Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00049310

Standard Name

CHD3 (Chromo-Helicase-DNA-binding domain 3 )

Aliases

PreTt11310 | 3.m01803 | 3824.m03069

Description

CHD3 SNF2 family amine-terminal protein; SNF2-related protein; SNF2 family N-terminal domain containing protein

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External Links

Gene Ontology Annotations

Molecular Function

Domains

No Data fetched for Domains

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source Identifier Score
Tetrahymena borealis EI9_01628.1 9.997093137033517e-262
Description: SNF2 family domain-containing protein (1496 aa)
WormBase WBGene00000482 1.9995317320402142e-140
Description: locus:chd-3 Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3 homolog status:Confirmed UniProt:Q22516 protein_id:CAA91810.1
DictyBase DDB_G0284171 7.0010636619989215e-130
Description: chdA on chromosome: 4 position 1645755 to 1651739
Oxytricha Contig16139.0.g36 6.001241942754875e-123
Description: SNF2 family N-terminal domain
SGD YOR304W 9.99679536751975e-103
Description: ISW2 ATP-dependent DNA translocase involved in chromatin remodeling; ATPase component that, with Itc1p, forms a complex required for repression of a-specific genes, INO1, and early meiotic genes during mitotic growth
Stentor Coeruleus SteCoe_29714 2.2856936767186716e-49
Description: None

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:17821280: Harrison JA, Fowler EH (1945) AN ANTIGEN-ANTIBODY REACTION WITH TETRAHYMENA WHICH RESULTS IN DYSTOMY. Science (New York, N.Y.) 102(2638):65-6

Sequences

>TTHERM_00049310(coding)
ATGTAGCGGTATATCAGCATTTTTTATTAAATAAATAATACTAAAGAAGAAGAAAATATA
AACTATAAAAAACAACCGCGAAAGTCCAAATTTACAAATAAAAAAAGAAAGAAAATATAA
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GCTAAAAAGTAAAACTCTAAAAACAATAATACAGGAGCAGCTAGCAATGCAAATAATTAC
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TCTGATATTGATCGTTTCTAGTTTGTACTTAATGGTTTTAATGAGTTCCATAGAATGGAA
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GAACTCCAAAAGAACAGACCTGAAACTTTCAAAAAAGACCATAAGCCTACTTACATGGAT
TTCAAAAAGTATCTCAAGGAATTCTACGCAGCACTTTTATTCTATAAGAGATTAGAAAAG
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ATCAATACAATCGATTCCGAACTAGGACAAAAGTACGTTATTAGGAAATTATAGAACAGA
GCTAACAACATGATGAATTTCTTGCTTGATGTAGATGAAGGAAAGAAGGAAGAATGA


>TTHERM_00049310(gene)
ATGTAGCGGTATATCAGCATTTTTTATTAAATAAATAATACTAAAGAAGAAGAAAATATA
AACTATAAAAAACAACCGCGAAAGTCCAAATTTACAAATAAAAAAAGAAAGAAAATATAA
ATCAAAGTAATTATCTTAATCATAATAAAAATTAAGCATTTTAAAAGAAATAAAGAAATA
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ATGGATTTTAATACAATCGATTAATTCTGGCTTGAACTCCAAAAGAACAGACCTGAAACT
TTCAAAAAAGACCATAAGCCTACTTACATGGATTTCAAAAAGTATCTCAAGGAATTCTAC
GCAGCACTTTTATTCTATAAGAGATTAGAAAAGCTTGACAATGCAGTGTTCTGTGGATTA
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AAAAGCCTGAACTTGTTGTTAGAAGAATCGGAGGTCTTTCAATTTTGCGTAAAAAGTACA
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GATTATCTTTTAATTCATGCTATTTTTGCAGTAGGATTTGGTAACTGGGAAAAGCTGTTA
GAAAACAAGATTTTATGGGATTACCCTCAAGATCTTAATTTATAAATATGGTAAATTATT
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AATTTAATATAGGTACGTTATTAGGAAATTATAGAACAGAGCTAACAACATGATGAATTT
CTTGCTTGATGTAGATGAAGGAAAGAAGGAAGAATGA


>TTHERM_00049310(protein)
MQRYISIFYQINNTKEEENINYKKQPRKSKFTNKKRKKIQIKVIILIIIKIKHFKRNKEI
TDKHNINFLSTKDILIIKFKMGTRRRQQAVSNDESSSKQQEVTQRTLRTRTKKLKVVSDS
EDDLEDELDAQYDDEEEDFDDEAVRKPKSKKNLKKNSSIIKSGNGRGRKSKAKQKKNEDS
MQEEEEESIQGGEEDNNQAENEIEEEIEGNEQDDQAHDQGEYAEDDLEDEPPSDDYEYDS
EEKANKVQRDEVYNLSETDANESWCFICRDQGKLICCENCSKTFHLTCVGIKKPPTGAWE
CPYCREENKDICCACEKSTNEAEIKVTCSLCYRLMHFECLGIPLKQLVDCPMNRNYFLDA
DTLTILQSISDKDDAEVANEKLKNLTEAIKKLHTTEGKQILYSCFTCIGYFGIDKIQDYV
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ELQKNRPETFKKDHKPTYMDFKKYLKEFYAALLFYKRLEKLDNAVFCGLSPELVVRRIGG
LSILRKKYNYFTKKPEKFRVSHKEYSFHQAKLDENNKIEFQKFKWTNYDDYLLIHAIFAV
GFGNWEKLLENKILWDYPQDLNLQIWQIIFHKFDEKEDRDINTIDSELGQKYVIRKLQNR
ANNMMNFLLDVDEGKKEE