Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00649380

Standard Name

VPS34 (Tetrahymena ortholog to yeast Vps34 and human PiK3c3 )

Aliases

PreTt09252 | 94.m00170 | 3677.m00078 | TtVPS34

Description

VPS34 phosphatidylinositol 3-kinase; A class III phosphatidylinositol 3-kinase involved in the nuclear degradation events of Programmed nuclear death (PND)

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External Links

Gene Ontology Annotations

Cellular Component

Molecular Function

  • 1-phosphatidylinositol-3-kinase activity (IEA) | GO:0016303
  • obsolete inositol or phosphatidylinositol kinase activity (IEA) | GO:0004428
  • phosphotransferase activity, alcohol group as acceptor (IEA) | GO:0016773

Biological Process

Domains

  • ( PF00454 ) Phosphatidylinositol 3- and 4-kinase
  • ( PF00613 ) Phosphoinositide 3-kinase family, accessory domain
  • ( PF00792 ) Phosphoinositide 3-kinase C2 domain

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source Identifier Score
Tetrahymena borealis EI9_17891.1 9.997093137033517e-262
Description: phosphatidylinositol 3- and 4-kinase (906 aa)
Oxytricha Contig7655.0.g67 1.9995317320402142e-140
Description: Phosphatidylinositol 3- and 4-kinase
DictyBase DDB_G0289601 6.001115222296727e-111
Description: pikE on chromosome: 5 position 3005109 to 3008075
SGD YLR240W 2.0006821221283624e-88
Description: VPS34 Phosphatidylinositol 3-kinase responsible for the synthesis of phosphatidylinositol 3-phosphate; forms membrane-associated signal transduction complex with Vps15p to regulate protein sorting; activated by the GTP-bound form of Gpa1p
WormBase WBGene00006932 2.999277470785175e-69
Description: locus:vps-34 Phosphatidylinositol 3-kinase status:Confirmed UniProt:Q9TXI6 protein_id:CCD61195.1
Stentor Coeruleus SteCoe_27893 5.166420632837861e-55
Description: None

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:24280724: Akematsu T, Fukuda Y, Attiq R, Pearlman RE (2014) Role of class III phosphatidylinositol 3-kinase during programmed nuclear death of Tetrahymena thermophila. Autophagy 10(2):209-25

Sequences

>TTHERM_00649380(coding)
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>TTHERM_00649380(gene)
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GCAGAGCTGCATTTCTTGAATATTTTAGATGAAAGTGAAACAGCTCTTTTTGCTAGAGTT
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>TTHERM_00649380(protein)
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