Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_01337400

Standard Name

HPL2 (Heterochromatin Protein 1 Like 2)

Aliases

PreTt02558 | 333.m00018 | 3795.m00073 | TCD1 | JUB5

Description

HPL2 heterochromatin protein; Heterochromatin protein 1

Genome Browser (Macronucleus)



Genome Browser (Micronucleus)

External Links

Gene Ontology Annotations

Cellular Component

Molecular Function

Biological Process

Domains

No Data fetched for Domains

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

Tetrahymena Stock Center

  • ( SD02157 ) Macronucleus: HA2-CDH2
  • ( SD02610 )
  • ( SD02611 )
  • ( SD02759 ) Micronucleus: Neo3 replaces most of coding Macronucleus: Neo3 replaces most of coding
  • ( SD02760 ) Micronucleus: Neo3 replaces most of coding Macronucleus: Neo3 replaces most of coding

Homologs

Source Identifier Score
Tetrahymena borealis EI9_21098.1 6.002203762674495e-72
Description: heterochromatin protein 1 (727 aa)
DictyBase DDB_G0283023 0.0000000000019997478866288316
Description: hcpA on chromosome: 4 position 170065 to 170742
WormBase WBGene00001995 0.00000039992052383199455
Description: locus:hpl-1 status:Confirmed UniProt:G5EET5 protein_id:CAA94152.1
Oxytricha Contig19010.0.g64 0.000000600201742947405
Description: Chromo (CHRromatin Organisation MOdifier) domain

General Information

No. Gene Name(s) Paragraph Text
111 JUB1, COI16, JUB3, JUB2, JUB4, HPL2, COI3, COI6, JUB6 This protein co-localizes with Pdd1p in heterochromatin body in the new macronucleus.

Associated Literature

  1. Ref:28692189: Wiley EA, Horrell S, Yoshino A, C Schornak C, Bagnani C, L Chalker D (2017) Diversification of HP1-like Chromo Domain Proteins in Tetrahymena thermophila. The Journal of eukaryotic microbiology ( ):
  2. Ref:26688337: Kataoka K, Mochizuki K (2015) Phosphorylation of an HP1-like Protein Regulates Heterochromatin Body Assembly for DNA Elimination. Developmental cell 35(6):775-88
  3. Ref:25989344: Xu J, Yuan Y, Liang A, Wang W (2015) Chromodomain protein Tcd1 is required for macronuclear genome rearrangement and repair in Tetrahymena. Scientific reports 5( ):10243

Sequences

>TTHERM_01337400(coding)
ATGTTAATTAAATTGAATTTCAGTTTAGTATTTATCACGCTAATTATTAGCTTAGTTATT
GTTTATATTAGCTAAACTCGTAAACTTAATAAATAAAAATTTTTCTTAATTAATTACATA
AATTAAAAAAAACCTTTTGTGTAGATGTTCACTGTAAAGCAACAGGCACTAAATAAAATT
TAAAGTAAGTAGGCTTAACTTCCTAAAAATACATAAGATTCCCTTCAATAAATGCTTGCT
TGGGATTAAGAGTTTCTTGCATCAAAGGATAAGCTGTTTAAAAATAAGCATTAATACTAA
GGGAACGGTGGTTCAGCTTTGCTATTGAATTTAAACACTAACAAAAAGACAAATTTATAA
CAACAGTAACAACAGTAGAATTAAATCTAACCAACATAAATGAGCTAAATTTCGTAACAT
GAACTAAGGTAGTTGTAAAAAAAAAGAAAATTGCAAGAATTAGCAAGAGAAAATAGTAAA
ATTTTAAAGTCATAAAAGTAGCAATAAAAAGAAAATAATGAGTAAATAGATTCATCTTAG
GACGCCTCTGACGAATATGAAGTTGAAAAAATTGTTGATAAAAAAATTGAAAATGGATAA
ATATTTTACAAAGTGAAGTGGAAAGGTTGGGATAGTACTTACAATACTTGGGAACCTGAA
AATAATCTTTTTAGAGTATCTGAAATGATTGAAGAGTACGAAGCTTCAAAAAAATATTAA
AAAAGATAAAATTTCCCAAAATAAGTAGATTCTGGGAGTAGTGATTTGGAAGATAACGAT
AAAAAGTAAAATTCAGCTCCAAAAAAAGGAGAAACTTCAAATTAAATAAATTAAAGTAAC
CTATAAAATAAAAATGAGAGTTTGTCAAAACTTTAGTAGAGTTAGTAAAAAATTTAATCT
AATGTAATAAAAAGTAGATAGCCTTCTAATAATACACCAATAACCCCAAAAGAATAACAA
GATAGACTTTATAAAGAAAATTTAACTGCAAATAAATAGAATAATGCAAAAGAAATGGAT
ACATACGAAAAGAATTAAAATATGAGCAATAGCTAAATTTAACTTGAAAAAAATAAATAA
TTTTATTAATTGCTGATGAATTAAAAATCATAATCTGCTTCTTCTACTTCTGCTTTAATT
CCACCACAAAAACAGAATTAAAAGAATTTAGAAGAAACATAAAATTTGTAAAACAATATA
AAAAATTAAGAAAAAAAGATTGCTAACAACATAGAATAATTAGATCTAGAGGATGATAAT
CTTGAAGTTGAAAAAGATTATTCTTAGTAAATTCATCAAAAGTCACAAAACAAAGAAAAA
TCATTTGAAGAAAATGAAGATGGAAATGAGGACGACAAAGAATACATTTTTGAAGCCATA
CTTGATAAGCGTTAATTAGAGGGATAAGAAGTCGAATATTTGCTGAAATTTTCTAACCAT
GATAAACCTGAGTGGGAACTGATAAGTAATTTAGAAAGCATAGAAGAAGAAATAAAAGAA
TATGAAGAAGGGTTAAAAAGGGCTTAAGAAAAAGCTATTTTGCTATCATAATAAGAAAAT
TTAGATTAATAAAACTTGTAATTTGAAGAGGTTTAATAAGACAAAGAATTTATTAGTTAA
ACTGAACCTGCTACAAGTTTAACAACTATGCAAAGTCTAGTTCATTAAAATAAAGAAAAT
TAATCTTAAGTAAATCATCAGACTAAAAAAAATAAGATTGTCCCTGAATAAATAGATGTG
GACTGCTCAGATGATTAATTTGAACAAGAGGTTTAAAAAAATTAAATGGATATTTAATCT
AATTTAAGCCCATAAAATTCTAACCAAAATATCAATTATTAACCAGACTAATAGAAAAAA
GATAAATAAACTATTGGCTCTGAATTGAATAGTAAATAAAAATAGTAATAATTAAATATC
CAGCAAGTACTTCCTTGCTAAACTAAAATATTAGAAAATGTAATCTAAAATTAATAACCA
TTTAATTTAATTAATCCTTTACTTAATAACACTTCTCTTCAGCAGCTAGCAAATATTTCA
AACCCTATTAATTACACATAAAATTATAACTTTAGCTAGGAAATTGGATGCTTTTATAAA
GGTGATCAAAGATTTTCTATTGAACCTTGTGACTAATCTACTCTACAAGATCTTTCTAAG
ACTACTTTCAAAGTTATGTGGAAACCAAGAGTTAATGGTTGTGTACCTCTACCAAGTCTA
ATATCTTACTAAATGCTAAAAGAACATGATCCAGTAGGCTTGGTTTTATTTTTTGAAAAT
CTAATATAGAAATAATAGTAATAAATAGCTAAATGA


>TTHERM_01337400(gene)
ATGTTAATTAAATTGAATTTCAGTTTAGTATTTATCACGCTAATTATTAGCTTAGTTATT
GTTTATATTAGCTAAACTCGTAAACTTAATAAATAAAAATTTTTCTTAATTAATTACATA
AATTAAAAAAAACCTTTTGTGTAGATGTTCACTGTAAAGCAACAGGCACTAAATAAAATT
TAAAGTAAGTAGGCTTAACTTCCTAAAAATACATAAGATTCCCTTCAATAAATGCTTGCT
TGGGATTAAGAGTTTCTTGCATCAAAGGATAAGCTGTTTAAAAATAAGCATTAATACTAA
GGGAACGGTGGTTCAGCTTTGCTATTGAATTTAAACACTAACAAAAAGACAAATTTATAA
CAACAGTAACAACAGTAGAATTAAATCTAACCAACATAAATGAGCTAAATTTCGTAACAT
GAACTAAGGTAGTTGTAAAAAAAAAGAAAATTGCAAGAATTAGCAAGAGAAAATAGTAAA
ATTTTAAAGTCATAAAAGTAGCAATAAAAAGAAAATAATGAGTAAATAGATTCATCTTAG
GACGCCTCTGACGAATATGAAGTTGAAAAAATTGTTGATAAAAAAATTGAAAATGGATAA
ATATTTTACAAAGTGAAGTGGAAAGGTAATTCTCTTTTTAAATTTATTAGGATCAATTAA
TAGATTTAATTTATTTTTTAATTTTAAAAAGGTTGGGATAGTACTTACAATACTTGGGAA
CCTGAAAATAATCTTTTTAGAGTATCTGAAATGATTGAAGAGTACGAAGCTTCAAAAAAA
TATTAAAAAAGATAAAATTTCCCAAAATAAGTAGATTCTGGGAGTAGTGATTTGGAAGAT
AACGATAAAAAGTAAAATTCAGCTCCAAAAAAAGGAGAAACTTCAAATTAAATAAATTAA
AGTAACCTATAAAATAAAAATGAGAGTTTGTCAAAACTTTAGTAGAGTTAGTAAAAAATT
TAATCTAATGTAATAAAAAGTAGATAGCCTTCTAATAATACACCAATAACCCCAAAAGAA
TAACAAGATAGACTTTATAAAGAAAATTTAACTGCAAATAAATAGAATAATGCAAAAGAA
ATGGATACATACGAAAAGAATTAAAATATGAGCAATAGCTAAATTTAACTTGAAAAAAAT
AAATAATTTTATTAATTGCTGATGAATTAAAAATCATAATCTGCTTCTTCTACTTCTGCT
TTAATTCCACCACAAAAACAGAATTAAAAGAATTTAGAAGAAACATAAAATTTGTAAAAC
AATATAAAAAATTAAGGTAAAAAATATAATTAAATTCATGTTTATTTTACCCATTAAATT
TATTAGAAAAAAAGATTGCTAACAACATAGAATAATTAGATCTAGAGGATGATAATCTTG
AAGTTGAAAAAGATTATTCTTAGTAAATTCATCAAAAGTCACAAAACAAAGAAAAATCAT
TTGAAGAAAATGAAGATGGAAATGAGGACGACAAAGAATACATTTTTGAAGCCATACTTG
ATAAGCGTTAATTAGAGGGATAAGAAGTCGAATATTTGCTGAAATTTTCTAGTAAATTTA
CTTAGCTTAATTAAGTTGTTTTTATTTTCTTTTAAAAAAATAGACCATGATAAACCTGAG
TGGGAACTGATAAGTAATTTAGAAAGCATAGAAGAAGAAATAAAAGAATATGAAGAAGGG
TTAAAAAGGGCTTAAGAAAAAGCTATTTTGCTATCATAATAAGAAAATTTAGATTAATAA
AACTTGTAATTTGAAGAGGTTTAATAAGACAAAGAATTTATTAGTTAAACTGAACCTGCT
ACAAGTTTAACAACTATGCAAAGTCTAGTTCATTAAAATAAAGAAAATTAATCTTAAGTA
AATCATCAGACTAAAAAAAATAAGATTGTCCCTGAATAAATAGATGTGGACTGCTCAGAT
GATTAATTTGAACAAGAGGTTTAAAAAAATTAAATGGATATTTAATCTAATTTAAGCCCA
TAAAATTCTAACCAAAATATCAATTATTAACCAGACTAATAGAAAAAAGATAAATAAACT
ATTGGCTCTGAATTGAATAGTAAATAAAAATAGTAATAATTAAATATCCAGCAAGTACTT
CCTTGCTAAACTAAAATATTAGAAAATGTAATCTAAAATTAATAACCATTTAATTTAATT
AATCCTTTACTTAATAACACTTCTCTTCAGCAGCTAGCAAATATTTCAAACCCTATTAAT
TACACATAAAATTATAACTTTAGCTAGGAAATTGGATGCTTTTATAAAGGTGATCAAAGA
TTTTCTATTGAACCTTGTGACTAATCTACTCTACAAGATCTTTCTAAGACTACTTTCAAA
GTTATGTGGAAACCAAGAGTTAATGGTTGTGTACCTCTACCAAGTCTAATATCTTACTAA
ATGCTAAAAGAACATGATCCAGTAGGCTTGGTTTTATTTTTTGAAAATCTAATATAGAAA
TAATAGTAATAAATAGCTAAATGA


>TTHERM_01337400(protein)
MLIKLNFSLVFITLIISLVIVYISQTRKLNKQKFFLINYINQKKPFVQMFTVKQQALNKI
QSKQAQLPKNTQDSLQQMLAWDQEFLASKDKLFKNKHQYQGNGGSALLLNLNTNKKTNLQ
QQQQQQNQIQPTQMSQISQHELRQLQKKRKLQELARENSKILKSQKQQQKENNEQIDSSQ
DASDEYEVEKIVDKKIENGQIFYKVKWKGWDSTYNTWEPENNLFRVSEMIEEYEASKKYQ
KRQNFPKQVDSGSSDLEDNDKKQNSAPKKGETSNQINQSNLQNKNESLSKLQQSQQKIQS
NVIKSRQPSNNTPITPKEQQDRLYKENLTANKQNNAKEMDTYEKNQNMSNSQIQLEKNKQ
FYQLLMNQKSQSASSTSALIPPQKQNQKNLEETQNLQNNIKNQEKKIANNIEQLDLEDDN
LEVEKDYSQQIHQKSQNKEKSFEENEDGNEDDKEYIFEAILDKRQLEGQEVEYLLKFSNH
DKPEWELISNLESIEEEIKEYEEGLKRAQEKAILLSQQENLDQQNLQFEEVQQDKEFISQ
TEPATSLTTMQSLVHQNKENQSQVNHQTKKNKIVPEQIDVDCSDDQFEQEVQKNQMDIQS
NLSPQNSNQNINYQPDQQKKDKQTIGSELNSKQKQQQLNIQQVLPCQTKILENVIQNQQP
FNLINPLLNNTSLQQLANISNPINYTQNYNFSQEIGCFYKGDQRFSIEPCDQSTLQDLSK
TTFKVMWKPRVNGCVPLPSLISYQMLKEHDPVGLVLFFENLIQKQQQQIAK