Identifiers and Description
Gene Model Identifier
TTHERM_00361720Standard Name
RCL1 (RNA terminal phosphate cyclase RCL1)Aliases
PreTt13387 | 38.m00222Description
RCL1 RNA 3-prime-terminal phosphate cyclase; RNA 3'-terminal phosphate cyclase family proteinGenome Browser (Macronucleus)
Genome Browser (Micronucleus)
External Links
Gene Ontology Annotations
No Data fetched for Gene Ontology Annotations
Domains
Gene Expression Profile
Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)
GeneMania
Tetrahymena Stock Center
No Data fetched for Tetrahymena Stock Center
Homologs
Source Identifier Score Tetrahymena borealis EI9_01321.1 1.0002211124116698e-173 Description: RNA 3-terminal phosphate cyclase (374 aa) DictyBase DDB_G0276159 3.9990760533890984e-36 Description: rtc1 on chromosome: 2 position 6274208 to 6275509 Stentor Coeruleus SteCoe_38408 0.000000000000004658886145103398 Description: None Oxytricha Contig3020.0.g29 0.0000000010002658722841845 Description: RNA 3-terminal phosphate cyclase SGD YOL010W 0.000000009996807949091551 Description: RCL1 Subunit of U3-containing 90S preribosome processome complex involved in 18S rRNA biogenesis and small ribosomal subunit assembly; stimulates Bms1p GTPase and U3 binding activity; similar to RNA cyclase-like proteins but no activity detected
General Information
No Data fetched for General Information
Associated Literature
No Data fetched for Associated Literature
Sequences
>TTHERM_00361720(coding)
ATGGTAGACGTAGTATATCTTTAAATAGATGGTTCTCTTCATGAAGGAGGAGGTTAGATA
ATCAGATCAAGCATGGCTCTTAGCAATATCTTATAAAAGCCTATTCAATTAAAAAATATA
AGAGTTAACCGACCAAATCCTGGATTGAATAATTAGCTTATGGGAGCTATTAAATTGATG
AGAGAAATCTCTAAAGCATAGGTAGTAGGTGATAAATAAAAATCATTGAAGATCACTTAT
GAACCTTAGATGAAAATTAAAAGCGGAAATTATGCAGGAGGATCTTAGAGTGCAGCTGCC
ATAAGTCTCATGGTTTAATCTTTAATTCCTACTATGATTTTTGGAAAAGCCTAGTCAACT
ATTAAACTTTAGGGTGGTAGTGATGTAAACAAATCTCCTCCATTTGAAACAATACAAAGA
ATTCTAAAGCCACTTTTAGAAAAAATGGGAATTCATTTTAATTACAATTTAATCACAGAA
GGTTACTACCCAAGAGGTGGTGGATAGATTTAATTAGAAGTATAGCCAATTGCTGATTAC
ATAAAGCCTATTACTATAACAAAACGCACTGTTATAAATAAAATTTATTTGCAATTTATT
TTGACTGAAACATGTGAAAAAGCTTAAAAAGATTATTTTAGACCTTTGAAAAAAGACATA
ATAAGCTTCTTAGTAAGTAAATAGCCTGGAATTAAAGAGGAAGATATTGAATTTGAAGTA
GATGTAAAGCAAATAAAAAACAAAAAATATAAAGAATGTTACTCTATTGTTGCTCATGCA
TATGGATCTGAAGATAATTATTTTGCTTTTTCTTTTTACAATGATGATGATCTAAAAGTC
GAAGTAATTATTTTATTAATACTAATAATATTAAATGATGTTTTTACTAGGATGCATCAC
AAAAAGTTTATGAAAACTTTGTTAAAGAACTTTCAGAAGGAGGCTGTTTAGATGAATACC
ATTAAGACTAATTATTATTGTACATGGCATTAGCTAATGGAGAGTCTCAAATTAGAGTAA
ACCCAGCTATCACAGATCACTCTTTAGCTTGCTTTTACGTACTTAAAGAATTTATCCCAG
AAGTAAAAATTGATGTAATTGATGAAGAAGTAGCTGGTCTTAGATCTAAAATTATCAAAA
TTGTAGGAGTAGGTTTTAAAAACGAATGAACAAGTTTTAAATTAAACTTGCTAAAATAAA
TTAATAAAAATATTTATTTATTTATAAAAAAAAATTAACATAAATAAAGATATATTTATA
ATAATTTTGGTTTTTATATTCAATAAACTTTAAATTGTATAATAAAACAAACAAATTGAA
TGCTACATGTAAAATAAATTAATTAATAATAAACCTCTATACTTATATAATATATAGCCT
CTTAGCATATAATTTCCATAAGAGGATTTATTTATATTTTTAATTGAGCTAGAAAGGGTT
TTTTTGGTTATATTTTTTTTAAAAAAACTCAAATAAATTTTTTAGAAATAACTCACTTAT
TTAAAAAATTAGATTTGA>TTHERM_00361720(gene)
ATGGTAGACGTAGTATATCTTTAAATAGATGGTTCTCTTCATGAAGGAGGAGGTTAGGTA
TATAAGTTATTAGTACATTTTATTTGGTATTGAATCATTATCGTGAAATTTAATTAGATA
ATCAGATCAAGCATGGCTCTTAGCAATATCTTATAAAAGCCTATTCAATTAAAAAATATA
AGAGTTAACCGACCAAATCCTGGATTGAATAATTAGCTTATGGGAGCTGTAAAAGATAAT
TACAAAATCATTTGAATATTACAATAAATTATATTTTTAGATTAAATTGATGAGAGAAAT
CTCTAAAGCATAGGTAGTAGGTGATAAATAAAAATCATTGAAGATCACTTATGAACCTTA
GATGAAAATTAAAAGCGGTATATAAAATAATCAAAAATTAGGTTGAAATAACTAAATAGT
TAGTGTTTTATATACAGGAAATTATGCAGGAGGATCTTAGAGTGCAGCTGCCATAAGTCT
CATGGTTTAATCTTTAATTCCTACTATGATTTTTGGAAAAGCCTAGTCAACTATTAAACT
TTAGGTAGAATATTAAAATTTATATATCAAATAAAGATATGCTTGCATTCCTCTACTAAT
TTAATAGACTCTTTTAAAACTAACAAATTAGTAAACAAAAAAGAGATAAAATCTTAATTT
AATTTAAATTAATTAATAATATTTGCAAAAAAAATAGACATTTAACAATATTATAATTAC
ACTTTTACAATTTCTAAATAATGTTTTTATTTATAAAAATTATTTTAGGGTGGTAGTGAT
GTAAACAAATCTCCTCCATTTGAAACAATACAAAGAATTCTAAAGCCACTTTTAGAAAAA
ATGGGAATTCATTTTAATTACAATTTAATCACAGAAGGTTACTACCCAAGAGGTGGTGGA
TAGATTTAATTAGAAGTATAGCCAATTGCTGATTACATAAAGCCTATTACTATAACAAAA
CGCACTGTTATAAATAAAATTTATTTGCAATTTATTTTGACTGAAACATGTGAAAAAGCT
TAAAAAGATTATTTTAGACCTTTGAGTAAGAAAATTAAATTTATTTAATGAATTGAATGT
TAAAGTGGTGTTAAAAAAGCAAACTTAAATTATTAAAAACAGAAAAAGACATAATAAGCT
TCTTAGTAAGTAAATAGCCTGGAATTAAAGAGGAAGATATTGAATTTGAAGTAGATGTAA
AGCAAATAAAAAACAAAAAATATAAAGAATGTTACTCTATTGTTGCTCATGCATATGGAT
CTGAAGATAATTATTTTGCTTTTTCTTTTTACAATGATGATGATCTAAAAGTCGAAGTAA
TTATTTTATTAATACTAATAATATTAAATGATGTTTTTACTAGGATGCATCACAAAAAGT
TTATGAAAACTTTGTTAAAGAACTTTCAGAAGGAGGCTGTTTAGATGAATACCATTAAGA
CTAAGTAATACTTTTATTTATTTATTTATTTATATTTTAACTTTAATTTTTTTTGTTAAA
GTTATTATTGTACATGGCATTAGCTAATGGAGAGTCTCAAATTAGAGTAAACCCAGCTAT
CACAGATCACTCTTTAGCTTGCTTTTACGTACTTAAAGAATTTATCCCAGAAGTAAAAAT
TGATGTAATTGATGAAGAAGTAGCTGGTCTTAGATCTAAAATTATCAAAATTGTAGGAGT
AGGTTTTAAAAACGAATGAACAAGTTTTAAATTAAACTTGCTAAAATAAATTAATAAAAA
TATTTATTTATTTATAAAAAAAAATTAACATAAATAAAGATATATTTATAATAATTTTGG
TTTTTATATTCAATAAACTTTAAATTGTATAATAAAACAAACAAATTGAATGCTACATGT
AAAATAAATTAATTAATAATAAACCTCTATACTTATATAATATATAGCCTCTTAGCATAT
AATTTCCATAAGAGGATTTATTTATATTTTTAATTGAGCTAGAAAGGGTTTTTTTGGTTA
TATTTTTTTTAAAAAAACTCAAATAAATTTTTTAGAAATAACTCACTTATTTAAAAAATT
AGATTTGA>TTHERM_00361720(protein)
MVDVVYLQIDGSLHEGGGQIIRSSMALSNILQKPIQLKNIRVNRPNPGLNNQLMGAIKLM
REISKAQVVGDKQKSLKITYEPQMKIKSGNYAGGSQSAAAISLMVQSLIPTMIFGKAQST
IKLQGGSDVNKSPPFETIQRILKPLLEKMGIHFNYNLITEGYYPRGGGQIQLEVQPIADY
IKPITITKRTVINKIYLQFILTETCEKAQKDYFRPLKKDIISFLVSKQPGIKEEDIEFEV
DVKQIKNKKYKECYSIVAHAYGSEDNYFAFSFYNDDDLKVEVIILLILIILNDVFTRMHH
KKFMKTLLKNFQKEAVQMNTIKTNYYCTWHQLMESLKLEQTQLSQITLQLAFTYLKNLSQ
KQKLMQLMKKQLVLDLKLSKLQEQVLKTNEQVLNQTCQNKLIKIFIYLQKKININKDIFI
IILVFIFNKLQIVQQNKQIECYMQNKLINNKPLYLYNIQPLSIQFPQEDLFIFLIELERV
FLVIFFLKKLKQIFQKQLTYLKNQI