Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00290710

Standard Name

VPS8A (vacuolar protein sorting 8A)

Aliases

PreTt26003 | 26.m00355 | 3688.m00147

Description

corvet complex core vacuolar protein; required for mucocysts biogenesis

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External Links

Gene Ontology Annotations

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Domains

  • ( PF00400 ) WD domain, G-beta repeat
  • ( PF00643 ) B-box zinc finger
  • ( PF05316 ) Mitochondrial ribosomal protein (VAR1)

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

Tetrahymena Stock Center

  • ( SD00666 ) The name of the strain is SB281, and it bears a mutation in the VPS8A gene causing defects in mucocyst biogenesis.

Homologs

Source Identifier Score
Tetrahymena borealis EI9_09364.1 9.997093137033517e-262
Description: hypothetical protein (1498 aa)
Stentor Coeruleus SteCoe_12909 0.00000000000003442477108469977
Description: None
Oxytricha Contig21963.0.g17 0.0000000000019997478866288316
Description: WD domain, G-beta repeat
DictyBase DDB_G0291606 0.000030009396760408108
Description: vps8 on chromosome: 6 position 397697 to 403037

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:31964712: Sparvoli D, Zoltner M, Cheng CY, Field MC, Turkewitz AP (2020) Diversification of CORVET tethers facilitates transport complexity in . Journal of cell science 133:
  2. Ref:29478853: Sparvoli D, Richardson E, Osakada H, Lan X, Iwamoto M, Bowman GR, Kontur C, Bourland WA, Lynn DH, Pritchard JK, Haraguchi T, Dacks JB, Turkewitz AP (2018) Remodeling the Specificity of an Endosomal CORVET Tether Underlies Formation of Regulated Secretory Vesicles in the Ciliate Tetrahymena thermophila. Current biology : CB 28(5):697-710.e13

Sequences 

>TTHERM_00290710(coding)
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GATTTTGAATAGGCTATAAAAATATATCTTGAAACATCTTTTGTAGACATCAGATTTAAA
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GAAGAAGAATCTTTTGAAGCTTTAATACATAATGTATAGCTCTCTTCTATTTTATAAAAT
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TAAAAAAAAGGGATTAAAATAAATTTCGCTTGCTCAAACTGCAAGAAAGAGTTGCAAAAA
GACTTTACTCATTATTATTGTTATCACACTTATTGTTCAGATTGTGATAAAAGTTTATGT
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AAAAACTTTGATAAAAATCTTTAAGAATCTAGAGCTGAATAGCTAAATTTTTTTGAATGA


>TTHERM_00290710(gene)
ATGGATCAGAAAGATAAAAAACTTCTTGCTGATAGCAATATTGATATAAATTCTTTTCTT
CTAGACAATCTCAATTCACTAGATATGAATTAATTGGATGATATTCTTTAAAACGAAAAT
AATTATTCAGATAATAAAAAAGTTGAAAAATAAATAAAAGTTGTTGATGATAATGCAATC
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>TTHERM_00290710(protein)
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EGEILQWEIQLNLKFDSRKDLASQIQTLEICLQIYQGKNQSFGEISTFKSDLKNYIARKV
KESFERYLIDLINFRIKNSPQKIKMISDISEINTKPFVDIIGENVLEIVKQNNALMMYMK
YLIFTDNVQFMFTEFLNRIRHVQLLKDSFFQSLEPYIVLEYIKFIPNEEIFKEFFTYFDS
KNKHDIIAKFIFCIDKQQQLEYRYIKRLCNKLELLSASIFISTNFENNFKAPLQQMVSDL
DSLSSSSSLQKSSDGSSQTNLIYTKEWIGYKLLWYIKRSLSSIVFPNTQMDDTQWSEAVN
SIFEWIFFERNLIKILKIDPDLALQNILMFFKGYSSEFLKIKEQEYKQKFQKLLQYDDKI
NRNVQSDKNGNGEAIKIKDSLKTLICKYIKYVISQENTDKYLPKDTFNYFYLLLAEVKEK
DVQIDQELSTEAIYFLLENPNSHFYRNKDWALEIEYRSKQIIKLIEPHISKNKLNLSEIL
RKALNSPFVEVCSYIYRYQGDFEQAIKIYLETSFVDIRFKIFSFIKELLDTNSEKQAQII
EKIFIHLPKLLAINYHYTKELLEKIQNYDIHAIIKALNGQEELTFKILSEYIHDQRKKII
EESLSIPQNEIYLYMLYMKLLIKFQPSEVVNELKTQLYSLEEVQQILKESNHLQGTAYVL
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GIQRIEQNIPKEMIEFQKKFEEESFEALIHNVQLSSILQNKDLLPLLGSNSSENFNQKSK
LYETLQTLLKSYSFEQKIFEYSKDILYFEYCRKENVSFRLQKKGIKINFACSNCKKELQK
DFTHYYCYHTYCSDCDKSLCLICFENQKNTFQNILNREEQKSINLKYQKYIQLEEEKKKK
VQEDKEKKNNNNNNLNQKQIQEQKNAQEQQLQKNRKLKKLKNFDKNLQESRAEQLNFFE