Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00142380

Standard Name

BroW-1 (Bromodomain and WD40 1)

Aliases

PreTt26644 | 11.m00341 | 3702.m00065

Description

bromodomain protein

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Domains

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source Identifier Score
Tetrahymena borealis EI9_04836.1 9.997093137033517e-262
Description: bromodomain containing protein (2072 aa)
Oxytricha Contig9009.0.1.g105 4.001416569413617e-37
Description: WD domain, G-beta repeat
SGD YMR146C 0.000000000007996637300921877
Description: TIF34 eIF3i subunit of the core complex of translation initiation factor 3 (eIF3), which is essential for translation; stimulates rate of ribosomal scanning during translation reinitiation
WormBase WBGene00001680 0.00000019998969434520019
Description: locus:gpb-2 Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-2 status:Confirmed UniProt:Q20636 protein_id:CAA95824.1

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:29523178: Saettone A, Garg J, Lambert JP, Nabeel-Shah S, Ponce M, Burtch A, Thuppu Mudalige C, Gingras AC, Pearlman RE, Fillingham J (2018) The bromodomain-containing protein Ibd1 links multiple chromatin-related protein complexes to highly expressed genes in Tetrahymena thermophila. Epigenetics & chromatin 11(1):10
  2. Ref:27892853: Hamilton EP, Kapusta A, Huvos PE, Bidwell SL, Zafar N, Tang H, Hadjithomas M, Krishnakumar V, Badger JH, Caler EV, Russ C, Zeng Q, Fan L, Levin JZ, Shea T, Young SK, Hegarty R, Daza R, Gujja S, Wortman JR, Birren BW, Nusbaum C, Thomas J, Carey CM, Pritham EJ, Feschotte C, Noto T, Mochizuki K, Papazyan R, Taverna SD, Dear PH, Cassidy-Hanley DM, Xiong J, Miao W, Orias E, Coyne RS (2016) Structure of the germline genome of Tetrahymena thermophila and relationship to the massivel

Sequences 

>TTHERM_00142380(coding)
ATGTAGGAAGAAGAAATTATTATGACAAAACACGTAAGCTCAAAAGGCAGAGTGTTTTTT
GATAATCAGAACATGGTTAAACAGCGTCTATATTTTTTGATTATCCAGTACTTATAGCAA
GACGAATATTTTGATAGAAGGCTACTAGAGCAGATTAAAGGCTACGCTGAAGCAAATCAT
TTATTGGGCTAGCTACTGGCATTTGATGGAAGCCACGTAGATGCAACATTTGATGAGTTA
AATTTCTAATAAAAAGGAAGTAGTTGTCATTCTGCACTCTTTTCAAAGGATGAAAATCTT
AATACAATCTTATCTATTTATTAGCGCTTTAGTGCATAGCGCGTAAAAAACTAAAATAAA
GGTATACAGAATTTGTTTATTTAAAAGATGACCAAGCTTTCTTAAATGCTCAATGAGCCT
GCAATGTATATTTAACCAGCTAGAGACTTGTTTATTAAGAAAAAGAGATAAGGTAAGAGC
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GACGAAGAAGGATTAATTAAGATTTGGAGTGCTGAGAACGGATTACTTTTGTCAAATTTA
AAAGGTCATACTAGCGGAATTTTGAGCAACGATATATCTCCTTGCAATAAGTATTTAGTA
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TGTTTTAAATCAAAAGAATAATTAAATGCTGTTGTTTTCTATAAATATCAAAATGAATTT
ACTGAATAACTCTACCTATTGATGATGAGCAATGTTGGAAATATTCTTATATACAAAGAA
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GCAATGAGAAAGCACAAAAAAATGCAAGAATCTAAGATAGTTGATAACGATAATAAGAAT
GAAGCTGTTTGCATAGAGACTCACCCATCTGGTTACTTAGTTGTCGGCACTGAAACAGGA
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GAGTTCATGATCACTGCTTCTTTCGATGGATATGCAAAAATATGGCCTTGGAAAAAGCTG
ATAGAAAACGATAAAAGACTCAGTGATTAAATCTTCTCAATTTATTTTGACAACTCCAAC
AAGTGCGAAAAAAACTGCTGGAATGTAGCATTCAGTTGCAAGAATAGATATGCATTCGCT
ACCTTTACCAGAAAAATGAAGAGGACAAAAGAAGTAGAAACAGTTGTTTATGTACATGAA
CTAGCTGAAAAGAAAATCAAGCATGAGTTTACTCAACAAAATACACCCGCAAGACTTTAA
GATCATATTTTAGTTTTTGAACCCCATCCAACATAAGAAAATATCCTCTTAACAGCAGAT
TACGCAGGTCAAATTATCATCTATGATGTCTCTTTAGGATGTATTTTGAATATATTCTAA
GAAAGGGGATACCATATTGGATATCCTAATCTTGAAGTACCCGTTTTAGATGGTTGTTGG
GCACCAGATGGATTAAAATTCGTCGCAAGTACTTACTATGGCTCTTTTAGCTTGTATGGA
TATGATTGCGCAGAAATATATAAGACTACTCCTACAGAATAATTCTTTGCTAATGACACA
GAGATATTTATATATAGTGATAATCATGTACCACTGTCTACAGATGATGATGTAGAAATT
AATACTAAAAGTAGAGGAAAAATTTGTGATTATTAGAGAATCCCATATAGATTTGAATAT
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TTAAAGTTGATAGAAGATAAAATATCTGAATTAAAAATATTAGAAAATGAATAAAAAGAA
AAAGATGAAAACTTTTCAGAAAATTTAGTTGAAAAATATTTAAAAAACTAAGAAAAAGAG
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GAAGATTTGTTTTAATAAGTTATTTAGCAATCGCAACCTAGAATTCTACAAGAAAGATAA
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TCAAATACAATACCATTTGGGAATTAATAACTAAGTAGAAGGCCTAGCTAAATGCCTTAA
CCAGCTGCTTTAAATAATTAAAATTCAAGAACTGGATAGCGCGGAAGAGGAAGAAGACCA
GGTGGTAGATAGAGTAATACTAATTAGGTTGGATTCAATGATGACTTTGAAGACTCTATG
CAATCTGAGGAAGAGATACCGAGTTAAGATGATAGTGAGGTAAATTTCAAAGACATAAAT
GAAGATGATGATGAAATTTAAAAAGATTTACTTGAAGAAATGGAGATGTTTGATGATCCT
TTGCCTAGAAGAACTGGGGGAGGGTTCGAAAGTAATGACAGAAGAAACTAATCTAATAAT
AGAAATAGATCAAGAGGAGGAAGGAGAATCGTGGCTGATGACTATTTAGATGAAGAGGAA
GAAGAGAAAAAGGATTCTTCAAATTAGAGAAGAACACGCTTGAAAAGATTTTCTAATACG
ACTTCAAATGAAACAAGAGCACAAACCATAAGCCAGTAATAAACAGAAGGATAGCAGCGC
TAAGGTACATTAAGATATAATAGGAATACGAGAAGTAGTTATAGTATGTAGTATACTACT
GGAGAAGATGCTACTCTCTAATCTAATGCAGGATATAATAGCAGCTAAGATTATGAAGGT
AACACAAACACAAGATTGAGAAGGAGAAATCAACACATCATCGAAGAGGACAATGATGAT
TTATACTTAGACAATAATACTAATAGCAATAACCATCATTCTTTGAGATAGAATAACTCT
TCTCATTTATAATAATCTCATAATTTGGCTGAAACAAGAGCTAATGCACATCAAACTAGA
AGCTCAACTGCGACATATTAAGATTCACAAAATAATACAAAGACTCTCAGAGCTTCATCA
AGAAATAAAAAGAGCAAGAAAAATAGATAATATAATGACGGCTTTAACAGCAACGATAGT
GAGTCTGAAGATAGGTTTTCAGATGAAATCATGGAAGAAGATGACGATGAAGTTGATATT
AATTATGAGGACGAGGATGATTATGAATATAAGTTGAGGAAACCAAAAAAATCAGTAGGC
GGTGCTTAATCTTTATCATAAAATAACTAAAATTCAAGATAGAGTGGTCGTTCGCTTCGT
ACTTCATACACAAACAGAAAAAAAATTTAAGATTCTGATGAAGAAGAAGATGAATTACCA
AAGTAAAAAAACAGAAGCAGTAAAAAGAATGGTATTGTTAATGACGAGGATGATAACCAA
GTTTAAAATGAGCATAAAAACATAGAGAAGCATAAAATCTATGATAATGATGAAGATGAA
GAAATAGATGACTTTGATGAAGAGGACGAAGAATACACTGACAAGAAGAAGAAAAATTAC
TTGAAAAAAAGAACTTCATCAGAAGCTGGTATTAAGAAAAGTGGTTAAAGTAGTAATAAA
TTAGTTAAAAAAATAAAAACTAACGACTCTGATGCGCTTAATGAAGATATGGCATCAATG
CCTGAAGATAAAAAATCTCTTTGCTAAAGATGTGAGCAAATTATTGAGGGAGAAGCAAAA
TCTTGCAATATTTGCAAACATGCTTACCATGATGAGTATTGCAGTAAATATAGAGGATGT
TTGAAAGATAAAAAGTACTTTTGTTTTGACTGTTATGCTAATAATAACACAGTACGTATA
CAGAAAGACGAATAAGATAAAAGAACTTTCAGCAGAGAGTACCTAGAAAGAGAAACAAAC
GATCCTTACCAATATATTCCATAAATAAATGACATGTGTTATTACATCTTCTAGGCTCAT
GAAGAGTACTGTGAAAAATATTTCGAAATCTTTGATTACGAACCATTGATTGACAGACTA
TAAAAAGAAAATGAAAAATCTCTTTAAAATGGAAATAATAAGTCTACAAAAAAAAGTATC
CAAAGGTCCTCTAAATTGATAGACAGTGGTGATGAATTTCAAGGAGATGAGCATTCTTCT
AACTTTTAAAAGAAAGGTTAGACATCTTAAGCTTAAGATTATCATATTCTACCATTTTTA
AGTTACAAAGAGCTCTATAAGCCAACCTTATGTCAAATAAGCTCTATCGAATACTCCTAT
CCTATGTTAAGCACAAAAAAGATGCAAGAAAAATATAGAGAAAGACCTATATTCTTACTT
ATTCAGCTCAAAATTTTAGAAACAGGAGAAGAATTCTCAGTTTATTTTTCAAATTCTTAA
GTTTAATGTGGAAGTTTCTTGATTCCTTAGGAATTATATGATTAGTCAATTTGCTTCTAA
GAAAACCTTAAGGTACCTCAGTAATTAGAATTCTTTTACCATAATTAAGTATTCAGCGGT
TAAGTGGTTGAAGTGTCACCAAAAGAAGAATATTAAAAGTTGAATTCTGAGTACTTGAAG
CTTAAAGTCAAATTAGATACAACAGATGAAAAAATTATACAAAAGTTAAAATAAAATTTA
GAAGGGCCTAATATGATTAGAATCTCTTGCTGGGATGTCATATATCCAATCAGAAGAACA
TCCTCTCCTGATGACTATCCAAACGATGACGCATGTCTTTCTAAGGAAGAAACAGAATAA
ATTTTTAAGCTAATTTAAGCAGTAATTGATAATCAAAGTGAAATAACTTGCTATTTTGAA
GAAGCTGTCAACTTAAAGAAATATAAACATTATTATGAATTTGTTGAATTCCCAATGGAT
ATTTCAAAAATTAGAAGAAGACTATTAAACGGATACTATCGTTCTCAACAAAGCATATTT
CATGATATAAACTTGATAGATTCGAATGCTCATAAATTTAATAATCCTGATAGTCCTATC
TGTGAGAGTTCGAAGAGAGTTAAAGAAATATTAACTTCGATTGTAAGCAATTTCCTAAAC
GTAGAAATGTGTTTATCTCTAGCAATAAAAAATAAAAAAAATCTAATAAAAACTATTTAA
ACTCTGTTCCCCAACTACAATACTAACTCCAACTAAAACAATTTATCAATAAATAATAAT
AACATTTAAATAAAGATTCCTTAATAATCTTAATAAAGTTTAATACCTGTACCAATAGAA
AAACCTCACGCTCTAATTAACAATCCTCTACTTTAGGCAGAACAATATTAATAAAAATAT
CCTAACTCTCAAGTAGCATATAATGCAATCCAACAATAAAAACCTCAACAAAATTATAAT
TAAATTAACAATAATTTTAATCAATAAAATTAATAATACCAGTATAATAATTCCGCATAT
CAAAATAACTCTAACAGTAATGATACTTATTTTAACCAACAAAATGCTAATTAAAATGGT
TAACCTTATGCAGTTACTGGTTTAATAAACGAACCTAGCAACTAATACTTTAATAATCAA
CAGAGCTAGATTAATTAAGATTTGAATTATAATTCTTAGTTATACGAACCCATTAATAAT
GCAGATAATAATTATAGTTAAACTAATTATAATTATGAGGCAAATTAAGGATATGATATA
AACTAAAATGTGAATTAAGATTACTAATTAAACGAATTCTAATCTTAAAATTTAGGATAG
CAAAATGTTTAATAAAATATTCCTAATTTACAATCACAGTAACAACAAAGAACTACTAGG
AGTGGAAGATTAACTAGAAATTCCTCAAAGTTCGACTATGATTAAATAGATTAAAGAAAA
AATTGA


>TTHERM_00142380(gene)
ATGTAGGAAGAAGAAATTATTATGACAAAACACGTAAGCTCAAAAGGCAGAGTGTTTTTT
GATAATCAGAACATGGTTAAACAGCGTCTATATTTTTTGATTATCCAGTACTTATAGCAA
GACGAATATTTTGATAGAAGGCTACTAGAGCAGATTAAAGGCTACGCTGAAGCAAATCAT
TTATTGGGCTAGCTACTGGCATTTGATGGAAGCCACGTAGATGCAACATTTGATGAGTTA
AATTTCTAATAAAAAGGAAGTAGTTGTCATTCTGCACTCTTTTCAAAGGATGAAAATCTT
AATACAATCTTATCTATTTATTAGCGCTTTAGTGCATAGCGCGTAAAAAACTAAAATAAA
GGTATACAGAATTTGTTTATTTAAAAGATGACCAAGCTTTCTTAAATGCTCAATGAGCCT
GCAATGTATATTTAACCAGCTAGAGACTTGTTTATTAAGAAAAAGAGATAAGGTAAGAGC
CTTAAAAATACTGATGAGTTATCCAACGATACATTTATCTTGAGGTTTTAGCATTTAAAA
ACATGTTTTGGTCATGCATATTCTGCTGACTCAGGCTCTATAAATGAGGAGAGTGGTGAA
CCTTACATTCCAATATACAATACAACATTCGATAAGAGCGGACGCCTAGTTATAACTGCA
GACGAAGAAGGATTAATTAAGATTTGGAGTGCTGAGAACGGATTACTTTTGTCAAATTTA
AAAGGTCATACTAGCGGAATTTTGAGCAACGATATATCTCCTTGCAATAAGTATTTAGTA
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ACTGAATAACTCTACCTATTGATGATGAGCAATGTTGGAAATATTCTTATGTAAATATTT
AAACATCATTTTTATTTTAATCTTTCCCTATTTTTTCAATATTTTTCCAGTGATTTTTCC
TCTTCAAAAACTAAAAAAATGACCTGGATCCCAAAATATTTGATCTTAATCAGCCATTTT
AATTTAGAATTTAGTTTGTTTAATTCTACTTTTTGATTAGCACTTCTATGCCAGCTTCAG
AAAATTTAGATTTATTTCAAAATACACAATTCAATTTAAACAATCAAATATTAATGAACG
GATAGAAATTTATTAGTATTGATTGCAATTTGCCCGCAGCGCAGTAAAAAATCAAATTTA
TGAATAAAAAAAAAGAAAATATTAATTTAGTTAGTTATTATTTATTTCTAAAGAATTAAA
TTAAGGATTTTGGTTGGTTGGTTATTAAAAAAGATTAATTGATTCATATCTATATTTCAA
AAATCAAAATTTGTTTTTAAAAATAATATTAATCAAAAATATAGATACAAAGAAGATTAA
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AGAAAGCACAAAAAAATGCAAGAATCTAAGATAGTTGATAACGATAATAAGAATGAAGCT
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TTAGTTTGGGAAAAGATACACACCCTCGAAAATAGAAATCGCTAAGTTCTTCCATTCATA
GAAAAGAAAGAACATTCTAAGAATTGCTAGCTGATAAAATTCTCACCCAACGGAGAGTTC
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AAAACTAACAAACTAACTAACAGCTAGTTTATCACTCTTTGTTTTCAAAATTTAATTAAT
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AATAATTAATTATTCGGTTTCTATTGTTGGATAAAATATTTTTCAAAATTAATAAAAAAA
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GTTGAAAAATATTTAAAAAACTAAGAAAAAGAGAAACATGCTTATTTTGCTTTATGTAAT
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TATAATGAAAGAATGGAAATTCTGAAAAAAATGTCAAAAGAAATGCAAAAAAGACACTCT
TTAGATATTAAGAAAACTGAAACTAAAACTGATGAAGATTTGTTTTAATAAGTTATTTAG
CAATCGCAACCTAGAATTCTACAAGAAAGATAAATTTCTGATCCTGCTCCTGCTCCTCTT
CTTAGATAAGAAAGTGAATAGGCTACTCTTATATAGTAAAGAAATAATAATAGAAGAAGA
GTCATAGACGATGAAGACTTGGATCAAGGACGCTCAAATACAATACCATTTGGGAATTAA
TAACTAAGTAGAAGGCCTAGCTAAATGCCTTAACCAGCTGCTTTAAATAATTAAAATTCA
AGAACTGGATAGCGCGGAAGAGGAAGAAGACCAGGTGGTAGATAGAGTAATACTAATTAG
GTTGGATTCAATGATGACTTTGAAGACTCTATGCAATCTGAGGAAGAGGTAAAATTTTTA
AAATTCAAATAATATCTTTAAACAATAAATAATAATTAAAGATACCGAGTTAAGATGATA
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AGTAATAAACAGAAGGATAGCAGCGCTAAGGTACATTAAGATATAATAGGAATACGAGAA
GTAGTTATAGTATGTAGTATACTACTGGAGAAGATGCTACTCTCTAATCTAATGCAGGAT
ATAATAGCAGCTAAGATTATGAAGGTAACACAAACACAAGATTGAGAAGGAGAAATCAAC
ACATCATCGAAGAGGACAATGATGATTTATACTTAGACAATAATACTAATAGCAATAACC
ATCATTCTTTGAGATAGAATAACTCTTCTCATTTATAATAATCTCATAATTTGGCTGAAA
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ATGACGGCTTTAACAGCAACGATAGTGAGTCTGAAGATAGGTTTTCAGATGAAATCATGG
AAGAAGATGACGATGAAGTTGATATTAATTATGAGGACGAGGATGATTATGAATATAAGT
TGAGGAAACCAAAAAAATCAGTAGGCGGTGCTTAATCTTTATCATAAAATAACTAAAATT
CAAGATAGAGTGGTCGTTCGCTTCGTACTTCATACACAAACAGAAAAAAAATTTAAGATT
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AAATCTATGATAATGATGAAGATGAAGAAATAGATGACTTTGATGAAGAGGACGAAGAAT
ACACTGACAAGAAGAAGAAAAATTACTTGAAAAAAAGAACTTCATCAGAAGCTGGTATTA
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AGCAAATTATTGAGGGAGAAGCAAAATCTTGCAATATTTGCAAACATGCTTACCATGATG
AGTATTGCAGTAAATATAGAGGATGTTTGAAAGATAAAAAGTACTTTTGTTTTGACTGTT
ATGCTAATAATAACACAGTACGTATACAGAAAGACGAATAAGATAAAAGAACTTTCAGCA
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ATTACGAACCATTGATTGACAGACTATAAAAAGAAAATGAAAAATCTCTTTAAAATGGAA
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ATAGAGAAAGACCTATATTCTTACTTATTCAGCTCAAAATTTTAGAAACAGGAGAAGAAT
TCTCAGTTTATTTTTCAAATTCTTAAGTTTAATGTGGAAGTTTCTTGATTCCTTAGGAAT
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TTTACCATAATTAAGTATTCAGCGGTTAAGTGGTTGAAGTGTCACCAAAAGAAGAATATT
AAAAGGTAATTAATTAATTATTTCATTAATTAAAATATATTTCAAAATAATTTATTTTAT
AATAGTTGAATTCTGAGTACTTGAAGCTTAAAGTCAAATTAGATACAACAGATGAAAAAA
TTATACAAAAGTTAAAATAAAATTTAGAAGGGCCTAATATGATTAGAATCTCTTGCTGGG
ATGTCATATATCCAATCAGAAGAACATCCTCTCCTGATGACTATCCAAACGATGACGCAT
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AAAGTGAAATAACTTGCTATTTTGAAGAAGCTGTCAACTTAAAGAAATATAAACATTATT
ATGAATTTGTTGAATTCCCAATGGATATTTCAAAAATTAGAAGAAGACTATTAAACGGAT
ACTATCGTTCTCAACAAAGCATATTTCATGATATAAACTTGATAGATTCGAATGCTCATA
AATTTAATAATCCTGATAGTCCTATCTGTGAGAGTTCGAAGAGAGTTAAAGAAATATTAA
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AAAAAAATCTAATAAAAACTATTTAAACTCTGTTCCCCAACTACAATACTAACTCCAACT
AAAACAATTTATCAATAAATAATAATAACATTTAAATAAAGATTCCTTAATAATCTTAAT
AAAGTTTAATACCTGTACCAATAGAAAAACCTCACGCTCTAATTAACAATCCTCTACTTT
AGGCAGAACAATATTAATAAAAATATCCTAACTCTCAAGTAGCATATAATGCAATCCAAC
AATAAAAACCTCAACAAAATTATAATTAAATTAACAATAATTTTAATCAATAAAATTAAT
AATACCAGTATAATAATTCCGCATATCAAAATAACTCTAACAGTAATGATACTTATTTTA
ACCAACAAAATGCTAATTAAAATGGTTAACCTTATGCAGTTACTGGTTTAATAAACGAAC
CTAGCAACTAATACTTTAATAATCAACAGAGCTAGATTAATTAAGATTTGAATTATAATT
CTTAGTTATACGAACCCATTAATAATGCAGATAATAATTATAGTTAAACTAATTATAATT
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CACAGTAACAACAAAGAACTACTAGGAGTGGAAGATTAACTAGAAATTCCTCAAAGTTCG
ACTATGATTAAATAGATTAAAGAAAAAATTGA


>TTHERM_00142380(protein)
MQEEEIIMTKHVSSKGRVFFDNQNMVKQRLYFLIIQYLQQDEYFDRRLLEQIKGYAEANH
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KGHTSGILSNDISPCNKYLVTCSIDLTARVWDIFNQRCLTCFKSKEQLNAVVFYKYQNEF
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