Identifiers and Description
Gene Model Identifier
TTHERM_01080600Standard Name
CDK5 (Cyclin-Dependent Kinase)Aliases
PreTt02102 | 222.m00058 | 3798.m00215 | MicNup98ADescription
cyclin-dependent kinaseGenome Browser (Macronucleus)
Genome Browser (Micronucleus)
Gene Ontology Annotations
Molecular Function
- obsolete manganese resistance permease activity (IEA) | GO:0015096
- succinate-semialdehyde dehydrogenase [NAD(P)+] activity (IEA) | GO:0009013
Domains
No Data fetched for Domains
Gene Expression Profile
Tetrahymena Stock Center
No Data fetched for Tetrahymena Stock Center
Homologs
Source Identifier Score Tetrahymena borealis EI9_20238.1 2.000724368835138e-100 Description: hypothetical protein (381 aa) Oxytricha Contig19821.0.0.g58 0.0000000000002999981760818895 Description: Nucleoporin autopeptidase SGD YGL092W 0.00000000039982266684865623 Description: NUP145 Essential nucleoporin, subunit of the Nup84p subcomplex; catalyzes its own cleavage in vivo to generate a C-terminal fragment that assembles into the Nup84p subcomplex of the nuclear pore complex, and an N-terminal fragment of unknown function that is homologous to Nup100p; the Nup84 subcomplex has a role in transcription elongation
General Information
No Data fetched for General Information
Associated Literature
- Ref:25788697: Iwamoto M, Koujin T, Osakada H, Mori C, Kojidani T, Matsuda A, Asakawa H, Hiraoka Y, Haraguchi T (2015) Biased assembly of the nuclear pore complex is required for somatic and germline nuclear differentiation in Tetrahymena. Journal of cell science 128(9):1812-23
- Ref:19375312: Iwamoto M, Mori C, Kojidani T, Bunai F, Hori T, Fukagawa T, Hiraoka Y, Haraguchi T (2009) Two distinct repeat sequences of Nup98 nucleoporins characterize dual nuclei in the binucleated ciliate tetrahymena. Current biology : CB 19(10):843-7
Sequences
>TTHERM_01080600(coding)
ATGAGGATTCATAGTATAAATAAGTATTACAAAAAAATGGATTATTTTTAATACTAAGAA
TAAGATCCAATTAAATAAGAATATAAAATATAATGTAAAGTAGCAGAGGGAGCATTTGGT
TCTGTTTTTAAAGCAATCAAATAAAATACGCAATAAATAGTTGCTATTAAAGATTTATTT
TTTAATCAGAATAAAAGATCTAAGTAGATTGTTGAAAGAGAGGTGTCCATTATGTAGGAT
TTAAATGATCATCCAAATATAGTAAAATTAATAGATTATTAGATATCTAACAACAAATGC
TCTCTTGTGATGGAATACATTGATTATGACTTAAAATAATTTATAGAAAGCTAAGTTTAT
CCTCTTAGTCATTCAAAAATAAAAAGAATAGCCTTTTAATTACTCACTGGATTATCATTT
ATTCACTCGAAGGGCATTATTCATAGAGATTTAAAACCATCAAATATATTAATTACTAAC
TAATTTATTGTTAAAATTGGTGATTTTGGATCAGCTATTAAAGAAGAGTAAAGAAAGGAT
AAATAATTTTCTATTGAGGGATTCACAAGATGGTATAAGTCTCCAGAGTAGCTTTTTGGA
TCTAGGGAGTATAATTACGAAATAGATATTTGGAGTTTTGCATGCATTTATGCTGAAATA
ATATAAGGATATCCTTTATTTTCTGGTAATAATGAAATAGAATAAATTGCTAAAATATCT
GATTTGCTTGGTAATCCATGTGAAGAAAATTGGCCTAGTATTGTTAAGATGCCAGATTAT
GGAAAAATTTTATTTAAACAAAAATAAAAAAAAAATTTGAGCACTTTATTTAGTTAAGCT
TCTGAAAAAGAAATAGAGTTTCTAAATTCAATGTTAAAATATGATAATAGACCTACTGCT
GAATAATTATTGCAGAGTGAATATTTTAAAGATGACTCTGTACCATTAAAATTATAAAAC
AAAAGTATAATTTTGCCTCCTAAGCATGAAGATAAGATATATTTTAATTATACTAGCGTG
CTAAAAAAATGA>TTHERM_01080600(gene)
ATGAGGATTCATAGTATAAATAAGTATTACAAAAAAGTTAAAAATTTTTTATCAATAAAG
ATATTCTAATTAAGATTTGAATTTTGTATTAACTATACATTATCGTAGAGTAAGATTTTT
ATCATTTTAATATTTTTAGAGAAAGATATTTTCACAATATATTTAAATTAAAAACTTTTT
TGTATTATTTAAAGCTATTTGATAAATTTTTTTCATATATTATCCATTCTATTAAGACTT
ATTTTTAAAAATGATTCTTTGGTATTTACTTTTAATAATCAAAAACTATAAAAACTTAAA
AATGATTTAATGAAACAATTTTAAATAAGTTAATATATTTGTGGACAATTAATAATATTT
ATATTTATAATTAAATTATTCAACTTAAAAAATAAAAGATGTAAATAACTATATCATGAT
TACTTATTCAAGATCACTGAGAATAGACAATTCAAAATTTAAAAATTTTTAATTGAAACA
AAAGAATTAATTGGCTATTTAATTATATTACAATCCTACTAATATCTATTTCTTAAATTA
TATAAATCAAATTATTTTTTTGTTTACAATAATAAAAACGATAGAAAAAGATACAAATAA
TACTTTTTAAGTAAAAAAAAAAGAGAATAAATATAATCGGTGGCTTGCTTGCTTTTTTTA
TTTATTAGTGTACATTTAAGAATTTAAATTTTTTCATACAACCAAGAGGTTATTATGATT
TTTGATACTAGTACTTATTGCATGAATGTATAAAAAAGATTGGGAAAAAATTTAGTTAAA
AATTCTAAATTTTATTTTTGAGTAATTTATGATGAATTTATTTAATAATAAAGAAATTTC
AATAGTTTTATTAATAATCTCTGATTCTATTTCCTTTATCTTATTGATATTATTATTATT
ATTATATCTAGCTATTATGACTTATCACTTCTTGTTAATATCCAAATACTATTTCACTCA
ATAAAACTATTTGGTCATATCTATTCTATTCCTTTTCTTAAAACTAAGTTTGGATGAAAG
TTCTATTGAAAACAATTTATTTATTTATTTCTTATTGGGAATTGAATTCTTCATAGTAAG
CTTTTGAAAAATTAATAAATAAAATTCGATTATTTTATTCTTCTGTGAGGCGTGACTCAT
CTATTATTATTTCTTTCAAGAATCCTTTGGTTGGATTACTTAAGACATTTATTAGATTAA
TTATAGATGTAAAATTGCATTTGAAGTAATCAAAATCTCCTTCCATTACATTATTACTCA
ATTAAAATAATTCATTTCCTATTGTTTCCTATAATTTTACTGGTTTTATATTATTATTTA
TTGCGAATTCGTATAAGTCTTTTTTATATTATAATTGCATTTTTTGCTTGCAGAATTTTG
TGATTTGTAGTATTTCAACTTAATTTTTGAATTTAAAAGTAAATTAATGGTTGTAAAGTA
GAGCTATTAGTATGTCTATATTTTTTAAAACAGTTGAAAGAAGTTACTAGTTGGCTCCTT
TATTACCTGCAGGGAATTTAGGGTCATTATAAAAAGTGGATAAGGTATCTCTACATTTTT
TTATTTCTATGTAAAAAGTATCTACATGATAATTAACGAAATCTCTTAAAAGTAAACCAA
ATTCTAACGCAAATTCTGGGTCTAGATGCTACTCTTCGATAAGAACAAAATTAGAATAGT
CTTTTGATACTTTTTAAATGTAAGGCTCACCTTAGGATATACACTCAGCAAACCACTCAT
GGTTGAACATTTCATGCCAGCTAATACGTTTTTTAGGGTTGAGAGTTAACATTTAATCTA
TTAGATTTTATGCACTCTAAGAAATATTCTACCTAAAAATAAGCTATCTTTAATTTATCA
GTCTTTTGAGTTCTTCAATACCTCCATTATTCGTAGGCAAAAAAGGAGCACGGCCTTCAA
GCATTTCATAGATCATACAGCCTACAGACCAAACATCACATCTGCTATCATATCCTAGAT
TATTTAATACTTCTGGAGCCATAGTCATAGGAGTACCAACCTAATCTTTATCTTTTTCAA
AGCTGGATTTGGCTAGGCCAAAGTCAGCAACTTTTAAGTGAAAATCTTTTGTAATTAATA
CATTGGCTAGTTTCATATCACGATGTATGATATTCATATCTGCTATACCTAAGAAAGCCA
AGAGTATTTAATATGCGAAAACTTTGACTAATTCTTCAGGCAATCTAAGTTTGGTAGCCG
AAAAATTATTTTTGATGAAAACTTCCAAATCACCCAATTCGCACAACTCAGTAACAATAT
AAATATAATCTCCTTCGTTGAAGAGATCTAAAAACTTAATTATATGCTCATTATTAAGTT
AAGAAAGCACTGATATCTCACTATCAATTAATTCTAAATACTGCTTATCAAATTTATTCT
TGTCAATCTTTTTTATAGCAACTTTTTCACCTGTTTCACTATTTATGCCTTTAAATACCT
TAGCAAATGAACCTTTACCAATTTCATTTGCCATTATGTATTTTGTTTTCAGAAGTCTCT
TAAACCCTTCCGAGCTTATTGTTTTCTAGCTAAAAGCTTATTATCTTTATTGTTATTATT
AAATCTATTATTAGTTTACTGTTGGTTGCTGGTAATATTATCTTTGCTGATAATTCTAGC
TACTTGGTTATTGATTCATGCTTATATACCTATTTTATTGGCCAGGAACATTGTTGATTC
CTTGGTAATTGTAAGCATTATGTTATGTAATTGGTACTCTATTTATTGTATTATTATTAT
AGTATTATTATTAATTGCTATAAGGAGGGTTATTATATCTTTAATCCATTTTTTTTACAA
TAAATATTAAGTGAATCTATTTTTTTAAGTATTCTAAAGAAAAATTGTTTGCTTCTCTTA
CTTCTTTGGGTGTTACTTGAGGCTGTTTTAAGCAAAACTTTAAATTTTCTTTTCTTTTTT
ATAAAGTTTTTAATTTATTTATCAATTTATTAATTACTAACCTCTATATAAATAATATTT
TTTAAAAGGGTGTTTCTTGATTTTCTCTTTAAATATGAAGTAATGTTATAAAATTAATCT
GATTATTAATATTTCTAATTCTTTTATCAGAATAAAAAAGGCCCTAAAAAATTTACCTAT
TATAAAGGAGACGCATAGGAGAGACCTGAACCTATTTTGACTGGTTTAAGAAAATACTTT
TAAAATAGTTAATCCTAGAGCAAATTTTTTTGTGCCATTATCAGAGAAAACAAAAGATTG
AGATAAGATAGTACAAATCAATATCACTGTTTGTTTACTTATTTACTGGTTTATATTGTA
AGTATAATTTTTTTAATGTATATCAATATGCCTTTTAGATTTTAATTTTTAGATGTAAAA
ATTGAAGTAAAAGTTGAAATATAAATAATTATTGAATAATTAAAATAGATATTAGAAAAA
GCATGAATTATAAGATATTAATGAGTTATAAAAATATAAACATTTAAATACTATAGACTT
AATAAATATATTTACGCAAAATTAATTAAAGGAAAATCTATATTAATTAATTATCAAAAA
TTTCTTTCTTTTTTATACATATAATTAATTAACTTTTATATAAAAAATATATTTAATAAA
TTAATTATTTTAATCAACAACTCCAGTCAAATACTCTAAAACTGAACCAGAATTTTTTTC
TATCAAAATTTACATACTCACATTTGTTCTTTTCACACTGTTTTTTAAGTTTTCTTTCCA
ATTTCTCATAGTCAATAGTTTTTTATCTGTGTTCCTCAAATGCTTTTTTATCAATGCAAT
ACAATGTTACAACAGCCTGTTAGTTTAATTTACATCCAACCTTAGGGCATTTACCAGAAT
ATAAGTGCTCAGGATAAACAATAGCCCTTTGTTATTCTATTATAACTATTTTATCTAGAT
CCTGTCTAGTTATCTCTACTGGATTTTCAAATTCTATTTTCCCGTATTGGTTCTAAATAA
TAAACTAGTTGACACTTTATAATTCTTCTATTGGCCAATGTCTCATTTCATATACAGAAG
GTGAGCATTTATACTTATCATTCTTTAGTACAGGCGCCTCACTAACAAAAATTTCTATAA
TTATTTTACCTTTATTAGTTACTTTAAAGTCCTTGAGCGATTTTTCAATAGGTGTCAAAG
CCACTATTTTCCCATCAGTGTCAATATATGTAGCATTTTTACCTATAAGTTCATCATAAT
CTCTATGCCAAATCAATCCACTTTTTAAAATGTGTTTTTAATAGTGGTCAGAAATAATTT
ATTAAATAGTGTCTGTTAACTTAAATTAAACCTTTTATAATTAATCAATTTCTTCACTTT
TTTGTGTGGAGATATTAGTCACATGGCAAATAACAGACACAAAAGCAAACTCTCTCTTCA
TTTCATATTTGAAAAGTCCAAATCCAAACTTTTCATATTTTCTTTATTTTGCAAGTTCTT
CTTTCCATTTCTCCAAATCGAGTAGCTTTTTTGTACACTTAGCTAAAATGTTTAAATCCA
TAAGGCCCTCATTATGAGAATCTAGATATTCCCTATAAAATTGTCTCTCTTATTCAACTT
CTTCTTCTGTTTCAAACTCTTCAATATGTTTACGATCTTTATCAAAAGGATGATTGCCAT
TTTCTTAAGCTTCTTACTATAACTAAATCCCTCTCTGTCTCATCTATTCTTCCATTAAAG
CTTTTCTTCTAGGTAAGTAAAATTCACTATTTGGATCTTACTCCATTTCATAGAGAAATT
GGTATTTCTTTTTAACGTTTTATTCTTACTTATTCAAACTCTATCTTTTTAAATCATTCC
ATAATCTGTTTTAATTATACAAACCAGGAAATAACTCCTTGATTTATTATTTTTTCTTTT
TTTCATCTTCCATATTTAGCAGGCTATTATTTAAATTATGAATGCTCTTTTGTTCTGCTG
CATTCCCACTATTACTTTACTGTAAATCCTCACTATTTCTTCTTAGATTAATAATCATAT
TTGAATTCTTGAGTATTCCTGTAGGTTTTTTTTCAGAAAAGAAACTTTTGGTACTTTATG
GTCGAATAAGTCTATCATTTAAAAATTATTTCTAATCTTAAGTCAAATCTCCTTTTTAAT
CTAGAATAATTTAAAATTTAATTATTATTGAAAATTAATTTTAAATAGCTAAGGTTGTTT
TAATAAAAGGAGAGCATATGTACTAAATTTCTTGAATAATAATAAGTTCATAAAATTTAA
TCAAAAAGATATTTTACCTATAAATGTATTAGCGACTCTCTTAACTTGTAGTCTCTTTGG
TGGAGGTAGTACTAGCTTATTATTAAATTATGGGATTAGATTATTCCCCTAACCATAATA
AGGTTAATTATTTGTCCTAAATGGACTCATATTGGCCAATCTAATCTTCGGAGTATATTT
AAGAAGTGAATTTTAAGTATCAAAAATGCTTGTTGGGGGCATGTAATTTATAACTTCCAA
TAGATTAGGTGCATTACCAAATATACTCTAAGTTTAATTTGGTTAATTTAAGATGCTATT
TGGCTAGTTAAATACATTTTAGATAGTATTATTATTGTTGTTGTTATTAAATATACTCTA
ATTGTTTGATCTATTTACATTTAAGTTGTTATTCATACTATTATTAAAAATACTTTAATT
ATTGCTATTATTAAAAATACTTGAATTATTATTTAATATACTTTAATTTGTATTATTAAA
AATACTTGAGTTGTTGTTGTTATTGTTATTACTGCTAAAAATATTCTAATTATTATTACT
AGATTTAAAAATATTATTGTTATTATTATTATTGTTGTTATTAAAAATACTTTAATTATT
ATTATTGTTTTTGCTAAATATATTTTAGTTGTTGCCATTATTGTTATTATTAAATATACT
TGAGTTGTTATTGTTAAAATTACTTTAATTATTGTTATTATTGTTGTTTTTAAAGATATT
TTGGCTATTGTTCGTATTGTTGAAGACATTTTGATTATTGTTACTATTGCTAAAAATATT
CAAATTATTATTTGTGTTGTTGTTATTATTATTAAAAATGCTTTAATTTTGATTGTTAAA
ATTTCTTTAAGTATTATTATTACCATTAAAGATACTTTGATTGTTTATGTTCTAATTGTT
GTAATAACCTTAAGTATTTTATCCAAAATTTGCAGTTTAATTACTATTATTGTAGTACAT
GTTGTTATTATTCACTTAATTTTAGTTGAAAATAGGATTAGCATTATTGTAGCTTGCGTA
CATATTTCTATTCATTTAGTTGTTTTAATTTCCACTGCCTCCTACTGGATTACTTGTTTA
CCTATTCATTCTACTTGCAACTATAGGATTTATGGGATTGCTGTTCATTACATTTTAATT
ATTAGATTAAAATATATTTTAATTTGGGATCTATTAAACACTTCTATTCATATTATTATT
GTATACACCATTTGCTAAATAATTCATCTAATTTTAATTTTGATACTACTGTTCAGTCAT
ATATTGTGGGTTATTATATGGATTCATATTTTAAGGATATCCATATTGCTATTAACTGTT
GCTCATATAAGGATTATATACATTTTAGTAGCCATACATTTACATCTGAATTAGGCCGTT
GTTTCCTAATTTTTGCTATAAATATTATTAAACAAAGATATTATTTATTTACCTTATTTA
CTTTATTTTTTAAATTAAAATTTCAAATTATTAAATATTTTATATCAAAAATAAACTAAA
TCCGCCAATTTTCTATTAAAAGTAAAAGGTAATTAAATTTGAGGCACTACATTCATGATA
AATTGAAATTATAAAATAGATAAGATGGATTATTTTTAATACTAAGAATAAGATCCAATT
AAATAAGAATATAAAATATAATGTAAAGTAGCAGAGGGAGCATTTGGTTCTGTTTTTAAA
GCAATCAAATAAAATACGCGTAGATTTTTATGAATATTTGTTGATGATTAGTTTGTTAAA
AATATTTTTATAGAATAAATAGTTGCTATTAAAGATTTATTTTTTAATCAGAATAAAAGA
TCTAAGTAGATTGTTGAAAGAGAGGTGTCCATTATGTAGGATTTAAATGATCATCCAAAT
GTAAATTTACTCATATTGGAAATGAAAATTCTTATTAAAATGAAATGAGTAGATAGTAAA
ATTAATAGATTATTAGATATCTAACAACAAATGCTCTCTTGTGATGGAATACATTGATTA
TGACTTAAAATAATTTATAGAAAGCTAAGTTTATCCTCTTAGTCATTCAAAAGTAAAATA
AAACAATAATCAATAATGAAAATAATTTGACTAGTTTTTCTAAGATAAAAAGAATAGCCT
TTTAATTACTCACTGGATTATCATTTATTCACTCGAAGGGCATTATTCATAGAGTAAAAA
ATTTCATTATAAATAAATAGTATAAGAATTTGATTTTTTTAAAAAGGATTTAAAACCATC
AAATATATTAATTACTAACTAATTTATTGTTAAAATTGGTGATTTTGGATCAGCTATTAA
AGAAGAGTAAAGAAAGGATAAATAATTTTCTATTGAGGGATTCACAAGATGGTATAAGTC
TCCAGAGTAGCTTTTTGGATCTAGGGAGTATAATTACGAAATAGATATTTGGAGTTTTGC
ATGCATTTATGCTGAAATAATATAAGGATATCCTTTATTTTCTGGTAAAAAAACTTCTAT
GTAAATTAATTAATAAATAAAATTTGAATAATAAAGGTAATAATGAAATAGAATAAATTG
CTAAAATATCTGATTTGCTTGGTAATCCATGTGAAGAAAATTGGCCTAGTATTGTTAAGA
TGCCAGATTATGGAAAAATTTTATTTAAACAAAAATAAAAAAAAAATTTGAGCACTTTAT
TTAGTTAAGCTTCTGAAAAAGAAATAGAGTTTCTAAATTCAATGTTAAAATATGATAATA
GACCTACTGCTGAATAAGTAAATAGTTTAACATAAATAAAAATTAAATTAATTTTGCTTA
CATAAATATAGTTATTGCAGAGTGAATATTTTAAAGATGACTCTGTACCATTAAAATTAT
AAAACAAAAGTATAATTTTGCCTCCTAAGCATGAAGATAAGATATATTTTAATTATACTA
GCGTGCTAAAAAAATGA>TTHERM_01080600(protein)
MRIHSINKYYKKMDYFQYQEQDPIKQEYKIQCKVAEGAFGSVFKAIKQNTQQIVAIKDLF
FNQNKRSKQIVEREVSIMQDLNDHPNIVKLIDYQISNNKCSLVMEYIDYDLKQFIESQVY
PLSHSKIKRIAFQLLTGLSFIHSKGIIHRDLKPSNILITNQFIVKIGDFGSAIKEEQRKD
KQFSIEGFTRWYKSPEQLFGSREYNYEIDIWSFACIYAEIIQGYPLFSGNNEIEQIAKIS
DLLGNPCEENWPSIVKMPDYGKILFKQKQKKNLSTLFSQASEKEIEFLNSMLKYDNRPTA
EQLLQSEYFKDDSVPLKLQNKSIILPPKHEDKIYFNYTSVLKK