Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_01030000

Standard Name

SGS1 (Homolog of budding yeast Sgs1 and fission yeast rqh1)

Aliases

PreTt10830 | 204.m00059

Description

SGS1 ATP-dependent DNA helicase RecQ family protein; ATP-dependent DNA helicase- RecQ family protein; Protein involved in DNA joint molecule resolution dHJ dissolution and crossing over

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External Links

Gene Ontology Annotations

Molecular Function

Biological Process

Domains

  • ( PF00270 ) DEAD/DEAH box helicase
  • ( PF00271 ) Helicase conserved C-terminal domain
  • ( PF01202 ) shikimate kinase
  • ( PF04851 ) type III restriction enzyme, res
  • ( PF06827 ) Zinc finger found in FPG
  • ( PF08839 ) DNA replication factor CDT1 like
  • ( TIGR00614 ) ATP-dependent DNA helicase, RecQ family
  • ( TIGR00643 ) ATP-dependent DNA helicase RecG
  • ( TIGR01389 ) ATP-dependent DNA helicase RecQ
  • ( TIGR01587 ) CRISPR-associated helicase Cas3
  • ( TIGR03158 ) CRISPR-associated helicase, Cyano-type

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source Identifier Score
Tetrahymena borealis EI9_10497.1 9.997093137033517e-262
Description: ATP-dependent DNA helicase, RecQ family protein (1193 aa)
Oxytricha Contig17511.0.g63 1.999149254372995e-126
Description: DEAD/DEAH box helicase
DictyBase DDB_G0292130 1.9992982665753866e-121
Description: blm on chromosome: 6 position 1240457 to 1244236
SGD YMR190C 1.0002857351297358e-115
Description: SGS1 Nucleolar DNA helicase of the RecQ family; involved in genome integrity maintenance; regulates chromosome synapsis and meiotic joint molecule/crossover formation; potential role as repressor of a subset of rapamycin responsive genes; rapidly lost in response to rapamycin in Rrd1p-dependent manner; similar to human BLM and WRN proteins implicated in Bloom and Werner syndromes
WormBase WBGene00019334 2.999180586171967e-98
Description: Putative ATP-dependent DNA helicase Q1 status:Confirmed UniProt:Q9TXJ8 protein_id:CCD61880.1
Stentor Coeruleus SteCoe_28767 2.572209372642415e-56
Description: None

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:26519827: Lukaszewicz A, Shodhan A, Loidl J (2015) Exo1 and Mre11 execute meiotic DSB end resection in the protist Tetrahymena. DNA repair 35( ):137-43
  2. Ref:23935123: Lukaszewicz A, Howard-Till RA, Loidl J (2013) Mus81 nuclease and Sgs1 helicase are essential for meiotic recombination in a protist lacking a synaptonemal complex. Nucleic acids research 41(20):9296-309

Sequences 

>TTHERM_01030000(coding)
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>TTHERM_01030000(gene)
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TAATCCAAACAAAATGACTGACAAAATCATGATCAATTAAGTAGTTTCTCAAAGCTCTAA
ATCAAAAGTAGATAGTCAATTTTTATTTGACAAAGAATTAATTGATGATATTACAGAATC
AGATTTACCTAAAGAGTAAGAATTTTTTGATTAAAATAAAAATCTCATTTTTGATGATGA
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TGAGGATTATAACAGTCAAAATAAATAAGCTAATGAAAAACTAAACTAAGAACAGATATA
AATTGAAGAGGATGATGATGACGATGATGACGACGATGATGATATTTTACAAATAGCAGC
TAAAACAAATCTTTTAGAATAAATAAAAAAATAAAACACGATGAGTGTAGAAAAATAAAA
TAGTTTGAAAGAAAATTATCTTTATAAATCTCCTCAAGAATAAGATAATTTCTTTTCTGA
ATTTAAATTAGGCAATAATAACAATAAACCTTAAACTTCTTTAGGATAAACAGGTCATAA
GCCACCTTAATAAAACAATTAAAATATGAGCTCATTGAATAATTTTAAATTTTCTACAGG
AAACAATAAATTAAAATAAGACTAAGCTGATCTTTTTTCATTTAACTTTCAAAAACTTGC
AAAAAATTGA


>TTHERM_01030000(protein)
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DGKISHCRIYYSPKDKNSLVFLITNNEGSNKQKKEECMAHLSKMIRYCEDTINCRRVLQL
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