Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00150000

Standard Name

MSH6L3 (MutS Homolog 6 (MSH6)-like protein 3)

Aliases

PreTt20760 | 12.m00434 | 3700.m00155

Description

DNA mismatch repair MutS family DNA-binding domain protein; MutS domain III family protein

Genome Browser (Macronucleus)



Genome Browser (Micronucleus)

External Links

Gene Ontology Annotations

Molecular Function

Biological Process

Domains

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source Identifier Score
Tetrahymena borealis EI9_05062.1 9.997093137033517e-262
Description: MutS domain III family protein (1389 aa)
Oxytricha Contig820.1.g122 1.999489510516749e-128
Description: MutS domain V
DictyBase DDB_G0268614 1.0003926095686843e-81
Description: msh6 on chromosome: 1 position 238722 to 242663
SGD YDR097C 1.0000310450948521e-65
Description: MSH6 Protein required for mismatch repair in mitosis and meiosis, forms a complex with Msh2p to repair both single-base & insertion-deletion mispairs; potentially phosphorylated by Cdc28p
WormBase WBGene00003422 1.9990871925214856e-61
Description: locus:msh-6 status:Partially_confirmed UniProt:Q9N3T8 protein_id:CCD72556.1
Stentor Coeruleus SteCoe_17585 3.392270193026015e-47
Description: None

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:23884606: Gao S, Xiong J, Zhang C, Berquist BR, Yang R, Zhao M, Molascon AJ, Kwiatkowski SY, Yuan D, Qin Z, Wen J, Kapler GM, Andrews PC, Miao W, Liu Y (2013) Impaired replication elongation in Tetrahymena mutants deficient in histone H3 Lys 27 monomethylation. Genes & development 27(15):1662-79

Sequences

>TTHERM_00150000(coding)
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>TTHERM_00150000(gene)
ATGCCTCCTAAAAAGACTAAATCAAGCGAAGTAAAAGAAAGCAGATCTTCTTCTAAGAAA
AATGTTATTGATTCTGAAGACAGTGAAGATCAAGCTATTAAGAAAACACCTAATACTAAA
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AGAACTATTGTATTAGGTAAAATTTTATTGACATTTAAATTATTTTTAAAATTTTTAAAT
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TAAAATGGAACATTATATGAATTCAGAAGATTAAAATATAGGTAATGTTCGTAGAATTAC
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>TTHERM_00150000(protein)
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LLQLLKNSF