Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00688470

Standard Name

DYH6 (DYnein Heavy chain )

Aliases

PreTt23142 | 105.m00109 | 3737.m00022

Description

DYH6 dynein-1-alpha heavy chain flagellar inner arm I1 complex protein; Heavy chain subunit of ciliary two-headed inner arm dynein (IAD) complex 1; KO mutants lack reversal response

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Gene Ontology Annotations

Cellular Component

Molecular Function

Biological Process

Domains

  • ( PF00617 ) RasGEF domain
  • ( PF01297 ) Periplasmic solute binding protein family
  • ( PF01920 ) Prefoldin subunit
  • ( PF03028 ) Dynein heavy chain
  • ( PF03789 ) ELK domain
  • ( PF04508 ) Viral A-type inclusion protein repeat
  • ( PF04778 ) LMP repeated region
  • ( PF05377 ) Flagella accessory protein C (FlaC)
  • ( PF05698 ) Bacterial trigger factor protein (TF)
  • ( PF05859 ) Mis12 protein
  • ( PF06391 ) CDK-activating kinase assembly factor MAT1
  • ( PF06658 ) Protein of unknown function (DUF1168)
  • ( PF07728 ) ATPase family associated with various
  • ( PF08112 ) ATP synthase epsilon subunit
  • ( PF08385 ) Dynein heavy chain, N-terminal region
  • ( PF08393 ) Dynein heavy chain, N-terminal region
  • ( PF08424 ) Protein of unknown function (DUF1740)
  • ( PF08671 ) Anti-repressor SinI
  • ( PF09061 ) Stirrup
  • ( TIGR00153 ) conserved hypothetical protein TIGR00153
  • ( TIGR00161 ) conserved hypothetical protein TIGR00161
  • ( TIGR00213 ) D,D-heptose 1,7-bisphosphate phosphatase
  • ( TIGR00449 ) tRNA-guanine transglycosylases, various specificities
  • ( TIGR00864 ) polycystin cation channel protein
  • ( TIGR01257 ) rim ABC transporter
  • ( TIGR01420 ) twitching motility protein
  • ( TIGR01612 ) rhoptry protein
  • ( TIGR02640 ) gas vesicle protein GvpN

Gene Expression Profile

Tetrahymena Stock Center

  • ( SD00706 ) Macronucleus: dyh6::neo2

Homologs

Source Identifier Score
Stentor Coeruleus SteCoe_4738 0
Description: None
WormBase WBGene00000962 9.997093137033517e-262
Description: locus:dhc-1 Dynein heavy chain, cytoplasmic status:Partially_confirmed UniProt:Q19020 protein_id:CCD64267.1
Tetrahymena borealis EI9_16664.1 9.997093137033517e-262
Description: dynein heavy chain family protein (4385 aa)
DictyBase DDB_G0276355 9.997093137033517e-262
Description: dhcA on chromosome: 2 position 6681538 to 6695830
Oxytricha Contig19661.0.g109 9.997093137033517e-262
Description: Dynein heavy chain and region D6 of dynein motor
SGD YKR054C 9.997093137033517e-262
Description: DYN1 Cytoplasmic heavy chain dynein, microtubule motor protein, required for anaphase spindle elongation; involved in spindle assembly, chromosome movement, and spindle orientation during cell division, targeted to microtubule tips by Pac1p

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:15068262: Asai DJ, Wilkes DE (2004) The dynein heavy chain family. The Journal of eukaryotic microbiology 51(1):23-9
  2. Ref:14691947: Deckman CM, Pennock DG (2004) Dephosphorylation of inner arm 1 is associated with ciliary reversals in Tetrahymena thermophila. Cell motility and the cytoskeleton 57(2):73-83
  3. Ref:12378538: Hennessey TM, Kim DY, Oberski DJ, Hard R, Rankin SA, Pennock DG (2002) Inner arm dynein 1 is essential for Ca++-dependent ciliary reversals in Tetrahymena thermophila. Cell motility and the cytoskeleton 53(4):281-8
  4. Ref:11499791: Angus SP, Edelmann RE, Pennock DG (2001) Targeted gene knockout of inner arm 1 in Tetrahymena thermophila. European journal of cell biology 80(7):486-97
  5. Ref:10069817: Lee S, Wisniewski JC, Dentler WL, Asai DJ (1999) Gene knockouts reveal separate functions for two cytoplasmic dyneins in Tetrahymena thermophila. Molecular biology of the cell 10(3):771-84

Sequences 

>TTHERM_00688470(coding)
ATGGAGAAAGATAAATCAAAATATTAAAACTAAAAAGTTCTAAACTCACTTTCAGCAGTG
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AGCGAAATCGTCAACGAAGCAAATCAAGAACATAAAAATGAAGAAGAAATTATGAAGATT
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TATCTTGAAAGTATTTTTATTGGTTCTGAAGATATCCGTCAATAACTTCGTGAAGAAGCT
AAAAAATTTGATAAAAACGACAAAACATTCATCAAAATTATGGAATAAACTTATAAAAAT
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ATCTTCCCTCGTTTTTACTTATTGTCAGATGATGATCTTCTTTCTATCCTTGGTAACTCT
GAGCCTGCTGGTGTTTAACCACATATGCTTAAACTTTTTGATAATTGTAAAGAATTGAAG
TTTGGTAAGAGTGGTAAATTAATTACTGGTTTGGAATCTGAAGAACAAGAAAAGTTTGAC
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TGGTGGACATGGCGTGTAGAAGATGTTTTCCGTAAAGTAAGAGAAGGCAACAAGCATGCT
ATGAAATAAGAAAATTCAAAACAAACAAAAGACTTGAATGATTTAATTGATTTAGTTAGA
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CTTAGAACTGAAGAGCATCCTTCTCATTGGGTACTTCAAGGTGTTTGCTTGGTTCTCAAT
GTAGATTTCTGA


>TTHERM_00688470(gene)
ATGGAGAAAGATAAATCAAAATATTAAAACTAAAAAGTTCTAAACTCACTTTCAGCAGTG
ATTAGAAGTGTTTTTATTCCTCTTGAGACTAAATCAAACGATCTCAAGTCAACCTTAGTA
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TGGTGTTTTAACTGAGCTTGAAGCAAACACTGATATTATAAAGAGCTTCTTAGTATTCTT
AGGTCCCAATCTAAAGGCTGTCACAGGTAATTCTGAAGGTATTGATAACCTTGTTACAGA
AGTTAAAAAGCTAGTTATTCCCTATCAAAACCCTAAAGTCAATTTATTCCAAAAATAACA
ATCTCACTAATGGAATCAGCTCTCTGCAAAGTTTAAAGCTGATAAAGGCTAGATTAGTGA
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