Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00242090

Standard Name

VPS18A (vacuolar protein sorting 18A)

Aliases

PreTt18947 | 20.m00411 | 3706.m00175

Description

corvet complex core vacuolar protein

Genome Browser (Macronucleus)

Full Screen View

No Genome Browser Data Present

Genome Browser (Micronucleus)

Full Screen View

No Genome Browser Data Present

External Links

• Uniprot
• Alphafold

Gene Ontology Annotations

No Data fetched for Gene Ontology Annotations

Domains

• ( PF00097 ) zinc finger, C3HC4 type (RING
• ( PF00628 ) PHD-finger
• ( PF00637 ) Region in Clathrin and VPS
• ( PF05131 ) Pep3/Vps18/deep orange family
• ( PF07337 ) DC-EC Repeat
• ( PF07649 ) C1-like domain
• ( PF09204 ) Colicin D

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

No results were calculated for this gene in GeneMania.

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source	Identifier	Score
Tetrahymena borealis	EI9_07784.1	9.997093137033517e-262
	Description: hypothetical protein (1136 aa)
DictyBase	DDB_G0269924	2.000065869309806e-55
	Description: vps18 on chromosome: 1 position 3875953 to 3879788
Oxytricha	Contig618.1.g107	6.001502944943701e-53
	Description: Pep3/Vps18/deep orange family
WormBase	WBGene00021058	3.00033207980219e-32
	Description: locus:vps-18 status:Partially_confirmed UniProt:Q23194 protein_id:CCD73641.1
Stentor Coeruleus	SteCoe_29243	2.1705220113036395e-29
	Description: None
SGD	YLR148W	6.002718307283067e-26
	Description: PEP3 Component of CORVET tethering complex; vacuolar peripheral membrane protein that promotes vesicular docking/fusion reactions in conjunction with SNARE proteins, required for vacuolar biogenesis

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

1. Ref:31964712: Sparvoli D, Zoltner M, Cheng CY, Field MC, Turkewitz AP (2020) Diversification of CORVET tethers facilitates transport complexity in . Journal of cell science 133:

Sequences

>TTHERM_00242090(coding)
ATGAATTAAAGCATACCTAGTGATTATAGCCCTTACTATAGCTAATAGGATGTGAAGGGA
TTTCAATCAAAAATTTATTAAACTGAATAGATTTTTGGAGATTTAAAGAACTATGATTTA
CCTTCTGAGTTATTTCGCAGTGAATAAATAAAATAATTGGCTGTGAGTCTTAACCAAATA
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CAAAATTAAGGAAATCTAATCACTAATTTATTCAGCAATGTCTTTAATGGAGTAGGGACA
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AATATTACAGATGGTGCTTAGCCAGTAATCATAGATAGAATTTATCTTGACCCTTTTGGT
TATCATTTAATAGCATGTAGCAATCAAGGATTTTCTTTCTATATTAATTACCATCATGAA
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TATGATAATCTTACAATTATGTCTAGAATTAACGAGAGAATAGTAACTTCTTATGACCTC
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ATTTATTGGCTAATTGAAATAAAAGCAGAGAAAATTAATGCTTAAGAAGTTAGATACTAA
TATTATTAGTAGTATCCTATCTCAAAGTTTAAAAACGAGCAGGATAAGAGATACTGCCTG
GAGTTAATTAGCTAAAAAATACAGAGCTTAAAAGATAGCTTGAAATAACTTTTAGAACAG
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AGATTGAAAGATTGCTTCGAATATGCTAGAAAAAAGTAATCCTTTGAGGTCATTATCAAG
AATGACATTAATGAAGATAAATTTGATTAGGTACTTTTAGATTTAGAGTCTATTCCTAGA
GAAAAAGAAAGATATAGAAATGATTTATTAGTCAAATATTCTCATCTCCTTATTTAGAAA
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AGCTAAAAAGAATAAAAAAAGCTAATGCTATAAGTCGCTAAATACTACCTTGAAAAGGAC
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TTAGAACAAAAGAACAAAAAGATTGAGGAACTCAGAATTTTAATCAAAGCCTACTCACTA
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TGTAAGCATGGGTTCCATCAAGCATGCCTGATTTATAAAGTGATAAAAAATGATGACGAT
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ATAGAATCTCTTACAACAAGAAAGAGAGCTTCAAGTGAAGATATTGACATAGGACTTTTC
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GAAGAAAATACTGTATAGCTAGAGTAATATTAGAAAGAGCTTCTTAAATATAGAGAAGAA
TTAGATTAGTTGTTAGCAATAGAATGTATAGAATGTGGTCCTAGTATTGTTGAAAGTATT
TATAAAAAACCTTTTAATGATAATATAAAAATTGCAGATACATGGAAACTCTGA

>TTHERM_00242090(gene)
ATGAATTAAAGCATACCTAGTGATTATAGCCCTTACTATAGCGTGATAAACTTTAATAGT
TAGATGAATAATATGGATAATTAGTTATTTGTTTTTAATATAGTAATAGGATGTGAAGGG
ATTTCAATCAAAAATTTATTAAACTGAATAGATTTTTGGAGATTTAAAGAACTATGATTT
ACCTTCTGAGTTATTTCGCAGTGAATAAATAAAATAATTGGCTGTGAGTCTTAACCAAAT
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ATTGGAGATTCCTGATAGAATAGAGTAACCAGTTTAGTAGCAATAATAGCAATAAGCACA
ACAAAATTAAGGAAATCTAATCACTAATTTATTCAGCAATGTCTTTAATGGAGTAGGGAC
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AGAACATTTTTTTAATCTTCGGATAATATTTAACATCTGAGAATGATTTTAAAGTTCAAA
ATATAAAACGTGAGTTCAAATAAAAAGAATATTGTTATATAAATTAAAATAGGTTATCAT
TTAATAGCATGTAGCAATCAAGGATTTTCTTTCTATATTAATTACCATCATGAAAACCAG
ATGAAGCTGCTTAAAAATGTAAGAGGAGAAGAGTATATCATTACATCTATTGGATGGGAA
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TTTTTTTAAAAATTAAAAGTTTATTTATCAAAAAAATGTATTGATAAAATTCTTACTATT
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AAATAAATTTAAAAATTTTTGGAAGCTATATATACTTAGTGGAATATTATATTCTAGTTT
AATATTAAGTTTAATGAAACATTCATTATAAATGTTTTTGTTAATAATAGAGTGTTTTTA
AATAATCAAAATCATAGTATTAAAAATAATAAATTAGATTAGAAAATTAAATTAAAAAAG
AAATTGATCTAAAATGTTTATATTTAAAACAATCACTATGAAGTTTACAATTTATTTTAT
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GCTGCATAGTTCAAGTTCTTCTAAAGCTATTAATGCTATTAAATATCTAAAAATATATAG
TGATAATAGAAAAGATAAAAAGTTTCTTGTCTTTGTTTCTACAAACTCCTCTGTATACGC
CTTTTCAGAAAAAGATATTGTCATTCATCTTTAAAATTTTAAATTGTATGACTATTAAAA
CAGAGTTAGCTTTAATGTGAATGACACTAGTTTTAATAACGATTTTAGAATTTCCCCAAA
TTCTTTACTTAGTGTATGCAGTGTTGTTGAGGGTCAAGATAAAAAGAAAATCCCTCATTC
TGTTTTATGGGTCAATGAATATGGCTTGTTTAATCAATTGGTAAGAGCATTTAATTCTTT
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TAAAATATTTATAAAAATGAATTATTTAAAATATTAGATTCCAACTTGTTACGAGTAATA
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AATAGTAACTTCTTATGACCTCAAAAGCATGGGTGTAGTTTATGGTATGTAATATGATAG
CTTTAATAAAATTATATGGATATATTCGAGCAAAGATATCAAATACCTTAGTATTTAAAA
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AAAGGATGGCTGGAAGCTTTATTTAGAAAAAAAATAATTCAATCTAGCTTTCGAAAGTGC
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ATATTAATTGTCTTTTTAATAATTTTTATAGCTAGCTGGATTGTATGGAGATCAATAGTT
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TCTTGAAGGTATTTTTTTAATTTTAGGTAATTTGTTATATCTTTTAATATCACTTTTAAT
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ATTAGATTATTAGTAGTATCCTATCTCAAAGTTTAAAAACGAGCAGGATAAGAGATACTG
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GAAGTTTAATTGATACTCCTCCATCTAAAAAAAGACATGTAATTGAGTATATAAAAGGTC
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CCTAACTAGATTAAGAATTTGAGTTAGATGAGTACTTTACTGAATAAGAACAGGTCAAAA
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ATTTCCATATCATACTTGTTAAATTATATGGGTAAGTCTTTTAATATTTTTTTTAAAACA
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TAAATTATCATTTATATTATAATACAGATTAAAGGATATGTGCAGCGAAGCTATCAAAGT
TGCTTTGGAAAATGATCTTGGATATCTTATTTAAAGTTATATAACTTAACCTTCAAGCTA
AAAAGAATAAAAAAAGCTAATGCTATAAGTCGCTAAATACTACCTTGAAAAGGACAATAT
TTTTGAAGTTATAGATTTATTGCAATAATATCCTGTTCTTCAGATTGAAGAAATTTTAGA
TCTGTTTTCTGAGAGTGTTGATGTTCAAAAAGTAACTGAGTAGATTTGCAACGGTTTAGA
ACAAAAGAACAAAAAGATTGAGGAACTCAGAATTTTAATCAAAGCCTACTCACTAGCAGC
TGATAAAATTAAATCTGATCTTAATAAAATTAATAAATATGTTATTATCAAATAAGATAA
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GCATGGGTTCCATCAAGTAAATTAAATTTATTTTTTTAATAAAGATTTTAAATAAAAAAT
AAAAAATAGGCATGCCTGATTTATAAAGTGATAAAAAATGATGACGATCAAATAAAATTA
GAAAAAATAAATACTTTGAATTCAAAAATAGAACAAATTTAAAAAAGCATAGAATCTCTT
ACAACAAGAAAGAGTAAATTCATTTTATTTTATCTATCTATTTTTACAAACAAATATTTT
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GAATAAGCTTGTAAATTTTGTTGCAAGCCATGCTATTGAAGAAGATAATGAAGAAAATAC
TGTATAGCTAGAGTAATATTAGAAAGAGCTTCTTAAATATAGAGTAATTTTTTTATACAA
ATTAGCTTTTTAAATATTTTATAATTAAATATTAGGAAGAATTAGATTAGTTGTTAGCAA
TAGAATGTATAGAATGTGGTCCTAGTATTGTTGAAAGTATTTATAAAAAACCTTTTAATG
ATAATATAAAAATTGCAGATACATGGAAACTCTGA

>TTHERM_00242090(protein)
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