Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00658770

Standard Name

RRM42 (RNA recognition motif-containing protein 42)

Aliases

PreTt02162 | 97.m00148 | 3724.m00055

Description

RRM42 polypyrimidine tract-binding protein

Genome Browser (Macronucleus)

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External Links

• Uniprot
• Alphafold

Gene Ontology Annotations

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Domains

• ( PF00076 ) RNA recognition motif. (a.k.a. RRM,
• ( PF04394 ) Protein of unknown function, DUF536
• ( TIGR01649 ) hnRNP-L/PTB/hephaestus splicing factor family
• ( TIGR01659 ) sex-lethal family splicing factor

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

No results were calculated for this gene in GeneMania.

Tetrahymena Stock Center

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Homologs

Source	Identifier	Score
Tetrahymena borealis	EI9_16215.1	9.997093137033517e-262
	Description: polypyrimidine tract binding protein (1174 aa)
WormBase	WBGene00004207	0.000000009996807949091551
	Description: locus:ptb-1 status:Confirmed UniProt:Q18999 protein_id:CAA85411.3
DictyBase	DDB_G0274995	0.000009999254677478949
	Description: DDB_G0274995 on chromosome: 2 position 4844842 to 4848156

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_00658770(coding)
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GAGCAGGGGAAAATCTAAAATACCAATTAAATGATCAATTAAGAGTAAAATCATACTAAC
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GCTAAAAATGCGCTTGAAAACTCTTCAATATGTGTCAATAATTTAGAACTTAAAATGAAG
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AAAGATTTAAACAAGAAATTTGAGAAAACTTAGCTCTCTTACAGCATTAAAATTGATCCA
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CATATTGCATCTTAATTTGTTTCTGCGCAGAGTATGTAGTTACCAAATCCCTAGTTACAA
ATGCTTAAAGTTACTGACCCTTCAGCTGTTTAGTCTATGACCTTTTAAGTTGGGGTTCCT
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TCTGGTTAGGTTAATTTACAATAATTTGATGGCTAAAATATTTCGTATAGCATGTAAATT
AAACCAAATTTCCATAGTATGAGTACAAATATTTCAGGTATGAGAATGGAAGAAAATATG
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TTAGTCATTTATGTTAACCATTTAATGAATAAAGATATTACTGTTACTCACCTCTACAAT
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TCTTTAATGGCTATAGCTCATATGCACAACAAAGAAATCAAAGGAAGAAAGATGCTTATT
TCATTTACTAGAAAAAAACTAGACACAACAACTAAAAATGTAGTAACTTACTCTAAAAAT
ATTCAATTCAACAATTGA

>TTHERM_00658770(gene)
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GAGCAGGGGAAAATCTAAAATACCAATTAAATGATCAATTAAGAGTAAAATCATACTAAC
TTAAACAATAATTTGGATGAAAATTGTGAGTCACCAAGCGATACTACTCATAGTAACTCG
AACATAGTAAATGGTAATTTTAATTATTCGTCTTCTTCATCATCGTGCTCATATAAAAAT
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CAACCTCAAAATGAGTGCTCTAAGGAAATAGATGGTTTGATTGCCTCTGAAAAAAAGGAA
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TATTATGTAAGTAGCAATAATAATGGCAATAGCAACAATGATAGCAGCAAAAACTAAATG
AATAATGATAACAATTCTGGCGGCAATAACAATACCAACAAACATTTTGGAATCAGTAAT
AATAATATTAGCCCTTAGAATGATTCAAGTTCTAAGATTGATTAATTGTCAAAAGGGATT
AGACCTTCTAAAGTTCTTTTAGTTATGGTATAAAATCCACAGGATGAAGTCATAGAACAT
AGAATTATTTTTGAAAAGTTTTCATTTTTTGGAGAGGTAGAATAGATTCTTATATTTAGT
AAGAAGCAACCATGGAAATTGTTTGTGGATATGAATTCAATAGAAGTTGCTATAAAGGCT
AAAAATGCGCTTGAAAACTCTTCAATATGTGTCAATAATTTAGAACTTAAAATGAAGGTT
TAATTTTCGAGCCAATAAAATCTTGTTCTTAAGAATGGTAATGGAGGAATAAACTATAAA
GATTTAAACAAGAAATTTGAGAAAACTTAGCTCTCTTACAGCATTAAAATTGATCCAACC
TCTTCATAAAGCTAAAACTTATATTAATCAGCTCAAATTATGGATATGAACAGGCGCCAT
ATTGCATCTTAATTTGTTTCTGCGCAGAGTATGTAGTTACCAAATCCCTAGTTACAAATG
CTTAAAGTTACTGACCCTTCAGCTGTTTAGTCTATGACCTTTTAAGTTGGGGTTCCTCCA
TAAAAGGTCTAAATAATGAGTAGTAGCTTGATATAATAAGATCAAAATTAATACATACCT
TAGTAAATGGCCCCAATAGTAGTTACTAACTCTGGAATGCAAACTATTTAGCCTTAAGTT
CCTATCTATTAAACAGGTAGAGATTCTCCACAAATGATGCAAAATTCAGGTTTAGCTCAT
CCAAAGTAGTAGAATTATTTATAAAATTATTTGATTTTTAATAATTTAAACTAAAAATAG
ATTTTTATATTATTTTATTTCAAGGTAAGTTTGATAAATTTAAAGTATTTCTTTCTTACC
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AGATAGAATTCAATATTTTCTTCTTTATCATATAAATATGATCTGTTTATTTATCTTTCT
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ATTAATAATAAATAGTTAAAACTTTATTAAACTTATTTAAATCAAACAAACTTGCATTTT
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TAAATGGCACCTTATAATTAATACGAGTAGCTTTAATAACCTTTAATGACTTATAGCTTT
GGTGGAAACCCTGTAATTCTTAAGGATGATTCTTTTTCAAATTAATAGGTTCAGCAGAAT
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CAACCTAAGTCTGAAATGACTAGCAGTTTGCAATATCCCATTAATTAAATATCTAGCTAT
CACTAAACAATAAATATGACTTAATCTATGAATATTCATAGCAATAGTATGACTTTCAGT
AAACCCTAAGAATCTATTTTTGCATTAAATAAAAATGATAATAACCCAAAAAATGAATCA
GTAGAACAACTTGATGATATCTTAGAAAGAATCCAAAATAATCAGTTTGAAAACTCTGGC
GAAATTTCTAAAGAAGACCTTAAAGACTTAGAAGAGCAAAAATCAAATTCATTTGACGAT
TTTAAAGGATTTAATGATCAAAAGACAAGTATTGGTTAAGAAAATTTATAAAATAATCAA
CAATTGTTAAATAGCTCTGACAATAGGAATGGCATTAACTAATCTCCCTTTAGTCCTGAG
TAAAAAAGTATTTAACCATAATCCACCATGCAAAGATCTCATAGCAATAGTTCAGATGGG
AATTAAATGACTGGCATCTAAAAATTAGATTAACTTATTGGATAGGCGTAAGGTTCAGAT
TAATCTGATGGTGAATAATACCCACTATCAGACGATGAAGGACCTACTTTTCCTTTCTAA
AAAACTTAATAAAAATCTTAGCAATAATAACCTATTAGAGCAATATAGTAACTGGATACT
CAGCTAAAAACATAATATGGTAGTAATAATTAAGGAGCTTACTTTATAAATATGTAAGGC
AGTGCAGGATAGTAGAATTAAAGCGCAAATATTATTGGAAATTAATTAATGAGCTCATCT
TAAGGCAAGCCTATTCATGGTAGCTTAATGATGTAGCCATATATTTAAAATAATTAATTA
AATTAAAATTAATCTCTCATGAACCAAGGATAAGTATAAATGCTACAGCAGTAAGCTAAT
TCTGGAGTTTAATTTGGTCAATTTTAAAACTAAAATGCTAATAACTCGTATTAGTAAATA
CCAAATTAGTATGGATACAATATGAGATAAAATAGGTAAAGAATGCAATAAAATAGTAAC
CCAGCTTATGCCTAATCATGCATGTTAGTTAATTAGCAGTAATAATAAAATTTATAATTA
TAACAATCTGGTTAGGTTAATTTACAATAATTTGATGGCTAAAATATTTCGTATAGCATG
TAAATTAAACCAAATTTCCATAGTATGAGTACAAATATTTCAGGTATGAGAATGGAAGAA
AATATGGGAACTTTCAATGGGTCTACCTACATAAAGTAAGGATTTTTGGAAGACAGCAAA
CCTTCTTTAGTCATTTATGTTAACCATTTAATGAATAAAGATATTACTGTTACTCACCTC
TACAATATCTTTAGCAATTTTGGTGACATAGTTAAAATTATATTGAAAAGAAATAAATGT
ACAGCTTTCATTGAGTATACGATGTAAGAGAACGCTACAAAAGCAAAGGAATTTATGGAT
AAAAAAATCTTCTTTGATAATGAGATCAGAGTATTCTATTCTCACTTTGAAACTCTCTAA
AAATAAGATGACAAATTCCAAGAATAATTTATAGGAAGCGAATAAACTAACCGTTTCTAA
AAAGATAGCAAAATGACTTTAAACCCTCCTTCTCTAGTTCTTCATATTTCAAGTCTCAAA
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AAAAATATTCAATTCAACAATTGA

>TTHERM_00658770(protein)
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