Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00648910

Standard Name

IFT52 (IntraFlagellar Transport 52 homolog)

Aliases

PreTt09205 | 94.m00123 | 3677.m00031

Description

IFT52 intraflagellar transporter-like protein; Intraflagellar transport protein; essential for ciliary assembly- maintenance- and rotokinesis

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External Links

• Uniprot
• Alphafold

Gene Ontology Annotations

Cellular Component

• cilium (IDA) | GO:0005929

Biological Process

• cilium assembly (IMP) | GO:0042384
• obsolete movement of cell or subcellular component (IMP) | GO:0006928
• septum digestion after cytokinesis (IMP) | GO:0000920

Domains

• ( PF01857 ) Retinoblastoma-associated protein B domain

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

No results were calculated for this gene in GeneMania.

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source	Identifier	Score
Tetrahymena borealis	EI9_17844.1	9.997093137033517e-262
	Description: IFT52/Intraflagellar transporter 52 (435 aa)
Oxytricha	Contig15520.0.g51	2.0005106264580874e-134
	Description: ABC-type uncharacterized transport system
WormBase	WBGene00003886	2.9990539278805726e-74
	Description: locus:osm-6 status:Confirmed UniProt:G5EDF6 protein_id:CAB61026.2
Stentor Coeruleus	SteCoe_19883	3.1743585474772134e-60
	Description: None

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

1. Ref:12925756: Brown JM, Fine NA, Pandiyan G, Thazhath R, Gaertig J (2003) Hypoxia regulates assembly of cilia in suppressors of Tetrahymena lacking an intraflagellar transport subunit gene. Molecular biology of the cell 14(8):3192-207

Sequences

>TTHERM_00648910(coding)
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>TTHERM_00648910(gene)
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TTTAAGCATATTTTAATATTTAATAATAACAGATAAATTTCAAGAAGCTCAATAACTGA

>TTHERM_00648910(protein)
MSGEQKIIVFNASKKEAGNPSTNIKKIIKKYKETYKCGRNKEDITYDRLKMASLVIFFCP
KEMFTKEEFDALKQYLESGGRVLVLSSEGGGHKNRTNINFFLEQYGISINNDCVVRTAFY
KYFHPKETYVHSGILNEEVTRVANGLPKETKRPQNTFLQNVIGKDDEEDEYQKEQSRVGL
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