATTTAAATAAA
CTCTTATTATTGATCGACAACAAATATTAAATAAATCAAATATTTAATAAAAAAATAAAT
TAAATTTTAATAATATAAATAGCCTAGCTCTGATTTCATCGGATATTAAACTGAATACGT
AAGCATGACTGGCGAGCTTGAATTCATTTTGAAGCACAACATATGCTGA


>TTHERM_00557810(protein)
MSNLDLRTLWVGDIENWMTEQFIESVFNKVGKVVSVKLIRTKETSLPAGYCFVEFQTHEQ
AERILMNYNQQLIPGTQNTFRMNWGKNPTNTGIIKQPTTQANNGYGNNQYGMMQQPVIQM
PPIQEFSIYVGELELGINEQQLAEHFRSKYSSVIGSKIITEPTSKMSKGYGFVKFSNPIE
GQRAIHEMNGSLFKGKFIKVSQAVSRQQQQAQAQAAGTPGFPQPAGYGAATGAADYNGYG
YYPQQPSQDPYYQYQQQYAGYASTQNTQYQYPYSYSSSYYQNGVYGTDPSQMYGQPAQAS
NMHGYQYPATASTQNAQGQAQQYSQQYPQQGQVPQVPTATTATNPAAIQQQYYNQTAQTP
QAANSQQVASTHDKYSQNNYQSQQQSASNAHYSQQQQYSHQQQQSQVQSQASSQSQTAQQ
QQLSTQQQLNQTEKKSDANSIPTPSVKESSLFQKPSSDFIGYQTEYVSMTGELEFILKHN
IC