Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00770730

Standard Name

TTLL3C (Tubulin Tyrosine Ligase-Like)

Aliases

PreTt13915 | 127.m00078

Description

TTLL3C tubulin glycylase 3E; Related to tubulin tyrosine ligase

Genome Browser (Macronucleus)

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Gene Ontology Annotations

Molecular Function

• hedgehog receptor activity (IEA) | GO:0008158

Biological Process

• positive regulation of gibberellic acid mediated signaling pathway (IEA) | GO:0009939
• positive regulation of interleukin-18 biosynthetic process (ISS) | GO:0045383 | Ref:15890843

Domains

• ( PF00612 ) IQ calmodulin-binding motif
• ( PF03133 ) Tubulin-tyrosine ligase family
• ( PF05923 ) APC cysteine-rich region
• ( PF08518 ) Spa2 homology domain (SHD) of

Gene Expression Profile

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source	Identifier	Score
Tetrahymena borealis	EI9_05635.1	9.997093137033517e-262
	Description: tubulin-tyrosine ligase (1118 aa)
Oxytricha	Contig11464.0.g112	4.0006908853687255e-76
	Description: Tubulin-tyrosine ligase family
Stentor Coeruleus	SteCoe_20530	3.6251409191435593e-34
	Description: None
DictyBase	DDB_G0281541	1.999981404597394e-31
	Description: DDB_G0281541 on chromosome: 3 position 4627625 to 4629265
WormBase	WBGene00044187	7.002116201343823e-26
	Description: locus:ttll-9 status:Partially_confirmed UniProt:Q564U4 protein_id:CAI79169.1
SGD	YBR094W	0.000004000864880866421
	Description: PBY1 Putative tubulin tyrosine ligase associated with P-bodies

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

1. Ref:15890843: Janke C, Rogowski K, Wloga D, Regnard C, Kajava AV, Strub JM, Temurak N, van Dijk J, Boucher D, van Dorsselaer A, Suryavanshi S, Gaertig J, Eddé B (2005) Tubulin polyglutamylase enzymes are members of the TTL domain protein family. Science (New York, N.Y.) 308(5729):1758-62

Sequences

>TTHERM_00770730(coding)
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TATAACAATATATAATTTATTAATGAAAATTAGAATAATAATTTAAGACAAAAGCCTAAA
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GAAGCTGTGGAGATACTCAAAAAATTAAAAAGATAGTAAGAGGAATATATAGATGAAACA
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GACAAAATTGTCAACAGAAAAAAAAGCTTTGAGTTATATGGCTTTGATATTTTGTTAGAC
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TCGTTTTTGACTGAAATGCTTGATGCGATGGCATACAAGATGTTCTAAATTGTTTTTAAA
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GCTTCTTGCCAAAATCCAGATTATGATTGGGAAGAAATTTATAATGAAGAGTAAAAAGAA
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GTTATAGGGTAAAAAGCAGATTTAAAAAAGGAAAAAAATCTTGATAAAAAATACTTCTAA
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CAATTTTTAGCTAAAAAGCAGTTAAATATTTTGAAAAAGCAATAATAAACAAATATAAAT
ATTCCAATAGAAGATTTTAACTAAGTTAGTGTTATTGAAGTATGA

>TTHERM_00770730(gene)
ATGATATTGCCTTTTGAATACTATTTTTTAAATGACGCTGATAACAGCAGCAAAAGCAAC
TATAACAATATATAATTTATTAATGAAAATTAGAATAATAATTTAAGACAAAAGCCTAAA
TTTTATCCAAACAACCAATTTTTAATTGAGCAAGAATAGGATAAATATGAGAATAAAAAG
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ATGAATCATTTTGCAAATATAAACAATTATTAAGACAATAAATTTTCTTTAGAATCTTTA
AATTAAGCTTAGTAAGATAATCTTTAGAAAGAAGAAGATTTATCCATTCTTTCTTTTGAT
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GGAGATATTTTTGGCTATTAAACTCGATACACATTTTTTGAAAATAGAAATAATTTATTA
GTAGAGGATGCAACAAACAAAAACAACAACAACTACAACTACAACTACAACAACAACAAT
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AAGAAGAAAAGTAATTTTTAAAATAAAAGTCAAAGTTAATTAAATAATCATAAAAATGAA
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AGAATTTACAATAAGGAACTATCATAAACTGTCACTAATGGATGGCTAAAACCTTCTTAA
GCTAAAACAATAAGTTAGGATAACAATTTAGGGAGTTCTGCTGCTAAGAGTAGCAAGGTT
TTTTACTAATAATAGAAACCTTTTTCTGCTTAAATTACAAATTCATCTCTTAAATATGCA
GCTGCTTCTAATGGTTTTCAAAATTTAGATTTTTCGTATAAATAAAAACAGTAACTTATT
TAACAAGAAACTAAAAATAAGATCAAGGAATAATAAAATGTAGAATCCAATAATAGAATA
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AATTCTGTTAATTCTCAGCCTTCTTCTTTGGTTTCCTAACCTCTAAAAATTTAAAGTATA
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TTAGGCTCAACTGAAACTACTGGCTTTTCTTTTTAGAATGTTTTTTAGTTGGCAGGTGTT
CCTAAAGATTTTATAGCTTCTCCTAGAAGTCCTGTACAAGAATTAAACCAAAAATAAGAA
AACAGGGAAAATGAACTAGATCAAATGTTAAATGATCATCATATTTATGTTGCAAGTTCT
GTTACAAATTAAAATTAAATAAGTAAATTTATATAGAAATTCAATATTTATTTTCTTAAA
TTTTATTTTAATTGTTATAGAAAATGAGCAAACAGAAAGGAAACCAAATATGTTTGGTAA
AACTCTGACAACTTTGGCTCGGCCCTTTTCAAAAGAATATTCAAACAGAAAGGATATTCT
TAAAAGTGCTTAGTAGAACGTAAGGTTCAACAAAAATTTAGATTATCTTGATAGTCAAAA
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TCCAAGGTGCTACGATCTTGGAAATGATCAGGAAAGAGGAGAATTTTCTAATGAATTTAA
TGTAAATTACTTAAAAAACTTTATTTAATATTAATTATTTTTTTTAGAGAATGAATGTGA
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GGATATTCTTTGCAAAAGTAACGAAATAGAAGTTCTTTAGTCCTTTAATGTACGAAGATA
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ATTTCAAAGATGCTGACCCATAATTTAAAGTTTCTGGAACAAAAAATATTTGGATAATTA
AACCATCTGCTAATTCAAGAGGATCTGGGATATATTTAGTAGATAAATTAGACGAAGCTA
TTGACAGTGGTTTAAAAATGTAGGCGAGAATAGTTTAAAAGTATATTGAGAGGCCTTTAA
TATTTCAAGGAGCAAAATATAAGAAACTGAACAATAAAAAATTTGACATCCGATAATGGG
TCTTGGTAACAAGCTTTAAGCCTCTCAAAATTTATTTTTTTACAAGCAGCTATTTAAGAG
TGTGCAGCTAATCTTTTGATTTGGACAATATTAAGATTCTTTCTAAGCACTTAACAAATT
TCAGTTTAAATAAAAATAGTCTAGCCAAAGAAAACTGGGATGAGACTGTAGTTGAGCTAA
AAGATTTCATTAGTTATTTGAAGGAGTTTAAAAATATAGATTATCAGGAAGATGTAAAGC
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GGTTGCTTGAAGTAAATTTAAGTCCAGCTTGTTCAGAAAGAAGCTCGTTTTTGACTGAAA
TGCTTGATGCGATGGCATACAAGATGTTCTAAATTGTTTTTAAATAAAACAACTTATAAG
AAGACTTAGAAATCAATAAAGAAACTGCAATTTCTACTGCACCTGCTTCTTGCCAAAATC
CAGATTATGATTGGGAAGAAATTTATAATGAAGAGTAAAAAGAATATTTTTGTGAAGAAG
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GCAGTTAAATATTTTGAAAAAGCAATAATAAACAAATATAAATATTCCAATAGAAGATTT
TAACTAAGTTAGTGTTATTGAAGTATGA

>TTHERM_00770730(protein)
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IKNYISDQIQLQPKNTPINKMNHFANINNYQDNKFSLESLNQAQQDNLQKEEDLSILSFD
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EYAHPWLLEVNLSPACSERSSFLTEMLDAMAYKMFQIVFKQNNLQEDLEINKETAISTAP
ASCQNPDYDWEEIYNEEQKEYFCEEDNNMQLAFNNDIQLMVIGQKADLKKEKNLDKKYFQ
YWGAIKIQSKIRSFLAKKKLQRLKNQKFTFAAIKIQQKMRQFLAKKQLNILKKQQQTNIN
IPIEDFNQVSVIEV