Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00672190

Standard Name

THD13 (Tetrahymena Histone Deacetylase 13)

Aliases

PreTt10965 | 101.m00120

Description

THD13 Sir2 family transcriptional regulator; Sir2-like histone deacetylase; suppresses DNA transcription by deacetylation of histones; homolog of Rattus norvegicus SIRT3

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External Links

Gene Ontology Annotations

Molecular Function

Biological Process

Domains

  • ( PF00220 ) Neurohypophysial hormones, N-terminal Domain
  • ( PF01023 ) S-100/ICaBP type calcium binding domain
  • ( PF01344 ) kelch repeat protein
  • ( PF02146 ) transcriptional regulator, Sir2 family
  • ( PF04640 ) Protein of unknown function, DUF597
  • ( PF07646 ) kelch repeat protein

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source Identifier Score
Tetrahymena borealis EI9_14307.1 9.997093137033517e-262
Description: hypothetical protein (944 aa)
Oxytricha Contig20663.0.g91 2.9992476920535046e-16
Description: Kelch motif
WormBase WBGene00002186 0.0002999184360822198
Description: locus:kel-10 Kelch repeat-containing protein kel-10 status:Confirmed UniProt:P34569 protein_id:CAA83141.3

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:18178773: Smith JJ, Torigoe SE, Maxson J, Fish LC, Wiley EA (2008) A class II histone deacetylase acts on newly synthesized histones in Tetrahymena. Eukaryotic cell 7(3):471-82

Sequences

>TTHERM_00672190(coding)
ATGATTGATAACTAAAGCGTAAACTAAGAGGGGCAGAACATTTCTTATTCTTGCTAAATT
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>TTHERM_00672190(gene)
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GTGATGCAAATGAACAGAGTATGCCCAGTAGTCTCATCTTTCACCACTATAGGTAGTGGC
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TATAAGGAGTAACCAATGTTATAAAGATAGGATTGAATCAATAAGAAATTTTAGCAACTC
ATTGTTTTTGA


>TTHERM_00672190(protein)
MIDNQSVNQEGQNISYSCQISNCPISKNGNFNEGDIKFCTDCNKLICNTCITSHDENHTI
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