Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00194460

Standard Name

RAB63 (RAB GTPase 63)

Aliases

PreTt06730 | 16.m00386

Description

RAB63 Rap/ran-GAP protein; Novel Rab family protein; small monomeric GTPase that regulates membrane fusion and fission events

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External Links

Gene Ontology Annotations

Cellular Component

Molecular Function

Biological Process

  • regulation of small GTPase mediated signal transduction (IEA) | GO:0051056

Domains

  • ( PF01814 ) Hemerythrin HHE cation binding domain
  • ( PF02145 ) Rap/ran-GAP
  • ( PF05316 ) Mitochondrial ribosomal protein (VAR1)
  • ( PF07540 ) Nucleolar complex-associated protein
  • ( TIGR00864 ) polycystin cation channel protein
  • ( TIGR01612 ) rhoptry protein

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source Identifier Score
Tetrahymena borealis EI9_03716.1 9.997093137033517e-262
Description: hypothetical protein (1916 aa)
DictyBase DDB_G0284825 7.998932288246191e-33
Description: DDB_G0284825 on chromosome: 4 position 2526025 to 2531286
WormBase WBGene00018734 1.9999391735788327e-19
Description: status:Partially_confirmed UniProt:H2L055 protein_id:CCD71458.1
Stentor Coeruleus SteCoe_24589 0.0000000000002543665647376923
Description: None

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:16933976: Eisen JA, Coyne RS, Wu M, Wu D, Thiagarajan M, Wortman JR, Badger JH, Ren Q, Amedeo P, Jones KM, Tallon LJ, Delcher AL, Salzberg SL, Silva JC, Haas BJ, Majoros WH, Farzad M, Carlton JM, Smith RK, Garg J, Pearlman RE, Karrer KM, Sun L, Manning G, Elde NC, Turkewitz AP, Asai DJ, Wilkes DE, Wang Y, Cai H, Collins K, Stewart BA, Lee SR, Wilamowska K, Weinberg Z, Ruzzo WL, Wloga D, Gaertig J, Frankel J, Tsao CC, Gorovsky MA, Keeling PJ, Waller RF, Patron NJ, Cherry JM, Stover NA,

Sequences 

>TTHERM_00194460(coding)
ATGAGCAATACAGATGATTAGGAGACTGCTATAATAAAGGCTTTTAATGCAAGCATAGAA
TTTATTTTAGATAAAGATAAAAAAACAAAGCATAGATTTTAGTAGTTAGTGGATGTTTAT
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CATAGAATAATAAAGAATATCAAACTCAATCATATATGGCACTAGTCCTTGAATCAAAAT
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TAAAAGCTAATTAATCAGAATAATTAATGTAGAGATATCCTTTAAACATTAAAGTTACTA
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CGCTTGCAAATCATTCAAACCATTTACTGCTGTCTCGATTATTAAAATAAAGAAGAAGCA
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AAGGAAAATTATTAAGAATCCCATCTTTAAAGTCATACTAAGATTACTCCAAAAAGAGCA
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GAGAAAATGCATCAAATGTCAATTGAATTATTAAACAGATACAACGTTTTAAAAAATTTA
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TTAGATATATTTTAAGGAGAAGTTGTTTATTTAGGAAATGTTTTGAAAAAGGAAAATTAG
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AATAGGAAACGAGATAATTCAAATTAACAAAACCTTCCAAAATCGGATTTTTCAGAGGTT
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AGCTAATTCTTGACAAAATAAGAAATTGATAGAAATATATCAAGGTTCATTCATTCAAAA
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GAGTCACTAAATTCTTCTCCAAAGAAAAACAAATCATAGAATTCAAAAGAAAAAGGATAA
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CAGTAAATAATCTATTGCTTCTTGACTCCTCACTAGAGCTAAAAGCATTCTAATTTCTTA
AATACTAGTTAAAGTCAAGCTTCTAGTTCTTTTAATATCTAAAATAAATAAAAACAATCA
TAAATAATAAGATATCCTCCATCAATAAATACTTTATTTTTTATATTTTACAGTTATTTA
AATATACAAAGTAAGTTAGAAACTTATTAGATCTTGTAAGATTTAGGTAACAAGCAATCA
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ATATACAACAAAGCTCATTCTTAACAAAACGAAACCTTAGGAGAGATAGTTAATCAATGG
GAATAACTCTTTAATTATTGTCTTAACGAAGACACAGATCCAATCTTTAGCGTGGCAGCA
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ATTCATAAATTTTTAGAGAAATCAAAGTAAATTTTAGGATATTTGATAGACCCTGTTTCA
GCACCTGAAGATTTTAGTTATATGCTAGCTATATTTCTAGCTGGTTAAGATTTTAATACT
GCTTGCCATTCTTCTTCATTTATCATTTCGTCTCTTTCTTCTATATTTCCTTCCTCTTCA
AATTAACATAGTTAAATACTTCTTTAAAATTATTTGTTGGAATCAACAACTATTTGGAAC
CATTCTGCAATTAATGATGAATTCAGTAAATAAAGTCGATCAATAGTTATTAGGTCAATA
ATTATCTTGTTAAAAAATTTGTATTAAATTTAAGAGATAAAGAAAACATCATTTCCACTT
ATTAATTATTTCATCACTACTCTAGTAAACCACTTTATTTCGCTATTTTAACCTAATATC
AATATTGAAACTCTCTTTACAATCGATGTGATATTTCATTTATAATCTCTCTTTTTTACA
GTTCTTTTAGATTAGCTCCAAAATCAAGAAATAAAACTGCTTATATGGGATTTCATCTTA
AAAAATATTAATTCTTAATACAATTCATGTAAATAAATCTAATACCACTCCATATAATTT
ATAAACTCGTTCGCTCTTGCTGATTAAATGTCATTAATACAAAAAACTACCATAAACAGG
ATTATGAGAACTATAACACAAATTTTATAAGAAAAAGTGTAAAAGGATGTATTAGTTTCT
AGATAGCTTCTTCATTGTTTGCAGAACTGGATTTTCAATTTTAGATATTTTGAAATTAAC
TGCAGAAAACATTTTAAAGATGCAAAAAGGTTTTTAGAAAATTTAATTAAGGCTTTACAT
AATATATCTTAAATTAGTGACTTATAGTATGATGTATAATTCTTTTTGTCATAGTTGATG
AAAAATTACCTTGATTAAAGGTAAGATGATATGTTTAGCTTTTAACTTGAAGATTTAGTT
GAGCCTTAAAGTGATTTGCTTAGCCTAAAGAGTCGCGAATCTGTTTATCATACTATTAGC
TGCCATGAATCAATGAAGCAATAGCAAAAAATAATTTTTGAAATTTCTAAAATAGAAAAA
GATGTTCTCAAGTAAAAAACGCATTAAGCAACTTCTTTTGACTGCAGTGCATAGAGCCAA
TTAAATAACTCAAGCGTTTTAAAAAAGAGTTAACAAAATCAAGGAGTTGTATCATAAATT
AAAAAATACATAAAAAAGAACAGTAACCATTAATTTTAAGATATCAGCGAATATATACCT
GAATTTATAGAAAACAAGTATTTAAGCTTTTGTTTAGATAGTGAGAAACTTGTTTCTTTT
TTACTTGATAGCAAATCCTAAATATATGCAATTATCAGGGACCTTAATGGAAAATTTATT
TGGAAAGTAAGAGAAAAATTAGTTGAATCTCCTCTTTAAAAAGCTTTGAGATCAAACGAT
AAGTTAGATGATAATTAAATAAATCTAAATCAATAATAAAATCATTTTACACAATAAATA
AATTTAAACAATCATAATGAATTAGCCTAAAAGTAAAGTAAATCAGAAATTAAAGATAAA
AAGCCCTAACCAAATAATTAAAACTTGACTTAATATTTATAAGAAACTCACAAGTCAGAA
GGAAGTTTGATACATATGATTAAAAATCCACCTATTAATTGTGAAGAAAAACGTAAAGTA
AGTAAAGAAATTCCTAAACAAACTAAAAATGATTAATTATCAAAAATAATTGAATAAATA
ATCTACTTTATTCACGAACAAATTGTTTAAACTGAAAATGAAAGCTAATTTGGTGATGAT
GATGATCAAGAGTAAGAAGAAGAAAATATGCCTAGAAGCCCTTAAAAGAATGGAAACTTT
AATAAATAATTTACTTTAGCAAATAAACATGACCCAGTTTATCAAGAAACTGTAACAAGA
AGTTTAAAGTCTTTCATTTAAGAAGTTCCTTTCATGATAAAAGATAATAATAAATGCAAT
TTTATAGATCATCAATAGGATTCTTATTTAAACATAATAAGCTAGATTGATTAATATTCA
ACAAGCGACAAGGTTAAAATTGGGGTCTTATTCATGGGTAAGGACTAAGATAATGAATAA
TAAATATTATAAGCTTAATGTGGTAGCTAAAGATATGAGAGATTCTTAGAAAATCTAGGT
GAAAAAGTGAAATTGAGTGAGCATTAGGGCTTTTTAGGAGGATTAAGTCCAGATAGAGAC
GGTGAATACACAATATATAATCATTTTTATAACTGTGAGGTAGTTTACCATGTAGTCACT
ATGATGCCAATAAAAAATAAAGAAGATAAGCAATTTGTATCTAAGAAAAGACATATTGGA
AACGATTTTGTAAATATCATCTGGTGTGAAAATATCAGAAAATACTAGTAATACATCATA
CCAAGTTAGCTGACTACAGCATATATAGTAATACACCCTTTGACTAATAATTACTATAGA
ATTAATCTTATAAGAAAGGATAAATTAGGAGATTTCTTCTTTCCTTGGATAGATAAATCA
GTTATTCATGAGTAATTCTTAGATACTTTAGTAAAGATAGTATCTCTTTAAGCAAGTTAT
TGCGTTCAGCAGTATTAAGCAAGATATCACCAAAATCTACCTTAAAATATATTACGTCCT
TATAAGTCTCGTTAAAGTTTGATATTTTAGATACAAGAACAGCTTTCTATCCCATAAAAA
AGCAACATTCCAATTTCAGAATTATTTTCAATAAATTAGCCTTAACCATATATAGGGAAT
ACAAATTAAAATTAAAACTAAAAAAATACTAACTCCATAATACAGAATTAATCTTAAATT
AAAGTATCTAGCAATACAAATATCTCAAATAATATTGCTAATCGTTTAAAAATTTGA


>TTHERM_00194460(gene)
ATGAGCAATACAGATGATTAGGAGACTGCTATAATAAAGGCTTTTAATGCAAGCATAGAA
TTTATTTTAGATAAAGATAAAAAAACAAAGCATAGATTTTAGTAGTTAGTGGATGTTTAT
AAACAAATCAGGGATGAAGGAGAGCAATAAAATACTAGCAAGGATGAATAAGCAGATAGT
CAGAATTAGTAAAATCAACACTCAAGCAACCAGCCAGTTAATTAGTCATAGTTGAATTAG
TCAGCTAATAACTCATCAGGAGTGCTTAATATTAACGGAATATCTATGATGAAATTGCAG
CATAGAATAATAAAGAATATCAAACTCAATCATATATGGCACTAGTCCTTGAATCAAAAT
TACAGGGTCGTTTATGAACTGATTTAAGATCATCTTAATAAAATTAATCCAGGCTTTTTT
TAAAAGCTAATTAATCAGAATAATTAATGTAGAGATATCCTTTAAACATTAAAGTTACTA
TATTTTTTCTTTGACAGTTTAGAAAATGTAAATATTCAAGAATTATTGAAAGGAGTCTTT
CGCTTGCAAATCATTCAAACCATTTACTGCTGTCTCGATTATTAAAATAAAGAAGAAGCA
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TTTAGCAAACCATACTCTTAAAACTCTATTAAAGATGTCTGCGTTTTTAACAGTCCGAGC
AATGGAATGCCTGTTTGGACAAATTATATTAAAGATGTAAGCCACGAAAAATCAGAAAAG
CAATATCTAGATGTAATTATGTTGATTCATTAGTTTTAGTTTCAAATTATCTATCAATAT
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GAAAAAAAATTATTTTAGATGAATAATGGATATTGAAATGTTAATTTACACTTTAAATAG
GAAAACACATAAAATTTATTTCCAAAACTATGATATTTTTATCTCAAATTTGTAATTACG
CAATAGTTTTTTTAATGATTTGCTATATTATTGTAATTTATTGGCTCTCAAAAAATACCA
CTAATTTTATGATATAGTAGTATTAAGTTGAATCAATAATAAATTATGTTAACGATACCG
AAATCAAAATCTAAATTTTATGAAATCTCAATAAGCAATACAATATGAAATTAAAATATA
TAAAAAACTAAGATAAAAATTTAATATTTTTGTTTTAATTTACTAAAAAATTAAATATTT
ATTTATTCATTCATTTAAAAATTTACTTTTAATTAGGAAATATGGAAATACATGCAATTG
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TTTGATAAAAGTTACCTTAAATGGTCCGAAGAATATTTTAAGAGATAAGATACTGTTACC
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AAAATAAATTTAACATCAAGCTTTCTTAAATAAATCAACTTTTTCTTTGTTATTCTTAGT
AATTATTAGCATTTTTCTGTTACGAAATTAAAAAATTTATTTTGTAAAAATTAGGCACTA
ATAAGAAGGAAAAGTAAAAAGAAAGAAGAAGCACAGCAGTTATTGCAGATTTAAGACACA
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AAGAAGAATATTATAAAATAGCAAATGATATAATAAGTACTTTTTCTGATCAAATGGCCA
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TCATTCAGAAAAGAAGATTCTCATAAGCTGTTGGAAGAGAATAAGCTAAACAGCGAAGAT
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GTTTTAAAAAATTTAAGTGACTATGTTAAAAATATTGCTTTTAAATTTATTGATACACTC
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AAAAAGGAAAATTAGCCATATTAGTTAGAAAATACTTTACAAATGATTTTAGATGTAATT
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CCTCAATACAAAGAAAAGCAAGATTAAAAAATACTGTAAGGAGTTTTAAAAAATTATCTA
AACATGGGAAAATTACTTAATATGGAAGATGTTATTCTACTTGATGAGTATATAGGTAAT
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TAAAACTTGTCCTTTAATAGGAAACGAGATAATTCAAATTAACAAAACCTTCCAAAATCG
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TCCTTCCTCTTCAAATTAACATAGTTAAATACTTCTTTAAAATTATTTGTTGGAATCAAC
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TATTAGGTCAATAATTATCTTGTTAAAAAATTTGTATTAAATTTAAGAGATAAAGAAAAC
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AACTGCAGAAAACATTTTAAAGATGCAAAAAGGTTTTTAGAAAATTTAATTAAGGCTTTA
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ATGAAAAATTACCTTGATTAAAGGTAAGATGATATGTTTAGCTTTTAACTTGAAGATTTA
GTTGAGCCTTAAAGTGATTTGCTTAGCCTAAAGAGTCGCGAATCTGTTTATCATACTATT
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AAAGATGTTCTCAAGTAAAAAACGCATTAAGCAACTTCTTTTGACTGCAGTGCATAGAGC
CAATTAAATAACTCAAGCGTTTTAAAAAAGAGTTAACAAAATCAAGGAGTTGTATCATAA
ATTAAAAAATACATAAAAAAGAACAGTAACCATTAATTTTAAGATATCAGCGAATATATA
CCTGAATTTATAGAAAACAAGTATTTAAGCTTTTGTTTAGATAGTGAGAAACTTGTTTCT
TTTTTACTTGATAGCAAATCCTAAATATATGCAATTATCAGGGACCTTAATGGAAAATTT
ATTTGGAAAGTAAGAGAAAAATTAGTTGAATCTCCTCTTTAAAAAGCTTTGAGATCAAAC
GATAAGTTAGATGATAATTAAATAAATCTAAATCAATAATAAAATCATTTTACACAATAA
ATAAATTTAAACAATCATAATGAATTAGCCTAAAAGTAAAGTAAATCAGAAATTAAAGAT
AAAAAGCCCTAACCAAATAATTAAAACTTGACTTAATATTTATAAGAAACTCACAAGTCA
GAAGGAAGTTTGATACATATGATTAAAAATCCACCTATTAATTGTGAAGAAAAACGTAAA
GTAAGTAAAGAAATTCCTAAACAAACTAAAAATGATTAATTATCAAAAATAATTGAATAA
ATAATCTACTTTATTCACGAACAAATTGTTTAAACTGAAAATGAAGTAATTTATTTTTTT
ATTTGATAAACATTCCAAAAATTCAATAAAAATTTTGTTAAAAAACCTTTCTATCAAATT
AAATAATTAAATTGATTAAAATTGCTCATTGGTTCATATTATTATAACATTTTCAACAAT
ATAATTAGAGCTAATTTGGTGATGATGATGATCAAGAGTAAGAAGAAGAAAATATGCCTA
GAAGCCCTTAAAAGAATGGAAACTTTAAGTAAATTAGAAAATTTGTATTTTATTAATTAG
TTTGAAATTTTTTTTTTCAGTAAATAATTTACTTTAGCAAATAAACATGACCCAGTTTAT
CAAGAAACTGTAACAAGAAGTTTAAAGTCTTTCATTTAAGAAGTTCCTTTCATGATAAAA
GATAATAATAAATGCAATTTTATAGATCATCAATAGGATTCTTATTTAAACATAATAAGC
TAGATTGATTAATATTCAAGTAAATATTTTTTAAAATACTTAACAATTTTACATTTTAAA
TCTAAAAAATTAGCAAGCGACAAGGTTAAAATTGGGGTCTTATTCATGGGTAAGGACTAA
GATAATGAATAATAAATATTATAAGCTTAATGTGGTAGCTAAAGATATGAGAGATTCTTA
GAAAATCTAGGTGAAAAAGTGAAATTGAGTGAGCATTAGGGCTTTTTAGGAGGATTAAGT
CCAGATAGAGACGGTGAATACACAATATATAATCATTTTTATAACTGTGAGGTAGTTTAC
CATGTAGTCACTATGATGCCAATAAAAAATAAAGAAGATAAGCAATTTGTATCTAAGAAA
AGACATATTGGAAACGATTTTGTAAATATCATCTGGTGTGAAAATATCAGAAAATACTAG
TAAAAATAATTTATAAATTTTTATAATTCAATCAAATTAAACATTTATATAGGTAATACA
TCATACCAAGTTAGCTGACTACAGCATATATAGTAATACACCCTTTGACTAATAATTACT
ATAGAATTAATCTTATAAGAAAGGATAAAGTAATTTGCTTTTTGAATGAAACTAACCAAT
AATAAATAATTTTTACTAAACAAATTAAAAATAGTTAGGAGATTTCTTCTTTCCTTGGAT
AGATAAATCAGTTATTCATGAGTAATTCTTAGATACTTTAGTAAAGATAGTATCTCTTTA
AGCAAGTTATTGCGTTCAGCAGTATTGTAAGCATTCATTCATATTTATTTTAACAATTAA
ACATTAATTTTTTATACCTTTACCAATTTTAGAAGCAAGATATCACCAAAATCTACCTTA
AAATATATTACGTCCTTATAAGTCTCGTTAAAGTTTGATATTTTAGATACAAGAACAGCT
TTCTATCCCATAAAAAAGCAACATTCCAATTTCAGAATTATTTTCAATAAATTAGCCTTA
ACCATATATAGGGAATACAAATTAAAATTAAAACTAAAAAAATACTAACTCCATAATACA
GAATTAATCTTAAATTAAAGTATCTAGCAATACAAATATCTCAAATAATATTGCTAATCG
TTTAAAAATTTGA


>TTHERM_00194460(protein)
MSNTDDQETAIIKAFNASIEFILDKDKKTKHRFQQLVDVYKQIRDEGEQQNTSKDEQADS
QNQQNQHSSNQPVNQSQLNQSANNSSGVLNINGISMMKLQHRIIKNIKLNHIWHQSLNQN
YRVVYELIQDHLNKINPGFFQKLINQNNQCRDILQTLKLLYFFFDSLENVNIQELLKGVF
RLQIIQTIYCCLDYQNKEEARILGFILLFKIISSYDFNQLFRLQELSVLTLFNYIIDFQS
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LLIFSQTWFQLCFDKSYLKWSEEYFKRQDTVTKQYQMIYGLSTDQILLDQNTKINLTSSF
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KPQPNNQNLTQYLQETHKSEGSLIHMIKNPPINCEEKRKVSKEIPKQTKNDQLSKIIEQI
IYFIHEQIVQTENESQFGDDDDQEQEEENMPRSPQKNGNFNKQFTLANKHDPVYQETVTR
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