Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_01075780

Standard Name

RPA2 (RNA polymerase I subunit 2)

Aliases

PreTt02690 | 219.m00043

Description

RPA2 DNA-directed RNA polymerase; DNA-directed RNA polymerase I complex subunit

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Gene Ontology Annotations

Molecular Function

Biological Process

Domains

  • ( PF00562 ) DNA-directed RNA polymerase, beta subunit
  • ( PF02363 ) Cysteine rich repeat
  • ( PF04560 ) RNA polymerase Rpb2, domain 7
  • ( PF04561 ) RNA polymerase Rpb2, domain 2
  • ( PF04563 ) DNA-directed RNA polymerase, beta subunit
  • ( PF04565 ) RNA polymerase Rpb2, domain 3
  • ( PF04567 ) RNA polymerase Rpb2, domain 5
  • ( PF06883 ) RNA polymerase I, Rpa2 specific
  • ( PF09268 ) Clathrin, heavy-chain linker
  • ( TIGR02013 ) DNA-directed RNA polymerase, beta subunit

Gene Expression Profile

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source Identifier Score
Stentor Coeruleus SteCoe_17515 0
Description: None
WormBase WBGene00008781 9.997093137033517e-262
Description: locus:rpoa-2 DNA-directed RNA polymerase status:Partially_confirmed UniProt:Q27493 protein_id:CAA99827.1
Tetrahymena borealis EI9_15329.1 9.997093137033517e-262
Description: DNA-directed RNA polymerase, beta subunit protein (1160 aa)
DictyBase DDB_G0293560 9.997093137033517e-262
Description: rpa2 on chromosome: 6 position 3044865 to 3048492
Oxytricha Contig2863.0.g30 9.997093137033517e-262
Description: RNA polymerase Rpb2, domain 6
SGD YPR010C 9.997093137033517e-262
Description: RPA135 RNA polymerase I second largest subunit A135

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences 

>TTHERM_01075780(coding)
ATGAAGGAATCATTAAGTAGAGAAGATCATATTGCTCGTGCAAAGCAATCAAATTTAGAT
TTTTCAAAAAAGCTTAAGTAAGCTGCCTTTGCTCACATAGACTCTTTCAACTTCATTTAC
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TGCATTGAAGAAGATATTAGAAACGATACTGAATACTAAGAACTCTCACCTTCATACATT
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ATGAGTGGTGAGGCTATTGATAGTTTCTATAATTACAATAAGGGTGTTTAAAAGTCAAAA
CCTAAATGCAGAAAGTGCCAAAATGCTGAGTGTTCTAAAGTAGTAATTCCTTTTGTATTA
AGATACTTGACTAACGAGCTTGCTGCTATGAATATCAAGCTTGCCTTTAAGCTTGAATGA


>TTHERM_01075780(gene)
ATGAAGGAATCATTAAGTAGAGAAGATCATATTGCTCGTGCAAAGCAATCAAATTTAGAT
TTTTCAAAAAAGCTTAAGTAAGCTGCCTTTGCTCACATAGACTCTTTCAACTTCATTTAC
GATGAAGGATTAAAAAAAATCACTTAGTACTTGTAGCCAGTTGAAATTATTAAAGAATAA
AGATCTGAAGAATACAAGTAGAGTTACTTGCCCTTTAAATCTATGAAGGTTTGGATTGAA
AACCTCGAAATAGCGTAATTAATTATGATTTATTCGTTTAATTACCTTTCATCTGCAAAC
CAAAAAGTGGTATTTTTTGAAGATTTGGTTTTCAAATCTTAAACAAGACTAATTTATTTA
TAAGTCCCATCAATGTTTTTTAAAAGAAATCTTCTACTTTAAAGAAAAGTACATTTTTTA
ATTTACTTTACAAACAGGACAGCATACCACAAAAACTAATAGAATAGAATCATTTTTATT
TCAAATATGATAAAATTTACTTTCGATTTTGACTTTTTTTTAAAGGAATTATAAAATAAC
AAATTGTCTAAGCAATACTTTATATTTAGTAGCTAATTTAACCATCTTCAAAAATAATTT
ATTTTCCAAGGTTTATAATTCCATTAAGATAGAATGATTTATTTGATACTTTTATATTTG
ATAATAATGATGATGGTGGATGATAAGGTTAATAATAGATAAATAAATTTAATGATATTT
CAAAAACAATTTCTTATAGTTGTAATGTTTTTAAACTTTTTTAATAATTATATTCTAGCA
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GAATAGGAAGAAAGACTTATGGAGCTCCTCTTTTCGCAAAGGTAGCTCGTAGTATTGATG
GAGGAAAGCCTGAAAGCATAAATATTAGATTAGGCGACATTCCTATCATCGTTAGAAGTG
ATCATTGCCATTTAGCAAAAATGACTCCTAAGGAATTAGTGAAAGCTCACGAAGATTGCA
ATGAATTTGGTGGATATTTTATTGTCAATGGTAATGAAAAGATAGTCAGAATGCTTATCC
TTCAAAAAAGAAATTATCCTATTGCTTTTATCAGAGCAGGTTATGTTAATAGAGGTCCTA
ATTACACACCTTTTGCAGTTTAAATGAAGTGTGTGAGAGAAGATTTATACTCAAAAACAA
TTACTCTCCACTATGTTTCTGATGGTTCTGTTTTCTTGCGTATTCTTCACAGAAAGCAAG
AATTCTTGATTCCAGCTATCGTTATCCTTAAAGCTTTAGCTGATATTTCTGACCTTCAAA
TTTACAATAAAGTAAATTTTTATTTAATGATAAATTTATTAAGTATTATAGTTTAATGAA
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AAACAATATTAATTAAATAGTTAGTTAAAGGTTAAAGCAGCAAGAGTGCTATTAGTGATA
GAGTTGAAGTACTTATTAGGGGTAGTAAAGCAATGAGTTTAAATACTAAGGAAGAATGTT
TGGCTCACTTAGGTAAAAATTTCAGAGTCGTACTCAACATCACTAACCCAGAAATTACTG
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TCGATAAGCTCAACACTATTTGTGTTATGATTAGCAAATTATATGCCTTAGTCAGTGATG
AAATTTGTCCTGATAACTTAGATTCTTTGCAAAATTAGGAAGTCCTCTTACCTGGTCATC
TCTATATGATGATTTTAAGAGAAAAGTTAGAAGAAATGCTTTTAGGTATCCGTGCTAAAG
TTTTTAAGGATGGTTCTAGACCCGAAGAAGCTATTAGAATTCCTCATATCGCTTACTTAA
AAAAAGCCATTGAATTTTAAGGCTCTATTGGAAATAAAATTGAATATTTCCTCTCTACTG
GTAATTTAAAATCCCAAACTGGTTTAGATCTCATGCAAGTAATATTTAAATTCATTTCTA
AAAAAATTTATATTGATTAAAAACTATCATAATAAAGGCTAAAGGTTTCACAATTATAGC
TGATAAGTTAAATAATATGCGTTTCTTGAGTCACTTTAGAAGTGTCCATAGAGGTGCTTA
TTTTACAGAAATGAAAACAACAACAGTTAGAAAATTATTACCTGAAAATTGGGGTTTCAT
TTGCCCTGTGCACACTCCTGATGGTGGTCCTTGCGGTTTGTTAAATCACATTTCTTAATC
ATGCAAACCCCTTACCAGACCTGGGTATGATGGTAATATTCACTTCAATTTAGTAACTCT
CTGCACTGAGATAGGTATGAATCCTATTGTAAACGATTTGTCTATCGTATTCCCTCCTAC
TTCTGTTACTATTATGCTTGATGGTAGAGTTATTGGTTATATTGAATCTAAAAATGCATA
AACATTCTGCCAATCATTAAAATATTTAAAAATTATGCAAGATCCTACTCGTTTAATCCC
TGCTGATTTGGAAATCGGTTATGTTCCTAAACTTAATCTTGAAAAACAAAATATTTTCCC
AGGTATCTTTTTACACACTAATGAAGCTCGTTTTGTTCGTCCTGTTAAGCACTTGAAATT
AAATGCCTTAGAATGGATTACTCCTTTCGAATAAGTCCATCTTTCTATTGCTTGCATTGA
AGAAGATATTAGAAACGATACTGAATACTAAGAACTCTCACCTTCATACATTCTTTCAAT
TTTACCTTCTTAAATTCCTTTCCTCAATTATAACTAATCCCCTAGAAATATGTATCAGTG
CTAGATGGCTAAGCAAACTATGGGTACTTCTATGCACAATTTCCCTTATCGCTTTGATAA
CAGAATATATAGATTATTAAATGGTTAAATTCCTATGGTTAAAGGTATGGATCCTGAAAG
TTATGGTCTTTCTGATTATCCTTCTGGAACAAATGCTATCGTTGCAGTTATCAGTTATAC
TGGTTATGATATGGAAGACGCTATGATTCTGAATAAATCATCATACGAAAGAGGATTCGG
ACATGGTTGTGTCTATAAAAACTACTCATACGATGTTGCTGAATTAAATAAAGAAAAAAA
TTCTAAATTTAAGATGTTGAATGAAGTTAAAAATATTGACAGTAAATTATCTTAATCTTT
TTTTTAATTAAAATTTATATTTTCTATTTGAAAATTATTTAGAGAGTTAAATCGCTGAAG
GTTTAGAAGGTGATGGTATTCCAGCTATTGGATCAGTAATTAAAAAAGGCACTGCTGTCT
TCTAAATATATGATACTTAAAAAAATGCTATGAAAACTTTCTACCACAAGGACTCAGAAT
TAGGTAGATTAGATGGTATAGCTTTAGTCCATGATGAAAAAACTAAAGAACCAAGAGTTG
AATATAGAATTAGAATTCCCAGAAATCCTATTATTGGTGATAAATTCTCATCTCGTCACG
GTCAAAAAGGTGTTCTTTCTGTCCTTTGGCCTCATATCGATATGCCCTTCACTGAAAGTG
GTATTACTCCTGATGTTATCATTAACCCTCACGCTTTCCCCTCCAGAATGACAATTGGTA
AATTTACTCTTTATTCAAGAAGATTAACTAATTAATTAAATTTTAATAAAAAAGGTATGT
TAATCGAAAGTATGGCAGGTAAATCTGGAGCTCTTAATGGAAATATATTAGAAACTTAAC
CTTTCTAAAATTATTAAGATGATGATATTGTTAATTATTTCGGTAAATAACTTTAATCTC
ATGGTTATAATTATTACGGTAACGAAGTTATGTATAGCGGTACATATGGTTGCATGATGA
AAGTTGATATCTATATGGGTATTGTATACTATCAAAGATTACGTCACATGGTATTTAAAA
TTTTTGTTAAAGATTGTTAATTAATTGTTATTTCTAATAATATATTAAAGGTTTCAGATA
AAGCTTAAGCAAGATCTACTGGTCCCGTTGATATGCTTACTTAACAACCTATTAAAGGTA
ATTATTAAAAAAATATGTCTTCTAGCTTACTTAATTATATACAAAAAAAAAAAAAAATAG
GTAGAAAGAGAGGTGGTGGTATTAGAATGGGTGAAATGGAAAGAGATGCTCTTCTTTCTC
ACGGTATCTCCTTCTGTATGCATGATAGATTCTTAAACTGCTCAGATTATTCTGAAGGTT
ATGTTTGTAATAGTTGTGGTTCATTGGTCTCAACATACCTACATACTAATTTAATGAGTG
GTGAGGCTATTGATAGTTTCTATAATTACAATAAGGGTGTTTAAAAGTCAAAACCTAAAT
GCAGAAAGTGCCAAAATGCTGAGTGTTCTAAAGTAGTAATTCCTTTTGTATTAAGATACT
TGACTAACGAGCTTGCTGCTATGAATATCAAGCTTGCCTTTAAGCTTGAATGA


>TTHERM_01075780(protein)
MKESLSREDHIARAKQSNLDFSKKLKQAAFAHIDSFNFIYDEGLKKITQYLQPVEIIKEQ
RSEEYKQSYLPFKSMKVWIENLEIATPIRADSGVAEDNKLMPEECRIGRKTYGAPLFAKV
ARSIDGGKPESINIRLGDIPIIVRSDHCHLAKMTPKELVKAHEDCNEFGGYFIVNGNEKI
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LHRKQEFLIPAIVILKALADISDLQIYNKLVKGQSSKSAISDRVEVLIRGSKAMSLNTKE
ECLAHLGKNFRVVLNITNPEITDKQVGEIFMNENICVHLNNNIDKLNTICVMISKLYALV
SDEICPDNLDSLQNQEVLLPGHLYMMILREKLEEMLLGIRAKVFKDGSRPEEAIRIPHIA
YLKKAIEFQGSIGNKIEYFLSTGNLKSQTGLDLMQAKGFTIIADKLNNMRFLSHFRSVHR
GAYFTEMKTTTVRKLLPENWGFICPVHTPDGGPCGLLNHISQSCKPLTRPGYDGNIHFNL
VTLCTEIGMNPIVNDLSIVFPPTSVTIMLDGRVIGYIESKNAQTFCQSLKYLKIMQDPTR
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EGYVCNSCGSLVSTYLHTNLMSGEAIDSFYNYNKGVQKSKPKCRKCQNAECSKVVIPFVL
RYLTNELAAMNIKLAFKLE