Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00189400

Standard Name

SEN1 (putative helicase SEN1)

Aliases

PreTt08690 | 15.m00401 | 3697.m00113

Description

SEN1 AAA domain protein; putative helicase required for processing of tRNAs- rRNAs- and small nuclear RNAs

Genome Browser (Macronucleus)

Full Screen View

No Genome Browser Data Present

Genome Browser (Micronucleus)

Full Screen View

No Genome Browser Data Present

External Links

• Uniprot
• Alphafold

Gene Ontology Annotations

No Data fetched for Gene Ontology Annotations

Domains

• ( PF00270 ) DEAD/DEAH box helicase
• ( PF00580 ) UvrD/REP helicase
• ( PF04851 ) type III restriction enzyme, res
• ( TIGR00166 ) ribosomal protein S6
• ( TIGR00376 ) DNA helicase, putative
• ( TIGR02876 ) sporulation protein YqfD

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

No results were calculated for this gene in GeneMania.

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source	Identifier	Score
Tetrahymena borealis	EI9_06264.1	9.997093137033517e-262
	Description: hypothetical protein (822 aa)
DictyBase	DDB_G0274399	4.001158060863534e-95
	Description: DDB_G0274399 on chromosome: 2 position 4681340 to 4684368
Oxytricha	Contig9372.0.1.g13	9.996907204735647e-62
	Description: AAA domain
SGD	YLR430W	3.0014802379878627e-60
	Description: SEN1 Presumed helicase required for RNA polymerase II transcription termination and processing of RNAs; homolog of Senataxin which causes Ataxia-Oculomotor Apraxia 2 and a dominant form of amyotrophic lateral sclerosis
WormBase	WBGene00004880	5.997865882830678e-40
	Description: locus:smg-2 Regulator of nonsense transcripts 1 status:Confirmed UniProt:O76512 protein_id:CCD73461.1
Stentor Coeruleus	SteCoe_14461	1.185064864233981e-27
	Description: None

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_00189400(coding)
ATGAGTAATTAGAATCCTAAAGAAGAGATAGAAAAAAAGGATAACAGAATCTTAGATGGT
CTTCATTATTATTTGTGCTCTAGGGATTATAACATTAATTTTGATGAATCTATTGACAAC
ATTAATTTAAATGTAGAAGGAGATGATGAGAATAAAAATAGTGATTTAAATAATATAATT
CCAGAGGAAACTGCTGATAAAAATGCAGATTAAGTTGAATAATAAAATACTTTATAGTAG
CCTTAGATGAGTTTTACAAATTTGGCAAATATTCCATTATCTTTTAACGACCCAGAAGAT
TATGTTAAAACATTTGAATAACATCTCTTTTCTGAAGCAAAAGCATAAATTATCAAAGCC
CAAGTTACAGAATCAAGAGCTCCTGAAATTATGAGATTAAAAAACTCTTAGGTAATTGCT
CTAAAAAATAATTCAGAGCTTTTCTTCAGAAAGCTAACTATGGAGAAAGTTGCTGACTCA
GAAACAAAATATGGAACTCATGATTTTATAGTTATATCATTACAAGATCCTTCCAAAGTA
ATATCAGGAGAACATATGTTAGGTGTAGTAGAAAGAGCTGAAGGAAATGAAATTTTAGTC
AAAGTAGTTTTTGATGAAAATAGCAGCGACCCACGTAATTAAAAAATACTTAAAGTCATG
TAACAAGATGAAAGCGTTTGGAGAAATTGGTATGTGAAAAAGTTTTGCAGTATAGTTACT
ATTCAAAGAGAATACGAAGCTCTACACAATTTTAATGATTTGCTTTTAAAAGAGTTCATA
CTTAATCCTGAAAAGTTAACTCAGAAGAAAGAAGAGAAGTTTTCTATCCCTGAATAGCTT
TCAATTCGTTTAAATTAGATTTATAATCCCTCCCAAATTCAAGCTATTAACTCAACACTA
AAGAAATAAGGTGTTACTTTAATTTAAGGTCCTCCTGGTACAGGTAAAACACGTACTGTG
CTAGGTACTGTTTCAGTGCTTATTAATTCATTTAATGAAGACTAGCTTAAGTAAAAGCAC
TCTATGGAGATTGAAGATAAATCAAAGTTAGTTGAGCAGTCAGGCGAATTCCATTTCGAA
TTAGCTATGCCATGGATGTAGCCTAATTATGTTGATTGGAGAGATAGTACTTTTGATCAC
TTGCATAATGATTTTTCTAATTTTACTAAAACAAAAAAATATATCACTGCTGATTAAACT
GATAAAGTCATTCCTATCCTAAAAGCTTAGGAAGAGCATGCACCCCCTGAAAAAATTTTA
ATTTGTGGTCCTTCAAATGCAGCTATAGATGAAATCGTTCGTAAAATGAAAAAAGAAGGT
TTATTGGACAAAAATGGTAATATTTATGATCCTTCTAAAATTATAGTCAGAATTGGTGAG
AATTATGATAAAGATTTGGAGGATGTATCTTTAGATTATTTAGTCAAGTAAAAACTTGGC
GAATAAAATATCAGATCAGAAGATGCTTAAGAAATAAGAAAGAAAATATTAAAAGAAGCC
AAGATTATCTGTGGTACTCTCAGTTCAACTGGTTCATAAATTTTAGCATCTGCTAACTTT
AAATTTGATACTGTCGTAATTGATGAAGCTGCTCAGTCTACAGAAATAAGTACTCTCATT
CCTTTGCAATATTAATGTACTAGACTTATTTTAATTGGTGATCATAATTAATTGCCTGCT
ACTATATTCTCTAAAAAATGTGAAAAGTTTAATTATCATTAGAGTTTATTCGAACGTTTT
GAAAAATGTAAAGTTGAAGTTCATATGTTAAATTAACAATATAGAATGAACCCCATTATT
AGTAAGTTTATTTCTTAAACTTTTTACTAAGACAAAATTTCAGATGCCGAAAAAATTAAC
GAGCTTGTAGGTTAACCTGAAATTTATTAGTTAAGACTATTTTAGCCTGTCGTTTTCTTT
AACGTTGAAGGTAATGAAATATTTGAAAAATCTTCATATAAGAACGAGGAAGAGTCAAAA
GCTATTGTTGAAATTTATAATAAATTGAGAACTACCTTCCCTAATTTCGATTTGAATAAG
TTAGGTATTATTACTGCTTACTCTCGTTAAGTTAAGGAAATAGAAAAAAAAATTAAAGCT
CACGATAAAACAGACAAGTGTATGGTTGAAGTACACACAGTTGATGGTTTCTAAGGTAGA
GAAAAGGATATAATTATATTCTCTACTGTGAGAGCTAGTTAGGTAAATGGAGAAAAAAAT
ACTAAAAAAACTATTGGTTTCTTAAATGACAGAAGAAGAATGAATGTCAGTTTAAGTAGA
GCAAGATTATGTGTTATAGTTGTGGGTGATCTCAAATAACTTAAATTTTCTAAATTATGG
AAAGGATTAGCAGAATATTCAATAGAATAAAGAAGTTGTTATAATATGGTTGCCCCATAT
TAAACTTTTGTTAGTAAATTAGAATTACACTTTGATTAATACAAAGTTTATAGGGCAACA
TAGAATTGA

>TTHERM_00189400(gene)
ATGAGTAATTAGAATCCTAAAGAAGAGATAGAAAAAAAGGATAACAGAATCTTAGATGGT
CTTCATTATTATTTGTGCTCTAGGGATTATAACATTAATTTTGATGAATCTATTGACAAC
ATTAATTTAAATGTAGAAGGAGATGATGAGAATAAAAATAGTGATTTAAATAATATAATT
CCAGAGGAAACTGCTGATAAAAATGCAGATTAAGTTGAATAATAAAATACTTTATAGTAG
CCTTAGATGAGTTTTACAAATTTGGCAAATATTCCATTATCTTTTAACGACCCAGAAGAT
TATGTTAAAACATTTGAATAACATCTCTTTTCTGAAGCAAAAGCATAAATTATCAAAGCC
CAAGTTACAGAAGTAAGTTTACTACAATTAAACAATATAGATTTGTTTTAAAATAAATAT
AAAATGTTTAAAAAAGTCAAGAGCTCCTGAAATTATGAGATTAAAAAACTCTTAGGTAAT
TGCTCTAAAAAATAATTCAGAGCTTTTCTTCAGAAAGCTAACTATGGAGAAAGTTGCTGA
CTCAGAAACAAAATATGGAACTCATGATTTTATAGTTATATCATTACAAGATGTAAATCA
AATATTTTATTTCTACATAAATTGCAATCAATTTAAGATTAAAAATTTAATTGATTGTTG
AATTTTAAAATATATTTTATTTTTAATCAATAAAGCCTTCCAAAGTAATATCAGGAGAAC
ATATGTTAGGTGTAGTAGAAAGAGCTGAAGGAAATGAAATTTTAGTCAAAGTAGTTTTTG
ATGAAAATAGCAGCGACCCACGTAATTAAAAAATACTTAAAGTCATGTAACAAGATGAAA
GCGTTTGGAGAAATTGGTATGTGAAAAAGTTTTGCAGTATAGTTACTATTCAAAGAGAAT
ACGAAGTAAATTACTTTATTATATATTTATTTGTCTATTAGTCTTGGATATTTGTGGCAA
AGTTTTATGATTTGATTTCGAAGTTATTAAAACTATTTTTATTATCGTAAAGGCTCTACA
CAATTTTAATGATTTGCTTTTAAAAGAGTTCATACTTAATCCTGAAAAGTTAACTCAGAA
GAAAGAAGAGAAGTTTTCTATCCCTGAATAGCTTTCAATTCGTTTAAATTAGATTTATAA
TCCCTCCCAAATTCAAGCTATTAACTCAACACTAAAGAAATAAGGTGTTACTTTAATTTA
AGGTCCTCCTGGTACAGGTAAAACACGTACTGTGCTAGGTACTGTTTCAGTGCTTATTAA
TTCATTTAATGAAGACTAGCTTAAGTAAAAGCACTCTATGGAGATTGAAGATAAATCAAA
GTTAGTTGAGCAGTCAGGCGAATTCCATTTCGAATTGTAATATTTTATTCTAATTTTGTC
TTTAAAAACTAATTAAAATTTTTAAAAATTAGAGCTATGCCATGGATGTAGCCTAATTAT
GTTGATTGGAGAGATAGTACTTTTGATCACTTGCATAATGATTTTTCTAATTTTACTAAA
ACAAAAAAATATATCACTGCTGATTAAACTGATAAAGTCATTCCTATCCTAAAAGCTTAG
GAAGAGCATGCACCCCCTGAAAAAATTTTAATTTGTGGTCCTTCAAATGCAGCTATAGAT
GAAATCGTTCGTAAAATGAAAAAAGAAGTAAAATAAAATATTTTTTATAAATGCCAAATA
TTCATTTATTTCAGAAATTTCATTATTTTTATATATTTTATTTATTCAAAAGGGTTTATT
GGACAAAAATGGTAATATTTATGATCCTTCTAAAATTATAGTCAGAATTGGTGAGAATTA
TGATAAAGATTTGGAGGATGTATCTTTAGATTATTTAGTCAAGTAAAAACTTGGCGAATA
AAATATCAGATCAGAAGATGCTTAAGAAATAAGAAAGAAAATATTAAAAGAAGCCAAGAT
TATCTGTGGTACTCTCAGTTCAACTGGTTCATAAATTTTAGCATCTGCTAACTTTGTAAA
TTAAAAAATAAATAATTCAACTATTTTGATTTAAATAATATGTTTATTTTCATCAAGAAA
TTTGATACTGTCGTAATTGATGAAGCTGCTCAGTCTACAGAAATAAGTACTCTCATTCCT
TTGCAATATTAATGTACTAGACTTATTTTAATTGGTGATCATAATTAATTGCCTGCTACT
ATATTCTCTAAAAAATGTGAAAAGTTTAATTATCATTAGAGTTTATTCGAACGTTTTGAA
AAATGTAAAGTTGAAGTTCATATGTTAAATGTAATAATTTATTTATATCCCATTTTGAGT
TTTAATTTAATAATATTTTTAGTAACAATATAGAATGAACCCCATTATTAGTAAGTTTAT
TTCTTAAACTTTTTACTAAGACAAAATTTCAGATGCCGAAAAAATTAACGAGCTTGTAGG
TTAACCTGAAATTTATTAGTTAAGACTATTTTAGCCTGTCGTTTTCTTTAACGTTGAAGT
AATTTTTTATATATAAATTAAGATAGGTTAAATTAAAAATCAATTAAAAATTATAGGGTA
ATGAAATATTTGAAAAATCTTCATATAAGAACGAGGAAGAGTCAAAAGCTATTGTTGAAA
TTTATAATAAATTGAGAACTACCTTCCCTAATTTCGATTTGAATAAGTTAGGTATTATTA
CTGCTTACTCTCGTTAAGTTAAGGAAATAGAAAAAAAAATTAAAGCTCACGATAAAACAG
ACAAGTGTATGGTTGAAGTACACACAGTTGATGGTTTCTAAGGTAGAGAAAAGGATATAA
TTATATTCTCTACTGTGAGAGCTAGTTAGGTAAATGGAGAAAAAAATACTAAAAAAACTA
TTGGTTTCTTAAATGACAGAAGAAGAATGAATGTCAGTTTAAGTAGAGCAAGATTATGTG
TTATAGTTGTGGGTGATCTCAAATAACTTAAATTTTCTAAATTATGGAAAGGATTAGCAG
AATATTCAATAGAATAAAGAAGTTGTTATAATATGGTTGCCCCATATTAAACTTTTGTTA
GTAAATTAGAATTACACTTTGATTAATACAAAGTTTATAGGGCAACATAGAATTGA

>TTHERM_00189400(protein)
MSNQNPKEEIEKKDNRILDGLHYYLCSRDYNINFDESIDNINLNVEGDDENKNSDLNNII
PEETADKNADQVEQQNTLQQPQMSFTNLANIPLSFNDPEDYVKTFEQHLFSEAKAQIIKA
QVTESRAPEIMRLKNSQVIALKNNSELFFRKLTMEKVADSETKYGTHDFIVISLQDPSKV
ISGEHMLGVVERAEGNEILVKVVFDENSSDPRNQKILKVMQQDESVWRNWYVKKFCSIVT
IQREYEALHNFNDLLLKEFILNPEKLTQKKEEKFSIPEQLSIRLNQIYNPSQIQAINSTL
KKQGVTLIQGPPGTGKTRTVLGTVSVLINSFNEDQLKQKHSMEIEDKSKLVEQSGEFHFE
LAMPWMQPNYVDWRDSTFDHLHNDFSNFTKTKKYITADQTDKVIPILKAQEEHAPPEKIL
ICGPSNAAIDEIVRKMKKEGLLDKNGNIYDPSKIIVRIGENYDKDLEDVSLDYLVKQKLG
EQNIRSEDAQEIRKKILKEAKIICGTLSSTGSQILASANFKFDTVVIDEAAQSTEISTLI
PLQYQCTRLILIGDHNQLPATIFSKKCEKFNYHQSLFERFEKCKVEVHMLNQQYRMNPII
SKFISQTFYQDKISDAEKINELVGQPEIYQLRLFQPVVFFNVEGNEIFEKSSYKNEEESK
AIVEIYNKLRTTFPNFDLNKLGIITAYSRQVKEIEKKIKAHDKTDKCMVEVHTVDGFQGR
EKDIIIFSTVRASQVNGEKNTKKTIGFLNDRRRMNVSLSRARLCVIVVGDLKQLKFSKLW
KGLAEYSIEQRSCYNMVAPYQTFVSKLELHFDQYKVYRATQN