Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00343570

Standard Name

INO80 (Chromatin-remodeling ATPase INO80)

Aliases

PreTt26137 | 35.m00198 | 3695.m00031

Description

SNF2 family amine-terminal domain protein; SNF2 family N-terminal domain containing protein. Homolgue of human INO80. Component of chromatin remodelling complex INO80. Co-purifies with Hv1 (Kanwal Ashraf et al., 2019)

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External Links

Gene Ontology Annotations

Molecular Function

Domains

  • ( PF00176 ) SNF2 family N-terminal domain
  • ( PF00261 ) Tropomyosin
  • ( PF00270 ) DEAD/DEAH box helicase
  • ( PF00271 ) Helicase conserved C-terminal domain
  • ( PF04851 ) type III restriction enzyme, res
  • ( PF05672 ) E-MAP-115 family
  • ( PF06244 ) Protein of unknown function (DUF1014)
  • ( PF07813 ) LTXXQ motif
  • ( PF08385 ) Dynein heavy chain, N-terminal region

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source Identifier Score
Stentor Coeruleus SteCoe_21534 0
Description: None
Tetrahymena borealis EI9_14703.1 9.997093137033517e-262
Description: SNF2 family domain-containing protein (1551 aa)
DictyBase DDB_G0292358 9.997093137033517e-262
Description: ino80 on chromosome: 6 position 1406177 to 1412714
Oxytricha Contig11938.0.g12 9.997093137033517e-262
Description: SNF2 family N-terminal domain
SGD YGL150C 8.001217864201775e-148
Description: INO80 ATPase and nucleosome spacing factor, subunit of complex containing actin and actin-related proteins that has chromatin remodeling activity and 3 to 5 DNA helicase activity in vitro; has a role in modulating stress gene transcription
WormBase WBGene00007027 2.0008734984431652e-95
Description: locus:ssl-1 Helicase ssl-1 status:Partially_confirmed UniProt:Q9NEL2 protein_id:CBW48563.1

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:30796450: Ashraf K, Nabeel-Shah S, Garg J, Saettone A, Derynck J, Gingras AC, Lambert JP, Pearlman RE, Fillingham J (2019) Proteomic analysis of histones H2A/H2B and variant Hv1 in Tetrahymena thermophila reveals an ancient network of chaperones. Molecular biology and evolution ( ):

Sequences 

>TTHERM_00343570(coding)
ATGCTTTGGATGAAGGGTTGTTTGTTTTTTTGTTTATTTATTTATTATTTTTTTGATTGT
TTGTTTGTTAGTTTTAGAAAAGCTTGGAGTTGTGTGAATTTTATTTATATTTGTTTTTAT
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>TTHERM_00343570(gene)
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GTTATTATAAAAGCAAACAAAAATAAAAAGATAGTTTAGTTTGGTTTATTTTATTTTATT
TGA


>TTHERM_00343570(protein)
MLWMKGCLFFCLFIYYFFDCLFVSFRKAWSCVNFIYICFYQIYYGAEGNLFLSYFTKIFR
RKKQIGSQLKKIQEQVQKQMNSTEHDGQGLNSSIRNYKNNSDISYEQNSTNLSKNQDSYK
DSIKKILETMKTESEKQNKKYDENLRKIDQWRQEMKINFEISDDEMNDEDSYNFDFDPEN
QLRQSDLANQKYNQLIEEQIDKLLQSSIIDKELDIVKQRIHNAHSSSTFLESKKAFLKNK
RKNLFKNYVKTVNQNNQNAEKIQNWQNGNNNLSTGVSSTSSQVSSSSNVQTLEQIIKESM
KLQSSKNSKLIEHQLMRLTQAIESPRHDDFIENHIFKKFKVTKDKLQTRTQQVIGYKPSD
FRKIKRYRFNPQNMPFCGSNFDEAKKALVPQYHAVYNDQSDPFNRLLSKPIIPRIGVNKQ
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SVFKEGMLNFNNQESFSNIEVVDFASLVADSAKLKYLDALLTKLKREGHRVLIFCQMTRM
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QITNFSNMFLFPFLNQQINKQIKQTQQFMVIFKNKIQIYIIKISIKEQVIIKANKNKKIV
QFGLFYFI