Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_01308010

Standard Name

POC1 (Proteome of centriole 1)

Aliases

PreTt02574 | 318.m00023

Description

POC1 POC1 centriolar-like protein

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External Links

Gene Ontology Annotations

No Data fetched for Gene Ontology Annotations

Domains

  • ( PF00400 ) WD domain, G-beta repeat
  • ( TIGR01396 ) flagellar basal-body rod protein FlgB

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source Identifier Score
Tetrahymena borealis EI9_14508.1 9.997093137033517e-262
Description: POC1 centriolar protein (614 aa)
Oxytricha Contig20042.0.g31 3.000935899181433e-99
Description: WD domain, G-beta repeat
DictyBase DDB_G0288375 9.9981864321491e-40
Description: lis1 on chromosome: 5 position 1452516 to 1453990
WormBase WBGene00003047 3.9990760533890984e-36
Description: locus:lis-1 Lissencephaly-1 homolog status:Confirmed UniProt:Q9NDC9 protein_id:CAB03282.3
Stentor Coeruleus SteCoe_36724 1.3336148155022614e-34
Description: None
SGD YBR198C 9.99967697349061e-30
Description: TAF5 Subunit (90 kDa) of TFIID and SAGA complexes, involved in RNA polymerase II transcription initiation and in chromatin modification

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:27251062: Meehl JB, Bayless BA, Giddings TH, Pearson CG, Winey M (2016) Tetrahymena Poc1 ensures proper intertriplet microtubule linkages to maintain basal body integrity. Molecular biology of the cell 27(15):2394-403
  2. Ref:20008567: Pearson CG, Osborn DP, Giddings TH, Beales PL, Winey M (2009) Basal body stability and ciliogenesis requires the conserved component Poc1. The Journal of cell biology 187(6):905-20

Sequences 

>TTHERM_01308010(coding)
ATGAAGAAAACAACAATTGCATCATCAGCAGTAGCATCTCAAAAATAGACTTAAAGTAAA
CTTGGCAATACTTCTAGCAAAATTACTGAATAATAAACAACCCATGATCCAGCTTTGTCT
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TCTGAAAATTAATATCCTGGACTTGAAATAGTTGGAAATCAATTCAATTTATAATAATCC
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GATCCTAAACAATAAACTATGAATTTTGGATATTCTAACATCCAAGACCATTCACTTTCT
GCAAGCTTAAACGACAGAAATGTAGTTAACATCTTCTAAGCCGGAGCTCTTGCAAACACT
GGATCAATTGAAGCTTCATTAATTAATAAGTAATAAGAAGAATGA


>TTHERM_01308010(gene)
ATGAAGAAAACAACAATTGCATCATCAGCAGTAGCATCTCAAAAATAGACTTAAAGTAAA
CTTGGCAATACTTCTAGCAAAATTACTGAATAATAAACAACCCATGATCCAGCTTTGTCT
AGATCATTCAGAGGTCATGAAGATATCATTACTTGTGCTGATTTTGATCCTAAAATGTAA
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CATCTTGTTCTAAGGACTCTATTGTTTATGTTTGGAATTTTAAGCCATAGCAAAGACCTT
TTAAATTTGTAGGACATAAAGGAGCTGTTTATTGCGTAAAATACAGTCCTGATGGTGAAA
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TGAAAACTAACTCGCAATTTAAATTTGAAAACTAAAGATTGTATTGATTTATTTAAATTT
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AAGTACAAGCAATATCTTAAATAAAACCTGAGAGTATATATAAAATATAAGCATCAAAAG
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TTTGAAATAATTGTTAATGATTAAGTAAATTATCTGTTAACATAATTAACTTTTAAATAC
AACTTCTGCTCTAAAAATTTTAATATAATTGCCAAAGAAAATTATTACAAAGTAGTTTTA
AATGATTAAAATTATTTTTATCATCATCAAAAATGTTTGATCTCTTTGATTAATTTTTAG
AATTTATTTCTTTTATTTTCTAAGATCTAATTTTGATAATTATTAATTGATTTTTTAATA
AATTAGATAATCTAAATGCTCTATTATTAAGGCTCACTGCGGTGCTATTAGAAGTATGTC
TTTCTCTGCAGATGGTGGTTACTTGCTTTCTTCCTCTGATGATAAGACTTTAAAACTTTG
GAGATTGTAAGATAAGAAATTTATGTGCTCTTTTGCAGGACACAAAAACTGGGTTCGTTC
TGGTGTCATTTCTCCAGACATGAGATTGGTTGCATCTGGCTCTGACGATAAGACAGTGAT
GCTATGGGATTTGAATTTCTAAAAAATAGTTAGCAAATATAGTACTCTAGATGATAATGT
TAAAATTAGTTAAATTAACAGTTATAGTGATCACATGGATACAGTTAGTTAAGTTCTTTT
CCATCCCGATGGAACCTGCTTGATTTCTTCTTCCTTCGATCATAAAATTAAGATTACTGA
TATCCGTTCAAATAAATTAATTTAACATTACAATGCTCATGATGCTTAAGTGAACAGCAT
TTCTATTCATCCAACTGGTTATTTCCTTGCTTCTGCAGGCTCTGACTCTAAGATTAAAAT
TTGGGATCTCCGTTAAGGCAGACAAATCTACACTCTTTATTCCAATGATAAAGACATCAC
AACCGTATAATTCAATCAATCTGGTGACTACTTCGCTACTGGAGGATCTCAAAATCTTTG
CATGGTTTGGAAGACCAATTTTGATCAAAATATTCAAAGTAAAAAAATATTTTATTTTTA
TTGATAATAAGTTTTTATAGAGATTTTAATAGAATAAAAATACATTGATAAAAAGTTAAA
CAATATTATTTTAAATGAGATAATTTGAAAATCTGTCTTTAAAGTTTTTAGCAGCAATAA
AAGTTAAATTTTTTCTTATTTGTAGAAAAAACAAAAAAAAAATGAATTAACTTTGAAATA
TTTAAAATAAAATCACATATTTAAAAGCAAAAAATAGCATTTAAAGGAATTTTTAAAAAT
AAATTATGATAAAAAATATTTTTTAAAATTGAAATAAAATTAATAAATTTGAAACAATAA
AAGCTATTTCTTTCTTTTGGATTAAAATTAATTTTAAATATAATTTATAAAAGATATCGA
ATAGGTTTAAAGATCTACAGTCAGATAAAATGATGTTGAATACAGCAGTGGTGGATTGTA
TGCTTAGACACTTTTCAAGACAAACAAAACTGCTTCTCTTTCTCCATCCAAAAAGACCAT
TTCTATAATTCCTCCTCAATAGTTATAAGACACATTCAATAATAGAGGCGATGATGAATT
AAATAACGGAAGAGTTCACGAAAATAAATAATCAAATTCACCTACCTTCTCTTAATAATA
ATAATAACAATAACTCAATTTATCTGAAAATTAATATCCTGGACTTGAAATAGTTGGAAA
TCAATTCAATTTATAATAATCCACTCTTTCTAATAACAATAATCAAAACAATCTTATTAA
ATCTCAAAACGACTCTATTGTTTCAAATAAAAACGCTATTCCTTTCCATCCTTCTTCTGA
ATTTTAACAATCTGCTGTTTAATAATAATTTTCCCAATAACCTAAATTAGTAGTAAACAA
CGGAACAGCAACTTATCCCTCGAACTTCGTACCTAAAGTTGAAGAAGAAAATGTAATATT
TATATTATTATTTACTTGTTTTAATTTGTTCTTTAAACTAGATTATGACTGAAGCCATAG
CCGCAAGCATGCAACAAATTTATAGCAGATTAGATACAATGTTCTAATATATGACAAACT
TGGAAAACAGAGTTGTCCAATCTGAATAATTACAAAAGAGTTTTGTGAGCTAAAACCACC
AAAATACTTTAGATCCTAAACAATAAACTATGAATTTTGGATATTCTAACATCCAAGACC
ATTCACTTTCTGCAAGCTTAAACGACAGAAATGTAGTTAACATCTTCTAAGCCGGAGCTC
TTGCAAACACTGGATCAATTGAAGCTTCATTAATTAATAAGTAATAAGAAGAATGA


>TTHERM_01308010(protein)
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DGTCLISSSFDHKIKITDIRSNKLIQHYNAHDAQVNSISIHPTGYFLASAGSDSKIKIWD
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