Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00991550

Standard Name

DRH39 (DExD/H box RNA helicase 39)

Aliases

PreTt07847 | 185.m00068

Description

DRH39 helicase carboxy-terminal domain protein

Genome Browser (Macronucleus)



Genome Browser (Micronucleus)

Gene Ontology Annotations

Molecular Function

Biological Process

Domains

  • ( PF00096 ) Zinc finger, C2H2 type
  • ( PF00097 ) zinc finger, C3HC4 type (RING
  • ( PF00270 ) DEAD/DEAH box helicase
  • ( PF00271 ) Helicase conserved C-terminal domain
  • ( PF00357 ) Integrin alpha cytoplasmic region
  • ( PF01485 ) IBR domain
  • ( PF01672 ) Putative plasmid partition protein
  • ( PF04000 ) Sas10/Utp3/C1D family
  • ( PF05377 ) Flagella accessory protein C (FlaC)
  • ( PF07599 ) Protein of unknown function (DUF1563)
  • ( PF07717 ) Domain of unknown function (DUF1605)
  • ( TIGR00864 ) polycystin cation channel protein
  • ( TIGR01587 ) CRISPR-associated helicase Cas3
  • ( TIGR01612 ) rhoptry protein
  • ( TIGR01967 ) ATP-dependent helicase HrpA
  • ( TIGR01970 ) ATP-dependent helicase HrpB
  • ( TIGR02300 ) conserved hypothetical protein TIGR02300

Gene Expression Profile

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source Identifier Score
Tetrahymena borealis EI9_02917.1 9.997093137033517e-262
Description: helicase domain-containing protein (2060 aa)
Oxytricha Contig12082.0.g38 2.000597631390999e-64
Description: Helicase associated domain (HA2)
DictyBase DDB_G0270110 2.9995010303521745e-64
Description: dhx33 on chromosome: 1 position 4244035 to 4246332
SGD YGL120C 9.004195835458823e-61
Description: PRP43 RNA helicase in the DEAH-box family, functions in both RNA polymerase I and polymerase II transcript metabolism, involved in release of the lariat-intron from the spliceosome
WormBase WBGene00018967 1.0003503620230312e-57
Description: locus:ddx-15 Putative pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase F56D2.6 status:Confirmed UniProt:Q20875 protein_id:CCD63138.1
Stentor Coeruleus SteCoe_9095 1.7587922024243116e-25
Description: None

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_00991550(coding)
ATGGATTCAAATTTAAAAGAAAATAATTGTTATATAGTTAATGAGGGCGTAGAAAACGAA
ATGCTCAGTGCTTCATATGTAATATAGAAATTAGAATAGGAATTGATCAATCCATTAAAA
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ATTGGATTAATTCATAGATCTCTAACTAACTCTAAATTAAATAAAAGCGGGATCAACTTT
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TAATAAACTATTTAAAATATGAAAGATAAATCCAACTATTAACCATATATCAAGTTGAAT
GGAGAAAGACCATTGTTGGAGTATTTCTCAAGAAATCAGTTTTTAAATATTTAATAATAA
TTAGATAAAATGGATATACCTAAGAAGGCTAAATATTGTGTACTTTTTGAAAAAGATAAA
GGTTATATCCGCTTTTTTTGCAACTAAGAAATGCAGCAATGTATGGACAGCTTAAATATT
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AAGGAAGTTAAAATCATTAAAGATTACATTAGCTAAACAGCTGTTGCTTTATTTATTTTC
AAGAACACTAAAAAAGCATTTGCTTTTTACGAAGCTTTGACAAAAATGAAGAGAAGTAAA
ATTGCAGAATTGCTGTCAGCAGAGGATAATTAGCTACCGAGAATAGTTCCTTAGCCTGAA
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AGTATATGTGAATCACTTTGCTTCGGTAATATGTACTTCAGTAACGAAGTGGATGTCTTG
GCGACCTATGATTAAATGAAAAAAGCCAATTTGTTTAAAGTAAAATACAATATCAAAGAA
GATGCTAACAGTGGAAATTTAATTCATATCTTAGCCTTAGACAAGCTTGATCCTCTTACC
GATGAAATAGATTTATAATCCTATGTTGTTAACACCTACTAAGGTTATTTATCTTGTGAA
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TAAAAGAGAAATCTTTAAAATTTAATCTAAGACACAATTAACGAATTTAATTTCTTAAAT
ACCAAGCAGAGCGTTAAAAGTTAAAAATTTTAAAAAGGCTAACAAAAATATTAAGAAGCT
AAAGAAAATATATAAATAAAATTAAAAATACACAATGGTGTTTGCAAGGCAGAGATTATG
CTTGACTCTCATGTATATGCTCAAGAGCTTGTCAATAAGTTTGATGGCATTGAATTTGAA
TGCCAAAGGCTTCGTATGTAAATACAAAATTAATAAAAAATTTTGGTTTTGGGTGCTGTT
TACTTATTTTACTATGACAATATTCGCTAGTATATTGATGAGGCAGGATAAAGTGTTCAA
GTCATTGCTCCTAAATACGATAAAGTATTTTATCTATCTAAAACGGTAGAGATTATTACA
AAATAAATTTACTCAAGCTCAAGTTAGATTTTTTAAAAGCTAAACTACTAAATTACCAAT
CTCATTAAACCTGATTTAATTTATTTAAATTGTCTTCCACTTGATCTAGAAAATTTGATG
AATCAGCAAAGTAATATAGTAGAAGGCATGGAAAAATAATACGAATGCATAATCAAGCTA
TCAGGAAAAAGAAGCTCACAGCTTAAAGTTTGGTTTAGAAAGGATAAAACAGGTGATCAA
ATAGCTTCAGAAAAGACGAAAATTAAATAAGTATTTGAGGAATACTTATTCTAAAAATTC
AAATTTAACAAACAAAATTATCATTTTAAATAAGTTGAAGATTATTTACAAAATATGCAA
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AAAAGCTAAATTTAAAAAATTTAACAAGAAATTAATGACAAGAATAAAAAATATCTTAAT
AAGTAGAAATCAAAAGTCGAACAACAAGATGATCTTGAGGAGGAAGAAACTTGTTAGATT
TGTTAAGAATTTAAAAATCTTTAAAGATTCTCATGTGAGTGCTTATTTTGTAAAGAATGT
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CCAAATCACCAAGATTAGCCTGTCAGTATTAAATTAATTGAATCTATTTTAGATCCCCAG
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TTGTCAGCCACCGAAAATTTTGGGATAGCCCCTAGAAGAGTTAAATGCTATGGCTGTTTC
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TAATTTAAAACCTCGAAAGAAGTGTATTAACATTTAGATAAAGAACATCAAGGATATTAC
AATTGA


>TTHERM_00991550(gene)
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ATGCTCAGTGCTTCATATGTAATATAGAAATTAGAATAGGAATTGATCAATCCATTAAAA
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AATCAAGACTTGGACGTGGATGATGATAATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGAT
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GAATATTTAATTAAGAATATTGAGTAAAATGTTGATTTAAATGAATAAATTCTTCAAAAA
TTAGAGCTTGTTGACAACAAAGAACAAATTAAAAGCTACTTAAACTAAGTTTGCATAACT
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AAAAAAAATATCATACAAAGCTATGAATAAGATAATAAAAACTTTACAATCACAGCTACA
AAAAGCTAAATTTAAAAAATTTAACAAGAAATTAATGACAAGAATAAAAAATATCTTAAT
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AATTGA


>TTHERM_00991550(protein)
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DDDDINTVTTQPLLEEEQIDIQGLQDNKEVEEEQKVNNEIQQISIQKGDLTQNATIEELN
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