Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00569500

Standard Name

GEF1 (Guanine nucleotide Exchange Factor 1 )

Aliases

PreTt10478 | 76.m00180 | SEC7 | 3810.m02041

Description

GEF1 guanine nucleotide exchange factor; Guanine nucleotide exchange factor

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Gene Ontology Annotations

Molecular Function

Domains

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Gene Expression Profile

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source Identifier Score
Tetrahymena borealis EI9_03460.1 9.997093137033517e-262
Description: Sec7 domain-containing protein (2007 aa)
Oxytricha Contig10719.0.g52 9.997093137033517e-262
Description: Sec7 domain
WormBase WBGene00012386 9.998707956568768e-117
Description: locus:agef-1 status:Partially_confirmed UniProt:G5EFH7 protein_id:CAA21704.3
SGD YDR170C 3.0011595823640496e-94
Description: SEC7 Guanine nucleotide exchange factor (GEF) for ADP ribosylation factors involved in proliferation of the Golgi, intra-Golgi transport and ER-to-Golgi transport; found in the cytoplasm and on Golgi-associated coated vesicles
Stentor Coeruleus SteCoe_8405 9.964733010103672e-77
Description: None
DictyBase DDB_G0273101 1.0003503620230312e-57
Description: DDB_G0273101 on chromosome: 2 position 2569065 to 2575617

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:15717927: Mouratou B, Biou V, Joubert A, Cohen J, Shields DJ, Geldner N, Jürgens G, Melançon P, Cherfils J (2005) The domain architecture of large guanine nucleotide exchange factors for the small GTP-binding protein Arf. BMC genomics 6( ):20

Sequences 

>TTHERM_00569500(coding)
ATGTAGTAAATGTAGCAGCCAGAAGAAAATCTATAGCCTATTTAGATATACCAAGATATT
TTGGGTAATTCTTTTGAAAAGATCAAAAAGAATCTTCCTAAAAAATATCTTGGAGTCAAA
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AATGAAAAGAGCATCTTTTCTCTTTCATTTGGTATTTTCCTGTAGCTTCTTATTTACCAT
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AATGTTCTGAGTGAGTTTACTGACCTAATTAACTTTTAAGATCGTAGGATTGATGTTGCT
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GGTGCTTATACTCTTTCTTTCTTGCTTATCATGCTTCAGACAGATATGTACAATCCTTAG
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ATTTCTGAGAAAAATAAACTTTCGAGCAAATTTATTAAAGCTAATTCTATGTATTACATA
GGCCCTCTAGTTGAAACAATAGGACCTAAGATTTTAAGTGCTTTTAAGCATGCATTAGAA
AACTGTGATGATGATAAGACAGTCAGATTTTCATTGGAAGGCTTCAATAGCACTATTTTG
CTGAGCTGCCATTTTAATTTAGAATAAGAAAGAAACTCATTTGTAGAAGCTCTTTGCTAA
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CAAGTATTGCATTTATCTTAAAAAATTGGAAACAGTCTGCATCAATCATGGTTGCCGATT
TTAACTTTAATCAGCAAGTTGAATGAAAATAGGCTTATATAAAACGGAGCAGATAAAAGA
CCCAGTGGTAGTGGTAGGAGACCAAGCAGCTTAGTCCTTACTGATTCAGAGTGGAGTCTT
TAGCAAAGCTATGTAGAGAGCGATTACATAGATAGAATATATGCTAAAAGCACACAACTT
GATGGAGAGAGTATTTAAGACTTTATTACTGCTCTTTGTCAAGTTTCTAAAGATGAGCTA
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TTAAACATGGATAGAGTTGTTATTGTCTGGAATAGAATATGGGCAATTATTAGAGACCAT
TTTGCAGAGGCTGGATGTCACTAGAACCCTTAGATTGCTATTTTAGCAGTTGATAGTCTG
AAACAGCTCTCATAAAAATTTTTTATTAAGGAAGAGAGATTCAATCAATAATTCTAAAGA
GATTTCTTAAAACCTTTCGAAATTATTTTTTAAAATGTCCCAATCTAAAACTTATTCATT
AAAGATTTTATCCTAGACTGCTTTAAAAATTTTCTTGGAAATAAGACTATATATAAAAAA
ATCAAATCTGGCTGGAGAATTATATTTAATATTCTCGGATTTGCTTTGCTAGAAGAATCT
GACGAGCTCTCTCGCAATGCTTATAACATTATAAAAGGAATTATGGAGGAAAATCTGGAC
ACGATACATGATGTCTTTGTTGATTTGGTGCAATGCCTCAATAAGTTGAGTAAAAAGAGA
TAAGAGGATTTAGCATTAGCCTCTATTGAGCTAGTTTAGAAATGCTTGTACTACTTAGCT
GATAAATCTCATGTAGTTCCTAAGTCAAAATTATCATTTTCTTCCCTTCAATCTTAATCA
TCCGATCCTAATATTAATTCATAAACAGGTGAGCATTCTAATACTCACCAAACTAATAAA
AAATCAAACGAAAGCTACTGGGTTCCTCTACTTGGTGTTTTATCAAACTTATGCGGAGAC
CATAGACCAGAAATTTAAGAAAAAAGTATGGAGTCATTATTCAACATCCTTACAGAATAC
GGTTACACTTTTTCAATAGAATTTTGGAAGATGATATTCTAAGGAGTATTGAGACCCTTA
TTCGATGAAATTTAATTTACCTTCCAAACAAAATCACAAAAGTAATTGAATAACACTCAA
AATAATAGAAAGTTTAACTGGCTCAAATAATCTTGTAATAAGGCATTCCATCATATCACA
AACTTGCTCTTTGATTATTATGATGAATTGCAATCACTTGTGATTGAGTTTATCAAGACT
TATGAAAATTGCATAAACAATACAAATGAATAGCTGATAAAGTAATCTGTAACAGCTGCC
AAAAATACAATCATTTAACTAGGTCCTAAATTTAAATCAGAAGATTGGGATATGATAATT
GGATTTTTTGAAAGAATGATCAGATTAACTACTCCTTAAAAGCTTTTGAGCATTAATTCA
GACGAAAATGGATAAAAGATAGCTTAAGATGTCAAAGGAAAGAGGAAAGAATCTCTCATG
TATTTTTATAATTAAAAAATTAACTTTGATGATGCAAACGCTTAATCAAAAGCATAGCTT
TTACTGATTAAGGTTATCTAAGATGTTATAAATTCCTTTTAAGATAAACTATCTTCAAAT
TAACTTGATAATCTCTGCAACATCCTAGACAAATCCTATCTTTTTGCTATTGAATTTAAC
TCTCAAATATTTTTGAGATACTGCTTATGGAAGACAGGATTTAATCCTGAGTTAAAGCAA
TTACCAGGAATACTAAGATAGGAGAGATAAGCTTAGGCAATGAGTTTGTACATCAAATAT
ACACATTATAGAAAATAAATGAAGTCAGGATCTTGCTTTAATTATAATGACCTAATAGAT
AAATTAGTGGAATACATGACACTCTTCTTAAAAAAGCACAAAGATTTACTTAAGATTATT
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TTGGATGTTCCAGATTTAAACGAAGAAACTATCGATCTTGTTGTGCACAAAATAAAACTC
ACCGAAGTAGAGAGAGATGTTAACAATCATCGCACTATGATATCAGAGACCGTTCTTCCT
ATTTTAGAAAAAATTGATTTGTCACATATGAAAGAAAGAGTAAAAGAAATATACTGTATT
CTTATAGATATGACTTAATATAGCTAAAATAGAAGCTTTAGTTAGATGGTTTGCTAGCTT
TGCAAAAATTGTAGTAGATGCTAGAATTTAGATGAAGATCTAGATATCTTTATAAGAAAA
ATATTAAAAAAGCTATTTAAGTTTATTTGCGACAATCCTTTACCTGCTTAAGCTCCAGTA
GCTTAGGTTGTTTTAGAATAAAGTGCTTTGCTAAAATCAGTAAATTAAAATCCTATAATT
ATTGCTAATTAGGAGAATGATAATGATAAACAGTTGAATAACCAATAAATTACTAATTAG
AAATCAATTAATTCAGACTATGTAAAAATAACAAATAGCTCCTCTTCGATACCTGAAGTA
ACAAATGAAATAAATGCTGAAATTGATGAAGTATAAAATGAAAATGACAAATAAAAAGTA
AATATAATAAGGAGTGAGTAACATTATCAAGACGATTCAGATAACTAGCTAAAAATTGAA
AAAAATTTAATTAAATAAGTTGCAGGAGATTATGATGAAGATGATTTAAATGGATCAGGA
AATAAAAATTTAAATTAAAATAATTAAATAAATATTAACAGCAATGATAATAGTAAGTCC
AACAGTGAAAACAATATAGATCAAAACTAGTAAAGCAAATGA


>TTHERM_00569500(gene)
ATGTAGTAAATGTAGCAGCCAGAAGAAAATCTATAGCCTATTTAGATATACCAAGATATT
TTGGGTAATTCTTTTGAAAAGATCAAAAAGAATCTTCCTAAAAAATATCTTGGAGTCAAA
GACCTAGTTCAGAAAATGCAAAGTAAATAGTTTTTGAGCAATTTGTTGAAAAAATGTAGC
ACTGTGGATGCTTAAAATTATAAATGAGGAAACATAAATTTTGCTCTTAAATGTTTATTA
TTTGAATTAAATTGATATTTTGTAATATAAAAGACCATGTGATGTAAGACCCTGCTCATA
AATTGGATGCAAACAGATATTTCATCATTTATAAACTAGCAATCAATACCAAATAACCAA
AGTTGATAGAAGTTTCTTTAAAAGCAATTCAAGTAGATAAAAACACTCATTTTATTTAAT
CAGCATTAATTATATTTTCTATTTTACCATGTTTAATCTTAGAGTTTAAACAAAAAATAT
CACCAAAAAGTATCTAAATAAGTTTAAGTTAGCTCATATCATTTTCAAAAAATACACTAC
TTATTCGTAATAATTTGAGTAGATGTAAATAATAGTTTGAAGGTGTGTACCTAACTGACT
AACTCAATAAAGCTTATGAAAATATTTTGCAAAAAACAAGTTGATACTTATTAAGTTTAA
TTAGTTGATAAATAAATGATTATTGCAAAACGAAATTGATTTGAAAAACTTAAATAAAAC
AATAGAAAAATCAGAAAATAATATTTCAGATATTTTAATTAAATATAAAACATATTATTT
TATTAAAAGCAACTAATTAGCTATAATTTCTTGAACGGTAATTGTCCAGATTACACTTTA
GAAGTTAATTTAGAGGAGTTTAAAGATCTCCATGACCCTTTCCCTCTCAGAGATTAGCTA
AATACGAGAAAATTAATATCTACAATAATGGATATGATGGTTTCTCTTACGAATGAAAAG
GATGAAAATCATTAAATGTTAGTTATTAAGATATTTGTCCTATTAGCAACTCACATTCAT
ACAGAAATGCATGGAATTCATATATCAGCTGCTATCCAAACAATCATCATATATTACTCT
CGTAATATTTATTTATTTACTTGTAAAAATCTCAGCATATATGCTTGCTTGCTTACTTTC
TTACTTACTTACTTAATTACTATCTAAGTCACTAAAATATTATGACAATATTTTCAAAAC
ATTTACTTCTTTCTAAAATTTTTTCTAATTAATTTTCTCTTTCCCTTTTAATTTTTTCAA
AAAAAATTAATAGTTTTTGAATAGCTTAAAAAGCAAATTATATAAAAAATAAAATAATTT
TTATTAAAAATAGAAACTAGAAATAGTCAAGTAGAGAAACTTGCTAAATAAGCACTTTAG
CAGATCATAAATTATAATTATTAGAAACTTTCCTTAATAGAAGGAGAAAAAATCAAAAAA
TAGTTGTTTGGTAATGGTTTTTTTATAGGAAATGCATAGCAATTGTAATAGCAAAGAGAA
AGAGGGAGAACAACTTAGGATTAAAGTGTTATTTAAAAAGAAAGATCTCCTTCTCCTAAC
CAAACAAATATGACAAAATAATTAATATCTATTAGAGGTGATACAACTCTAATGCAGCAG
AATCAATTAAATTAAAAAGAGTTATCGCCAATTAACAATATCCTCAAATCATAAGAAGAT
GCTTAAGATGCAGATATGAGTGGATATTTTGATGGTGTAAACAGCTTTTCTAAAAATCAA
AACTTTATGTTTTAAGGAATTAGAAAGAATAATGATAAAAATTAGCCTACTTTTGATACA
ATTTGTCTAGATACTCTCATCAATATAGTAGACGATGTTTGCATTTATGAAGCAAGGAAA
GATGCTATAGTTGAAAAAATTAACCAAGATGAAAATATTCCAAGCGATTAGAAGTAAAAT
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AATGATCCATAATATTATAGAGTACTACCCATTAACTCAGACCAATTAGTAAATGAAAAC
GATTAACCTGCTGGATTATTTGGTTGGTGCTCAAAATGTAGAAATACTGCAAATTATTAT
TGTAAAGATCTTCGTGTACCTGTATGCTCTATTGAGTGCAAAATTAGCTACTAATAAATG
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TACATTTTTTGTTAAAAGGCATAAATTGTTGATAGAATTCTTCAGAAATTCGGTGATAAA
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TAAGAGACTTAAAAAATGATCGAGAAAGGAAAAAATTTGATTTCTGAGAAAAATAAACTT
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GTCAGATTTTCATTGGAAGGCTTCAATAGCACTATTTTGCTGAGCTGCCATTTTAATTTA
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TAGCAAAGCTATGTAGAGAGCGATTACATAGATAGAATATATGCTAAAAGCACACAACTT
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ACTAGTAAAAGTTAAACTCCTCGTATTTTTTCTTTGTAGAAAATAGTAGAAATTGCTGAA
TTAAACATGGATAGAGTTGTTATTGTCTGGAATAGAATATGGGCAATTATTAGAGACCAT
TTTGCAGAGGCTGGATGTCACTAGAACCCTTAGATTGCTATTTTAGCAGTTGATAGTCTG
AAACAGCTCTCATAAAAATTTTTTATTAAGGAAGAGAGATTCAATCAATAATTCTAAAGA
GATTTCTTAAAACCTTTCGAAATTATTTTTTAAAATGTCCCAATCTAAAACTTATTCATT
AAAGATTTTATCCTAGACTGCTTTAAAAATTTTCTTGGAAATAAGACTATATATAAAAAA
ATCAAATCTGGCTGGAGAATTATATTTAATATTCTCGGATTTGCTTTGCTAGAAGAATCT
GACGAGCTCTCTCGCAATGCTTATAACGTATTATTTTATTTGTGTTTTCATTTTAATTCT
AATTTAAAAAAACAAAAGCAATTAATCTAAATTATCTAGATTATAAAAGGAATTATGGAG
GAAAATCTGGACACGATACATGATGTCTTTGTTGATTTGGTGCAATGCCTCAATAAGTTG
AGTAAAAAGAGATAAGAGGATTTAGCATTAGCCTCTATTGAGCTAGTTTAGAAATGCTTG
TACTACTTAGCTGATAAATCTCATGTAGTTCCTAAGTCAAAATTATCATTTTCTTCCCTT
CAATCTTAATCATCCGATCCTAATATTAATTCATAAACAGGTGAGCATTCTAATACTCAC
CAAACTAATAAAAAATCAAACGAAAGTAATTAATTAATAGTTTAAAATATTCTTTTAATT
TTTTCAATTAATTTTTTTTTAGGCTACTGGGTTCCTCTACTTGGTGTTTTATCAAACTTA
TGCGGAGACCATAGACCAGAAATTTAAGAAAAAAGTATGGAGTCATTATTCAACATCCTT
ACAGAATACGGTTACACTTTTTCAATAGAATTTTGGAAGATGATATTCTAAGGAGTATTG
AGACCCTTATTCGATGAAATTTAATTTACCTTCCAAACAAAATCACAAAAGTAATTGAAT
AACACTCAAAATAATAGAAAGTTTAACTGGCTCAAATAATCTTGTAATAAGGCATTCCAT
CATATCACAAACTTGCTCTTTGATTATTATGATGAATTGCAATCACTTGTGATTGAGTTT
ATCAAGACTTATGAAAATTGCATAAACAATACAAATGAATAGCTGATAAAGTAATCTGTA
ACAGCTGCCAAAAATACAATCATTTAACTAGGTCCTAAATTTAAATCAGAAGATTGGGAT
ATGATAATTGGATTTTTTGAAAGAATGATCAGATTAACTACTCCTTAAAAGGTATTGAAT
TATTTACAAACAAGATACCATTTTAATTATTTTTCTTTAAAAATAATAAGCTTTTGAGCA
TTAATTCAGACGAAAATGGATAAAAGATAGCTTAAGATGTCAAAGGAAAGAGGAAAGAAT
CTCTCATGTATTTTTATGTAAAACAAATTATTTTCTTTTTTGGTTGTAAATTAATTTTAT
TTATTTATTTATTTTTTATAAAGAATTAAAAAATTAACTTTGATGATGCAAACGCTTAAT
CAAAAGCATAGCTTTTACTGATTAAGGTTATCTAAGATGTTATAAATTCCTTTTAAGATA
AACTATCTTCAAATTAACTTGATAATCTCTGCAACATCCTAGACAAATCCTATCTTTTTG
CTATTGAATTTAACTCTCAAATATTTTTGAGATACTGCTTATGGAAGACAGGTAATATAT
TTGATTAATTTAAAAAAGAATGAGTAAATAAATTGTTTATTAATTAATTAAAAGGATTTA
ATCCTGAGTTAAAGCAATTACCAGGAATACTAAGATAGGAGAGATAAGCTTAGGCAATGA
GTTTGTACATCAAATATACACATTATAGAAAATAAATGAAGTCAGGATCTTGCTTTAATT
ATAATGACCTAATAGAGTAAGAATATAAAAAAAATTACAATACTAAAAATATTTTATCAT
ATCAAATAGTAAATTAGTGGAATACATGACACTCTTCTTAAAAAAGCACAAAGATTTACT
TAAGATTATTGAAAGTGAAAGAGAAAAAAGAAATACAGATGAAAGGAGCTATTATGATAG
CTATGAAAGATTGGATGTTCCAGATTTAAACGAAGAAACTATCGATCTTGTTGTGCACAA
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CGTTCTTCCTATTTTAGAAAAAATTGATTTGTCACATGTAAGTTACAACATATTTTACTT
ATTTATTTATGAGTATATAAAATTATTTATTATCAACCAACAGATGAAAGAAAGAGTAAA
AGAAATATACTGTATTCTTATAGATATGACTTAATATAGCTAAAATAGAAGCTTTAGTTA
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TATCTTTATAAGAAAAATATTAAAAAAGCTATTTAAGTTTATTTGCGACAATCCTTTACC
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TTAAAATCCTATAATTATTGCTAATTAGGAGAATGATAATGATAAACAGTTGAATAACCA
ATAAATTACTAATTAGAAATCAATTAATTCAGACTATGTAAAAATAACAAATAGCTCCTC
TTCGATACCTGAAGTAACAAATGAAATAAATGCTGAAATTGATGAAGTATAAAATGAAAA
TGACAAATAAAAAGTAAATATAATAAGGAGTGAGTAACATTATCAAGACGATTCAGATAA
CTAGCTAAAAATTGAAAAAAATTTAATTAAATAAGTTGCAGGAGATTATGATGAAGATGA
TTTAAATGGATCAGGAAATAAAAATTTAAATTAAAATAATTAAATAAATATTAACAGCAA
TGATAATAGTAAGTCCAACAGTGAAAACAATATAGATCAAAACTAGTAAAGCAAATGA


>TTHERM_00569500(protein)
MQQMQQPEENLQPIQIYQDILGNSFEKIKKNLPKKYLGVKDLVQKMQNHVMQDPAHKLDA
NRYFIIYKLAINTKQPKLIEVSLKAIQQLISYNFLNGNCPDYTLEVNLEEFKDLHDPFPL
RDQLNTRKLISTIMDMMVSLTNEKDENHQMLVIKIFVLLATHIHTEMHGIHISAAIQTII
IYYSQTRNSQVEKLAKQALQQIINYNYQKLSLIEGEKIKKQLFGNGFFIGNAQQLQQQRE
RGRTTQDQSVIQKERSPSPNQTNMTKQLISIRGDTTLMQQNQLNQKELSPINNILKSQED
AQDADMSGYFDGVNSFSKNQNFMFQGIRKNNDKNQPTFDTICLDTLINIVDDVCIYEARK
DAIVEKINQDENIPSDQKQNYIQVELQNIPTRVVPTQLDPNDPQYYRVLPINSDQLVNEN
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