Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_000697499

Standard Name

SNM1 (homolog of Sensitive to Nitrogen Mustard 1 (SNM1) nuclease)

Aliases

None

Description

kinase domain protein

Genome Browser (Macronucleus)



Genome Browser (Micronucleus)

External Links

Gene Ontology Annotations

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Domains

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Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

Tetrahymena Stock Center

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Homologs

Source Identifier Score
Tetrahymena borealis EI9_18118.1 9.997093137033517e-262
Description: hypothetical protein (719 aa)
Oxytricha Contig13766.0.g88 2.9994376937714457e-52
Description: DNA repair metallo-beta-lactamase
DictyBase DDB_G0277755 9.99723014177113e-33
Description: dclre1 on chromosome: 2 position 8451915 to 8454935
Stentor Coeruleus SteCoe_28813 4.780892883885469e-25
Description: None
WormBase WBGene00045237 9.000561397357242e-21
Description: locus:mrt-1 status:Confirmed UniProt:Q8T3E0 protein_id:CAD30439.1
SGD YMR137C 9.997019043202629e-21
Description: PSO2 Nuclease required for a post-incision step in the repair of DNA single and double-strand breaks that result from interstrand crosslinks produced by a variety of mono- and bi-functional psoralen derivatives; induced by UV-irradiation

General Information

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Associated Literature

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Sequences

>TTHERM_000697499(coding)
ATGGTACTTATTAGCTTTACTAACATAGTTGTGGACGAGTTTTCTTATGGTAAAAGACAC
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>TTHERM_000697499(gene)
ATGGTACTTATTAGCTTTACTAACATAGTTGTGGACGAGTTTTCTTATGGTAAAAGACAC
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AAAAAAGACTGAAAAAGGGAGCTCAACTTGCAGATCCTACTGAAAATAATTCAATTTGCA
TTGATAAATTTATTGAAATTAAAAAAAGTATAGAATTAATAAAGGAAATGAAGGCAAAAT
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TTGAGAGCGAAAATGAATAAGATTATGATCAAAATCATGAGAATGATGAGTTTGATGAGA
GTTTTAAAAACTAAGGTGATGATCATAATTTCTTGAGTGAAAAATAAATTAGTCAGTAAA
AACAAGATGATGAGGATAATAGAAGCATTTCTTCAAAAATAAATCAAATTAATTAAAAGC
TGACAGATCATTTAAATAAACAGAAATTCCAAACAGAGTAGTAGTATGAAAAAGATGGGG
AAGGTGATGATGAACAAGAAGAAGGATATGAAGAAAATAATAATTTAATAAACTAAAAAC
TTAAAAAAGCTACTACTTATCAAAGATTTAGCTCAGAAATAGCTTTTAATTCAACCTAAT
CCAAAAGTCCTCCTTCAGAAAAATGTGAAGACGTTTTAGATAAATTTATGCTTAAAAAGA
TAGTAAAAGCAAATACAATAAATTAACAAAACTAAAATTCTTTAAAAAATACTTCTAATA
ATGAGTATAGTAACACATAGGCAAGTTAATCAAGTAATGGGATAGCGAAAAAAAAATAAA
TTAAAATTAAAATTTCTAAGAAAATTAGTATGGATAAATTTGATAATAGTAACAATAATA
ATAATAATAATAATGATAATAATAGCAATGACTAAGAAGAAGTTTTAGAATAAAAAAATT
TCTAAAAAATTATTGAGTAAAAAGAAGATACTACAAATACTTATCTTTAAGAAAAATAAA
ATGAAGAAAATGTTTCTTCAAGATCGTCAGAAATAAATAAGGAAATACCTGTCTTTAGAA
ATTCTTCATTAAATAAAATATTTAATTAATTTCTTAATAAATAATGA


>TTHERM_000697499(protein)
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