Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00292270

Standard Name

VPS18C (vacuolar protein sorting 18C)

Aliases

PreTt26055 | 26.m00407 | 3688.m00198

Description

corvet complex core vacuolar protein

Genome Browser (Macronucleus)

Full Screen View


Genome Browser (Micronucleus)

Full Screen View

External Links

Gene Ontology Annotations

No Data fetched for Gene Ontology Annotations

Domains

  • ( PF00637 ) Region in Clathrin and VPS
  • ( PF05131 ) Pep3/Vps18/deep orange family

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source Identifier Score
Tetrahymena borealis EI9_09412.1 9.997093137033517e-262
Description: hypothetical protein (1060 aa)
Oxytricha Contig618.1.g107 2.0009803861620222e-78
Description: Pep3/Vps18/deep orange family
DictyBase DDB_G0269924 4.001287313050914e-66
Description: vps18 on chromosome: 1 position 3875953 to 3879788
Stentor Coeruleus SteCoe_29243 2.7487850079102147e-43
Description: None
WormBase WBGene00021058 3.9990760533890984e-36
Description: locus:vps-18 status:Partially_confirmed UniProt:Q23194 protein_id:CCD73641.1
SGD YLR148W 8.003613776907505e-34
Description: PEP3 Component of CORVET tethering complex; vacuolar peripheral membrane protein that promotes vesicular docking/fusion reactions in conjunction with SNARE proteins, required for vacuolar biogenesis

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:31964712: Sparvoli D, Zoltner M, Cheng CY, Field MC, Turkewitz AP (2020) Diversification of CORVET tethers facilitates transport complexity in . Journal of cell science 133:

Sequences 

>TTHERM_00292270(coding)
ATGTCTTAATTAAAGGAAGGATATGTGGAGGAAAGCATTGATGAATTCGGCTTCCAAGAT
AAAATTTATAATTCCTAAGAAATATTTTAGCGCCTAAAGCAATATGACCCATTAGGCATT
CCCTTAGATTCTGAAAAAATTAAATTATTTGCAGTTAGCACTCATCAGATAGTAATTGTT
ACAGATTAGAATAAAGTTTATCGCTTGAGAGAAGAACTTGATGAGAAATTTATAAATTAT
CCTGTGCCTGAAAAAAAAGTTGATAATCCAAATAAAGAATTCAAAGAAAAAATTAAAGAT
ATGGGCAAACAAATTTTATTCTTAGGTGCCTAAGGTCCAAAAGTTTCTATTGATAGAATT
TTCCTTGATCCAAATGGTTATCACTGTATTTTGACTTGTGACTCTGGTTGTAGCTTTTAT
CTAAATTATGATCACAATAAAATAAAATTTCTCAAAAATTTGAAGGGTACCGAATTCGTT
ATTAAAAGTGTTGGATGGGACGAAACTTGCAATAACACTACAACAAAGAATATACTTTTT
GGAACATAAGAAGGTATGCTCTATATTTATAAAATAGAAATAGGGAAAAATAACGAAATA
ATAGATTGTAATCCTGAAAAAACACTTGCTCTTAAAGGAGGAAGATCTGTCCTTTAAATT
AATTATCTTAGATTAGGTTCTGAAGAAAATCCTAGGATTGTAATATTAGTATCAACAAGC
ACTTCAATATTTACCTTTCATGGCACAGAATTTAATTTGATGTTCTAAAAATTCAGAACA
ATAGAAAGTTAAGAATAAGCTGAGCTTAAATTCCCAAATATCACACTTACTTCTGTAATG
AGTGTTTGTTATACTTAAAAGGAAGATACTGGAAAAAAAGAACCTCATTCCTTTATATGG
ACAAACGGTGTAGCTCTACAAGTTTTTGATATTCCTTAAGATGCTTCTTCTTTATAAGAA
ACAAAATATTATAAATATGCAAAAAATTCTGATGAGCATTCATAAGATGAGTATAAAGTT
AAAGAAATGCCCATAGATATATTTTTAAGTGAATTTCACTACTTTCTCTTACATTCTGAT
TAGCTTACAATACTTTCTAGGATAAACGAAAAAATAGTTTAAAAGTTTGATCTAAAGTTT
ATGGGAATAGTCTATGGTATGAGCTTTGATTATTCTAGCTAGTCTTTATGGATATACTCT
TCTAAGTAAATATTTAAGCTTAGCATCAGGAATGAAGGAACAGACGCTTGGAGATTACTG
CTAGAAAAAAAGATGATAAAATAAGCTTATGAAATAAGCATGAGAAACGGTTAAGATGCT
ACTGAATATTTAGGAGGACTTTATGCTGATTCCCTTTTAGAAGCTAAGAAGTATCAGGAA
GCTGCAAATTAGTATTTTTAAACTTCAAGAAGTTTTGAAGAGATTACATTAAAATTCTTA
AATTTGCAGGTAAAAGGAGATATGGATTCTGTAGATGGATTAGAAGTTTATTTAATGCTG
TGGCTAAGTAATTTAAGTCCTGAGGCAAAAGTTTAAAGGATTATGATAATTAATTGGTTG
ATTGAGCTTAAAGTTAGCCGTTACAATTATTTTATCTAGCAAGTAACAAAGTATAAAATT
CATCGCCCAAAGGATTAGCATGGAACTGAATGGGTTAAATATCAAGATTACAAAAAATGG
GAAAGATCTTTAAATTTTTAAGATTAAAATATTGAATAGTTCTTAGAGTAATATTGTGAT
GATATTCCTGAGGAGTCTATTTATCAGATTATGCAAAGTCATGGAAGGCTTAAAGAATGC
ATTTAATTTGCCAAACAAAGAAAATCATATGAAATGATTGTTTAGCATTATATAAATGAA
GAATAATTTGATAATGTTATAGAAGTATTCAAAGGTATTAATAAGCCTAAAAAGTTAGCA
TAACTTTTGTAAAAGTATTGCCATATTCTATTACAGAAATATGCTCCTGAAACAATTGAT
TTAATGAAGAAATCTATTGAATTTCTCAGAAAGTATAAGTTCAGAACTGAAAAACTAGTT
ATAGGCATCATGAACGTTCCTGAAAAGCATAAAAAGGATGCAATTAGTTTTGTTTAGTTG
CTAGTTGATAATAACTTTAAAGAAAAAACAATACATAATCTTTATATTTATCTGTTATGT
GATAAAAACTATAAATCAGAGCTAAATAAACATCTGACTTAGTAATAAAAAAAGATTATG
AATGAAGAGAAAATAAATTTCGATATCGATTTTGCATTGAGACTTACATCCTAGAAAATG
CTCAGAAATGCTCAAATTCAAATTTACGGAATGATGGATTTGTATTAAGAAGCAATTGAT
TTGGCTTTAAATCAAGAACTAATTGAAGCAGCTATTAGCTTTGCTAGAAAGCCTTACTTT
AAAGAAGAAAAGAAGAAGAAAATGTGGCTAAAGATAGCCAAGCATCTTTTGAACAAAGGT
GGTAACAATGTGTAAGAAGTAATTAAAATGATAAATGACGAATAATAATTTATTAAAATT
GAGGATCTTCTATCTTAATTTAGTGAAAATGTTAAAATTGAGCATTTTAAAGATTAAATC
TGCAATTGCTTATAAAATTATAATACAGAAATTAAAGAGTTAAAATAGATCATTAAATAG
TATTCAGACTCAGCTGACAAATTACAAATAGATTTGAAGTTGATCAAAAACAGGTATGTT
GAAATGAATCAAAATGTAACTTGCATGGAATGTGTGCAAAGTCTCTTTAACGAGTCCTTT
TATATATTTCCTTGTATGCATGGATTCCATAAAGCTTGCTTGATATAAAGAATGAAAAAA
GATAACATAGATTAAGGCAAAATAAATTAAATAGAATAATTGAATTAGGAAATTGAGATT
TTATAATAGAAGCAGCTCAAAATAGAAGTTAGGAAGAGATAATCAGGTAGTGGATTCTTT
AACAACATAAACCAAATTTTTTCAGCTGCAAGAGGAGGATCTGAAGAAATTGAAATTAAT
TAACAACAAATGAGTCTAAATGAAGAGAGGGAGCTTTAAGAATAAAAATAAAAAATAGAT
TAACTGTTAGCTAATGAATGCATTTTCTGTGGGCCAGGAGTAGTTGATAATATATTTATG
ATATACGAAAAGGATAAAGATCCAAAAACATCATGGGAATTTTGA


>TTHERM_00292270(gene)
ATGTCTTAATTAAAGGAAGGATATGTGGAGGAAAGCGTAATATTTCTATCATAAACTTTT
TAACTAATTAATGATTTTGTTTTAATTAATTTGTAAAATATAAAGATTGATGAATTCGGC
TTCCAAGATAAAATTTATAATTCCTAAGAAATATTTTAGCGCCTAAAGCAATATGACCCA
TTAGGCATTCCCTTAGATTCTGAAAAAATTAAATTATTTGCAGTTAGCACTCATCAGATA
GTAATTGTTACAGATTAGAATAAAGTTTATCGCTTGAGAGAAGAACTTGATGAGAAATTT
ATAAATTATCCTGTGCCTGAAAAAAAAGTTGATAATCCAAATAAAGAATTCAAAGAAAAA
ATTAAAGATATGGGCAAACAAATTTTATTCTTAGGTGCCTAAGGTCCAAAAGTTTCTATT
GATAGAATTTTCCTTGATCCAAATGGTATTATTCTTATTTTTAATATCTTTTGAACTAAA
CCATTAGGATATATATATGAATTTGATGTTTAAAGCTATTTATATATCAACAAGATTAGC
AAAATAAATCTTGATTTTTATAATGGAAAATGCATTGAATATCTTACTTAATGCATTTAA
TTATTAGGTTATCACTGTATTTTGACTTGTGACTCTGGTTGTAGCTTTTATCTAAATTAT
GATCACAATAAAATAAAATTTCTCAAAAATTTGAAGGGTACCGAATTCGTTATTAAAAGT
GTTGGATGGGACGAAACTTGCAATAACACTACAACAAAGGTAAATTTAGAAAAATTCTTA
AGATATATTTTTATAAAAGCATTATCAATATCAAACAGAATATACTTTTTGGAACATAAG
AAGGTATGCTCTATATTTATAAAATAGAAATAGGGAAAAATAACGAAATAATAGATTGTA
ATCCTGAAAAAACACTTGCTCTTAAAGGAGGAAGATCTGTCCTTTAAATTAATTATCTTA
GATTAGGTTCTGAAGAAAATCCTAGGATTGTAATATTAGTATCAACAAGCACTTCAATAT
TTACCTTTCATGGCACAGAATTTAATTTGATGTTCTAAAAATTCAGAACAATAGAAAGTT
AAGAATAAGCTGAGCTTAAATTCCCAAATATCACACTTACTTCTGTAATGAGTGTTTGTT
ATACTTAAAAGGAAGATACTGGAAAAAAAGAACCTCATTCCTTTATATGGACAAACGGTG
TAGCTCTACAAGTTTTTGATGTAAGAATTAATATTAATAAATTTTTTAAATAATAATTTA
AAATTGCTATTTTAAAAAACAATCAATAATTAGGATTCTAATTTTAAATAAAGTGTTTGT
TTTAGCATATAGTCTAAATAAAAATTCTTTTAATTTTTAATCATTTTATATTTATAGACT
AAAAAAAATTAAAATTATATTTTTAAAAACGTGTTATTTAAAATTATGAGTTCTCTGTAT
TTAATAAATTGAAAGTCTTTAAGATAAAAATATTAAAATAAATATTACTTTATTAAATTA
GATTCCTTAAGATGCTTCTTCTTTATAAGAAACAAAATATTATAAATATGCAAAAAATTC
TGATGAGCATTCATAAGATGAGTATAAAGTTAAAGAAATGCCCATAGATATATTTTTAAG
TGAATTTCACTACTTTCTCTTACATTCTGATTAGCTTACAATACTTTCTAGGATAAACGA
AAAAATAGTTTAAAAGTTTGATCTAAAGTTTATGGGAATAGTCTATGGTATGAGCTTTGA
TTATTCTAGCTAGTCTTTATGGATATACTCTTCTAAGTAAATATTTAAGCTTAGCATCAG
GAATGAAGGAACAGTAAACTTTTTATTTTATTACCAAGCTTTTTAAACTAAGCTATAATT
AAATAATAATATTAAGGACGCTTGGAGATTACTGCTAGAAAAAAAGATGATAAAATAAGC
TTATGAAATAAGCATGAGAAACGGTTAAGATGCTACTGAATATGTATATTTTTAAAGCTA
CAAAATTTTATTAAAAGATTCATCATAACATTTTAGTTAGGAGGACTTTATGCTGATTCC
CTTTTAGAAGCTAAGAAGTATCAGGAAGCTGCAAATTAGTATTTTTAAACTTCAAGAAGT
TTTGAAGAGATTACATTAAAATTCTTAAATTTGCAGGTAAAAGGAGATATGGATTCTGTA
GATGGATTAGAAGGTTGATATTAATTTAAACTAATTAATTTTTCTAGTTTTTTATAATTA
AAATAGTTTATTTAATGCTGTGGCTAAGTAATTTAAGTCCTGAGGCAAAAGTTTAAAGGA
TTATGATAATTAATTGGTTGATTGAGCTTAAAGTTAGCCGTTACAATTATTTTATCTAGC
AAGTAACAAGTAAAATATTTTTTATTTTTATTTTTTAAGATACTAAATGAAAAATAAATA
TCAATAGAGTATAAAATTCATCGCCCAAAGGATTAGCATGGAACTGAATGGGTTAAATAT
CAAGATTACAAAAAATGGGAAAGATCTTTAAATTTTTAAGATTAAAATATTGAATAGTTC
TTAGAGTAATATTGTGATGATATTCCTGAGGAGTCTATTTATCAGATTATGCAAAGTCAT
GGAAGGCTTAAAGAATGCATTTAATTTGCCAAACAAAGAAAATCATATGAAATGATTGTT
TAGCATTATATAAATGAAGAATAATTTGATAATGTTATAGAAGTATTCAAAGGTATTAAT
AAGCCTAAAAAGTTAGCATAACTTTTGTAAAAGGTACATTAGAATTTTGCATTTTGTTAA
AAAGTTTTTAATTAATAAAATTAATTAATAATTAGTATTGCCATATTCTATTACAGAAAT
ATGCTCCTGAAACAATTGATTTAATGAAGAAATCTATTGAATTTCTCAGAAAGTATAAGT
TCAGAACTGAAAAACTAGTTATAGGCATCATGAACGTTCCTGAAAAGCATAAAAAGGATG
CAATTAGTTTTGTTTAGTTGCTAGTTGATAATAACTTTAAAGAAAAAACAATACATAATC
TTTATATTTATCTGTTATGTGATAAAAACTATAAATCAGAGCTAAATAAACATCTGACTT
AGTAATAAAAAAAGATTATGAATGAAGAGAAAATAAATTTCGATATCGATTTTGCATTGA
GACTTACATCCTAGAAAATGCTCAGAAATGCTCAAATTCAAATTTACGGGTAAATGATAT
TCAAAAGCTATCATTTTTAATGCAATATTTTTTAATTACCAAAAATTTTTGATCTATTTA
TATTTTTTAACTTAAGGTTTAAAAATATTTTTCTTTTTTTCAAATAGAATGATGGATTTG
TATTAAGAAGCAATTGATTTGGCTTTAAATCAAGAACTAATTGAAGCAGCTATTAGCTTT
GCTAGAAAGCCTTACTTTAAAGAAGAAAAGAAGAAGAAAATGTGGCTAAAGATAGCCAAG
CATCTTTTGAACAAAGGTGGTAACAATGTGTAAGAAGTAATTAAAATGATAAATGACGAA
TAATAATTTATTAAAATTGAGGATCTTCTATCTTAATTTAGTGAAAATGTTAAAATTGAG
CATTTTAAAGATTAAATCTGCAATTGCTTATAAAATTATAATACAGAAATTAAAGAGTTA
AAATAGATCATTAAATAGTATTCAGACTCAGCTGACAAATTACAAATAGATTTGAAGTTG
ATCAAAAACAGGTATGTTGAAATGAATCAAAATGTAACTTGCATGGAATGTGTGCAAAGT
CTCTTTAACGAGTCCTTTTATATATTTCCTTGTATGCATGGATTCCATAAAGTAAAAATA
AATAAATTATACCTTTATGTTTTTTATTAAATATAGTTTTTTAATAAAATAATTTATTTT
TATCAAATAAAAGGCTTGCTTGATATAAAGAATGAAAAAAGATAACATAGATTAAGGCAA
AATAAATTAAATAGAATAATTGAATTAGGAAATTGAGATTTTATAATAGAAGCAGCTCAA
AATAGAAGTTAGGAAGAGTAAATTTAAATAATAATAAAAAATATTAAATTAATTATTTAT
TAGGATAATCAGGTAGTGGATTCTTTAACAACATAAACCAAATTTTTTCAGCTGCAAGAG
GAGGATCTGAAGAAATTGAAATTAATTAACAACAAATGAGTCTAAATGAAGAGAGGGAGC
TTTAAGAATAAAAAGTAAACTAATTTAACATTTTAAATTTTATTAATTTCTTTTTTAGTA
AAAAATAGATTAACTGTTAGCTAATGAATGCATTTTCTGTGGGCCAGGAGTAGTTGATAA
TATATTTATGATATACGAAAAGGATAAAGATCCAAAAACATCATGGGAATTTTGA


>TTHERM_00292270(protein)
MSQLKEGYVEESIDEFGFQDKIYNSQEIFQRLKQYDPLGIPLDSEKIKLFAVSTHQIVIV
TDQNKVYRLREELDEKFINYPVPEKKVDNPNKEFKEKIKDMGKQILFLGAQGPKVSIDRI
FLDPNGYHCILTCDSGCSFYLNYDHNKIKFLKNLKGTEFVIKSVGWDETCNNTTTKNILF
GTQEGMLYIYKIEIGKNNEIIDCNPEKTLALKGGRSVLQINYLRLGSEENPRIVILVSTS
TSIFTFHGTEFNLMFQKFRTIESQEQAELKFPNITLTSVMSVCYTQKEDTGKKEPHSFIW
TNGVALQVFDIPQDASSLQETKYYKYAKNSDEHSQDEYKVKEMPIDIFLSEFHYFLLHSD
QLTILSRINEKIVQKFDLKFMGIVYGMSFDYSSQSLWIYSSKQIFKLSIRNEGTDAWRLL
LEKKMIKQAYEISMRNGQDATEYLGGLYADSLLEAKKYQEAANQYFQTSRSFEEITLKFL
NLQVKGDMDSVDGLEVYLMLWLSNLSPEAKVQRIMIINWLIELKVSRYNYFIQQVTKYKI
HRPKDQHGTEWVKYQDYKKWERSLNFQDQNIEQFLEQYCDDIPEESIYQIMQSHGRLKEC
IQFAKQRKSYEMIVQHYINEEQFDNVIEVFKGINKPKKLAQLLQKYCHILLQKYAPETID
LMKKSIEFLRKYKFRTEKLVIGIMNVPEKHKKDAISFVQLLVDNNFKEKTIHNLYIYLLC
DKNYKSELNKHLTQQQKKIMNEEKINFDIDFALRLTSQKMLRNAQIQIYGMMDLYQEAID
LALNQELIEAAISFARKPYFKEEKKKKMWLKIAKHLLNKGGNNVQEVIKMINDEQQFIKI
EDLLSQFSENVKIEHFKDQICNCLQNYNTEIKELKQIIKQYSDSADKLQIDLKLIKNRYV
EMNQNVTCMECVQSLFNESFYIFPCMHGFHKACLIQRMKKDNIDQGKINQIEQLNQEIEI
LQQKQLKIEVRKRQSGSGFFNNINQIFSAARGGSEEIEINQQQMSLNEERELQEQKQKID
QLLANECIFCGPGVVDNIFMIYEKDKDPKTSWEF