Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00683400

Standard Name

TFC4 (TFIIIC subunit 4)

Aliases

PreTt16177 | 103.m00168 | 3734.m00080

Description

TFC4 tetratricopeptide repeat protein; RNA polymerase III transcription initiation factor complex (TFIIIC) subunit TFC4

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Gene Ontology Annotations

No Data fetched for Gene Ontology Annotations

Domains

  • ( PF00515 ) tetratricopeptide repeat
  • ( PF00806 ) Pumilio-family RNA binding repeat
  • ( PF04702 ) Vicilin N terminal region
  • ( PF06784 ) Uncharacterised protein family (UPF0240)
  • ( PF07719 ) tetratricopeptide repeat
  • ( TIGR02521 ) type IV pilus biogenesis/stability protein
  • ( TIGR02552 ) type III secretion low calcium

Gene Expression Profile

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source Identifier Score
Tetrahymena borealis EI9_17828.1 9.997093137033517e-262
Description: hypothetical protein (1001 aa)
Oxytricha Contig9885.0.g74 1.999598840915195e-17
Description: TPR repeat
DictyBase DDB_G0278321 1.000361553249356e-16
Description: gtf3C3 on chromosome: 3 position 689224 to 692344
SGD YGR047C 9.001232279470736e-16
Description: TFC4 One of six subunits of the RNA polymerase III transcription initiation factor complex (TFIIIC); part of the TauA domain of TFIIIC that binds BoxA DNA promoter sites of tRNA and similar genes; has TPR motifs; human homolog is TFIIIC-102
WormBase WBGene00001025 0.000030009396760408108
Description: locus:dnj-7 status:Partially_confirmed UniProt:P91189 protein_id:CCD68078.1

General Information

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Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences 

>TTHERM_00683400(coding)
ATGAGTAATAATACCAAACGTGAATATTAAGATGATGATGACGAGGAACATGATAGCGAT
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>TTHERM_00683400(gene)
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TTAATGAGGTTATTTATCTTTAGCCATTTACTTTTCATTCAAATAAATTATATGTGATTC
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AGAGAAGACTAACAACTCCTAATAACCTAAAGACATTTGATAATCCAAATTAAACACTTC
TTATTAAAAAGAAAAGACAAATGGAGGAACAAGAAATATTAATGAAAAAAAAATTCAAAA
AATCAGAAGAACTGACAGCAAAATATTTATAGAATGTTGAAGTTCTTTCTTTAAAAGTTG
GTCATGAAGAATATATTTAATATTTAATTAAAATGCTTAAAGTGTTAGTGAAGTATGATT
GCTATGTAAAAATATCCAAAATTTGTTCATTGGCACATAAGTTGCATGTATGGAAAGATA
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TAGAGGTTCATTTTTATTTATTTTTTAATTTAATATTTTGTCATTGTTTTAAGTTTAATT
TTATTTATGAATATAAATAGAACTATGATAAAGCTTTTACATACATAAAGTTATTAATTA
ACAGAAATTCAGATAGACTGTATCTTTAAGTTATTTTATGTATTATAATGAGACATATAT
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CTAAATTTTTACCAATTGTTGCATGTGGTTTTTTAGAAACAGGAAACTTTGATTTAGCAA
CTGATGTTCTTCATACAATACTTAAAAATGATAAAGCAAATTCATTATGTAATTTATCTT
TAAGTGTATGCTATGCTTAACTAACAACAGCAAGAACAACTTATGAAAAAGAGCAAATGG
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TGGAAATATATTATAATTTAGGTAGATTCTTCATTCATCTTAGCATGAATGAAAAAGCTA
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TAATTTTGCTTCATAAAAATTTAGGTAATTACCAAATAGCCCAATCTTTATTAAGATAAT
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>TTHERM_00683400(protein)
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