Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00658770

Standard Name

RRM42 (RNA recognition motif-containing protein 42)

Aliases

PreTt02162 | 97.m00148 | 3724.m00055

Description

RRM42 polypyrimidine tract-binding protein

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Gene Ontology Annotations

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Domains

  • ( PF00076 ) RNA recognition motif. (a.k.a. RRM,
  • ( PF04394 ) Protein of unknown function, DUF536
  • ( TIGR01649 ) hnRNP-L/PTB/hephaestus splicing factor family
  • ( TIGR01659 ) sex-lethal family splicing factor

Gene Expression Profile

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source Identifier Score
Tetrahymena borealis EI9_16215.1 9.997093137033517e-262
Description: polypyrimidine tract binding protein (1174 aa)
WormBase WBGene00004207 0.000000009996807949091551
Description: locus:ptb-1 status:Confirmed UniProt:Q18999 protein_id:CAA85411.3
DictyBase DDB_G0274995 0.000009999254677478949
Description: DDB_G0274995 on chromosome: 2 position 4844842 to 4848156

General Information

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Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences 

>TTHERM_00658770(coding)
ATGAATCCATCAAATGACACTACCAAAGGGTAACCATTTTACATAGAAAAAGAAGATTAA
GAGCAGGGGAAAATCTAAAATACCAATTAAATGATCAATTAAGAGTAAAATCATACTAAC
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ATTAGACCTTCTAAAGTTCTTTTAGTTATGGTATAAAATCCACAGGATGAAGTCATAGAA
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GCTAAAAATGCGCTTGAAAACTCTTCAATATGTGTCAATAATTTAGAACTTAAAATGAAG
GTTTAATTTTCGAGCCAATAAAATCTTGTTCTTAAGAATGGTAATGGAGGAATAAACTAT
AAAGATTTAAACAAGAAATTTGAGAAAACTTAGCTCTCTTACAGCATTAAAATTGATCCA
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CATATTGCATCTTAATTTGTTTCTGCGCAGAGTATGTAGTTACCAAATCCCTAGTTACAA
ATGCTTAAAGTTACTGACCCTTCAGCTGTTTAGTCTATGACCTTTTAAGTTGGGGTTCCT
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GTTTAATTTGGTCAATTTTAAAACTAAAATGCTAATAACTCGTATTAGTAAATACCAAAT
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AAACCAAATTTCCATAGTATGAGTACAAATATTTCAGGTATGAGAATGGAAGAAAATATG
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TTAGTCATTTATGTTAACCATTTAATGAATAAAGATATTACTGTTACTCACCTCTACAAT
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TCTTTAATGGCTATAGCTCATATGCACAACAAAGAAATCAAAGGAAGAAAGATGCTTATT
TCATTTACTAGAAAAAAACTAGACACAACAACTAAAAATGTAGTAACTTACTCTAAAAAT
ATTCAATTCAACAATTGA


>TTHERM_00658770(gene)
ATGAATCCATCAAATGACACTACCAAAGGGTAACCATTTTACATAGAAAAAGAAGATTAA
GAGCAGGGGAAAATCTAAAATACCAATTAAATGATCAATTAAGAGTAAAATCATACTAAC
TTAAACAATAATTTGGATGAAAATTGTGAGTCACCAAGCGATACTACTCATAGTAACTCG
AACATAGTAAATGGTAATTTTAATTATTCGTCTTCTTCATCATCGTGCTCATATAAAAAT
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CAACCTCAAAATGAGTGCTCTAAGGAAATAGATGGTTTGATTGCCTCTGAAAAAAAGGAA
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ATAATAAAAAAGTAGGAATAGCAACAAGACTCTAGTTCTTAATCTGATTATTAGTATTTA
TATTATGTAAGTAGCAATAATAATGGCAATAGCAACAATGATAGCAGCAAAAACTAAATG
AATAATGATAACAATTCTGGCGGCAATAACAATACCAACAAACATTTTGGAATCAGTAAT
AATAATATTAGCCCTTAGAATGATTCAAGTTCTAAGATTGATTAATTGTCAAAAGGGATT
AGACCTTCTAAAGTTCTTTTAGTTATGGTATAAAATCCACAGGATGAAGTCATAGAACAT
AGAATTATTTTTGAAAAGTTTTCATTTTTTGGAGAGGTAGAATAGATTCTTATATTTAGT
AAGAAGCAACCATGGAAATTGTTTGTGGATATGAATTCAATAGAAGTTGCTATAAAGGCT
AAAAATGCGCTTGAAAACTCTTCAATATGTGTCAATAATTTAGAACTTAAAATGAAGGTT
TAATTTTCGAGCCAATAAAATCTTGTTCTTAAGAATGGTAATGGAGGAATAAACTATAAA
GATTTAAACAAGAAATTTGAGAAAACTTAGCTCTCTTACAGCATTAAAATTGATCCAACC
TCTTCATAAAGCTAAAACTTATATTAATCAGCTCAAATTATGGATATGAACAGGCGCCAT
ATTGCATCTTAATTTGTTTCTGCGCAGAGTATGTAGTTACCAAATCCCTAGTTACAAATG
CTTAAAGTTACTGACCCTTCAGCTGTTTAGTCTATGACCTTTTAAGTTGGGGTTCCTCCA
TAAAAGGTCTAAATAATGAGTAGTAGCTTGATATAATAAGATCAAAATTAATACATACCT
TAGTAAATGGCCCCAATAGTAGTTACTAACTCTGGAATGCAAACTATTTAGCCTTAAGTT
CCTATCTATTAAACAGGTAGAGATTCTCCACAAATGATGCAAAATTCAGGTTTAGCTCAT
CCAAAGTAGTAGAATTATTTATAAAATTATTTGATTTTTAATAATTTAAACTAAAAATAG
ATTTTTATATTATTTTATTTCAAGGTAAGTTTGATAAATTTAAAGTATTTCTTTCTTACC
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ATTAAATTATCAAATCATATCTTAAGCAAGGTTTGTAATTTTAACTGCATAGGATGAGAT
AGATAGAATTCAATATTTTCTTCTTTATCATATAAATATGATCTGTTTATTTATCTTTCT
TAAGCTCAAGGCAGGCAATATATATATTCTTAAATACCATCAATAGAAGTTTTCTTATTT
ATTAATAATAAATAGTTAAAACTTTATTAAACTTATTTAAATCAAACAAACTTGCATTTT
AAAATAACTTATAAAAATATGATTAAAAAATTACTATTTTAATTAAATTGATTTTTTAAT
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TAAATGGCACCTTATAATTAATACGAGTAGCTTTAATAACCTTTAATGACTTATAGCTTT
GGTGGAAACCCTGTAATTCTTAAGGATGATTCTTTTTCAAATTAATAGGTTCAGCAGAAT
TAGAATTAGTTATTCTAATCTTAACATTATATTGGCTAGCATTTAAATAATTAGTATTAA
CAACCTAAGTCTGAAATGACTAGCAGTTTGCAATATCCCATTAATTAAATATCTAGCTAT
CACTAAACAATAAATATGACTTAATCTATGAATATTCATAGCAATAGTATGACTTTCAGT
AAACCCTAAGAATCTATTTTTGCATTAAATAAAAATGATAATAACCCAAAAAATGAATCA
GTAGAACAACTTGATGATATCTTAGAAAGAATCCAAAATAATCAGTTTGAAAACTCTGGC
GAAATTTCTAAAGAAGACCTTAAAGACTTAGAAGAGCAAAAATCAAATTCATTTGACGAT
TTTAAAGGATTTAATGATCAAAAGACAAGTATTGGTTAAGAAAATTTATAAAATAATCAA
CAATTGTTAAATAGCTCTGACAATAGGAATGGCATTAACTAATCTCCCTTTAGTCCTGAG
TAAAAAAGTATTTAACCATAATCCACCATGCAAAGATCTCATAGCAATAGTTCAGATGGG
AATTAAATGACTGGCATCTAAAAATTAGATTAACTTATTGGATAGGCGTAAGGTTCAGAT
TAATCTGATGGTGAATAATACCCACTATCAGACGATGAAGGACCTACTTTTCCTTTCTAA
AAAACTTAATAAAAATCTTAGCAATAATAACCTATTAGAGCAATATAGTAACTGGATACT
CAGCTAAAAACATAATATGGTAGTAATAATTAAGGAGCTTACTTTATAAATATGTAAGGC
AGTGCAGGATAGTAGAATTAAAGCGCAAATATTATTGGAAATTAATTAATGAGCTCATCT
TAAGGCAAGCCTATTCATGGTAGCTTAATGATGTAGCCATATATTTAAAATAATTAATTA
AATTAAAATTAATCTCTCATGAACCAAGGATAAGTATAAATGCTACAGCAGTAAGCTAAT
TCTGGAGTTTAATTTGGTCAATTTTAAAACTAAAATGCTAATAACTCGTATTAGTAAATA
CCAAATTAGTATGGATACAATATGAGATAAAATAGGTAAAGAATGCAATAAAATAGTAAC
CCAGCTTATGCCTAATCATGCATGTTAGTTAATTAGCAGTAATAATAAAATTTATAATTA
TAACAATCTGGTTAGGTTAATTTACAATAATTTGATGGCTAAAATATTTCGTATAGCATG
TAAATTAAACCAAATTTCCATAGTATGAGTACAAATATTTCAGGTATGAGAATGGAAGAA
AATATGGGAACTTTCAATGGGTCTACCTACATAAAGTAAGGATTTTTGGAAGACAGCAAA
CCTTCTTTAGTCATTTATGTTAACCATTTAATGAATAAAGATATTACTGTTACTCACCTC
TACAATATCTTTAGCAATTTTGGTGACATAGTTAAAATTATATTGAAAAGAAATAAATGT
ACAGCTTTCATTGAGTATACGATGTAAGAGAACGCTACAAAAGCAAAGGAATTTATGGAT
AAAAAAATCTTCTTTGATAATGAGATCAGAGTATTCTATTCTCACTTTGAAACTCTCTAA
AAATAAGATGACAAATTCCAAGAATAATTTATAGGAAGCGAATAAACTAACCGTTTCTAA
AAAGATAGCAAAATGACTTTAAACCCTCCTTCTCTAGTTCTTCATATTTCAAGTCTCAAA
TAAGAAATTTGTGATCACGAGAAAATACATGAATTGTTCCGTCCTTATGGCAAAATTGAA
GCAATCCATATTGAAAAAGTTCCTCCTAGATACATGAGCCATATAAAATTTTCTTCGTTG
AAGGAGTCTTTAATGGCTATAGCTCATATGCACAACAAAGAAATCAAAGGAAGAAAGATG
CTTATTTCATTTACTAGAAAAAAACTAGACACAACAACTAAAAATGTAGTAACTTACTCT
AAAAATATTCAATTCAACAATTGA


>TTHERM_00658770(protein)
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