Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00128640

Standard Name

UDH5 (UvrD/REP-family DNA helicase 5)

Aliases

PreTt09428 | 9.m00449 | 3699.m00157 | REP1

Description

UDH5 UvrD/REP helicase family protein; UvrD/REP-family DNA helicase

Genome Browser (Macronucleus)



Genome Browser (Micronucleus)

External Links

Gene Ontology Annotations

No Data fetched for Gene Ontology Annotations

Domains

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source Identifier Score
Tetrahymena borealis EI9_19668.1 5.997537942519205e-151
Description: UvrD/REP helicase (1047 aa)
SGD YJL092W 0.000000019990673443141236
Description: SRS2 DNA helicase and DNA-dependent ATPase involved in DNA repair, needed for proper timing of commitment to meiotic recombination and transition from Meiosis I to II; blocks trinucleotide repeat expansion; affects genome stability
Oxytricha Contig14871.0.0.g77 0.00000039992052383199455
Description: UvrD-like helicase C-terminal domain

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:23884606: Gao S, Xiong J, Zhang C, Berquist BR, Yang R, Zhao M, Molascon AJ, Kwiatkowski SY, Yuan D, Qin Z, Wen J, Kapler GM, Andrews PC, Miao W, Liu Y (2013) Impaired replication elongation in Tetrahymena mutants deficient in histone H3 Lys 27 monomethylation. Genes & development 27(15):1662-79

Sequences

>TTHERM_00128640(coding)
ATGGAATAAAAAGTTTCAGATAACAATAGCTTTTAATAAAACATAGCATTAACTGATGAA
TAATAAAAAATAATTTATTCGAATATCGATGAAGATCAAAGAATTTTAGCATGCGCAGGT
TCAGGTAAAACAACTACACTAATTTATCGAATCGAGTATTTGATTAAATAAGGAATACCT
GCAAGCTAAATATTACTGAGTACTTTTAATGTTGAAGCTGCTAATAACTTAAAAATAAAA
GCAAAACAAGTGTTACATTAAGATGAAGTAGAAGAAAAAAATATAATGAACATAGACAAA
TTTACTGCTGATATTTATAAGAATTATATAAAAGATAATGATAAAAACTTTAAATTAGAT
GTAAAAGAATTTGGATATAAAGTTAAAAATTACTTAAGTACAATAGAAGGAGAATAAAAG
GTTTTAAAGTAATATAAATACTTTTTTTTTGATGAGTTTTAAGATGTAAATCAAATCTAG
TATGACATCCTAATTCTTTTCAAAAAAGCAGGATGCAAAATTATTGTTATAGGAGATGAG
GCTTAAAATATTTACAGCTTTAGAGATACTAAATTAGAATTTATTCAAAGCAAAATAAAT
TAAGATATACTAAAAATCTCATAATAGGAAATAAAAACATATCACCTTAGCATAAATTTT
AGATGTTCAAGCAAAATCACAAAATTCTGCAATTAAATTTTTGCAAACACGTAGCATTTT
GCAAAACCTATGTAAAGCTTAAAAGAAGCGGACTAAGTGAAATTTTATCCTAAAATTAGA
CTTTATAAAAATTCAGATGAGTTAGTAAATGATATAATTATACAACTTCAAAATTTAATA
AATATCTATTAGTGGAGTGATTTGGCAATACTTAGTCCTACAAGAAAACCATTAATACAT
TTTTAGGAAATTTTAGAAAAGCATAATTCTACTTTATAACAGATAATTCCCTATTCCTTA
AGATTCAGAGATATGAATAATGTTTTCACTTGTGATAATTCTGATGCTACTGAGGAGTAA
AAGAACTTGACTTTGAGCACGATTCATGCTTCTAAGGGTTTAGAATGGAAAGTAGTATTT
ATAATCGGAATTAATGATTCAAATTTTCCAGGAGTTTTCATCAACTATTTATAAGAAGAA
AACGAAATTTAAGAAAAGTTAAGCGAGTGCAGAAGATTATTCTACGTAGCTTGTACTAGA
GCTAAGGAATAATTAAGCTTTTCTTTCATAAAATAAAAAGGAAAATATATATGTAGATTT
TTCAGTGAAATTAATGAAGAATAATATGAATGCTAAGATACAAATTTTAAAAGAGAACAT
ATAGCTTAAATCCAATCAAAAAAATCAAATTTTAAACCATTAAATATCAAGAACAACATA
GCTGATATCATACAAAATTTTGACTTTAATGACTATGAAGTAGTGAACAGTTTTCTATAA
AAAATATAACTTGTTAATAAAGAAACAGGAAAAGAGGCCACTTACAACAGTTAAAAAATA
AGATAAAACGCTCTTTAATAAGATTTGATTTGTTATCTTGACATATTACTTTATAGATGT
GTTACCGAAAAATACTTATAAAGCTAGAAAATTTTAAATGAAGATGCTGAGAAAATACTA
TGTACAATAAATTGGAAAGGAAAATCAAAGGTTGTTTATAATAAATTTATAGAATTCTTC
AACAAAAAAAGTTTAATAGATTTAGAAATATTGAACAGCCAGGAGTAATTTATAAACTGT
TTAAACAATCATTACAGTAACAAGTAGCAATTTGATCAAAATGAAATTAAAATTTTACAA
GAAATGCGTACATAAATTAAATCATTTTTAGAAAAAAATAAACTAAAATATGAAGATATT
TGCCATGCAACTGAGAGTCACTCGTTGGATTATTTTCCTGAAGATTTTATGGATAAGTAG
AAATATGTTGACAGTTATTTAAAATTTTCAGATAAAACATAGAAAACAGAAAATATTATC
AAAGATGTTTATAATGTGAGTAAATGCCATTTAATTTCCTAAGGAATAAGGAGATCATTG
TACAGAGATGATATTGAATTACTTTAACCTTGGAATTTAAAATTAAATATCAATAGATTT
TTAAAAAGTCTCAATTTAAAATATGATAAGAATAGGTTTGAAATAAAAAAGAAAGTAGAA
TATGATAGTTTAAATGGAGTTATAGATTTAATAGCATTTGATAAAGATAAAGGTGATATA
ATTTAATTTATCTATCATTAAGGAAAGTCTAAATTAAGCATTTCTAAAGAATAAATTATT
CAATCTCTAGTTTATGCATACATATTAAAAAAGAAAAGTTACAGTATAAAAAATATTGTT
TTCTATAATGTACTTAATGAAGATTTGATCACTTATTCGATAGATTAATGGAATTAAGAA
GAAGAATTCTTAAGATTTTTGTAAAAGAAAAAAGAAGATTACTAAAAAGAGTAAGAAGAG
ACTGATGATAATTTAGAGGAAGAAGAAGATTAATAGGAATTAGAAATCTAGGAGAATACT
TTGTAAAACTTATACACTTCTATTGAAGAAGAACAAGAAGATGAAAAAGAAGAAAAAGAG
AATAATAGTAAGAAAATTAATAATTATAACCTATAAGAAAGTTAATAGGTATAGAAAAAT
TAACTTCCTTATCAATTTAATAATCTATATTCTAGAAGTTCAACTTAAAATTTAAGTTAA
AATTCTGTTTAGACAGTATAAGAAAATAATCTTTAATGTAAGTACAATTAAAATGATTAA
GAAGATAATGTTGAGATCGAAAATTAATTAATTTATGGTAATTAAAGTGATTAAAATGAG
AATTTAATACAAAAAGCTTTAGATAACTAAAAAATTAACTAAAATGAGCCATTAGAAAAT
CAAAATAATTTAGTTAGCAATATTCAATAAAATAGAGATAACTCCAAGAAAATTGAAGAG
CCTTGTTAATTATTATTTAATTTAAAGAATCATGAAGATGAGAACTCTTAAATTGAAAAC
AAAATGAGTAATTTAAACTCAAAAAGGAAGAGAGAGAAGAATTAAGTTGAATATGAATAG
TAGAAAATCAATTTAAAAAAACAAAAAGTAGAATTAAAAGAGAAAGCTATCAATGTCTAG
ATTATATTTTTTATAATTTATATATTAATTTAAGTCTTTTAAACTTCATTACAATACAAG
GTAATTATTTTTAACAAATAAATTTTTAATTTAATTTTGTTTAATGTAAATTAAAGGCAA
TAAACTCATGAAGAATCAAAAAATGTGGCTAAGAATACAAATCAAAAGCCAAAATTATTT
TTTTCTTTAATAAAATTAGTTAATATATTTCTGTGTTAAATTAATGTTTTAATTCTTATT
TTCTATGATTTGTCAGCATATTGTAAAATTAATATTTAAATAAGCATTTTAAAGTTTAAG
AGTTGTGCATCACCTTCGATTGAAAATTTTTTATATTTAAATTTAATTTCCATATATTTT
TTATAAAATAGACTTAATTACATTGTTACATTGTAAAAAATTTAATATTTTTCTTTCAAA
GTAAAGATAATTTTAATTTTAATTGTCAATTTTAAAAAGCTTACTGTATATTTAAGATTT
AAAAATATGAAATTATTTGCTTAACTAAATATCATTTTTTTATGGAAAAAAAAAGATTCA
TGCTTGTCTTAATCATTTATACCATATCCTCACATTTTATTTAATACATTTTTCAATAGA
ATTTTATTCAAAAAATGTATTCTAAATTTATAAAATGTAATAGAAATTGAATGA


>TTHERM_00128640(gene)
ATGGAATAAAAAGTTTCAGATAACAATAGCTTTTAATAAAACATAGCATTAACTGATGAA
TAATAAAAAATAATTTATTCGAATATCGATGAAGATCAAAGAATTTTAGCATGCGCAGGT
TCAGGTAAAACAACTACACTAATTTATCGAATCGAGTATTTGATTAAATAAGGAATACCT
GCAAGCTAAATATTACTGAGTACTTTTAATGTTGAAGCTGCTAATAACTTAAAAATAAAA
GCAAAACAAGTGTTACATTAAGATGAAGTAGAAGAAAAAAATATAATGAACATAGACAAA
TTTACTGCTGATATTTATAAGAATTATATAAAAGATAATGATAAAAACTTTAAATTAGAT
GTAAAAGAATTTGGATATAAAGTTAAAAATTACTTAAGTACAATAGAAGGAGAATAAAAG
GTTTTAAAGTAATATAAATACTTTTTTTTTGATGAGTTTTAAGATGTAAATCAAATCTAG
TATGACATCCTAATTCTTTTCAAAAAAGCAGGATGCAAAATTATTGTTATAGGTATTGTT
TGTTTAACTTCTACTATTTATTTAATTAAATCAACCTAATTTTTAAAATTATTTTTTTAG
GATTTTTTATAAATATCTTATTTAAACTAGGAGATGAGGCTTAAAATATTTACAGCTTTA
GAGATACTAAATTAGAATTTATTCAAAGCAAAATAAATTAAGATATACTAAAAATCTCAT
AATAGGAAATAAAAACATATCACCTTAGCATAAATTTTAGATGTTCAAGCAAAATCACAA
AATTCTGCAATTAAATTTTTGCAAACACGTAGCATTTTGCAAAACCTATGTAAAGCTTAA
AAGAAGGTATAGATCACAAAACTAAATAAATAAATAAAAATCATTTTATTATTTTAATTT
AAATTTTTTTTATATTTTAAATATTAAAGCGAATTAAATAAACAAATTCTTTACATAATT
AAATGATTAATAATCTTTTAATACTTTAGCTACATGTAAACATGTTCAAATTTTTTAAAA
AAATAGCGGACTAAGTGAAATTTTATCCTAAAATTAGACTTTATAAAAATTCAGATGAGT
TAGTAAATGATATAATTATACAACTTCAAAATTTAATAAATATCTATTAGTGGAGTGATT
TGGCAATACTTAGTCCTACAAGAAAACCATTAATACATTTTTAGGAAATTTTAGAAAAGC
ATAATTCTACTTTATAACAGATAATTCCCTATTCCTTAAGATTCAGAGATATGAATAATG
TTTTCACTTGTGATAATTCTGATGCTACTGAGGAGTAAAAGAACTTGACTTTGAGCACGA
TTCATGCTTCTAAGGGTTTAGAATGGAAAGTAGTATTTATAATCGGAATTAATGATTCAA
ATTTTCCAGGAGTTTTCATCAACTATTTATAAGAAGAAAACGAAATTTAAGAAAAGTTAA
GCGAGTGCAGAAGATTATTCTACGTAGCTTGTACTAGAGCTAAGGAATAATTAAGCTTTT
CTTTCATAAAATAAAAAGGAAAATATGTAAACTTTAGATAATATTTACATGCAATAATAA
TATTTTAATTATTAAGATATGTAGATTTTTCAGTGAAATTAATGAAGAATAATATGAATG
CTAAGATACAAATTTTAAAAGAGAACATATAGCTTAAATCCAATCAAAAAGTAAAATCTA
AATTAAAAAAATAAATTTAAATTATTTTTCTAAAATAGAATCAAATTTTAAACCATTAAA
TATCAAGAACAACATAGCTGATATCATACAAAATTTTGACTTTAATGACTATGAAGTAGT
GAACAGTTTTCTATAAAAAATATAACTTGTTAATAAAGAAACAGGAAAAGAGGCCACTTA
CAACAGTTAAAAAATAAGATAAAACGCTCTTTAATAAGATTTGATTTGTTATCTTGACAT
GTAAAATTTAATAAATTAATTTTCAGTAAAGATAAATTAATAATATCAAAATAAAATACT
AACTTACTTTTTATATAAACTTAAATTCCGCGCTTTTTCTACAAGACCAGCCATTTAACA
CTTAATAAATAAAAATATAAAAATATTTAATTAATCTTATTTGGTTATTCAACCTTTTTA
TATTTATCATAATAAAAATGAGAACTTACATTTACATTTATTTTTTATTTAGATTACTTT
ATAGATGTGTTACCGAAAAATACTTATAAAGCTAGAAAATTTTAAATGAAGATGCTGAGA
AAATACTATGTACAATAAATTGGAAAGGAAAATCAAAGGTTGTTTATAATAAATTTATAG
AATTCTTCAACAAAAAAAGTTTAATAGATTTAGAAATATTGAACAGCCAGGAGTAATTTA
TAAACTGTTTAAACAATCATTACAGTAACAAGTAGCAATTTGATCAAAATGAAATTAAAA
TTTTACAAGAAATGCGTACATAAATTAAATCATTTTTAGAAAAAAATAAACTAAAATATG
AGTAATATGATTTATTTTAATCAAATATAAATAAAGTATCTTTAATATTTAAAATAGAGA
TATTTGCCATGCAACTGAGAGTCACTCGTTGGATTATTTTCCTGAAGATTTTATGGATAA
GTAGAAATATGTTGACAGTTATTTAAAATTTTCAGATAAAACATAGAAAACAGAAAATAT
TATCAAAGATGTTTATAATGTGAGTAAATGCCATTTAATTTCCTAAGGAATAAGGAGATC
ATTGTACAGAGATGATATTGAATTACTTTAACCTTGGAATTTAAAATTAAATATCAATAG
ATTTTTAAAAAGTCTCAATTTAAAATATGATAAGAATAGGTTTGAAATAAAAAAGAAAGT
AGAATATGATAGTTTAAATGGAGTTATAGATTTAATAGCATTTGATAAAGTAAATTATTT
ATTTATTTATTAATATAGTGAGTGATTGAATGAATAATTTTTTTTTTATAATATAAATTT
TAAAATAAATTATAATAGGATAAAGGTGATATAATTTAATTTATCTATCATTAAGGAAAG
TCTAAATTAAGCATTTCTAAAGAATAAATTATTCAAGTAAACATTTTCAATTAGCTTCAT
AATTTATATTCAAGCAAATTTATTTATATCAAAAAGTCTCTAGTTTATGCATACATATTA
AAAAAGAAAAGTTACAGTATAAAAAATATTGTTTTCTATAATGTACTTAATGAAGATTTG
ATCACTTATTCGATAGATTAATGGAATTAAGAAGAAGAATTCTTAAGATTTTTGTAAAAG
AAAAAAGAAGATTACTAAAAAGAGTAAGAAGAGACTGATGATAATTTAGAGGAAGAAGAA
GATTAATAGGAATTAGAAATCTAGGAGAATACTTTGTAAAACTTATACACTTCTATTGAA
GAAGAACAAGAAGATGAAAAAGAAGAAAAAGAGAATAATAGTAAGAAAATTAATAATTAT
AACCTATAAGAAAGTTAATAGGTATAGAAAAATTAACTTCCTTATCAATTTAATAATCTA
TATTCTAGAAGTTCAACTTAAAATTTAAGTTAAAATTCTGTTTAGACAGTATAAGAAAAT
AATCTTTAATGTAAGTACAATTAAAATGATTAAGAAGATAATGTTGAGATCGAAAATTAA
TTAATTTATGGTAATTAAAGTGATTAAAATGAGAATTTAATACAAAAAGCTTTAGATAAC
TAAAAAATTAACTAAAATGAGCCATTAGAAAATCAAAATAATTTAGTTAGCAATATTCAA
TAAAATAGAGATAACTCCAAGAAAATTGAAGAGCCTTGTTAATTATTATTTAATTTAAAG
AATCATGAAGATGAGAACTCTTAAATTGAAAACAAAATGAGTAATTTAAACTCAAAAAGG
AAGAGAGAGAAGAATTAAGTTGAATATGAATAGTAGAAAATCAATTTAAAAAAACAAAAA
GTAGAATTAAAAGAGAAAGCTATCAATGTCTAGATTATATTTTTTATAATTTATATATTA
ATTTAAGTCTTTTAAACTTCATTACAATACAAGGTAATTATTTTTAACAAATAAATTTTT
AATTTAATTTTGTTTAATGTAAATTAAAGGCAATAAACTCATGAAGAATCAAAAAATGTG
GCTAAGAATACAAATCAAAAGCCAAAATTATTTTTTTCTTTAATAAAATTAGTTAATATA
TTTCTGTGTTAAATTAATGTTTTAATTCTTATTTTCTATGATTTGTCAGCATATTGTAAA
ATTAATATTTAAATAAGCATTTTAAAGTTTAAGAGTTGTGCATCACCTTCGATTGAAAAT
TTTTTATATTTAAATTTAATTTCCATATATTTTTTATAAAATAGACTTAATTACATTGTT
ACATTGTAAAAAATTTAATATTTTTCTTTCAAAGTAAAGATAATTTTAATTTTAATTGTC
AATTTTAAAAAGCTTACTGTATATTTAAGATTTAAAAATATGAAATTATTTGCTTAACTA
AATATCATTTTTTTATGGAAAAAAAAAGATTCATGCTTGTCTTAATCATTTATACCATAT
CCTCACATTTTATTTAATACATTTTTCAATAGAATTTTATTCAAAAAATGTATTCTAAAT
TTATAAAATGTAATAGAAATTGAATGA


>TTHERM_00128640(protein)
MEQKVSDNNSFQQNIALTDEQQKIIYSNIDEDQRILACAGSGKTTTLIYRIEYLIKQGIP
ASQILLSTFNVEAANNLKIKAKQVLHQDEVEEKNIMNIDKFTADIYKNYIKDNDKNFKLD
VKEFGYKVKNYLSTIEGEQKVLKQYKYFFFDEFQDVNQIQYDILILFKKAGCKIIVIGDE
AQNIYSFRDTKLEFIQSKINQDILKISQQEIKTYHLSINFRCSSKITKFCNQIFANTQHF
AKPMQSLKEADQVKFYPKIRLYKNSDELVNDIIIQLQNLINIYQWSDLAILSPTRKPLIH
FQEILEKHNSTLQQIIPYSLRFRDMNNVFTCDNSDATEEQKNLTLSTIHASKGLEWKVVF
IIGINDSNFPGVFINYLQEENEIQEKLSECRRLFYVACTRAKEQLSFSFIKQKGKYICRF
FSEINEEQYECQDTNFKREHIAQIQSKKSNFKPLNIKNNIADIIQNFDFNDYEVVNSFLQ
KIQLVNKETGKEATYNSQKIRQNALQQDLICYLDILLYRCVTEKYLQSQKILNEDAEKIL
CTINWKGKSKVVYNKFIEFFNKKSLIDLEILNSQEQFINCLNNHYSNKQQFDQNEIKILQ
EMRTQIKSFLEKNKLKYEDICHATESHSLDYFPEDFMDKQKYVDSYLKFSDKTQKTENII
KDVYNVSKCHLISQGIRRSLYRDDIELLQPWNLKLNINRFLKSLNLKYDKNRFEIKKKVE
YDSLNGVIDLIAFDKDKGDIIQFIYHQGKSKLSISKEQIIQSLVYAYILKKKSYSIKNIV
FYNVLNEDLITYSIDQWNQEEEFLRFLQKKKEDYQKEQEETDDNLEEEEDQQELEIQENT
LQNLYTSIEEEQEDEKEEKENNSKKINNYNLQESQQVQKNQLPYQFNNLYSRSSTQNLSQ
NSVQTVQENNLQCKYNQNDQEDNVEIENQLIYGNQSDQNENLIQKALDNQKINQNEPLEN
QNNLVSNIQQNRDNSKKIEEPCQLLFNLKNHEDENSQIENKMSNLNSKRKREKNQVEYEQ
QKINLKKQKVELKEKAINVQIIFFIIYILIQVFQTSLQYKVIIFNKQIFNLILFNVNQRQ
QTHEESKNVAKNTNQKPKLFFSLIKLVNIFLCQINVLILIFYDLSAYCKINIQISILKFK
SCASPSIENFLYLNLISIYFLQNRLNYIVTLQKIQYFSFKVKIILILIVNFKKLTVYLRF
KNMKLFAQLNIIFLWKKKDSCLSQSFIPYPHILFNTFFNRILFKKCILNLQNVIEIE